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十月聚焦：2005年诺贝尔奖全接触
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抑制HIV基因表达的植物天然物被发现
生物通报道：HIV，即人类免疫缺陷病毒，是导致威胁人类生命的艾滋病的罪魁祸首。最近，Temple大学医学院神经学系和神经病毒学中心的研究人员发现一种从金丝桃科植物（St. John's wort，圣约翰草，贯叶连翘）的愈伤组织中提取出的新蛋白p27能够抑制HIV-1的表达并抑制病毒的复制。研究的结果公布在10月27日的Gene Therapy上。研究人员表示，实验原本是为了检测植物提取物对细胞生长或离体脑细胞行为的影响。在研究中，他们还观察了这些从愈伤组织中分离到的植物提取物是否具有抗病毒活性。很快，研究人员发现这种植物提取物能抑制受感染细胞中HIV-1基因的表达和复制。接着，研究组从植物提取
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PNAS：蚊子为什么不得疟疾？
生物通报道：疟原虫是一种导致人类疟疾的寄生虫。这种寄生虫是由蚊子传播给人类的。据统计，世界上每年有5500万人被蚊子传染了疟疾，并且导致其中超过200万的人死亡。这些病例绝大多数发生在生活贫困的非洲落后国家和地区。但可恨的是，传播给人类这种疾病的蚊子却不会因为寄生虫的感染而患上疟疾，这是为什么呢？伦敦帝国大学和德克萨斯州的研究人员在蚊子体内确定出了一种能够帮助蚊子抵御由疟原虫引起的感染。他们将这些发现公布在10月24日的Proceedings of the National Academy of Sciences的网络版上。引发疟疾的疟原虫具有一个复杂的生命周期。蚊子在吸取患疟疾的人类的血液时
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Y染色体分析得到神秘起源？
生物通报道：来自英国休斯顿桑格尔中心（Wellcome Trust Sanger Institute）的研究人员针对Y染色体进行遗传学分析，发现在中国北部和蒙古的大约150万的男性也许来自同一个祖先—Giocangga(觉昌安，努尔哈赤的祖父)。这一研究发现公布在10月的American Journal of Human Genetics上。Y染色体，这个小小的染色体，存在于每个男性的每个细胞中。虽然经过许多年进化，人体内的其它染色体都发生了巨大的变化，但是这个染色体由于与X染色体匹配度不高（缺少一部分）因此得以完整稳定的从父亲传给了儿子，也因此成为了分析追溯祖先血统的重要工具。Wellcom
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冷泉港：发现“切开就跑”的基因调节机制
生物通报道：最近，美国冷泉港实验室的研究人员发现了一种新的信使RNA分子——在细胞压力下（如病毒感染），它能从非蛋白质编码状况被转变成蛋白质编码状态。这一发现揭示出了一种“切开就跑”的机制，这种机制可能控制着人类和其他生物体中许多基因的表达。因此，更为深入地了解这个机制将对生物学和生化研究具有广泛的意义。分子生物学的中心法则认为基因的DNA被转录成信使RNA，接着信使RNA又被翻译成蛋白质。转录和翻译的调节最终决定着特定基因是否被开启以制造蛋白质或者被关闭。一旦开启，就会有大量的mRNA分子从细胞核输送到细胞质中，在那里mRNA被作为模板合成蛋白质。但是在数年前，冷泉港David Specto
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Cell：关乎癌症和细胞生长的分子结构被发现
生物通报道：在所有的生物中，基因组被承载在多个染色体上，每个染色体上的DNA可再细分成功能性的DNA片段，即基因。基因是构建细胞机器特定成分的蓝图，但不同的细胞需要不同类型的细胞机器，因此细胞必须根据“生物时间表”制造出正确的细胞器。最近，来自犹他州大学Huntsman癌症研究所的研究人员发现了一种特殊类型的分子结构：这种分子结构帮助基因的适时关闭，直到这种结构离开这些基因时，基因才能被开启。研究的结果公布在10月21日的Cell杂志上。分子生物学的一个核心问题就是弄清细胞如何调节哪些基因该开启或处于活性状态、哪些基因该关闭或者抑制。这个谜底的解开与否与人类疾病具有直接的关系，例如调节细胞生长
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Science：华人学者为活细胞蛋白计数
生物通报道：最近来自耶鲁大学的研究人员发明了一种计算活细胞体内蛋白分子绝对数目的方法，并且利用这种方法还可以对蛋白分子所在的功能部位进行绝对数目和浓度的测量。这样以往在生物学上定量研究的两大难题都被解决了，文章发表在近期的Science上。文章的第一作者为华人学者——武建秋，他在中国海洋大学（原青岛海洋大学）获得的学士学位，在中科院获得的硕士学位，随后在北卡罗莱纳大学Chapel Hill分校获得博士学位。在酵母体内利用Cdc15p（红色）和fimbrin（绿色）标记的蛋白可以显示出收缩环和肌动蛋白斑块武建秋博士将一个黄色荧光蛋白标记在目的蛋白上，并且在荧光显微镜下对活体酵母中的这些蛋白进行观
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PNAS：细胞组织如何利用生理流
