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scCRAFT:突破单细胞 RNA 测序数据整合困境,开启精准细胞分析新时代
在生命科学研究领域,单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)技术的出现,如同为科学家们打开了一扇全新的大门,让我们得以深入细胞层面,窥探生命的微观奥秘。在过去十年间,它迅猛发展,不断改写着我们对细胞多样性和功能的认知。然而,这一技术在实际应用中却遭遇了诸多挑战。不同实验条件下产生的 scRNA-seq 数据,常常受到复杂批次效应的干扰,这些效应就像隐藏在数据中的 “噪音”,与细胞状态的异质性相互交织,严重影响了数据的质量和后续分析的准确性。比如,测序深度的差异、实验试剂的细微变化,甚至样本的组织来源和个体间的自然差异,都可能导致批次效应的产生。这使得在整合来自不同实验的数据时,难以在消除批次
来源:Communications Biology 5.2
时间:2025-04-05
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可可叶发育关键期叶绿体与气孔空间格局研究:解锁生长优化新密码
可可,这种与巧克力产业紧密相连的热带作物,在全球经济和农业中占据着重要地位。它生长过程中的 “flush growth”(快速生长阶段)对其产量和品质有着关键影响。在这一时期,可可叶的发育至关重要,而叶绿体和气孔作为叶片的重要组成部分,它们的发育和空间分布直接关系到叶片的光合作用、气体交换以及植物的整体生长。然而,目前关于可可叶在生长关键阶段,尤其是 Stage C 期(叶绿素快速积累阶段),叶绿体和气孔的发育机制还存在诸多未知。虽然已有研究表明,在其他植物中叶绿体和气孔的发育与多种因素相关,但在可可叶中,相关的系统性研究却十分匮乏。例如,目前缺乏关于可可叶叶绿体或叶绿素合成的时空数据,这限制
来源:Communications Biology 5.2
时间:2025-04-05
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靶向 SCD 触发癌细胞脂毒性并增强乳腺癌脑转移小鼠模型的抗肿瘤免疫:开启癌症治疗新征程
乳腺癌是女性健康的一大威胁,而乳腺癌脑转移(BCBM)更是让病情雪上加霜。目前,BCBM 患者的预后极差,即便接受了手术、化疗、放疗和免疫治疗等多种方式,2 年生存率仍低于 10% 。这是因为脑微环境使得癌细胞的脂质代谢发生改变,为其在脑部的存活和增殖创造条件。其中,硬脂酰辅酶 A 去饱和酶(SCD)在 BCBM 中表达上调,催化单不饱和脂肪酸(MUFA)的合成,对癌细胞的生存和增殖至关重要,因此成为潜在的治疗靶点。此前的 SCD 抑制剂(SCDi)因难以穿过血脑屏障(BBB),限制了其在 BCBM 治疗中的应用。不过,新型脑穿透性 SCDi——YTX-7739 的出现,为研究带来新希望。来自
来源:Communications Biology 5.2
时间:2025-04-05
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突破界限:突触标记与捕获中超乎想象的时间灵活性
在大脑的奇妙世界里,每天都有海量的信息涌入。大脑如同一个智能筛选器,会过滤掉无关紧要的细节,留下有用信息。但有时,那些看似无关的细节,一旦和难忘的经历联系起来,或者在时间上靠近重要事件,就会被大脑强化,变成长期记忆。这种将相关记忆连接起来的神奇能力,被称为联想性(associativity)。在细胞层面,联想性在长时程增强(Long-Term Potentiation,LTP)中有所体现,LTP 是一种被广泛研究的突触可塑性形式,被视为学习和记忆的细胞关联。而突触标记与捕获(Synaptic Tagging and Capture,STC)模型,更是巧妙地解释了 LTP 的联想特性。根据这个模
来源:Communications Biology 5.2
时间:2025-04-05
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心力衰竭患者贫血患病率及影响因素研究:埃塞俄比亚吉马大学医学中心的横断面调查
心力衰竭(HF)这个"沉默的杀手"正成为全球公共卫生的重大挑战,而在医疗资源有限的非洲地区,其威胁尤为严峻。当心脏这个"人体发动机"出现故障时,往往伴随着一个被忽视的"帮凶"——贫血。这种红细胞数量不足的状况,就像给已经疲惫不堪的心脏又戴上了一重枷锁,显著增加患者的死亡风险和医疗负担。令人担忧的是,在埃塞俄比亚这样的发展中国家,关于心力衰竭患者贫血状况的系统研究几乎空白,这使得临床决策缺乏本土化数据支持。正是基于这一背景,吉马大学医学中心的研究团队开展了一项开创性研究。团队由Elsah Tegene领衔,成员包括Abdulkadir Mohammed、Tamirat Godebo等多位专家。他
来源:BMC Cardiovascular Disorders 2
时间:2025-04-05
