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首份酵母磷酸化激酶网络图谱完成(资源)
生物通报道:蛋白磷酸化涉及很多基本细胞过程的调控,所以它是蛋白组学所分析的一个主要目标。今年年中,德国科学家已经利用高通量RNAi方式对人类基因组范围内激酶磷酸化作用网络进行了初步作图。最近来美国的研究小组利用蛋白质组新片的方法,将实验中经常用到的模式生物——酵母的磷酸化激酶网络完成了。初步结果发表在12月1日的Nature杂志上(文献1)。据估计,蛋白的磷酸化作用会影响到大约30%的蛋白质组,是许多细胞过程的重要调节机制。目前对蛋白质磷酸化还缺乏一个生物化学基础上全面的认识。在酵母中大约只有一半激酶的作用对象是已知的,而已知进行磷酸化作用的激酶蛋白不超过160种。现在,研究人员利用蛋白质组芯
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科学家破解鱼儿不畏冰雪的秘密
生物通报道:寒冷的冬天,在冰封的湖水中,鱼类仍然在自由自在的游弋。但人类还不知道它们为什么能够如此“逍遥”于寒冬。在最新的《新科学家》杂志上,美国密歇根大学的研究人员破解了鱼抗冻的原因。通过利用计算机进行精细的模拟,研究人员证明了有关抗冻蛋白质通过依附在冰晶之上并迫使其改变形状来阻止冰晶大量生成的理论。 银鱼、南极鳕鱼等多种生物都会通过制造抗冻蛋白质来帮助它们在冰水中生存。从理论上来看,它们的体液中应该会形成冰晶,并能破裂脆弱的细胞膜和细胞组织。而抗冻蛋白质则会依附于冰晶的表面,从而起到阻遏冰晶进行破坏的作用。 密西根大学的伦纳德·桑德尔和阿列克谢·特卡琴科已经通过计算机模拟出了这个过程是如何
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美公布癌症基因组图谱绘制计划
生物通报道:来自纽约12月9日的消息,美国国立癌症研究协会(the National Cancer Institute, NCI)和国家人类基因组计划研究协会(the National Human Genome Research Institute, NHGRI)表示将于12月13日在华盛顿的记者招待会公开介绍他们的一项癌症基因组小规模试验计划的大致内容。今年8月,NCI与NGRI各投入资金5千万美元,准备进行一项为时3年的癌症基因组试验性质的计划,主要目的是“analyze whether the comprehensive cataloguing of the sequence chang
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美两公司合作开发分析系统生物途径软件
生物通报道:纽约消息,美国Stratagene和Stand生命科学公司计划合作开发用于分析系统生物学途径和Affymetrix新GeneChip芯片的生物信息软件。这项协议要求两家公司共同设计和开发软件——将包括Stand的Avadis技术。Stratagene公司将独立销售两项产品。据悉,之前Affymetrix公司曾表示会使用Stratagene软件用于GeneChip信息分析。因此,Stratagene将会开发出一种新的软件包,即ArrayAssist Lite,它将被用作Affy芯片的标准统计分析攻击。(生物通记者杨遥)
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12月9日Science选读
生物通综合:大脑的情绪中心帮助处理不确定性一个神经科学家和经济学家小组的研究发现,当一个人面临作有不确定性的决定时,大脑处理情绪的区域活跃起来。Ming Hsu和同事说,有关在缺少信息情况下作决定的大脑“硬连线”的新信息“很重要,因为这是每个社会层次的基本活动,包括人们为退休养老存钱,公司为保险定价,国家评价军事、社会、和环境风险”比如为气候变化或恐怖主义者袭击做准备。研究显示,与由于缺少信息而有不确定风险的不明确选择相比,人们比较容易地作出带有已知风险的决定。Hsu和同事将这些“风险与不确定性”决定用一个赌博游戏的形式提供给被测试者。研究人员用成像技术来观察他们作选择时的大脑活动,发现当被测
