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2005全国优秀博士论文选介及高校排名
吉林大学505上海第二医科大学505天津大学325西南交通大学415中国农业大学325大连理工大学224南京农业大学224四川大学314四川农业大学404西安电子科技大学314西北大学404北京理工大学213北京林业大学213第四军医大学213国防大学303哈尔滨工程大学303华东理工大学303南京航空航天大学303南京理工大学303西北农林科技大学303北京工业大学112北京科技大学202北京中医药大学202东华大学202海军工程大学112湖南大学112解放军信息工程大学202兰州大学202南京师范大学202上海大学202石油大学202天津中医学院202西南政法大学202厦门大学112扬州大
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蛋白质序列分析新工具被开发出来
生物通报道：自从人类基因组测序完成后，生命科学研究的重心逐渐由基因组转移到了蛋白质上。随着越来越多的蛋白质序列的获得，研究人员越来越需要找到能够抽出小的信息亚单元来确定蛋白质功能的方法。除了找出使相关蛋白相互区别的地方，这些信息还可能帮助研究人员加工蛋白质，以使它们执行新的任务。现在，美国能源部Brookhaven国家实验室的研究人员编写了一种能够将“小麦”从“谷壳”中挑选出来的计算机程序。有关这个程序的信息在BMC Bioinformatics上有描述。这个程序能够对相关的蛋白质组进行比较并标记出可能控制蛋白质功能的个体氨基酸位置。这个新的程序叫做CPDL即conserved propert
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挑战主流癌症学研究者的新证据!
生物通报道：耶鲁大学医学院的一项新研究的结果对主流癌症学研究者提出了挑战，并认为肿瘤细胞与白细胞的杂交是癌症转移扩散到身体其他部分的一个主要原因。耶鲁的这项研究的成果刊登在12月的Lancet Oncology杂志上。这项研究的领导者John Pawelek指出，癌细胞表现出了许多与巨噬细胞类似的一些能力，包括迁移到淋巴结和远距离器官以及形成新的血液供应的能力。其实，有关白细胞与肿瘤细胞杂交的观点并非新观点。早在20世纪初，德国的病理学家Otto Aichel就提出癌症转移是由于癌细胞与巨噬细胞融合而造成的。可惜的是一直没有证据证明这个观点。巨噬细胞是人体中活动最灵活的细胞，通过整合巨噬细胞的
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2005艾滋病研究主要新成果大汇总
生物通报道：2005年12月1日，是第18个“世界艾滋病日”。据最新的调查结果显示，2005年，全球艾滋病患者增加了约500万人。而我国艾滋病患者人数也在不断上升。更可怕的是，目前确定出的艾滋病患者数量可能只占到所有艾滋病患者数量的5%，也就是说95％的艾滋病患者并没有被找出来。导致这种病的元凶是HIV（人类免疫缺陷病毒），这种病难治的一个重要原因就是HIV病毒会不断发生变异，从而使艾滋病疫苗失效。最近，马里兰大学人类病毒学研究所的Robert Gallo博士通过对动物进行研究，向着制造出艾滋病疫苗前进了一大步。并且，他希望在之后的一年之内能开始临床试验。他的研究组在制造能与不同的HIV病毒株
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首两份人类蛋白质组相互作用图谱已绘出
生物通报道：因为蛋白质是生命实行功能的分子，所以对其的研究是特别重要的。目前，我国有多个蛋白质组计划正在实行当中，蛋白质组其中的一个重要研究方向就是相互作用组（interactome）。所谓一个巴掌拍不响，很多时候蛋白需要相互作用才能正常行使功能。研究蛋白质两两之间相互作用手段最常见的就是酵母双杂交（Yeast 2 Hybrid, H2Y）。有赖于酵母双杂交的高通量化，果蝇、线虫等模式生物的蛋白质相互作用图谱已经有科学家绘出，而最近科学家又利用此技术完成了人类蛋白质组相互作用图谱，有两个来自不同国家的研究小组先后完成了这一历史性的任务。9月1日，来自德国的研究小组首先在Cell电子版上刊登了他
