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  • DLBCL NOS(n = 99)的细胞组成特征…… 开放获取

    本文探讨了弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)肿瘤微环境(TME)的细胞组成、细胞间相互作用以及空间组织结构,并分析了这些特征与患者预后之间的关系。研究利用了多色免疫荧光(mIF)技术、细胞表型分析以及邻域分析,对99名未经治疗的DLBCL患者样本中的1218756个单细胞进行了详细研究,识别出17种细胞表型和10种复发性细胞邻域(RCN)。研究发现,B细胞和PD-1阳性的T细胞的回避与较低的疾病侵袭性和较好的生存预后相关,而CD8+ T细胞丰富的RCN与免疫贫乏的RCN的接近则与较好的患者预后有关,反之,PD-L1阳性的B细胞丰富的RCN和CD8+ T细胞丰富的RCN的接近则与较差的预后相关。

    来源:Cancer Immunology Research

    时间:2025-10-03

  • 弥漫大B细胞淋巴瘤中肿瘤微环境的空间分析揭示了具有临床意义的细胞相互作用及反复出现的细胞邻域 开放获取

    这项研究聚焦于弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)肿瘤微环境(TME)的组成及其空间组织方式,并探索这些特征如何影响患者的预后。通过使用多重免疫荧光(mIF)技术、细胞表型分析以及邻近区域分析,研究人员对来自99名患者的一共1,218,756个单细胞进行了深入分析,从而揭示了DLBCL中不同的细胞表型和反复出现的细胞邻近区域(RCN)分布。这些发现为DLBCL的临床预后提供了新的视角,并提出了可能的治疗方向。### 肿瘤微环境的细胞组成研究团队发现,DLBCL患者的TME中存在17种不同的细胞表型,涵盖了不同的B细胞、T细胞以及肿瘤相关巨噬细胞(TAM)。在所有分析的样本中,B细胞的比例最高,平

    来源:Cancer Immunology Research

    时间:2025-10-03

  • 组织特异性免疫抑制性和增殖型巨噬细胞促进了人类结直肠癌早期向肝脏转移的过程 开放获取

    摘要 早期同步性结直肠肝转移(CRLM)是一种临床病症,其特征是原发性结直肠癌和肝转移灶同时存在。在本研究中,我们分析了接受结直肠癌和CRLM手术切除的患者肿瘤微环境(TME)中肿瘤相关巨噬细胞(TAM)的组织特异性转录组、表型及其功能特征。高通量单细胞转录分析显示,结直肠癌和CRLM的TME中炎症性TAM与免疫调节性TAM的比例呈反比,且两种肿瘤组织均存在异质性。此外,我们发现结直肠癌中的炎症性TAM表达抑制性配体,这可能有助于肿瘤逃避免疫系统,从而促进肝转移的发生。

    来源:Cancer Immunology Research

    时间:2025-10-03

  • IMPACT的表达减少了代谢可塑性,并增强了NK细胞的杀伤能力,从而抑制了转移性生长 开放获取

    摘要 鉴于侵袭性上皮肿瘤容易形成肝转移,我们使用小鼠肝脏以及KRAS G12D/TP53 R273H胰腺细胞进行了体内cDNA筛选,结果发现RNA结合蛋白GCN1是肝转移过程中的关键成分。RNA干扰实验表明,GCN1能够触发整合应激反应(Integrated Stress Response, ISR),激活丝氨酸、叶酸和甲硫氨酸的生物合成途径以及氨基酸转运蛋白,这些途径共同作用以促进代谢物的获取并恢复氧化还原平衡。除了激活ISR外

