• 卢冠达团队新文：精确控制哺乳动物细胞的合成基因控制系统

  使用基于CRISPR蛋白质的方法，麻省理工学院的研究人员开发了一种新方法，可以精确控制哺乳动物细胞中产生的一种特定蛋白质的数量。这项技术可用于精细调整有用蛋白质的生产，如用于治疗癌症和其他疾病的单克隆抗体，或用于细胞行为的其他方面。在他们发表在《Nature Communications》上的新研究中，研究人员表明，该系统可以在多种哺乳动物细胞中工作，结果非常一致。“这是一个高度可预测的系统，我们可以预先设计，然后得到预期的结果，”前麻省理工学院研究科学家William C.W. Chen说。“这是一个非常可调的系统，适用于不同细胞类型的许多不同的生物医学应用。”其他作者还有前麻省理工学院研究

  来源：Massachusetts Institute of Technology

  时间：2022-11-03

• 利用CRISPR编辑T细胞治疗耐药白血病的进一步发展

  大奥蒙德街儿童医院(GOSH)和伦敦大学学院大奥蒙德街儿童健康研究所(UCL GOS ICH)的研究人员使用CRISPR/Cas9技术改造供体T细胞，试图治疗患有耐药性白血病的重症儿童，否则这些儿童已经用尽了所有可用的治疗方法。这项发表在《科学转化医学》(Science Translational Medicine)上的第一阶段试验，是“通用的”CRISPR编辑细胞首次在人类身上使用，代表着在使用基因编辑细胞治疗癌症方面向前迈出的重要一步。作为试验的一部分，研究团队构建并应用了新一代“通用”基因组编辑T细胞，这是建立在以前使用较老的、不太精确的技术的基础上的。T细胞被CRISPR修饰，它在细胞

  来源：Science Translational Medicine

  时间：2022-11-02

• 国际首例六基因编辑猪-猴多器官多组织同期联合移植

  异种移植技术要大规模进入临床应用，还需要更长时间、更谨慎的观察探索。作为一项新兴的科学技术，异种移植是人类探索生命科学奥秘的有效手段和模型，尤其如果能彻底地突破该技术，将打开人类免疫新纪元，从长远发展来看，有利于科学发展和人类进步。10月25日，空军军医大学西京医院宣布，由中国科学院院士、该院窦科峰教授领衔，肝胆外科、泌尿外科、心血管外科等20个学科共同开展的国际首例六基因编辑猪-猴多器官、多组织同期联合移植获得成功，实现了国际异种移植领域多器官多组织移植零的突破。这项移植手术于10月16日实施，历时14个小时结束。研究团队通过获取一头基因编辑猪的肝脏、心脏、肾脏3个脏器，以及角膜、皮肤、骨骼

  来源：澎湃新闻

  时间：2022-11-01

• 利用CRISPR技术，科学家发现基因是如何启动和关闭的奥秘

  酵母，这种制造啤酒和面包必不可少的简单生物体，为康奈尔大学的研究人员揭示了基因如何被控制的关键机制。基因转录——我们的细胞用来读取储存在DNA中的遗传信息的复杂过程——长期以来被认为只有当某些调节因子到达特定的DNA序列时才会启动。在新的研究中，康奈尔大学的一组科学家发现，某些基因的转录调节因子和辅助因子已经存在，但处于潜在状态。有了适当的信号，这些“镇定”的基因变得高度活跃。利用CRISPR技术，研究人员移除了酵母的部分转录机制，以系统地检查它们在调节基因中的作用。酵母和人类调节基因的分子机制基本相同，因此酵母为理解人类基因调节提供了一个极好的模型。“这就像叠叠乐游戏，你从积木塔上取下一块木

  来源：Genes & Development

  时间：2022-10-29

• 北大胡家志课题组与合作者追问在体基因编辑的安全性

  近年来，CRISPR-Cas等新一代的基因编辑工具在肿瘤免疫治疗和基因在体治疗等过程中展现出了极大的应用前景。基因编辑工具的优化大概经历三个时期：一是编辑效率和应用范围的提高和拓展；二是脱靶活性的抑制；三是关注基因编辑的基因组毒性，其中主要指染色质结构变异。染色体结构变异包括染色体易位和大片度DNA丢失1。染色体结构变异严重威胁基因组的稳定性并干扰细胞的正常生命活动，进而促使细胞死亡、恶性增殖及癌变等，例如多种淋巴瘤和白血病均由染色体易位导致。2021年，NIH体细胞编辑项目组在Nature撰文，强调关注基因编辑导致的染色体结构变异的重要性和必要性2。同年，因在输注了通用型CAR-T