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DNA条形码有负众望？
生物通报道：世界上的物种消失的速度似乎总是比生物学家鉴定它们的速度要快。因此，一些专家将他们的希望寄托在了DNA条形码上。DNA条码是一种新出现的方法，它将一小段DNA作为确定物种的通用产品编码。但是这种技术从一开始就引起了争议：持怀疑者认为一个单个的基因片断不能完成这么大的任务。在刊登在最新一期的Plos Biology上的一项新研究中，Christopher Meyer和Gustav Paulay利用一种常见的热带水生贝类进行了检测研究。Meyer和Paulay发现尽管条形码能很好地确定出特征已经了解的很详细的组的样本，但是当它用于发现新物种时往往会出错。对于大多数动物来说，DNA条码都是
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“尼古丁疫苗”可用来戒烟
生物通报道：“吸烟有害健康”，可能人人都知道，但是有些人则在不知不觉中上瘾而欲罢不能。现在，美国明尼苏达大学的 Dorothy Hatsukami 博士的研究组发现，目前正进行人体试验的尼古丁疫苗NicVax，可能有助于瘾君子戒烟，并且具有很高的安全性。这项长达38周的试验共有58位吸烟者参与。 Hatsukami指出，这种新疫苗含有能与尼古丁结合的抗体，因此能阻止吸烟时大部分尼古丁进入大脑。这个过程可能会降低吸烟的愉悦感和对尼古丁的上瘾。由于这种疫苗只针对尼古丁而不影响脑部功能，因此对中枢神经系统只产生很小的副作用。试验结果显示，38%的受测者在接受高剂量疫苗后，能持续戒烟至少达30天之久。
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增加癌症风险的基因
生物通报道：通常，从子女脸上都可以找到父母亲的印记，你可能很会长，将父母的优点集于一身，但你也可能从会他们身上遗传到与增加癌症风险有关的基因。Marshfield 诊所的遗传学专家Carrie Zabel在分析患者发生癌症的可能性时，都先从他们的家族病史入手。虽然环境因素是导致癌症的主要原因之一，但是基因突变也会导致个体患癌症的风险增加。目前已经知道，有些特殊的基因会增加癌症如乳腺癌的发病风险。以乳腺癌为例，如果患者携带一个BRCA1 或BRCA2基因的突变，他们发生乳癌的风险将分别增加35％和87％ 。以普通人作对照，这类基因突变也与卵巢癌风险的增加有关，会使卵巢癌风险增加40％。但是，这些
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12月1日Nature选读
生物通综合：拮抗miRNA的药物及miRNA的功能微RNA（miRNAs）、即被认为通过对基因表达的影响参与很多生物过程的非编码RNA的发现，正在改变我们对基因被调控的方式的认识。我们对它们在哺乳动物活体中的功能知之甚少，但新开发的一组能使小鼠的miRNA沉寂的化合物，可为研究它们的功能提供一个强大的工具，也可为使患者的miRNA沉寂提供一个潜在的治疗策略。被称为“antagomirs”的这些新试剂是通过化学方法合成的寡核苷酸，具有与天然miRNA形成互补的序列。对小鼠静脉注射拮抗miR-16、-122、-192 和 -194的“antagomirs”，会使肝脏、肺脏、肾脏、心脏、小肠、脂肪、
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专家称在中国人身上发现抗艾滋基因
人体中是否有基因可以抵抗艾滋病？哪些基因与人体抗艾有关？在昨天暨南大学举行的“首届中国东南部艾滋病国际学术研讨会”上，有关专家透露，广州及美国医学机构的合作研究后，曾在白人身上发现的“抗艾滋病基因”——“杂合子”基因，目前同样在中国人身上找到了。 该基因在白种人身上已找到 去年开始，暨南大学艾滋病基因与疫苗研究中心、广州市传染病医院和美国华盛顿大学医学院艾滋病分子病毒学实验室合作进行有关抵抗艾滋病感染与基因关系的研究。 目前，研究组已采集到1000多份健康者的血液样本，并对其中512例展开了研究；同时从广州市第八人民医院、广州及深圳疾控中心等处采集了300个H
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美发现乳腺癌也有“干细胞”
