-
利用CRISPR检测癌症生物标志物
大多数癌症诊断技术依赖于不舒服的侵入性程序,如活组织检查、内窥镜检查或乳房x光检查。血液样本可能是一个不那么令人不快的选择,尽管目前只有少数几种疾病可以用这种方法诊断。但是现在,研究人员在ACS传感器上报告了一种易于使用的方法,可以检测血浆外泌体中少量的癌症相关分子,并有效区分恶性和良性样本。外泌体是一种小泡,从宿主细胞中分离出来,在里面携带核酸、脂质和蛋白质等货物。这意味着它们提供了一扇了解其起源细胞状况的窗口。因此,癌细胞独特的胞内环境将通过微rna (miRNAs)等生物标志物反映在其外泌体中。这些是非常小的核酸,只有几个核苷酸长度,在细胞中调节蛋白质表达,在肿瘤中可能会失调。因此,有可
来源:ACS Sensors
时间:2023-02-03
-
复旦大学Nature子刊发文:实现TadA重编程与高精度迷你碱基编辑器的开发
2016年以来,哈佛大学David Liu实验室分别将胞嘧啶脱氨基酶APOBEC1蛋白及定向演化后的腺嘌呤脱氨酶TadA与CRISPR-Cas9系统融合,开发出了可实现C·G--T·A碱基对高效转换的胞嘧啶碱基编辑器(CBE)以及实现A·T--G·C碱基对高效转换的腺嘌呤碱基编辑器(ABE)【1-2】。考虑到单碱基点突变在所有致病遗传变异中的占比超过60%【3】,CBE和ABE的出现极大推动了点突变功能研究和人类遗传病的治疗研究,也开启了碱基编辑器工具研发的热潮。近年来研究者发现早期碱基编辑器存在多种缺陷与不足。其中两大核心问题是脱靶效应导致的安全风险和体积过大导致的体内递送困难。脱靶效应导致
-
复制自然来抵御病毒
图片:温室里的植物 资料来源:Kyoka Kuroiwa - INRAE数千年来,作物一直在驯化过程中形成。农民杂交和选择新品种,以适应不断变化的环境。虽然效率很高,但这个过程很耗时。此外,所期望的性状必须存在于要改进的物种多样性的某个地方。因此,将一种机制从一个物种复制到一个具有农艺价值的物种中成为一个新的挑战。在现有的技术中,新的植物基因组编辑技术自2012年以来已经可用。CRISPR-Cas9技术经常被比作分子剪刀,它可以以有针对性和精确的方式修改植物DNA的某个区域。在许多作物品种中,如辣椒和豌豆
来源:Plant Biotechnology Journal
时间:2023-02-02
-
Nature:这一次我们也许走对了!增强抗癌T细胞的CAR-T疗法
Crystal Mackall还记得,当她第一次听到有关利用T细胞识别和杀死癌症的方法的讲座时,她所持的怀疑态度。1996年,在德国的一次会议上,这位儿科肿瘤学家坐在观众席上,转向她旁边的人说:“不可能。这太疯狂了。”今天,情况不同了。Mackall说,“我已经被驯服了,”她现在在斯坦福大学工作,开发这种细胞来治疗脑瘤。2017年,美国食品和药物管理局批准了第一批被称为嵌合抗原受体(CAR)-T细胞的修饰T细胞,用于治疗一种白血病。这些治疗方法已经改变了几种癌症的游戏规则。五种类似的产品已获批准,超过2万人接受了这种治疗。一个曾经只有少数顽强的研究人员在推动的领域,现在在学术界和工业界拥有数百
-
《自然》:2023年有望改进科研的七大技术
从单分子蛋白质测序到体电子显微镜,英国《自然》杂志网站在近日的报道中,列出了有可能在2023年改进科学研究方式的七大技术。单分子测序曙光初现可对样本中的许多蛋白质进行测序的单分子技术可能即将问世。美国得克萨斯大学正在研究一种“荧光测序”方法,美国生物技术公司“量子硅”则描述了使用荧光标记的“黏合剂”来识别蛋白质末端特定氨基酸序列的技术。其他研究人员正在开发模仿基于纳米孔的DNA测序技术的单分子测序技术,其能根据多肽通过微小通道时引起的电流变化来分析氨基酸。以色列理工学院团队正在研究由硅基材料制造的固态纳米孔器件,其可同时对多个蛋白质分子进行高通量分析。韦布望远镜再接再厉詹姆斯·韦布
-
《Neuron》挑战教条:没有爱情,只有亲情才是田鼠家庭幸福的原因