  来源：北京大学新闻网

  时间：2022-10-27

• Science Advances：即使是好的基因编辑也会变坏

          图片:莱斯大学的研究人员正在努力揭示CRISPR-Cas9基因编辑的潜在威胁。左起分别是：Julie Park, Lavanya Saxena, Mingming Cao and Gang Bao.莱斯大学的一个实验室正在努力揭示基于CRISPR-Cas9(诺贝尔奖得主)基因编辑技术的治疗方法的有效性和安全性的潜在威胁，即使该技术似乎按计划发挥作用。莱斯大学生物工程师Gang Bao和他的团队在《科学进展》杂志上发表的一篇论文中指出，虽然DNA脱靶编辑长期以来一直是一个令人担忧的问题，但伴随脱靶编辑的看不见的变化也需要被认识到——并

  来源：Science Advances

  时间：2022-10-26

• 非编码基因组变化对神经发育的影响

  人类基因组中只有不到2%是由编码蛋白质的基因组成的，剩下的98%是非编码基因，它们参与调节基因表达。科学家们在基因组编码区域发现了许多直接关闭基因并导致疾病的变化，现在他们发现基因组非编码区域的变化也会产生临床后果。在一项新的研究中，麻省理工学院布罗德研究所、哈佛大学和麻省总医院(MGH)的研究人员发现，一种名为MEF2C的基因(一种与神经发育障碍NDDs有关的转录因子)附近非编码区域的结构变异可以模拟基因本身变化的影响。他们的论文今天发表在《American Journal of Human Genetics》上，首次描述了人类神经元细胞系中编码和非编码MEF2C变体的长期影响，并指出该基因

  来源：broad institute

  时间：2022-10-26

• 《Science》封面故事：基因编辑的蝴蝶突变体揭示了古代“垃圾”DNA的秘密

  一项新的研究解释了位于基因之间的DNA——被称为“垃圾”DNA或非编码调节DNA——如何适应一个保存了数千万到数亿年的基本计划，同时允许翅膀图案极其快速地进化。在10月21日出版的《Science》杂志上，“蝴蝶翅膀图案的深度顺式调控同源性”作为封面故事发表。这项研究支持这样一种观点，即蝴蝶基因组中已经编码了一种古老的颜色模式，非编码调节DNA像开关一样工作，打开一些模式，关闭另一些模式。“我们很想知道相同的基因是如何造就这些长相迥异的蝴蝶的，”该研究的第一作者、农业与生命科学学院生态和进化生物学教授Robert Reed实验室的前研究生、Anyi Mazo-Vargas博士说。Mazo-Va

  来源：Science

  时间：2022-10-24

• 《Science》发现一个进入线粒体膜的“门”

          MTCH2充当蛋白质进入线粒体外膜的通道。    线粒体——人类细胞中负责产生能量的细胞器——曾经是自由生活的有机体，在10亿多年前发现了进入早期真核细胞的途径。从那时起，它们就像共生进化的经典例子一样，无缝地与宿主融合在一起，现在它们依靠宿主细胞核中产生的许多蛋白质来正常工作。线粒体外膜上的蛋白质尤其重要;它们允许线粒体与细胞的其他部分进行通信，并在免疫功能和一种称为凋亡的程序性细胞死亡中发挥作用。在进化的过程中，细胞进化出一种特殊的机制，通过这种机制将这些在细胞细胞质中产生的蛋白质插入线粒体膜。但这一机制是

  来源：Science

  时间：2022-10-21

• Nucleic Acids Research：追问在体基因编辑的安全性

  近年来，CRISPR-Cas等新一代的基因编辑工具在肿瘤免疫治疗和基因在体治疗等过程中展现出了极大的应用前景。基因编辑工具的优化大概经历三个时期：一是编辑效率和应用范围的提高和拓展；二是脱靶活性的抑制；三是关注基因编辑的基因组毒性，其中主要指染色质结构变异。染色体结构变异包括染色体易位和大片度DNA丢失1。染色体结构变异严重威胁威胁基因组的稳定性并干扰细胞的正常生命活动，进而促使细胞死亡、恶性增殖及癌变等，例如多种淋巴瘤和白血病均由染色体易位导致。2021年，NIH体细胞编辑项目组在Nature撰文强调关注基因编辑导致的染色体结构变异的重要性和必要性2。同年，因在输注了通用型CAR-T细胞的病

