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  • 综述:大规模人工智能模型在生物信息学中的应用

    大型人工智能模型在生物信息学中的多模态应用与发展趋势摘要随着深度学习技术的快速发展,基于Transformer架构的大型语言模型(LLMs)、视觉模型(LVMs)和多模态模型(LMMs)正逐步渗透到生物信息学的各个领域。本文系统梳理了三类模型在基因组分析、蛋白质结构预测、单细胞测序、药物研发等关键任务中的具体应用,并探讨了当前面临的挑战与发展方向。3.1 基于LLMs的基因组分析与预测在基因组学研究方面,LLMs通过序列建模能力实现了多项突破性应用。以DNA序列分析为例,模型首先通过分词技术将原始序列切割为固定长度的k-mer片段(k通常取6),随后利用嵌入层将生物碱基转换为高维向量表示。关键

    来源:Quantitative Biology

    时间:2025-12-24

  • 高密度采样揭示了热带泻湖中二氧化碳通量的生物和潮汐驱动的时空变化

    本文聚焦于台湾省尺谷潟湖(Chiku Lagoon)的二氧化碳动态研究,通过部署自主浮标和采集水样,揭示了潟湖中二氧化碳时空变化规律及其驱动机制。研究结合物理混合、温度波动和生物活动三个维度,为沿海碳循环评估提供了新视角。### 一、研究背景与科学问题潟湖作为连接陆地与海洋的过渡生态系统,其碳循环机制复杂且受多重因素影响。当前研究存在两大局限:其一,传统采样难以捕捉潮汐与昼夜叠加的动态变化;其二,生物活动与物理过程的贡献度缺乏定量解析。本文通过高密度连续监测,首次在单一潟湖尺度上同时解析潮汐与昼夜周期对二氧化碳排放的影响权重。### 二、研究方法与技术路线研究团队采用五组自主浮标系统( Sta

    来源:Limnology and Oceanography

    时间:2025-12-24

  • 对非法交易海龟相关没收决定的分析

    本研究聚焦非法野生动物贸易中水龟的处置难题,以濒危物种木材龟(*Glyptemys insculpta*)为案例,通过决策分析工具构建多层级决策模型,为执法部门、科研机构及保护组织提供科学决策支持。研究涉及四大核心环节:一、问题背景与挑战全球非法野生动物贸易规模已达数百亿美元,其中龟类占比超过50%。美国1996-2008年间已查获12.7万只活体爬行动物,其中半数为龟类。木材龟因栖息地丧失、气候变化及非法贸易导致种群持续下降,被列入CITES附录II及13个州的重点保护物种。非法贸易中,被捕水龟面临三大风险:携带病原体(如 ranavirus、疱疹病毒等)可能引发种群健康危机;遗传基因不匹配

    来源:Conservation Science and Practice

    时间:2025-12-24

  • 综述:触觉科学的奥秘:化妆品触觉评估的教学综述

    ### 感官分析在化妆品开发中的应用:从触觉感知到技术创新#### 摘要(中文)感官分析是化妆品开发的核心环节,但其在学术文献中的 representation 仍显不足。本文探讨了触觉感知在化妆品感官评价中的多维角色,强调皮肤作为主要触觉器官的生理机制,并系统分析了视觉感知的辅助作用。研究指出,化妆品行业在感官分析方法学上与食品工业存在显著差异:食品行业依赖味觉和嗅觉,而化妆品则更侧重触觉和视觉。尽管传统感官方法(如 hedonic 测试、discriminative 探索)和仪器分析(如 rheology、texture analysis)已取得进展,但行业仍面临方法标准化不足、跨学科研究