草原田鼠(Microtus ochrogaster)以其对家庭的强烈承诺而闻名,这归因于催产素系统。不起眼的草原田鼠(Microtus ochrogaster)长期以来因其对家庭的不同寻常的承诺而受到尊敬。成对的伴侣们挤在一起,一起抚养幼崽,至少大多数时候都是这样。把另一对夫妇的幼崽放进一对草原田鼠的笼子里,成年田鼠通常会把这些幼崽当作自己的孩子抚养——这对啮齿动物来说是极不寻常的行为。但是1月27日发表在Neuron上的一项研究挑战了几十年的研究,该研究表明,一种检测“爱情荷尔蒙”催产素的蛋白质是田鼠家庭幸福的原因。研究人
-
CRISPR技术迎来十岁生日:基因组编辑的发展历程
自CRISPR- cas9作为基因组编辑技术发表以来的十年里,CRISPR工具箱及其应用深刻地改变了生物学研究,通过在植物、动物和人类中的应用实现了进步。在一篇综述中,Joy Wang和Jennifer Doudna强调了CRISPR基因组编辑的10年,讨论了该技术的重要进展、当前的局限性和未来的巨大潜力。利用细菌免疫系统的核心组成部分,包括CRISPR-Cas9在内的CRISPR基因组编辑工具的开发,使研究人员能够精确地编辑和重写几乎任何生物体的遗传密码。CRISPR技术的应用不仅为治疗包括镰状细胞病在内的罕见和难治性疾病的临床试验奠定了基础,还推动了农业进步,如开发出更有营养的CRISPR
-
Nature Biotechnology:可以将整个基因插入基因组的新一代CRISPR技术!
研究亮点:研究人员已经开发出一种改进的方法,可以更准确地将大片段的DNA序列(如整个正常的替代基因)插入细胞中这一进展可能会导致具有广泛临床应用技术的发展,修复不同的致病突变许多遗传疾病是由散布在整个基因上的不同突变引起的,为每个患者的突变设计基因组编辑方法是不切实际的,而且成本高昂。麻省总医院(MGH)的研究人员最近开发了一种优化方法,可以提高将大DNA片段插入基因组的准确性。这种方法可以用来插入一个完整的正常或“野生型”替代基因,这可以作为一种疾病的全面治疗,而不考虑患者的特定突变。这项工作涉及对一类新技术的优化,即CRISPR相关转座酶(CAST),这是一种很有前途的工具,用于大规模的D
来源:Nature Biotechnology
时间:2023-01-19
-
一种基于CRISPR,更安全的基因驱动“黑客”系统
荧光果蝇:表达红色眼睛和绿色身体荧光标记的果蝇证明了一种新系统的可行性,可以安全地将分裂的基因驱动转换为完整的基因驱动。 来源:加州大学圣地亚哥分校比尔实验室科学家们继续拓展CRISPR的技术前沿,以及它的巨大潜力,涉及从人类健康到全球食品供应等领域。基于CRISPR的基因驱动就是这种情况,这是一种基因编辑工具,旨在影响遗传元素如何从一代传递到下一代。为蚊子设计的基因驱动有可能遏制疟疾感染的传播,疟疾感染每年导致数十万人死亡,但由于这种驱动可以迅速传播并主导整个种群,因此安全性问题也随之提出。科学家们通过
来源:Nature Communications
时间:2023-01-19
-
Science:首次利用CRISPR-Cas9碱基编辑治疗心脏病
一项针对小鼠的研究表明,一种新的CRISPR-Cas9方法可以靶向心脏中的有害信号通路,从而防止缺血/再灌注损伤。研究结果表明,基因编辑可以为治疗心脏病提供一种永久性和先进的策略,心脏病是全球发病率和死亡率的主要原因,研究表明这种方法可以作为心脏病发作后立即修复心脏损伤的干预措施。CRISPR-Cas9基因编辑正在成为基因组突变的一种前瞻性疗法。然而,目前的编辑方法主要是针对具有特定突变的相对较小的患者群。最新研究描述了一种可能适用于广泛的心脏病患者的心脏保护策略。研究人员使用碱基编辑来消除CaMKIIδ的氧化激活位点,这是心脏疾病的一个主要驱动因素。通过来自人类诱导多能干细胞的心肌细胞中显示
-
Nature子刊:预防/治疗打开新门,吸入型纳米颗粒有效向肺部传递mRNA