    来源:Cancer Discovery

    时间:2025-10-03

  • 蔗糖醇的摄入通过破坏微生物群抑制癌症免疫疗法的反应 开放获取

    摘要 肠道微生物群的组成与癌症患者对免疫治疗的反应直接相关。饮食对肠道微生物群以及由此产生的免疫反应的影响仍不明确。在本研究中,我们发现摄入一种常见的非营养性甜味剂——三氯蔗糖(Sucralose)会改变微生物组的组成,限制T细胞的代谢和功能,并降低癌症临床前模型及接受抗PD-1免疫检查点抑制剂治疗的晚期癌症患者的免疫治疗反应。摄入三氯蔗糖会导致肠道微生物群中可利用的精氨酸减少,而通过补充氨基酸或从对PD-1治疗有反应的小鼠体内转

    来源:Cancer Discovery

    时间:2025-10-03

  • 肌动蛋白组氨酸甲基转移酶SETD3是一种CHD1赖氨酸二甲基转移酶

    彭伟林 | 王克里斯托弗 | 杨瑞 | 彭雄 | 赵振宇 | 何博学 | 青北 | 蔡启东 | 尹伟 | 陈一川 | 余峰雷 | 王翔 | 韦光涛中南大学第二湘雅医院胸外科,中国湖南长沙410011摘要蛋白质甲基化是一种普遍存在的翻译后修饰,主要作用于赖氨酸、精氨酸和组氨酸残基。尽管SETD3(一种组氨酸甲基转移酶)在癌症中的具体作用尚不完全清楚,但异常的蛋白质甲基化已被证实与肿瘤发生有关。在本研究中,我们发现CHD1是SETD3的一种新的底物,SETD3能够对CHD1的209位赖氨酸(K209)进行二甲基化。该位点的二甲基化通过减少CHD1的泛素化来增强其稳定性。此外,SETD3还通过甲基化

    来源:Cancer Letters

    时间:2025-10-03

  • 综述:病毒相关恶性肿瘤中的磷脂酰肌醇动态变化

    亮点磷脂酰肌醇(PPIn)的动态变化,包括PI3P、PI4P、PI5P、PI(3,4)P2、PI(3,5)P2、PI(4,5)P2和PI(3,4,5)P3,受到激酶、磷酸酶和脂质转运蛋白的调控。PPIn的失调是癌症的一个特征。包括人乳头瘤病毒、乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒、Epstein–Barr病毒、卡波西肉瘤相关疱疹病毒、人类T细胞白血病病毒和Merkel细胞多瘤病毒在内的致癌病毒,已经进化出能够操纵这些脂质以促进自身复制的能力,从而导致细胞转化。致癌病毒会利用PI4P和PI5P来实现其入侵、复制和分泌过程。致癌病毒会干扰核内PPIn的代谢,并调节染色质重塑、表观基因组以及DNA损伤反应。致

    来源:TRENDS IN Cell Biology

    时间:2025-10-03

  • 构建肾脏微环境图谱:推动组织工程肾脏模型向功能化迈进

    在生物医学研究领域,科学家们一直梦想着在实验室中重建人体器官,以用于疾病研究、药物测试甚至未来的移植。肾脏,这个负责过滤血液、维持体内平衡的重要器官,因其结构功能复杂,成为组织工程领域的重点挑战对象。过去十年,单细胞技术的飞跃让我们通过肾脏图谱精细揭示了小鼠和人类肾单位的复杂构造,细胞层面的认知已达到前所未有的高度。然而,一个令人困惑的悖论随之出现:尽管我们拥有了详尽的“细胞地图”,但当前最先进的体外肾脏模型,无论是自组装的肾脏类器官、精巧的肾脏芯片,还是3D生物打印组织,其功能依然不完整,结构也过于简化。它们就像拥有了正确砖块(细胞)却未能建成稳固大厦的建筑,在模拟复杂疾病和实现再生医学应用