    来源:International Journal of Cosmetic Science

    时间:2025-12-24

  • 基于MIMIC-IV数据库对入住ICU的缺血性中风患者发生呼吸衰竭的预测:一项回顾性分析

    本研究旨在构建并验证一项针对重症监护室(ICU)收治的缺血性脑卒中(IS)患者呼吸衰竭风险预测的量化模型。通过整合MIMIC-IV和eICU两大真实世界医疗数据库的临床数据,研究团队系统性地探讨了影响IS患者呼吸衰竭的多因素关联性,并建立了具有临床实用价值的预测工具。**研究背景与科学价值**全球范围内,缺血性脑卒中作为第二大死因和致残原因,其并发症的早期识别具有重要临床意义。呼吸衰竭作为IS患者常见的严重并发症,不仅显著增加住院死亡率,更会延长康复周期。值得注意的是,现有文献多聚焦于急性期神经功能损伤评估,而对呼吸系统并发症的预测模型仍存在研究空白。本研究通过构建预测模型,为临床工作者提供早

    来源:Brain and Behavior

    时间:2025-12-24

  • 非糖尿病患者中脑小血管疾病与胰岛素抵抗及认知功能的关系:脑淋巴系统功能的作用

    本研究聚焦于非糖尿病性脑小血管病(CSVD)患者中胰岛素抵抗(IR)与脑脊液清除功能(通过DTI-ALPS指数评估)对认知功能的影响机制。研究采用横断面队列设计,纳入110例经MRI确诊的CSVD患者,排除糖尿病、近期卒中及其他神经系统疾病患者,最终分为IR组(40例)和非IR组(70例)。主要发现如下:### 一、研究背景与核心问题脑小血管病(CSVD)是老年认知障碍的重要病理基础,其核心机制涉及"血管-神经-认知"轴的异常。该轴由血管内皮细胞、胶质细胞(如星形胶质细胞)及神经元共同构成,其中神经-胶质-血管单位(NGVU)是关键功能单元。近年来研究发现,脑脊液清除功能(由 glymphat

    来源:Brain and Behavior

    时间:2025-12-24

  • 综述:不同联合疗法治疗双相情感障碍躁狂期的疗效:系统评价与荟萃分析

    本研究通过系统综述和元分析,旨在对比分析抗精神病药物扎来普隆与奥氮平联合情绪稳定剂治疗双相情感障碍躁狂发作的疗效与安全性。研究采用PRISMA指南规范操作流程,系统检索PubMed、Web of Science等6个中英文数据库,涵盖2012至2025年期间发表的随机对照试验(RCT),最终纳入10项符合标准的RCT研究,涉及842例患者。在疗效评估方面,研究显示两种联合治疗方案的整体临床有效率无显著差异(OR=1.18,95%CI:0.80-1.75,p=0.41)。但针对核心症状评估指标Young Mania Rating Scale(YMRS)发现,扎来普隆联合组在降低躁狂症状评分方面具

    来源:Brain and Behavior

    时间:2025-12-24

  • 威尔逊病患者的社会支持、自我管理行为与应对方式:一项定量实证研究

    威尔逊病(Wilson's disease, WD)是一种罕见的常染色体隐性遗传性疾病,其病理特征为铜代谢失衡,临床表现为肝损伤和神经系统损害。由于该病发病率低(约1/30,000至1/50,000),且缺乏特异性的早期诊断标志物,患者常在出现严重并发症后才被确诊。近年来,随着诊疗技术的进步, WD患者的长期管理逐渐受到重视,但其在自我管理行为方面的研究仍存在空白。本研究基于Roy适应模型,系统探究WD患者社会支持、应对方式与自我管理行为之间的关联机制,为临床干预提供理论依据。### 一、研究背景与理论框架WD患者的自我管理能力直接影响疾病预后。尽管慢性病自我管理理论已广泛应用于糖尿病、高血压

