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旅美学者郭培宣phi29 DNA packaging motor获7百万美元资助
生物通报道:一支国际性跨学科研究小组所率领的一美国国家纳米发展中心,最近从美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)获得7百万美元资助,致力于研究nanomotors在诊治癌症、AIDS、乙肝和流感等疾病中的作用。第一步研究计划是利用nanomotors包装、呈递治疗用的DNA和RNA到达患病细胞。中心主席、分子病毒学教授郭培宣(Peixuan Guo)评价说这就有可能引发一场医疗改革,但是面临许多挑战。 “纳米医药,作为纳米技术的一个分支,涉及到工程学、生物学、化学、数学、计算机技术和物理学等众多领域,”郭说,“NIH中心将这些科学家组织起来,
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测量病毒质量的新设备
生物通报道:病毒是地球上最简单的生命形式,只有DNA/RNA和蛋白质外壳。为了更好地了解这些各式各样的微小有机体的结构和特征,需要确定它们的质量,以及在特定群落中的变化情况。台湾研究人员最近利用非常精妙的离子化技术和其自主研发的小型化离子阱(ion trap)设备,可以准确分析出一个完整病毒的质量。先前测定病毒质量的方法,误差范围在±15%,对于质量差异微小的病毒来说精确性太低。常涣成(Huan-Cheng Chang,音译)率领的研究小组设计了一种提高精确度的新方法。为了测定病毒质量,首先要对其进行气态化,添加电荷,使其在电场中做加速运动。然而,这种过程不可避免地破坏病毒的完整性。因此,研究
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DNA-蛋白相互作用时,DNA并非完全被动
生物通报道:我们体内细胞众多的基因中,只有那些表达的基因使我们成为现在这个样子。特定的蛋白通过结合DNA上的关键位点——包含遗传信息的核酸,调节基因表达。这些蛋白是怎样识别特定结合位点的?蛋白结构和DNA结构的改变,有时是结合位点内的DNA纽结或急剧弯曲,使得DNA-蛋白紧密结合。研究人员认为DNA在这种遗传相互作用中是被动的一方。但是由伊利诺斯州大学生物物理学副教授Anjum Ansari发现,DNA并不是所想象的完全被动的。为了对蛋白-DNA结合时发生的结构变化进行实时检测,Ansari及其同事利用一种细菌来源的检测蛋白,和持续一百亿分之一秒的激光脉冲加热、搅乱蛋白-DNA复合物,观察结合
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Wistar 研究所博士眼中的RNA研究进程
生物通报道:传统观点认为DNA和基因控制生命活动,基因组统治着整个生命。但越来越多的实验结果显示,许多RNA也可以与基因相互作用指导基因组。比如,由不编码蛋白的DNA转录得到的RNA,在基因表达过程中扮演重要角色。这种RNA被称为非编码RNA (non-coding RNA),意思是尽管它们具有生物学活性,但是不携带编码蛋白的指令。由于非编码RNA在胚胎发育、细胞和组织分化、癌症形成过程中具有重要作用,因此研究非编码RNA具有意义深远。最近,Wistar 研究所Gene Expression and Regulation Program教授Kazuko Nishikura博士,在12月《Nat
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第三军医大学等发表《自然》子刊文章
生物通报道:来自美国La Jolla过敏与免疫研究所(La Jolla Institute for Allergy and Immunology,LIAI)分子免疫学,以及来自中国重庆第三军医大学基础医学部全军免疫学研究所(Institute of Immunology PLA)的研究人员发现了极光激酶(kinases aurora)B和mTOR在T淋巴细胞的G1期-S期细胞周期中的调控作用,这对于了解进一步激酶系统在细胞周期中,信号传导中的作用有重要意义。这一研究成果公布在11月26日《Nature-Immunology》杂志上。这一文章的第一作者为来自第三军医大学的宋建勋博士。原文摘要:P
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南京大学校友谢新凯《化学和生物学》杂志文章