核酸类药物具有较高的灵活性,可编码多种治疗性蛋白用于治疗、预防或疫苗。目前,慢病毒、腺相关病毒(AAV)等病毒载体以及脂质纳米颗粒(LNP)等非病毒载体的开发和优化,极大地促进了核酸药物的发展。然而,目前的核酸给药系统容易在肝脏中富集。大量的肺部疾病,包括COVID-19、流感、囊性纤维化、肺癌等,迫切需要一种能够有效将mRNA传递到肺部的载体,通过mRNA疫苗/疗法促进肺部疾病的防治。到目前为止,肺靶向mRNA的传递基本是在小鼠体内使用聚乙烯亚胺(PEI)和脂质纳米颗粒(LNP)进行的学术研究,在人体上进行的临床试验很少。最著名的临床试验之一是用于治疗囊性纤维化的LNP传递mRNA的气雾剂制
来源:Nature Materials
时间:2023-01-11
-
比起基因编辑,消费者更关心鲜食葡萄的味道
根据华盛顿州立大学领导的一项对美国消费者的调查,尽管对基因编辑食品有一些犹豫,但味道胜过一切。在《公共科学图书馆·综合》杂志上发表的这项研究中,研究人员调查了美国各地的2800多人,以评估他们对基因编辑的鲜食葡萄的接受程度,尽管市面上还没有这种葡萄。大多数参与者更关心葡萄的味道,其次是外观,而不是葡萄是如何培育的。受访者还将更少的农药排在第三位,只有第四位,他们表达了对传统育种葡萄的轻微偏好,而不是基因编辑的葡萄。该研究的通讯作者、华盛顿州立大学经济学教授卡琳娜·加拉尔多说:“一般来说,他们最关心的是味道,和味道相关的属性。”“他们确实表示希望降低基因编辑的价格,但差异在统计上并不显著,这意味
来源:PLoS ONE
时间:2023-01-10
-
哈佛大学:以癌治癌
科学家开发细胞疗法,在高级小鼠模型中杀死和预防脑癌布里格姆妇女医院的科学家们正在利用一种新方法将癌细胞转化为有效的抗癌药物。来自Khalid Shah的实验室,哈佛附属BWH的研究人员开发了一种新的细胞治疗方法,可以消除已建立的肿瘤,并诱导长期免疫,训练免疫系统,使其能够防止癌症复发。该团队在致命的脑癌胶质母细胞瘤的高级小鼠模型中测试了他们的双作用抗癌疫苗,结果很有希望。研究结果发表在《Science Translational Medicine》杂志上。“我们的团队一直在追求一个简单的想法:提取癌细胞,并将它们转化为癌症杀手和疫苗,”通讯作者Khalid Shah说,他是干细胞和转化免疫治疗
-
《Nature》同期两篇文章发现新型CRISPR基因剪刀
像人类一样,细菌和古生菌也会受到病毒的攻击。这些微生物已经发展出自己的免疫防御策略来对抗病原体。细菌防御,如CRISPR-Cas系统,具有不同的蛋白质和功能,帮助细菌保护自己免受外来入侵者的侵害。这种防御基于一种常见的机制:作为“引导RNA”的CRISPR核糖核酸(crRNA),有助于检测外源基因组的区域,如病毒的DNA,以进行靶向切割。由crRNA引导的CRISPR相关核酸酶(Cas)可以像剪刀一样切割其目标:这是人类在许多技术中利用的一种自然策略。Chase Beisel说:“考虑到不同的核酸酶已经很好地转化为新的和改进的技术,
-
CRISPR+新冠病毒=?最新Nature首次发现CRISPR蛋白可以作为细菌的一种多用途自毁系统
在这张基于冷冻电子显微镜图像的插图中,Cas12a2蛋白解开了DNA双螺旋,允许它切割DNA单链(蓝色和绿色)。 最近发现的一种蛋白质可以作为细菌的一种多用途自毁系统,能够降解单链RNA、单链DNA和双链DNA,这是被称为CRISPR的基因工具箱的第一个自毁系统。该研究的作者表示,由于该发现能够靶向如此多类型的遗传物质,有可能为包括COVID-19、流感、埃博拉和寨卡病毒在内的各种传染病开发新的廉价和高灵敏度的家庭诊断测试。这一研究成果公布在Nature杂志上,相关两篇论文详细解析了这种新系统。 
-
一举两得的癌症疫苗:可预防+杀死脑癌