据《中国医药报》报道，美国密歇根大学综合癌症中心科研人员在最近研究中发现，人乳腺癌的肿瘤细胞中只有一小部分（百分之一左右）能形成恶性肿瘤。尽管在人类白血病中也发现过类似细胞，但这是第一次在实体瘤中的发现。这些肿瘤“干细胞”是从九名接受治疗的妇女原发性或转移性乳腺癌里分离出来的。 该研究小组成员穆罕默德·阿尔-哈吉解释说，所有癌细胞的表膜都有独特的蛋白质标记，类似于指纹。“我们利用特定抗体和流动细胞计数技术，根据表层蛋白质标记，将肿瘤里的癌细胞分隔为独立的群体。”研究人员将这些分离出来的细胞群体分别注入有免疫缺陷的小鼠体内，然后每周对小鼠进行肿瘤生长观察，为期六个月。 该研究小组负责人、
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质谱与蛋白质组学
Current Opinion in Chemical Biology 2000, 4:489-494蛋白质组学对一个细胞或组织所表达的蛋白质进行的系统分析，而质谱是它的关键性分析工具。在过去的两年中，标准蛋白质组技术中的进展增进了更高水平自动化和敏感性的蛋白质识别技术。另外，新的技术促成了鉴定蛋白质功能相关特性的里程碑性的进展，包括它们的定量和在蛋白质复合物中复杂情况。缩写2DE two-dimensional gel electrophoresis双向凝胶电泳CID collision-induced dissociation碰撞诱导的解离ESI electrospray ionizati
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控制干细胞分化的基因被确定
生物通报道：最近，犹他州大学的 Peter W. Reddien 博士与 霍华德休斯医学院的 Alejandro Sanchez Alvarado 博士等人通过利用涡虫作为研究模型，发现了控制干细胞分化成特定细胞的基因。这种基因能合成与 PIWI 相似的蛋白，而PIWI是包括植物到人类在内的干细胞的重要调控者。这项研究的发现将有助于科学家了解干细胞如何分化。 目前已经知道，涡虫依赖体内的neoblasts（副胚层）干细胞从而能完整再生。副胚层能形成多种不同细胞形式，破坏涡虫的副胚层会导致其死亡。 Sanchez Alvarado 博士和其同事于今年初发现，他们关闭的涡虫的 1,065 个基因中
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MicroRNA决定哺乳动物基因的前途（上）
生物通报道：RNA一直是DNA忠实的伙伴，没有它，DNA就会变得很寂寞。而microRNA则是RNA群体中比较特殊的一类：它们并不编码蛋白质，但却参与生物体生长、发育等重要生理过程的调节。想了解更多有关microRNA的信息，请进入生物通7月聚焦：走进microRNA的大世界。现在，怀特黑德研究所（Whitehead Institute）的成员David Bartel发现microRNA对基因进化的影响力远远超过先前研究的预测。MicroRNA正在功能水平和进化水平上影响着大部分蛋白质编码基因。在刊登于2004年1月的Cell杂志上的一项研究中，Bartel的实验室与麻省理工的Chris Bu
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MicroRNA决定哺乳动物基因的前途（下）
生物通报道：Bartel实验室的研究生Kyle Kai-How Farh发现携带非保守位点的mRNA通常不存在于拥有相对应的microRNA的细胞中——其缺乏的程度比统计学模型预测的要深。研究人员推测在进化过程中，许多mRNA为了维持它们的功能并确保生物体的健康，在很短的时间内丢弃了那些能与microRNA配对的位点。除了找到大量的有关基因避开microRNA打靶的例子外，Farh还分析了另一个极端，即基因在进化过程中保存了microRNA靶标位点的例子。他发现当未成熟的肌肉细胞停止分裂并称为成熟的肌肉细胞时，microRNA被活化并抑制在成熟肌肉中不在需要其处于高活性水平的基因。研究人员指出
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免疫反应研究新发现