    来源:TRENDS IN Biotechnology

    时间:2025-10-03

  • 受生物启发的热可逆生物墨水调控依赖黏附力的骨生成过程

    技术成熟度受骨细胞外基质(ECM)启发的热可逆离子-共价缠结(TRICE)生物墨水与承重3D生物打印(LB-3DBP)技术目前处于技术成熟度级别(TRL)5:在相关环境中验证一个组件的性能。该平台通过将机械作用和生物作用分离为两种墨水系统,在生物打印领域实现了重要的功能改进。这种支架具有类似小梁骨的强度,并能在不添加合成成分的情况下促进新骨形成,显示出其在承重应用中的潜力。要实现全面应用,必须解决一些关键挑战。基于κ-卡拉胶(κC)的生物墨水初期引发的炎症反应需要得到缓解,以加速愈合过程,我们正在研究可扩展且经济有效的方法来修改κC结构并调节病原体相关分子模式(PAMP)的激活。此外,还需要进

    来源:TRENDS IN Biotechnology

    时间:2025-10-03

  • 从单个细胞的动态和几何特征中学习细胞特异性网络

    亮点•通过对细胞动态的估计,可以推断出定向的相互作用网络•超越伪时间排序,可以实现更灵活、更准确的推断•locaTE利用细胞状态流形上的动态估计来进行网络推断•对基准进行系统评估,并将其应用于单细胞数据总结细胞动态和生物功能由复杂的分子相互作用网络所调控。从数据中推断这些相互作用是一个众所周知的难题。大多数现有的网络推断方法构建的是基因相互作用网络的群体平均表示,它们无法自然地帮助我们理解不同细胞群体之间的相互作用活性差异。我们提出了locaTE,这是一种信息论方法,它利用单细胞动态信息以及细胞状态流形的几何结构,来推断特定于细胞的因果基因相互作用网络,而不依赖于潜在生物轨迹的拓扑结构。通过广

    来源:Cell Systems

    时间:2025-10-03

  • 蛋白质表面化学特性赋予了生物体对干燥环境的适应性耐受能力

    亮点•脱水会导致广泛的但多样的蛋白质功能障碍•我们利用定量蛋白质组学技术来分析酵母蛋白质组中的脱水耐受性•具有耐受性的蛋白质其表面富含负电荷以及Ala/Gly/Pro等氨基酸•在重新水化的细胞中,耐受性蛋白质的富集会促进小分子的产生总结细胞脱水——即细胞内几乎所有水分的流失——是一种常见的压力因素,会导致广泛的蛋白质功能障碍。为了生存,部分蛋白质必须在重新水化后恢复功能。哪些蛋白质具有脱水耐受性,以及这种耐受性的分子基础,在很大程度上仍然未知。在这里,我们利用定量质谱技术和结构蛋白质组学方法发现某些蛋白质天生具备耐受极端水分损失的能力。结构分析表明,蛋白质表面的化学性质是决定其脱水耐受性的关键

    来源:Cell Systems

    时间:2025-10-03

  • 丝状欺骗性噬菌体会导致细菌和噬菌体种群的适应性降低

    亮点•突变丝状噬菌体的感染会导致噬菌体产量的增加•铜绿假单胞菌可以利用突变丝状噬菌体在竞争中胜过野生型细菌•高产量的噬菌体会促使缺乏衣壳基因的“作弊”迷你噬菌体出现•这些“作弊”噬菌体会经历快速的繁荣与衰退周期,并影响细菌的进化总结许多细菌的染色体中携带噬菌体基因组,这使得细菌和噬菌体的适应性相互关联。大多数铜绿假单胞菌菌株携带称为Pf的丝状噬菌体,这些噬菌体会建立慢性感染,且无需宿主裂解即可传播。然而,Pf抑制基因(pf5r)的自发突变会导致噬菌体产量急剧增加,从而减缓细菌生长并增加细胞死亡,打破了细菌与噬菌体之间的表面平衡。我们在模拟囊性纤维化呼吸道营养环境的培养基中,通过铜绿假单胞菌的进