    来源:Brain and Behavior

    时间:2025-12-24

  • HIV感染者中的社会交往模式及其与抑郁、孤独感和污名化之间的关联

    摘要感染艾滋病病毒(HIV)的人群中,超过一半的人年龄在50岁及以上,他们普遍患有多种慢性疾病(MCC),且社会网络较为脆弱。尽管社交活动有助于预防对身体健康、认知能力和心理健康的不利影响,但目前关于老年HIV感染者与家人、朋友及社区互动的社交情况及相关因素的研究仍较为有限。本研究利用在纽约市进行的“老年HIV感染者研究”(ROAH 2.0)中的13项“休闲活动频率量表”,探讨了这部分人群的社交状况。我们通过因子分析和回归分析来描述社交活动,并考察这些活动与多种慢性疾病、艾滋病诊断结果、社会脆弱性指数(SVI)、经济压力、孤独感、HIV相关污名化以及抑郁症状之间的关系,同时控制了人口统计因素的

    来源:AIDS and Behavior

    时间:2025-12-24

  • 导师妈妈参与快速返还病毒载量结果对HIV感染孕产妇干预效果的试点研究

    在撒哈拉以南非洲,随着抗逆转录病毒治疗(ART)的普及,围产期HIV传播已显著下降,但彻底消除的目标依然遥远。在肯尼亚,导致传播持续的主要原因是孕产妇在孕期和产后脱离治疗和护理。这个特殊时期,女性面临着新的责任和变化的日常,给坚持治疗带来了挑战。尽管她们通常有强烈的动机保护自己的孩子免受感染,但可能缺乏维持病毒学抑制和持续参与护理所需的资源或知识。病毒学监测和咨询能让女性了解自己的病毒抑制状况,并为出现病毒血症的患者及时干预创造条件。然而,现实中的病毒载量监测流程存在显著延迟。按照肯尼亚指南,孕妇和哺乳期HIV感染女性需要定期进行病毒载量检测。但血液样本通常需要送往中央实验室,结果返回到医疗机

    来源:AIDS and Behavior

    时间:2025-12-24

  • 综述:HIV感染者身体意象及其相关因素:范围综述及对整合护理的启示

    引言HIV已成为一种可管理的慢性健康问题,但感染者(PLWH)仍面临由HIV感染本身和抗逆转录病毒治疗(ART)带来的独特挑战,身体意象紊乱是其中之一。身体意象被概念化为个体对其身体或特定部位的主观感知、想法和感受。在PLWH中,此类问题可能因病毒或ART的生理影响,以及污名化和其他社会心理压力源而被放大。身体意象感知会随时间发生显著变化,诊断初期、感染进展期以及与社会医疗系统的互动均会塑造个体的自我形象。研究表明,负面身体意象与不依从药物治疗、降低护理保留率和社会孤立相关。然而,目前对PLWH身体意象问题及相关因素的了解仍然有限,缺乏标准化的评估工具和针对性的干预措施。因此,本范围综述旨在全

    来源:AIDS and Behavior

    时间:2025-12-24

  • 液泡K⁺外排转运蛋白TaTPK1-5D通过与面包小麦中的TaCIPK23-4D相互作用,导致‘Zhengmai 136’品种对低K⁺环境的耐受性降低

    摘要关键信息定位于液泡膜上的转运蛋白TaTPK1-5D通过与TaCIPK23-4D相互作用,促进液泡中的钾离子(K⁺)外排,从而增强小麦对低钾(low K⁺)环境的耐受性,为提高小麦钾利用效率提供了关键的遗传靶点。摘要面包小麦(Triticum aestivum L.)是全球超过三分之一人口的主食,而钾(K⁺)对小麦的产量和品质至关重要。然而,小麦在低钾条件下生存的分子机制仍不明确。在这项研究中,通过对712个小麦品种进行表型筛选,发现了一个对低钾敏感的基因型(H735)和一个耐低钾的基因型(H467,即Zhengmai 136)。通过测量钾离子浓度和非侵入性微测试技术发现,这两种基因型之间的