  来源：北京大学

  时间：2022-10-21

• 调节基因元素是蝴蝶翅膀形态进化的基础

  在20世纪20年代，生物学家提出，蝴蝶翅膀图案的多样性是随着图案元素平面图的变化而演变的，这些图案元素的颜色、形状和位置在不同物种之间有所不同。Mazo Vargas等人发现，该平面图的主要方面是由一组古老的高度保守的非编码DNA序列决定的。这些调控序列既有正面影响，也有负面影响，非编码区之间的细微相互作用塑造了翅膀图案。因此，复杂、快速进化性状的深度同源性可以反映在非编码基因组序列中-LMZ和DJ这项新的研究，古老且高度保守的多功能基因调控元件在创造装饰蝴蝶翅膀的各种图案中发挥着关键作用。表型性状的进化通常是通过控制基因表达的基因组非编码区域的序列差异而发生的。然而，很少有研究描述了快速进化

  来源：Science

  时间：2022-10-21

• 上海交大开发出基因编辑作物突变体筛选、分型及编辑效率评估新方法（SMART和Cc-qPCR）

  近日，化学分析领域权威期刊《Analytical Chemistry》和《Sensors and Actuators: B. Chemical》在线发表了上海交通大学生命科学技术学院张大兵团队杨立桃教授课题组的研究成果“One Versatile Cas9-Integrated Single-Tube Duplex Quantitative Real-Time PCR System for Rapid Analysis of CRISPR/Cas-Induced Mutants”和“In vitro Argonaute cleavage-mediated quantitative PCR fa

  来源：上海交大 新闻学术网

  时间：2022-10-18

• Nature子刊：应用PEM-seq技术全面解析Cas12家族基因编辑工具酶的特性

  基因编辑的安全性问题一直是CRISPR-Cas系统应用于临床的关键。除了具有脱靶活性，CRISPR-Cas系统在基因编辑过程中还会产生染色体易位、染色体大片段缺失等染色体结构异常产物；并会同时介导外源载体DNA片段的整合1。这些副产物严重威胁了基因组的稳定性，常常与癌症的发生相关联，阻碍了CRISPR-Cas系统临床转化的进程。为了检测上述基因编辑过程中的副产物，北京大学生命科学学院、北大-清华生命科学联合中心胡家志研究员课题组前不久开发出高灵敏度的可以全面且定量评估CRISPR编辑特征的高通量测序方法PEM-seq2。从理论上来说，基因编辑工具包括Cas9和碱基编辑器等都可以利用P

  来源：北京大学新闻网

  时间：2022-10-18

• Nature Biotechnology：新的CRISPR-Cas方法带来更精确的DNA切割

  由马萨诸塞州总医院(MGH)的研究人员领导的一个团队已经克服了通过CRISPR-Cas酶和其他技术切割和编辑DNA的主要限制。最近的这项创新发表在《自然-生物技术》杂志上，它将简化和加快分子克隆方法，并扩大它们的用途。CRISPR-Cas编辑已经改变了研究人员改变DNA的能力——例如，用限制性内切酶或从细菌中分离的蛋白质无法做到的方式切割特定的DNA序列，而这种蛋白质已经被用于切割特定位点的DNA序列几十年了。尽管CRISPR-Cas工具可以被编程定位和切割几乎任何DNA序列，但其定位的一个主要限制是要求首先识别位于目标侧翼的短序列，称为原间隔相邻基序(PAM)。因此，DNA以前只能在这个特定

  来源：Nature Biotechnology

  时间：2022-10-13

• RNA折纸技术在合成生物学中的应用

          分子模型显示dCas9结合到引导RNA - RNA折纸融合分子，将转录因子带入启动子序列。开发精确控制生物过程的工具一直是合成生物学这个现已成熟的领域的主要支柱之一。这些科学工具借鉴了大量研究领域的原理，当结合在一起时，可以实现独特的应用，对现代社会具有潜在的变革意义。由于与细胞折叠和表达的兼容性，在生物学背景下翻译现代RNA纳米技术创新具有巨大的潜力，但也带来了独特的挑战，如严格的性能条件和RNA分子固有的不稳定性。然而，安德森实验室最近开发的一种被称为“RNA折纸”的RNA结构设计方法正试图解决这个问题。这种方法试图生成复杂的人