    来源:Current Biology

    时间:2025-10-03

  • TMK-PIN1驱动一个短小的自组织电路,该电路负责拟南芥中生长素的输出和信号传导过程

    亮点 • 生长素会形成一个包含其质膜受体(PM receptor)和转运蛋白(transporter)的两元复合物 • 生长素通过TMK触发PIN1的磷酸化,从而调节其极性和活性 • 被PIN输出的生长素对于TMK的激活是必需的,这形成了一个自组织的调控回路 总结 植物激素生长素在调节植物生长发育中的多功能和关键作用

    来源:Developmental Cell

    时间:2025-10-03

  • 星形胶质细胞介导的中脑杏仁核微回路调控慢性疼痛患者的共病焦虑症状

    亮点•中枢杏仁核(CeM)中的星形胶质细胞KOR受体调节与疼痛相关的焦虑•慢性疼痛通过激活CeLPdyn-CeM神经回路增加强啡肽的释放•强啡肽激活CeM星形胶质细胞中表达的KOR受体•KOR受体介导的星形胶质细胞激活通过D-丝氨酸增强CeM神经元的兴奋性总结共病焦虑症状是慢性疼痛的重要情感成分,但其背后的中枢机制仍不清楚。中枢杏仁核(CeA)调节慢性疼痛中的伤害感受处理及相关焦虑。然而,CeA中具体调节疼痛相关焦虑的微回路和细胞类型尚未完全阐明。在本研究中,我们发现了一个位于CeA中的微回路:其中,中央杏仁核外侧亚区(CeL)的强啡肽能神经元投射到内侧亚区(CeM),其激活会引发与慢性疼痛相

    来源:Neuron

    时间:2025-10-03

  • 骨骼肌胰岛素抵抗分子特征揭示糖尿病个体化治疗新靶点

    在全球糖尿病负担日益加重的背景下,2型糖尿病(T2D)的治疗仍面临巨大挑战。其核心病理特征——胰岛素抵抗(IR)和β细胞功能障碍——在不同患者中表现出高度异质性,导致标准化治疗方案效果参差不齐。更棘手的是,当前临床主要依赖血糖和糖化血红蛋白(HbA1c)等宏观指标进行诊断和治疗评估,缺乏反映个体分子特征的有效工具。这种"一刀切"的治疗模式,无法应对T2D复杂的分子机制多样性。正是在这样的背景下,Kjaergaard等人在《Cell》发表的重要研究开始受到关注。他们试图从分子层面揭示骨骼肌胰岛素抵抗的特异性特征,为个性化治疗提供新思路。骨骼肌作为胰岛素刺激下葡萄糖摄取的主要场所,是胰岛素抵抗最早

    来源:Signal Transduction and Targeted Therapy

    时间:2025-10-03

  • 综述:周期素依赖性激酶4/6抑制剂在激素受体阳性、HER2阴性的晚期乳腺癌治疗中的应用:一项系统评价和荟萃分析(REIGNITE研究)

    乳腺癌是全球女性中最常见的恶性肿瘤之一,其治疗挑战在于肿瘤的分子多样性、临床表现差异以及对不同治疗方案的反应性。HR阳性/HER2阴性(激素受体阳性/人类表皮生长因子受体2阴性)亚型在所有乳腺癌病例中占比高达60%-70%,这类患者的治疗策略近年来有了显著进展,特别是通过将细胞周期依赖性激酶4/6抑制剂(CDK4/6i)与内分泌治疗(ET)结合,成为晚期乳腺癌(MBC)的一线治疗标准。然而,随着新型靶向药物的不断问世,例如针对ESR1突变的口服选择性雌激素受体降解剂(SERD)elacestrant,针对PIK3CA突变的α特异性PI3K抑制剂alpelisib,以及针对PTEN、PIK3CA