    来源:Theoretical and Applied Genetics

    时间:2025-12-24

  • ERAP1/ERAP2罕见与常见变异在耶尔森菌感染选择压力下对炎症性肠病等自身免疫疾病的贡献机制研究

    在人类进化长河中,感染性疾病与免疫系统的博弈塑造了当今的遗传景观。14世纪席卷欧洲的黑死病(耶尔森菌感染)作为最强烈的自然选择压力之一,促使人类基因组中与免疫应答相关的基因发生适应性演化。内质网氨肽酶ERAP1和ERAP2作为抗原加工的关键酶类,其高活性变异在黑死病流行期间为携带者提供了生存优势,但这些变异在当代环境中却可能增加自身免疫疾病易感性。这种进化遗产与现代社会环境的错配,或许是近年来炎症性肠病等自身免疫疾病发病率持续攀升的重要原因。《Mammalian Genome》最新发表的研究深入探讨了这一科学问题。随着英国IBD患病率从2000年起显著增长,至2016年已达142.1/10,0

    来源:Mammalian Genome

    时间:2025-12-24

  • 全基因组单核苷酸多态性(SNP)证据表明本土牛群具有遗传独特性

    摘要印度常见的非特定品种牛群占全国1.9346亿头牛总数的52%,对国家的遗传多样性至关重要,但它们在牛奶产量中的贡献仅占9.82%。这凸显了对这些牛群进行基因组测序的迫切需求,以便将这些信息用于保护工作和育种策略中。本研究使用Bovine GGP50K SNP芯片,分析了马哈拉施特拉邦Vidarbha地区两个重要的本土牛群——Umarda(UM)和Pahadi/Melghati(PAH)的遗传独特性、种群结构、祖先比例及保护状况。这两个牛群是当地生计经济的基础。共有18个品种/种群(包括3个牛品种)接受了基于Bovine GGP50K SNP芯片的基因组分析。这两个本土牛群的杂合度较高(UM

    来源:Mammalian Genome

    时间:2025-12-24

  • 安格斯牛全球群体的基因组结构与选择历史:基于ROH、选择图谱和功能分析的新见解

    在牛肉产业的广阔画卷中,安格斯牛无疑是最耀眼的明星之一。这个原产于苏格兰的牛种,经过400多年的人工选育,已成为全球肉牛产业的重要支柱。然而,随着各国育种目标的差异化和地域环境的特殊性,一个关键问题逐渐浮现:分布在世界各地的安格斯牛群体,其基因组结构是否依然保持高度一致性?不同国家的育种实践又是否导致了遗传背景的分化?这些问题不仅关系到品种资源的保护,更直接影响着跨国基因组评估的准确性和育种效率。为了解开这些谜团,由Henrique A. Mulim领衔的国际研究团队在《Mammalian Genome》上发表了最新研究成果。研究人员收集了来自美国、加拿大、澳大利亚、巴西和红安格斯五个群体的7

    来源:Mammalian Genome

    时间:2025-12-24

  • 利用从制革厂废水中分离出的Bacillus cereus F4810/72菌株,通过生物吸附法去除六价铬

    摘要西孟加拉邦的皮革工业持续排放含有铬的废水,其中六价铬(Cr(VI)具有特别强的持久性和毒性。来自制革厂废水的六价铬因其高迁移性、溶解性和致癌性而对环境和公共健康构成严重威胁。生物吸附为传统的物理化学修复方法提供了一种可持续且经济有效的替代方案。在本研究中,系统评估了先前从制革厂废水中分离出的Bacillus cereus F4810/72菌株在不同物理化学条件下的六价铬(Cr(VI)吸附潜力。通过批量实验研究了初始金属浓度(10–1000 µg/mL)、接触时间(10–100 min)、pH值(1–9)、生物量浓度(1–4 g/L)、温度(10–60 °C)和搅拌速度(10–120 rpm