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日科学家发现糖尿病相关基因 这种基因有抑制生长激素分泌的作用
新华社东京12月12日电 日本德岛大学板仓光夫教授等人发现,一个名为SOCS2的基因与糖尿病有关,该基因的某个“版本”能抑制胰岛素分泌,携带该“版本”基因的人易患糖尿病。 板仓教授对780名健康日本人和710名Ⅱ型糖尿病患者的基因进行了比较,结果发现SOCS2基因特定的碱基序列因人不同而分为两种“版本”,其中一种“版本”的人体胰岛素分泌量少,易患糖尿病。研究人员将该“版本”的基因植入老鼠胰腺进行实验,结果发现老鼠胰岛素分泌量变少。此前人们已经发现,SOCS2有抑制生长激素分泌的作用。 Ⅱ型糖尿病发病与基因、生活习惯等多种因素有关,在糖尿病患者中占多数。日本Ⅰ型、Ⅱ型糖尿病
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华人学者首次实现直接确定DNA突变
一些疾病,比如:某些癌症的发生是由于DNA中一个核苷酸的突变造成的,因此研究这单个核苷酸的突变具有重要的治疗意义。同时可以根据每个人突变的不同配以个性化的治疗药物。目前检测单核苷酸多态性的方法大多利用生化原理,都比较耗时且需要经费较多。而陶农建等研究人员从DNA的物理本质着手,利用DNA本身的物理特性——导电率第一次实现了对DNA突变的直接检测。DNA在以往的实验中根据特定的实验条件下会同时显示出导体和绝缘体的特性。研究人员将单个分子绕成一个电流回路,这样可以直接阅读一个DNA分子中的生物学信息。要测得DNA的传导率必须要将DNA分子环绕起来,这其中有两个重要之处。一个是需要将DNA在两个电极
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NIH选中普渡大学测序虱子基因组
生物通报道:最近,美国健康研究院(NIH)批准了普渡大学的身体虱子完全基因组测序计划。普渡大学的昆虫遗传学家Barry Pittendrigh已经鉴定出了一些与虱子消化人类血液以及对细菌作出反应有关的一些基因。麻萨诸塞大学环境毒理学专家John Clark发现了一种维持遗传上均衡的虱子群落的途径。由这两位研究人员领导的研究组将会收集有关虱子基因组的初步信息并将这些信息传送给美国人类基因组研究院(NHGRI)的大规模测序网的五个中心。NHGRI的人员透露说这项测序工作将在一年内完成。人体上的虱子是NIH选择的7种非哺乳动物物种中的其中一个,并且是三个将进行高质量测序的目标之一。研究人员希望虱子基
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美公司和学校联合启动病原体测序计划
生物通报道:454生命科学公司和华盛顿大学医学院的基因组测序中心打算测序导致疾病的病原体并研究在哺乳动物细胞和组织中的基因表达情况。这个计划的第一部分叫做GSC:由454的科学家利用454的Genome Sequencer 20 System测序和分析病原体。在这项计划的第二部分中,来自华盛顿大学的研究人员将测序RNA,以分析基因在哺乳动物和组织中的表达特征。454公司的CEO Christopher Mcleod指出,这项合作将会扩展到其他方面的项目。(生物通记者杨遥)
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科学家发现癌细胞扩散的秘密
据路透社报道,美国科学家最近在癌症研究领域取得了显著进展,研究人员发现了癌细胞从身体的原发部位向其它部位扩散的秘密,这个发现为癌症的治疗和预防铺平了道路。这也是科学家首次发现癌细胞扩散的秘密,这项研究成果发表在《自然》杂志上。 在实验室对动物的研究中,科学家对乳癌、肺癌以及食管癌细胞的扩散过程进行了细致的研究,结果发现癌细胞在其扩散前滋生出的“使节”细胞是确定癌细胞下一个扩散地点的决定性因素。研究人员表示,癌细胞在扩散的过程中并不是简单地从肿瘤中分离出癌细胞,再通过人体的血管扩散到身体的其它器官,从而导致并发肿瘤的形成或是造成癌细胞转移的恶果。与上述过程不同