生物通报道：Melody Swartz教授领导的一个EPFL（Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne）研究组首次证明非常缓慢的生理流的存在影响着对组织形成和细胞迁移至关重要的细胞外环境。研究的结果公布在10月24日的Proceedings of the National Academy of Sciences上。组织工程学的一个主要的挑战就是要确定出细胞交流、迁移和组织成生活组织所需的关键环境成分。其中的一种成分就是细胞外存在的浓度变化很小的特殊蛋白质——成形素。细胞能感应成形素浓度极其微小的变化，并且相应地改变它们的功能。在胚胎发育过程中，干细胞在成
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视网膜退化与中风有关
最新研究显示，视网膜退化也许能作为一项独立指标，预测无糖尿病史的中老年人几年内中风发病的风险。 澳大利亚悉尼大学研究人员的这项研究发表于美国《神经病学》杂志上。在研究中，研究人员为３６５４名４９岁以上且无糖尿病史的中老年人拍摄了视网膜照片，然后进行了７年跟踪调查，监测他们脑血管的健康状况。 ７年中有８５９名研究对象死亡，其中９７人死于脑血管疾病。另外，还出现了２４例非致命性中风和１１例大脑局部暂时缺血。 进一步分析表明，上述中风病例与视网膜退化之间有很
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加拿大研究人员在雪蚤身上发现防冻蛋白 启发器官冷冻
加拿大的研究人员表示，他们在厚厚的积雪下面的菌类上发现跳蚤仍能存活。是什么让这种小东西不被冻死呢？原来跳蚤身上有一种独特的“防冻剂”。研究人员认为，如果将这种物质应用于农业或者器官移植手术，农作物和牲畜就不可以不再害怕霜冻和寒流，捐献的用于移植的器官也就可以在低温状态下保存和运输，器官移植的成功率将大大提高。这些研究人员的研究成果发表在最新一期的《科学》杂志上。长着6条腿的雪蚤只有1至2毫米长，没有翅膀。它们还被称为“跳虫”（springtail），因为它们的腹部有一个被称为“弹器”（furcula）的“弹簧”，可以让它们从捕食者边上迅速跳走。据加安大略金斯敦奎恩大学的研究人员说，这种雪蚤的体
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首次在人类胚胎干细胞发现离子通道
生物通报道：人类胚胎干细胞是一类具有分化成身体中各种细胞类型潜能的“全能”细胞。现在，来自约翰霍普金斯大学的研究人员首次发现人类胚胎干细胞（ESC）中存在功能性的离子通道。研究的结果公布在8月5日的Stem Cell杂志的网络版上。这些离子通道就好比电线，它容许ESC传导和通过电流。如果研究人员能够有选择性地阻断由干细胞衍生而来的移植细胞中的一些通道，那么将能够预防潜在的肿瘤的形成。Ronald A. Li博士表示，人类ESC移植治疗的一个重要的问题就是有可能因为一些未分化的人类ESC的污染导致经改造的移植物在移植后混杂在一起并形成肿瘤。功能性离子通道是细胞外膜中的阀门，它容许带电的原子通过。
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一种抑制癌细胞存活的新药被发现
生物通报道：白血病是一种造血组织的恶性疾病，俗称“血癌”，特点是某一类型的白血病细胞在骨髓或其他造血组织中的肿瘤性增生，可浸润体内各器官、组织、使各个脏器的功能受损，产生相应的症状和体征。目前，我国白血病患者约为3-4人/10万人口，且男性多于女性。最近，弗吉尼亚联邦大学Massey癌症中心的一个研究组发现了一种目前正处于临床试验阶段的激酶抑制剂新药的一个全新的作用机制。这种药物叫做BAY 43-9006，被设计用于干扰肿瘤细胞的存活途径。研究的结果公布在10月21日的Journal of Biological Chemistry杂志上。这种药物最初是为抑制Raf-1途径而设计的，Raf-1途
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10月20日Nature 精彩DNA世界
生物通报道：本期新鲜出炉的的Nature在DNA基础研究与进化方面有了几个结论性的进展：首先封面文章“Crystal structure of a junction between B-DNA and Z-DNA reveals two extruded bases”延续了26年前的Nature封面——左手性DNA（Z-DNA，高能状态DNA）的报道。这篇来自韩国科学家的研究确定了在生物体天然状态的右手性DNA（B-DNA）和在B-DNA中局部区域出现的Z-DNA这两种DNA结构之间衔接的过渡点的结晶结构，并且发现在这个结合点上有一个碱基被从双螺旋中挤推了出来，而这个碱基很有可能就
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是时候该考虑禽流感DNA疫苗了
生物通报道：到目前为止，禽流感病毒H5N1被证明是对人类最危险的禽流感病毒形式。英国的生化工程师表示，研究抵御能突变成易于在人类间扩散的禽流感毒性形式的研究人员是时候应该考虑开发以DNA为基础的疫苗了。因为DNA疫苗比常规的疫苗能更迅速地制造出来，并且它们可能在发生全球性的流感时拯救无数生命。DNA疫苗将是抵御新发生的流感大流行的一个强大的武器——尤其是在传统的疫苗不足的情况下。研究人员同时还提醒说任何DNA疫苗都只能用于减缓这种疾病的的扩散，因为这种技术基本上还未在人类中进行过试验。这项分析的结果公布在11－12月间的Biotechnology Progress杂志上。在整个东南亚，禽流感病