    来源:Biodegradation

    时间:2025-12-24

  • 乙烯膦与生长素对夏季雪花莲(Leucojum aestivum L.)离体小鳞茎增殖及加兰他敏生物合成的协同效应

    摘要Leucojum aestivum 0.85),表明这些过程之间存在协调的代谢和形态发生响应。有趣的是,酶类抗氧化剂的活性与生物碱含量呈负相关。这些发现证明了乙烯利和IBA在促进生物量及次级代谢产物生成方面的协同作用。所优化的实验方案为Leucojum aestivum的体外繁殖和高价值生物碱生物合成提供了一个高效且可持续的平台,有助于其保护和药用开发。Leucojum aestivum 0.85),表明这些过程之间存在协调的代谢和形态发生响应。有趣的是,酶类抗氧化剂的活性与生物碱含量呈负相关。这些发现证明了乙烯利和IBA在促进生物量及次级代谢产物生成方面的协同作用。所优化的实验方案为Le

    来源:Plant Cell, Tissue and Organ Culture (PCTOC)

    时间:2025-12-24

  • 优化光质与激素调控提升梣叶枫微繁殖效率及生理品质的研究

    在中央欧洲的森林中,梣叶枫(Acer pseudoplatanus L.)是一种兼具生态价值与经济价值的硬木树种。其木材纹理独特的个体——特别是波浪纹理(wavy grain)基因型——因其能显著提升木材的商业价值而备受关注。然而,这类珍稀基因型的传统无性繁殖方法(如嫁接或扦插)效率低下,且易受内生菌污染和基因型依赖性的限制。因此,开发高效、稳定的离体繁殖技术对于实现梣叶枫优良种质的规模化繁殖及保存具有重要意义。为攻克这一难题,研究人员在《Plant Cell, Tissue and Organ Culture (PCTOC)》上发表了题为“Developing an improved pro

    来源:Plant Cell, Tissue and Organ Culture (PCTOC)

    时间:2025-12-24

  • 菌根植物根系在湿润土壤中水分耗竭更快的机制解析

    随着全球气候变化加剧降水格局的波动,植物水分利用策略成为生态学和农业研究的焦点。丛枝菌根真菌(Arbuscular Mycorrhizal Fungi, AMF)与绝大多数陆地植物形成的共生体系,长期以来被视为增强植物抗旱性的关键机制。传统理论认为,在干旱胁迫下,AMF通过其延展的菌丝网络帮助植物获取根系无法触及的水分,或通过调节气孔开闭和养分供应间接提升植物的耐旱能力。然而,当土壤水分充沛、接近田间持水量时,菌根共生是否仍能影响植物的水分利用效率?这一问题长期被忽视。毕竟,在水分极易获取的湿润土壤中,菌丝网络的“勘探优势”似乎不再必要,菌根植物与非菌根植物(Non-Mycorrhizal,

    来源:Mycorrhiza

    时间:2025-12-24

  • 关于干旱胁迫下水稻(Oryza sativa)生理、生化及代谢物特征的机制性研究:二氧化硅纳米颗粒处理的战略应对机制

    摘要气候变化导致干旱发生的频率增加,对农作物产量构成了严重威胁,尤其是对像水稻(Oryza sativa)这样的耐旱性较差的物种。干旱胁迫会不利地影响植物的生理和生化功能,最终导致产量下降。本研究旨在填补关于有效缓解干旱损害和提高水稻产量的方法的知识空白。我们假设施用二氧化硅纳米颗粒(SiO2-NPs)可以通过影响水稻的生理和生化反应来增强其耐旱性。为了验证这一假设,采用完全随机设计(CRD)并在四个重复实验中,将水稻植株分别培养在水分充足和干旱条件下(干旱条件为20%的聚乙二醇(PEG;MW 6000)中。研究结果表明,施用不同浓度的SiO2-NPs(50 mg/L、100 mg/L和200

    来源:Journal of Plant Growth Regulation

    时间:2025-12-24


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