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一种抵御肿瘤的新基因被发现
生物通报道:一项新的研究发现一个在免疫功能中起到重要作用的基因还可能在抑制慢性肺炎和肿瘤形成过程中起到至关重要的作用。这个基因就是toll-like receptor4(TLR4)。研究人员通过对小鼠进行研究获得这些发现。研究的结果公布在12月7日的Journal of the National Cancer Institute。已经知道,慢性炎症能够使患者容易患上多种癌症。通过利用这些新发现,研究人员将能够抑制慢性肺炎并降低癌症的发生率。新的研究揭示出,TLR4被移除或发生改变的小鼠发生肺癌的几率比那些具有完整受体的小鼠要高出60%——这意味着TLR4具有保护性功能。TLR4是先天免疫系统的
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12月8日Nature选读
生物通综合:封面故事:狗的基因组完成测序从遗传上来讲,家狗的基因组在地球上5500种哺乳动物中可以说是最有趣的。不同品种的狗之间在行为和体征方面的明显差异(这些特征是由在相对较短的时间内人类的强化选择造成的),这意味着,狗的基因组含有了解基因组演化和组织的关键线索,也含有了解疾病易感性的线索。在本期Nature上,Lindblad-Toh等人发表了狗基因组的高质量序列草图,更具体地说,是一只名叫“塔莎”的、品种为“拳击手”的德国母狗的基因组,并且还列出了不同品种的狗之间的一些遗传差异。将狗与人类和啮齿类动物所做的比较分析,为我们提供了一个关于基因和基因组的演化的具有普遍性的视角。狗为什么比人更
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Nature:人和昆虫竟然具有相同的干细胞
生物通报道:无论从外在还是内在来看,六只腿的果蝇和人类似乎毫无相似之处。但是一项新的发现表明它们事实上是人类的渺小的远房亲戚。卡内基研究所胚胎学系的研究人员发现成年果蝇的肠道中具有与人类肠道相同的能控制细胞调节的干细胞。这一发送对了解包括一些癌症在内的消化系统疾病以及研发相应的治疗药物和方法具有重要意义。果蝇的肠道中具有与人类相似的遗传程序,强烈地表明人类和果蝇在5亿年前具有相同的祖先。这一发现公布在12月7日的Nature杂志上。这些发现非常令人吃惊,但事实上昆虫肠道的基本构造确实与脊椎动物的肠道结构很相似。它们也有嘴巴、食道、类似胃的结构和大小肠。研究人员对果蝇的小肠进行了研究。它们的小肠
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犬类基因组图谱与人类比较分析结果公布
与人类差异的比较将狗与人类、啮齿类动物所做的比较分析,为我们提供了一个关于基因和基因组的进化的大致模式。研究惊奇的发现比起小鼠基因组,狗基因组与人类的相似度更高,这就意味着用利用狗遗传模式来研究人类疾病的可行性。更重要的是通过对比发现人类基因组种在所有哺乳动物中保守的部分。人类基因组中大概有5%的序列是在过去1亿年进化中表现出高度保守的,这也就意味着这些序列编码的产物起到相对重要的作用。这5%的序列并不是随机分布的,它们相对集中的出现在一个小片段(大概占到1%)中,这个片段编码的蛋白大多都是参与发育的调控蛋白。不同狗品种间差异所有犬类的祖先都是灰狼,人类在过去1.5万年里,根据自己的意志和狗的
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南洋理工大学研制抗疟疾疫苗
南洋理工大学一组科研人员正尝试找出有效的疟疾(malaria)疫苗,以制止这种致命的传染病继续在全球散播。 疟疾被国际卫生组织视为全球最令人关注的传染病之一,在每年发生的五六百万宗疟疾病例中,致命的有一两百万,单单在南亚和东南亚,每年就有大约120万至200万宗疟疾病例。 南大生物科学院的贝尔瑟教授(Peter Preiser)受访时说,他们的研究工作,主要是确认传播疟疾的寄生物的习性,并找出哪些寄生物分子(molecule)适合用来制造疫苗。 虽然全球各地的研究人员展开有关疟疾的研究,但寄生物对多种疟疾药物已经产生抵抗力,而真正有效治疟疾药物也有限。 贝