生物通报道：已经知道，在幼年期感染 EBV (Epstein-Barr virus) 通常都不会有什么症状，但是在青少年和成年期再度感染这种病毒时则会引发 IM (infectious mononucleosis传染性单核细胞增多症)。最近，麻萨诸塞州大学的 Liisa Selin 和其同事发现 T 细胞可能会对与 EBV无关的病毒感染反应过度，从而增加免疫反应的严重性并导致IM。这项研究的结果公布在Journal of Clinical Investigation杂志上。 研究人员在IM 患者体内发现，针对流感病毒抗原决定基（epitope）的CD8+T细胞还能识别EBV 的抗原决定基。而流
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蓝色力量：从海洋动物基因到人类免疫
生物通报道：蓝色的海洋是美丽而神秘的，它是地球上最大的一座资源宝库。海洋中的动物对人类的益处不仅仅是能为我们提供食物那么简单。斯坦福大学医学院的一项研究显示，从大海里微小的无脊椎动物海鞘(sea squirt)所发现的基因，居然能够成为人们了解免疫系统的运作工具。 海鞘是大海里相当独特的一种生物，它们通常聚集在浅海里，远远看起来像朵盛开的花朵——其实每一个“花瓣”都是一个独立的个体，它们为了在险恶的环境中生存，从而演化出彼此融合(fusion)的能力并形成一个大的群落。 Anthony De Tomaso博士领导的研究组发现了海鞘里的一个特殊的基因，它负责感应海鞘彼此融合前的辨识工作。当这个负
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《新英格兰医学杂志》上禽流感重大新成果
生物体报道：到目前为止，人类已经发现了好几种类型的禽流感病毒，随着时间的推移，病毒不断地在发生着变异。最近，美国圣路易斯大学疫苗研究中心的研究人员表示，1918年发生的西班牙流感病毒基因可以帮助研究人员预测目前禽流感病毒的演变趋势。研究人员从中获得的信息，将有助于人们预测H5N1型禽流感的演化方向，并及时了解这种病毒何时能会引起重大的疫情。 1918年暴发的西班牙流感是迄今最大的流感疫情，据统计全球有二千万至五千万人死亡。2005年10月，美国武装部病理学研究所、疾病控制和预防中心等机构的专家在Nature和Science杂志上发表了多篇文章，指出他们已经成功地使这种引发1918年流感的Ｈ１Ｎ
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第一个非脊椎动物组织相容性基因被发现
生物通报道：在现代医学研究中，移植手术过程中所遇到的组织排异性情况是个令人头痛的问题，由于这种生物自身的保护作用，导致许多移植手术无法进行。来自斯坦福大学病理与发育生物学系（Departments of Pathology and Developmental Biology, Stanford University School of Medicine）的研究人员近期所作出一项研究成果可能为解决这一难题提供了一个理论基础。这一研究成果刊登在11月24日的Nature杂志上。同种异体移植物（allograft）移植后常发生免疫排斥反应，引起这种排斥反应的抗原称为移植抗原或组织相容性抗原。动物和人
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Cell封面：p53调控调亡研究重大发现
生物通报道：在DNA受损的时候肿瘤抑制因子p53有两种方式对此进行补救，一是使细胞走向调亡（Apoptosis）；二是使细胞停止分裂，进行修复。但是这一关键步骤在某些细胞类型中是如何进行的还不是十分确定。来自美国哈佛医学院的研究人员利用造血祖细胞（hematopoietic progenitor cell）发现了转录抑制因子Slug如何通过抑制另一由p53调节的下游因子puma来阻止凋亡发生的。这一具有意义的科研成果以封面故事形式发表在11月18日的Cell上。SLUG是转录因子家族中编码锌指蛋白的基因,它最近发现与促癌转移有关，一般在背部神经管表达, 参与神经胚的形成。而PUMA（p53 u
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