科学家开发了一种双功能治疗策略,将活的肿瘤细胞转化为治疗药物。Shah的团队使用基因编辑工具CRISPR-Cas9改造活的肿瘤细胞,并重新利用它们释放肿瘤细胞杀伤剂。此外,工程肿瘤细胞被设计成表达因子,使它们易于被免疫系统发现、标记和记忆,为免疫系统的长期抗肿瘤反应做好准备。科学家们正在利用一种新方法将癌细胞转化为有效的抗癌药物。在布里格姆妇女医院(Brigham and Women’s Hospital)的Khalid Shah 实验室的最新工作中,研究人员开发了一种新的细胞治疗方法,可以消除已建立的肿瘤,并诱导长期免疫,训练免疫
来源:Science Translational Medicine
时间:2023-01-05
-
Nature子刊:植物育种的突破!将嫁接与CRISPR工具相结合
马克斯·普朗克分子植物生理学研究所的科学家们在《Nature Biotechnology》发文,正将CRISPR工具(又名“基因剪刀”)的突破性进展用于编辑植物基因组,这标志着方法上的变化。通过将嫁接与“移动”CRISPR工具相结合,这一发现可以简化和加速新型、基因稳定的商业作物品种的开发。未经修改的芽被嫁接到含有可移动CRISPR/Cas9的根上,这允许基因剪刀从根移动到芽上。它在那里编辑植物DNA,但不会在下一代植物中留下自己的痕迹。这一突破将节省时间和金钱,规避目前植物育种的限制,并有助于多种作物的可持续粮食解决方案。养活全世界的许多作物已经受到高温、干旱和植物病虫害的威胁,而气候变化正
来源:MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT
时间:2023-01-04
-
生物钟研究解释“温度补偿”的分子机制
温度越高,生理过程越快。但有一个例外:所谓的生物钟,它调节着生物体的睡眠-觉醒周期。对科学家来说,一个有趣的问题是,为什么即使温度波动,内部时钟也会以几乎不变的方式运行。这种现象被称为温度补偿。研究表明,不同的分子机制促成了这一现象。由明斯特大学(德国)的Ralf Stanewsky教授领导的生物学家团队,与加拿大达尔豪西大学和德国美因茨大学的团队合作,现在已经发现了这个难题中的一个重要部分,为这个问题提供了答案。他们的研究结果发表在《Current Biology》杂志上。研究小组在果蝇黑腹果蝇身上发现了一种点突变,这种突变会导致依赖温度的生物钟周期延长。它位于一个被称为“周期”(per)的
来源:Current Biology
时间:2022-12-30
-
生命学院胡家志课题组与合作者利用Cas9TX在年龄性黄斑病变小鼠模型中实现高效且安全的基因编辑
CRISPR-Cas9是目前领域内最为常用的基因编辑工具,在基础科研领域以及临床应用上都有着广阔的使用前景。然而Cas9在完成靶向位点突变的同时,还会在脱靶位点进行切割,并会造成染色体易位和染色体大片段缺失等染色体结构异常副产物。除此之外,在以腺相关病毒(Adeno-associated virus,AAV)为递送载体的体内基因编辑治疗中,存在着AAV片段高频插入的现象。这些基因编辑中的副产物严重威胁了基因组的稳定性,可能会导致细胞的癌化,为基因编辑的治疗结果带来不确定性。通过抑制Cas9反复切割靶向位点的完美修复产物,胡家志课题组近期发表的Cas9TX可以在CAR-T的改造过
-
《Nature》一种新的基于RNA的编辑工具,CellREADR可以准确编辑任何类型的细胞
在一项新的研究中,来自美国杜克大学和冷泉港实验室的研究人员开发了一种基于RNA的编辑工具,该工具针对单个细胞,而不是基因。它可以精确地针对任何类型的细胞,并选择性地添加任何感兴趣的蛋白质。该工具可能能够通过修改非常特定的细胞和细胞功能来控制疾病。相关研究成果将于2022年10月5日在线发表在《Nature》杂志上,论文标题为“可编程RNA传感用于细胞监测和操纵”。到目前为止,几乎所有获取细胞类型的遗传方法都依赖于基于DNA的转录调控元件来表达模仿细胞特异性RNA表达的效应基因(如传感器、效应物和标记物),这些效应基因主要是通过生殖系工程在少数几种生物中实现的。然而,所有的生殖细胞方法,包括基于