  来源：Nucleic Acids Research

  时间：2022-10-11

• 微生物学家改善啤酒的味道

  比利时研究人员通过识别和改造一种基因，改善了现代啤酒的味道，这种基因对啤酒和其他一些酒精饮料的味道有很大影响。这项研究发表在美国微生物学会的《应用与环境微生物学》杂志上。几个世纪以来，啤酒都是在开放的水平大桶中酿造的。但在20世纪70年代，该行业转向使用大型封闭容器，这更容易灌装、清空和清洁，使酿造量更大，降低了成本。然而，这些现代方法生产的啤酒质量低劣，因为风味生产不足。在发酵过程中，酵母将麦芽浆中50%的糖转化为乙醇，另外50%转化为二氧化碳。问题是:二氧化碳给这些封闭的容器加压，削弱了味道。分子细胞生物学名誉教授Johan Thevelein博士和他的团队开创了识别酵母中负责重要商业特性

  来源：American Society for Microbiology

  时间：2022-10-11

• Science Advances：侵袭性肺癌的新基因靶点

  西北医学院(Northwestern Medicine)的科学家发现并描述了一种新的基因，该基因负责激活小细胞肺癌的一种侵袭性亚型——P亚型，目前尚无有效的治疗方法。西北大学范伯格医学院生物化学和分子遗传学助理教授、该研究的主要作者Lu Wang说:“这种癌症对很多药物都有耐药性，但关注它的研究并不多。”“通过识别这个重要的基因，我们现在有了一个非常好的药物靶点。”Lu Wang说:“当我们告诉患者这种癌症没有有效的治疗方法时，对患者和他们的家人来说是毁灭性的打击。”部分问题在于，小细胞肺癌的治疗方法一直相对不变，主要依靠化疗。王说，大多数患者会产生化疗耐药，影响有限的治疗方案的整体疗效，并导

  来源：Science Advances

  时间：2022-10-11

• 将诺贝尔奖技术与治疗技术结合，克服CRISPR一个关键限制

  美国西北大学的一组研究人员设计了一种新的基因编辑平台，它可以为未来基于crispr的近乎无限的治疗方法的应用提供信息。通过化学设计和合成，该团队将获得诺贝尔奖的技术与他们自己实验室诞生的治疗技术结合在一起，克服了CRISPR的一个关键限制。具体来说，这项突破性的工作提供了一种系统，可以为生成名为CRISPR-Cas9的基因编辑机器提供所需的数据。该团队开发了一种将Cas-9蛋白转化为球形核酸(SNA)的方法，并将所需的关键成分装入其中，以访问广泛的组织和细胞类型，以及基因编辑所需的细胞内分隔室。这项研究发表在《美国化学学会杂志》上的一篇题为“CRISPR Spherical Nucleic A

  来源：Northwestern University

  时间：2022-10-10

• 一种与干细胞分化有关的特殊液滴可能为新的癌症疗法提供靶点

  干细胞充满潜力。它们变成其他细胞类型的能力对我们的身体至关重要，无论是在发育过程中还是在整个生命过程中。但如果这种潜能出了问题，就会让我们垮掉，把一些最有用的细胞变成恶性癌症。在研究干细胞分化通路时，加州大学圣巴巴拉分校的研究人员发现，所有参与的蛋白质并没有形成流水线或刚性结构，而是结合成一个液滴。通过建模和操作，研究小组开始揭示细胞如何使用这种液滴来处理和传递信息，以及它在癌症中是如何发生故障的。他们的研究结果发表在《PNAS》上。分子、细胞和发育生物学系的助理教授、资深作者Max Wilson说:“细胞中也发生了组织蜘蛛网上露珠的相同过程，使这种液体分子计算机根据命令出现或消失。一旦出现问

  来源：PNAS

  时间：2022-10-09

• Science子刊：肺癌治疗的新靶点

  肺癌是全球癌症死亡的主要原因之一。尽管筛查和治疗技术都有了改进，但肺癌通常在肿瘤扩散的晚期才被诊断出来。西北医学院的研究人员在小鼠身上进行的一项新研究证明并描述了一种负责激活一种侵袭性小细胞肺癌亚型的新基因。他们的发现可能会导致改进方法和治疗方法。这项名为“POU2AF2/C11orf53 functions as a coactivator of POU2F3 by maintaining chromatin accessibility and enhancer activity”的新研究发表在《Science Advances》杂志上。研究人员写道:“小细胞肺癌(SCLC)约占所有肺癌的1

  来源：Science Advances

  时间：2022-10-08

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