    来源:ESMO Open

    时间:2025-10-03

  • NALIRIFOX在治疗转移性胰腺导管腺癌中的应用:一项基于真实世界数据的探索性分析

    在当前癌症治疗领域,胰腺导管腺癌(Pancreatic Ductal Adenocarcinoma, PDAC)因其高致死率和治疗难度而备受关注。尤其是在晚期阶段,即转移性胰腺导管腺癌(metastatic PDAC, mPDAC),其治疗选择极为有限,且预后普遍较差。根据现有研究,mPDAC患者在诊断时大多已处于晚期,且5年生存率仅有约3%。随着医学技术的发展,新的治疗策略不断涌现,其中NALIRIFOX作为一种三联化疗方案,结合了纳米脂质体伊立替康、5-氟尿嘧啶/亚叶酸钙和奥沙利铂,其在NAPOLI 3临床试验中显示出优于吉西他滨联合纳米白蛋白结合型紫杉醇(nab-paclitaxel)的

    来源:ESMO Open

    时间:2025-10-03

  • 综述:从图像到理解:深度学习在细胞动力学分析中的进展

    深度学习(DL)在生物图像分析领域带来了革命性的变化,为理解细胞动态提供了前所未有的洞察力。这一综述旨在概述当前最先进的DL方法,用于从二维显微镜图像中量化细胞动态,并探讨三个基本分析步骤:在空间中识别对象、通过跟踪将它们连接起来,以及从它们的轨迹中提取有意义的测量数据。文章强调了近年来DL方法在补充传统算法方面的进展,并讨论了新兴趋势以及确保DL驱动的细胞动态分析在科学上的严谨性和可访问性的重要性。通过介绍方法上的创新和可用的实用工具,本文旨在弥合计算专家与生物学应用之间的鸿沟,为研究人员提供指导,帮助他们在这一快速发展的领域中找到适合特定研究问题的方法。近年来,机器学习和深度学习在生物图像

    来源:Current Opinion in Cell Biology

    时间:2025-10-03

  • 综述:从先天能力到智能设计:基于NK细胞的癌症免疫疗法的演变

    自然杀伤细胞(Natural Killer Cells,NK细胞)作为癌症免疫治疗的重要研究对象,近年来因其独特的生物学特性而受到广泛关注。NK细胞在免疫系统中扮演着关键角色,它们能够迅速识别并杀伤受感染的细胞或肿瘤细胞,而无需事先接触抗原或依赖主要组织相容性复合体(MHC)的限制。这种先天性的抗肿瘤能力使得NK细胞成为开发安全、可大规模生产的“现货型”(off-the-shelf)疗法的有前景平台。然而,尽管NK细胞在癌症免疫治疗领域展现出巨大的潜力,其临床疗效仍受到诸多因素的制约,尤其是在实体瘤的治疗中。实体瘤的治疗一直是癌症免疫治疗的难点之一,主要原因是肿瘤微环境(Tumor Micro

    来源:Critical Reviews in Oncology/Hematology

    时间:2025-10-03

  • 综述:免疫检查点抑制剂联合曲妥珠单抗和化疗治疗晚期HER2阳性胃癌:系统评价与荟萃分析

    胃癌是一种全球范围内常见的恶性肿瘤,其发病情况和治疗挑战引起了医学界的广泛关注。在所有癌症类型中,胃癌位列第五,尤其在发展中国家,其发病率和死亡率均较高。胃癌与食管癌共同构成了全球超过130万例的恶性肿瘤病例,这使得针对胃癌的治疗研究成为一项重要的任务。在临床实践中,胃癌的治疗手段主要包括传统的化疗、靶向治疗以及近年来逐渐兴起的免疫治疗。其中,HER2阳性胃癌和胃食管交界区癌(GEJ)在治疗上具有特殊的意义,因为HER2蛋白的过表达可能影响肿瘤的生长和扩散,进而影响治疗效果。HER2阳性胃癌和GEJ癌的治疗策略通常基于抗HER2药物的使用,例如曲妥珠单抗(Trastuzumab)。曲妥珠单抗作

    来源:Critical Reviews in Oncology/Hematology

    时间:2025-10-03


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