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青蒿素首次面临抗药性威胁——科学家首次发现疟原虫对青蒿素产生抗药性
三思科学网2005年12月9日报道 目前人类抵御疟疾的最佳药物之一青蒿素开始受到抗药性威胁,科学家最近首次发现了疟原虫对青蒿素产生抗药性的实验证据。尽管目前还没有病人死于抗青蒿素的疟疾,但专家警告说,使用青蒿素必须非常谨慎,以免抗药性扩散。 青蒿素从菊科蒿属植物青蒿中提取,是中国科学家于20世纪70年代开发出的抗疟药物,最近几年在全世界开始广泛使用。青蒿素及其衍生物青蒿琥酯、蒿甲醚对恶性疟疾有着强大的治疗效果。即使在疟原虫已进化出对目前多数药物有抗药性的地区,青蒿素类药物也能迅速治愈多达90%的病人。&nbs
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亚洲禽流感防控合作部长级会议在昆明举行
新华社昆明12月7日电 亚洲禽流感防控合作部长级会议7日在昆明举行。国务院副总理、全国防控高致病性禽流感指挥部总指挥回良玉在开幕式致词中指出,中国政府一贯以对地区和全球事务高度负责的态度,积极倡导和参与全球禽流感防控的交流与合作。在防控禽流感的关键时期,亚洲国家和地区、相关国际组织共同探讨加强防控禽流感合作问题,充分反映了亚洲国家和人民战胜禽流感疫情的坚定决心和信心,充分展示了国际社会防控重大动物疫病的共同意愿和要求,充分体现了在防控禽流感工作中加强国家、地区间的协作配合、国际区域组织交流与合作的必要性和重要性。 回良玉指出,禽流感
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前列腺癌起因新发现:特异性基因融合可能是“罪魁”
前列腺癌是男性泌尿系统肿瘤中最常见的一种,但不同地区、不同种族的前列腺癌发生率却不尽相同。黑人的发病率及死亡率最高,白人次之,黄种人最低,因此前列腺癌在北欧的发病率占当地男性泌尿系统肿瘤的第一位,而在亚洲地区则相对低一些。如前列腺癌在美国50岁以上的男性中,每年新增病例约20万人。 尽管人们对前列腺癌的研究已经有许多年,但是到目前为止,有关前列腺癌的起因问题尚无定论。通过对患者的大量流行病学调查发现,前列腺癌与多种环境和遗传因素有关,如年龄增加和体内雄激素含量增加、泌尿系统的病毒感染、家族遗传史、过多地接触镉等某种有害化学物质、大量饮酒或吸烟等,但究竟是哪
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加州大学:适合所有人的艾滋疫苗是不可能的
生物通报道:HIV病毒是导致艾滋病的罪魁祸首,对这种病毒的敏感性则因人而异。美国加州大学洛杉矶分校的研究人员对洛杉矶的一对在1983年出生后不久就感染了HIV病毒的男性双胞胎进行了长期的跟踪调查。研究人员发现被同种病毒株感染的这对双胞胎继续生活在洛杉矶并在同样的环境下长大。出乎意料的是,他们的T细胞受体(TCR)对病毒的反应并不相同,这意味着身体的防御反应是随机的,并且是无法预测的。TCR在免疫系统中起到重要作用,它们能与病毒和其他抗原结合,从而杀死入侵者。但是,HIV能够通过改变形状使自己不适合TCR细胞上的受体而避开了这种作用。这些发现证明这对双胞胎的免疫系统和HIV病毒的相互作用是随机的
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新发现:雌激素竟能杀死癌细胞
生物通报道:乳腺癌是妇女的一种常见疾病,多发于绝经后的中年妇女身上。最近,Fox Chase癌症研究中心的研究人员报道说一些乳腺癌细胞一旦获得雌激素,就会被这种激素杀死。这一发现揭示出,在剥夺雌激素后用雌激素治疗乳腺癌的方法可能克服细胞最终对激素疗法产生抗性 。这些发现公布在12月7日的Journal of the National Cancer Institute上。许多乳腺癌细胞需要雌性激素才能生存,即雌激素受体阳性乳腺癌。患有这种类型乳腺癌的妇女能够利用一些抑制雌激素的药物加以治疗,例如tamoxifen、fulvestrant或aromatase抑制剂,它们能够导致癌细胞发生凋亡。虽然