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静电除尘器助力防控猪群空气传播病毒:潜力与成效
在现代化的畜禽养殖产业中,动物们生活在相对封闭且通风受控的环境里,这虽然便于管理,但也带来了一个棘手的问题 —— 空气传播疾病极易爆发和传播。像猪繁殖与呼吸综合征(Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome,PRRS)、猪流感(Swine Influenza)这类疾病,可通过气溶胶传播,给养猪业造成巨大的经济损失。以 PRRS 为例,它能让母猪繁殖失败,各年龄段的猪都可能出现呼吸障碍,在美国,2006 - 2010 年期间,每年因它造成的损失近 6.64 亿美元。甲型流感病毒(Influenza A virus,IAV)不仅影响猪的生产性能,还因
来源:Veterinary Research 3.7
时间:2025-04-05
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澳大利亚沿海陆地水产养殖面临海平面上升威胁:三分之一产区或将受严重影响
在全球气候变化加剧的背景下,海平面上升(SLR)正成为威胁沿海生态与经济系统的重大挑战。作为全球重要的蛋白质来源,水产养殖业特别是依赖海岸带区域的陆地养殖系统,正面临着前所未有的气候风险。澳大利亚作为南半球重要的水产养殖国家,其昆士兰州贡献了全国最大的陆地水产养殖产量,但该区域同时被预测将在2100年面临0.8米的海平面上升(RCP8.5情景)。这种矛盾现状催生了一项具有前瞻性的研究——由昆士兰科技大学领衔的团队在《Aquaculture Science and Management》发表论文,首次系统评估了海平面上升对该地区水产养殖业的潜在影响。研究团队创新性地整合了多源数据:通过Googl
来源:Aquaculture Science and Management
时间:2025-04-05
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儿童急性中毒潜在有害急救行为的模式、影响因素及意义探究
在低中收入国家,儿童急性中毒是个严峻的公共卫生问题。孩子们常常在不经意间接触到有毒物质,比如家中的化学用品、药品等。一旦发生中毒,护理人员的急救措施对中毒事件的结果有着关键影响。然而,现实中不少护理人员依赖家庭土方或传统做法,有些措施不仅没效果,还可能让孩子的情况更糟,耽误正规治疗。就像给误食毒物的孩子大量喝水催吐,或是喂椰子奶,这些做法不仅没有科学依据,还可能导致孩子呛噎、吸入性肺炎等严重后果。所以,了解这些有害急救行为的模式和影响因素,显得尤为重要。为了弄清楚这些问题,来自斯里兰卡凯拉尼亚大学医学院儿科(Department of Paediatrics, Faculty of Medic
来源:BMC Research Notes 2.8
时间:2025-04-05
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新型麦角酸二乙酰胺(LSD)类似物的鉴定及其研究意义:从网络售卖纸片产品中发现 1S-LSD 和 1T-AL-LAD
目的:近年来,全球出现了许多麦角酸二乙酰胺(Lysergic acid diethylamide,LSD)类似物作为新型毒品。这些化合物主要以纸片产品的形式流通。本研究从纸片产品中鉴定出两种新的 LSD 类似物。方法:通过气相色谱 - 质谱联用仪(Gas Chromatography-Mass Spectrometry,GC-MS)、液相色谱 - 光电二极管阵列 - 质谱联用仪(Liquid Chromatography-Photodiode Array-Mass Spectrometry,LC-PDA-MS)、液相色谱 - 混合四极杆飞行时间质谱联用仪(Liquid Chromatograp
来源:Forensic Toxicology 2.8
时间:2025-04-05
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综述:非编码 RNA 在园艺作物品质改良中的作用:鉴定与分析的计算工具、数据库和算法
### 非编码 RNA 在园艺作物品质改良中的重要性园艺作物,像水果、蔬菜、花卉和草药等,对粮食安全和经济可持续发展意义重大。生物技术的进步,例如基因编辑和组学研究手段,在改良园艺作物性状方面成果显著。起初,转基因研究主要围绕编码蛋白质的基因展开,不过近年来,非编码 RNA(ncRNAs)在植物生长、发育和基因调控中的关键作用逐渐受到关注。ncRNAs 涵盖了微小 RNA(miRNAs)和长链非编码 RNA(lncRNAs)等。它们通过转录和转录后调控机制,参与到植物众多重要的生物学过程中。研究 ncRNAs 的分类、功能及调控机制,对于挖掘其在提升园艺作物品质方面的潜力至关重要,这也为提高作
来源:Functional & Integrative Genomics 3.9
时间:2025-04-05