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20年来处理snRNA的迷题被揭开
生物通报道：我们知道对mRNA进行处理、拼接的蛋白称为剪接体（spliceosome）。而剪接体本身需要一些小核RNA（small nuclear RNA，snRNA）参与。这些snRNA不会翻译出任何蛋白，但是对于调控遗传活动起到重要作用。它是如何加工产生的一直是个迷，最近来自Wistar研究所的研究人员解开了这个迷题。他们发现了一种新的、负责处理snRNA的蛋白，这种蛋白被命名为综合体（Integrator）。文章发表在10月21日的Cell杂志上。 基因中存在外显子（exon）和内含子（intron）现象是1977年
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生物系统中热传递的纳米研究
生物通报道：记得在中学的物理课上，我们首先学到的就是固体导热性能比液体好。但是一项新的研究却显示，在纳米级的材料中，事情并非如此。利用计算机模拟技术，Rensselaer Polytechnic研究所的研究人员发现热能事实上在液体的接触面间能够比固体间更好地运动。这些发现将可能用于计算机芯片加工到癌症治疗的一系列领域中。研究的结果公布在10月11日的Nano Letters杂志的网络版上。传导是热从温度较高的物体传递到温度较低的物体的运动过程。通常，液体与固体相比具有低的传导率。例如，钻石是最好的一种导体，其传导率大约是水的5000倍。但是这种传统的概念只是指“大尺度”的热传导率。在纳米材料中
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Sigma推出新shRNA载体文库
生物通报道：目前市面上的RNAi商品化产品主要是提供核苷酸合成，但是这些产品主要是对于一些常用的细胞系有效，而对一些难以转染的原代细胞作用不明显。因此为了解决这个问题，RNAi联盟（The RNAi Consortium，TRC）最近开始展示了其旗下机构商品化产品MISSION TRC shRNA文库。在这一系列产品中，Sigma-Aldrich公司提供了三种形式的克隆：冻存的甘油菌($345/clone)、纯化DNA质粒($415/clone)和一个活化的lentivirus vector （慢性毒源性载体）(pricing not yet set)(这一文库将包含150,000个人类和小鼠
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基因预测的魅力
过去五十年里，单个基因、蛋白质的研究构成了我们现在所认识的发育过程的基础。但是，当前扩大的高通量筛选和积聚的基因表达，以及遍布的蛋白质相互作用数据库，都似乎在暗示我们这种单个基因、蛋白质的研究不会走太远了。现在，Kristin Gunsalus和同事给在早期发育中起作用的分子机器预测了系统模型，数据的来源主要有转录组（Transcriptome）、相互作用组（Interactome）和表型数据库。但究竟什么样的合适系统可以发展出这样的预测性模型来，又该如何去客观评价它们？线虫为高通量研究铺平了道路，因为在早期胚胎发育（embryogenesis）过程中，如细胞的分裂、极性形成，都可以为大范围的
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根除恶性肿瘤的T细胞疗法
生物通报道：在一项由Terry Fox基金赞助的研究中，Claude Perreault成功地发明了一种根除小鼠中恶性黑素瘤肿瘤的新方法。Perreault和他的研究组将这些发现公布在Nature Medicine上。简单来说，这种方法将从健康小鼠获得的能够识别并破坏异常细胞的T细胞注入患癌症（黑素瘤）的小鼠。这些淋巴细胞能对寄主小鼠癌细胞中存在的一种特殊的抗原H7a产生免疫作用。虽然在寄主的一些健康细胞中也发现了这种靶标抗原。但是这种治疗不会导致任何副作用，因为这种抗H7a淋巴细胞基本都围绕在肿瘤周围——它们被便利肿瘤生长的血管上存在的一种叫做VCAM-1的分子所吸引。因此，T细胞会产生ga
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PNAS：调节拼接，Rett基因的新功能
生物通报道：Rett综合症是一种破坏性的神经疾病，多发生在女孩中。Baylor医学院的研究人员发现导致Rett综合症的基因不但沉默一些基因，而且还与另外的一个基因合作调节选择性拼接——对蛋白质形成至关重要的一种细胞过程。这一发现或许能解释这种综合症和其他相关疾病。研究的结果公布在Proceedings of the National Academy of Sciences的网络版上。这一新发现使人们对神经元工作以及为何不能正常工作的谜团有了新的了解。一个神经元做出与其他神经元交流的决定需要多个步骤。神经元会表达产生RNA的特定的基因，根据这些RNA制造特定的蛋白，然后将这些蛋白给突触。选择性R
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