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探究嗜酸两面菌(Acidianus ambivalens)在厌氧硫还原代谢中的能量机制及与好氧硫氧化的对比意义
嗜酸两面菌(Acidianus ambivalens)是一种代谢灵活的兼性厌氧菌,它能够分别利用氧气(O2)和氢气(H2)氧化和还原元素硫。在这项研究中,研究人员测定了嗜酸两面菌在 76°C 厌氧条件下,以元素硫氧化氢气作为产能分解代谢反应时的生长能量学。生物质产量(每消耗 1 摩尔氢气所产生的生物质碳摩尔数)大约在 0.004 至 0.01 之间。生长速率在 0.003 至 0.012 h−1之间。基于细胞生长宏观化学方程式计算出的孵化吉布斯自由能在 - 881 至 -3349 kJ/C - 摩尔之间。通过量热测量得到的孵化焓在 - 610 至 -4090 kJ/C - 摩尔之间。研究人员将
来源:Extremophiles 2.6
时间:2025-04-05
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结核病通过组织移植传播的风险评估:基于加拿大魁北克地区的定量分析
近期美国爆发的两起结核病疫情被追溯到含有活细胞的污染骨移植产品,这凸显了建立循证供体筛选标准的紧迫性。为填补组织移植传播结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)风险量化的空白,研究团队以加拿大魁北克地区为样本,创新性地构建了确定性数学模型,系统评估了皮肤、心血管、肌肉骨骼及眼组织移植的传播风险。通过最可能、乐观和悲观三种情境模拟显示:经γ射线辐照处理的非活细胞组织(如肌肉骨骼移植物)传播风险极低(<1/100万例),而含活细胞的角膜移植风险相对较高(最可能情境下1/312,160例)。值得注意的是,即使将关键参数人为放大50%-100%,绝大多数组织类型的风险
来源:Cell and Tissue Banking 1.4
时间:2025-04-05
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揭秘 YY1/EGFR 轴在哮喘炎症与氧化应激中的关键作用及机制
为了研究转录因子阴阳 1(YY1 )和氧化应激对支气管上皮细胞系中表皮生长因子受体(EGFR )表达上调的影响,研究人员用白细胞介素(IL-4 、IL-13 和 IL-17A )刺激支气管上皮细胞系(BEAS-2B )模拟哮喘微环境。从 BEAS-2B 细胞中提取总 RNA 和总蛋白,测定炎症标志物(TSLP 和 IL-25 )以及 YY1/EGFR 的表达。在 BEAS-2B 细胞中过表达或抑制 EGFR ,检测细胞活性(CCK-8 )、硫氧还蛋白还原酶(TrxR )和丙二醛(MDA )表达的变化。干扰 YY1 后测定 EGFR 的表达。通过在线数据库预测 YY1 和 EGFR 启动子区域的
来源:Cell Biochemistry and Biophysics 1.8
时间:2025-04-05
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二甲双胍调控 ERK-MMP10-IL-1β 轴抑制幽门螺杆菌(H. pylori)相关胃炎发展:开启胃炎治疗新希望
幽门螺杆菌(H. pylori)感染是诱发胃黏膜炎症的常见因素之一。当它感染胃上皮细胞后,会产生活性氧(ROS),而 ROS 能作为基质金属蛋白酶(MMPs)的诱导剂。ROS 可通过细胞外信号调节激酶(ERK)信号通路调控 MMP 基因表达并促进其生成,其中 MMP-10 是H. pylori感染时诱导产生的主要 MMP。MMP-10 通过介导胃上皮层和固有层的重塑,增强H. pylori的定植和促炎作用。由于H. pylori对根除疗法的耐药性显著增加,其根除率持续下降。研究人员探究了二甲双胍对细胞活力、迁移和侵袭的抗氧化作用,评估了H. pylori感染的胃上皮细胞中 ROS、MMP-10
来源:Cell Biochemistry and Biophysics 1.8
时间:2025-04-05
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免疫抑制方案大对决:探究诱导 Wistar 大鼠外阴阴道念珠菌病的理想之选
外阴阴道念珠菌病(Vulvovaginal Candidiasis,VVC)是全球普遍存在的公共卫生问题。现有疗法频繁复发和治疗失败,迫切需要探索新的潜在治疗方法。然而,在啮齿动物中诱导外阴阴道念珠菌病的方案有限且缺乏标准化。大多数方法依赖免疫抑制来模拟人类情况。本研究旨在比较两种免疫抑制方案在雌性 Wistar 大鼠外阴阴道念珠菌病感染模型中的效果。实验动物接受两种免疫抑制处理:使用环磷酰胺的化学免疫抑制(IMS)和慢性不可预测轻度应激模型(CUMS)。免疫抑制期过后,大鼠接种白色念珠菌(C. albicans)ATCC10231。确认感染后,动物用含克霉唑(10mg/g)的阴道乳膏或赋形剂
来源:Brazilian Journal of Microbiology 2.1
时间:2025-04-05
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绿色合成银纳米颗粒抗光滑念珠菌(Candida glabrata)真菌及生物膜活性的研究:对抗耐药菌的新希望
光滑念珠菌(Candida glabrata)是一种重要的人类真菌病原体,可在免疫系统受损人群中引发危及生命的感染。在口腔、气管和导管中,光滑念珠菌生物膜肆意生长,是念珠菌病病理生理学的主要病因,严重时会导致全身感染。因此,开发新型生物膜预防和治疗药物迫在眉睫。在本研究中,研究人员致力于探究由蓝藻(Anabaena variabilis)合成的银纳米颗粒(AgNPs)作为一种新型抗生物膜药物在念珠菌病中的作用。利用Anabaena variabilis细胞提取物合成 AgNPs,并通过紫外 - 可见光谱对其进行表征。在光滑念珠菌中,AgNPs 的最低抑菌浓度(MIC)为 25μg/mL。在 2
来源:BioMetals 4.1
时间:2025-04-05
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揭秘多个 MlaC 拷贝:揭示脂质不对称(Mla)系统的多面性
脂质不对称(Mla,Maintenance of the lipid asymmetry)系统在革兰氏阴性菌的内膜和外膜之间促进磷脂运输的过程中起着关键作用。在大肠杆菌(E. coli)中,该系统由六种蛋白质组成:MlaA - OmpF/C 复合物(外膜)、MlaC(周质)和 MlaFEDB 复合物(内膜)。尽管对 Mla 系统的核心蛋白(MlaFED)已有大量研究,但 MlaA、MlaB 和 MlaC 等 Mla 组件在双膜菌中的存在情况仍不确定。这一空白为进一步研究提供了重要契机,尤其是对于 MlaC,它是 Mla 系统中唯一的移动组件。研究发现,在 63 个不同属的变形菌门(Proteo
来源:Archives of Microbiology 2.3
时间:2025-04-05
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泥炭地鼓藻的耐旱性:托马斯微星鼓藻(Micrasterias thomasiana)和多毛十字藻(Staurastrum hirsutum)的比较研究 —— 探寻湿地生物对干旱的应对策略
泥炭地,那是大自然中独特的生态系统,宛如地球的 “绿色海绵”,在维持生态平衡、调节气候等方面发挥着重要作用。鼓藻(Desmids)作为泥炭地植物底栖生物中常见的原生生物类群,对环境变化十分敏感,是淡水生态系统中宝贵的生物指标。然而,全球气候持续变化,在温带和寒温带湿地,水生栖息地的季节性干旱愈发频繁和严重,这给泥炭地生物带来了巨大挑战。目前,虽然有研究关注泥炭地鼓藻在自然环境中的分布受干旱影响的情况,但对于鼓藻耐旱性的实验研究却较为缺乏。科学家们不清楚不同鼓藻物种在面对干旱时的具体反应,也不了解它们是否具备适应干旱的机制。因此,开展对鼓藻耐旱性的研究迫在眉睫,这有助于揭示泥炭地生物对干旱的适应
来源:Protoplasma 2.5
时间:2025-04-05
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根异细胞揭示芸香科植物地下组织中储存假定生物碱的特殊位点
芸香科(Rutaceae)植物是生物碱的丰富来源,但除了芸香(Ruta graveolens)根中含吖啶酮的异细胞外,其地下组织中生物碱在细胞层面的具体定位情况仍相对未知。为弥补这一空白,研究人员进行了广泛的分类抽样,对芸香科植物的微化学特征和根结构展开调查。研究人员利用透射光显微镜和落射荧光显微镜(epifluorescence microscopy),对 7 种不同的芸香科植物进行检测,以确定根异细胞(root idioblasts)是否存在。对于异细胞内含物的微化学分析,研究人员采用尼罗红染色(Nile red staining)和 Dragendorff’s 试验。所有被分析的物种都有
来源:Protoplasma 2.5
时间:2025-04-05
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新型人类真菌病原体南美毛孢子菌(Trichosporon austroamericanum)基因组解析:探索其致病机制与进化奥秘
在微生物的神秘世界里,隐藏着许多对人类健康有潜在威胁的 “小怪兽”。真菌,作为其中的一员,近年来给医学领域带来了不少挑战。新型人类真菌病原体不断涌现,让医生和科研人员应接不暇。南美毛孢子菌(Trichosporon austroamericanum)便是这样一种 “崭露头角” 的真菌,它可引发侵袭性毛孢子菌病,从轻微的浅表感染到严重的全身性侵袭,给患者的健康带来极大危害。在发现南美毛孢子菌之前,侵袭性真菌病的病原体研究主要集中在一些常见菌种上,对这种新兴病原体的了解少之又少。其独特的致病机制、与其他真菌的亲缘关系,以及在不同环境下的生存策略,都是亟待解开的谜团。如果不能深入了解这些问题,就难以
来源:Mycopathologia 3.6
时间:2025-04-05