生物通报道:在2006年11月的《化学和生物学》杂志上刊登了加州大学洛杉矶分校的唐毅(Yi Tang)教授研究组发表的一篇有关降血脂药物洛伐他汀( lovastatin )类似物生物合成研究的新文章。该文章的第一作者是华人研究生谢新凯(Xinkai Xie),他在南京大学获得学士学位并于2005年在南京大学获得硕士学位。 天然产物lovastatin和它的半合成物——更有效的衍生物simvastatin都是治疗血胆脂醇过多症的重要药物。在这项研究中,研究人员报道了lovastatin生物合成途径中的一种酰基转移酶LovD的生化特征。 他们证实,LovD对酰
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《自然》《科学》三篇文章聚焦癌症研究
生物通综合:11月30日出版的《Nature》杂志和12月1日出版的《Science》杂志的有三篇文章聚焦到了近期癌症相关的前沿研究。原文摘要:Science 1 December 2006:Vol. 314. no. 5804, pp. 1467 - 1470DOI: 10.1126/science.1130471Prevention of Brca1-Mediated Mammary Tumorigenesis in Mice by a Progesterone Antagonist [Abstract]Nature 444, 633-637 (30 November 2006) |doi
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《科学》:三世界顶级研究所联合阐明伤寒进化史
生物通报道:在一项刊登在2006年11月24日的《科学》杂志上的研究中,来自世界顶级研究机构——德国马克思-普朗克学会、英国Wellcome Trust研究所和法国巴斯德研究所阐明了伤寒沙门氏菌(Salmonella typhi)的进化史。 伤寒菌能导致伤寒症,每年导致全世界2100万人生病并且杀死200000人。在我国古代,伤寒就曾经引发大范围的瘟疫。我国古代的医圣张仲景也是因治疗伤寒而闻名。 这项由世界三大权威研究机构联合进行的研究表明,无症状的携带者在伤寒菌的进化和全球传播中起到关键作用。这种携带状态重要性的重新发现预示包括疫苗接种在内的着急性疾
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Nature子刊:翻译因子可引起转录因子复合体降解(图)
生物通报道:果蝇胚胎发育过程中,翻译因子(translation factor)eIF4A通过诱导有活性的Smad转录因子复合体降解,调节decapentaplagic(Dpp)途径。decapentaplagic(Dpp)为转化生长因子-β(transforming growth factor-β ,TGF-β)家族成员,在果蝇胚胎形成过程中启动背部化(dorsalization)等一些形态形成过程(morphogenic processes)。Dpp结合TGF-β-type受体Ttv后,导致Smad家族成员Mad的磷酸化,然后磷酸化的Mad向核内迁移,调节基因转录过程。泛素连接酶(ubiq
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改造后的血清蛋白可将水分解为氢和氧
生物通报道:早稻田大学(Waseda University)Tsuchida博士 和Komatsu博士,与伦敦大学帝国学院(Imperial College London)的同事联手,将两种血液中常见的分子结合为一种分子复核物,可以利用太阳光能,将水分解为氢和氧。这是对于传统造氢的电极法的很好替代,而且这种技术将来也可能被应用于新型的制造氢替代能源的方法。具体细节刊登于12月1日《Journal of the American Chemical Society》。血清白蛋白是血清中最上层的成分。自然状态下,卟啉分子经常与金属结合,血液中的卟啉中心结合有一个铁原子。研究人员将卟啉分子中的铁原子更
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2.0版本IMG已向公众开放
生物通报道:日前,美国能源部Joint 基因组研究所(Joint Genome Institute ,DOE JGI)向公众开放了2.0版本的IMG(Integrated Microbial Genomes,综合微生物基因组)数据管理系统。IMG 2.0的内容全部更新,并根据最新版本的NCBI参考序列库(Reference Sequence , RefSeq)给出的基因组信息进行增容。IMG2.0的新面貌:1 增加了1541种新公布的微生物、病毒和真菌基因组,使得基因组总数达到2301种(细菌595,archaea l32,真核基因组13,病毒1661)其中2058种已经完成测序,另外243种
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Springer新杂志《Genomic Medicine》
生物通报道:2007年,Springer将于推出新杂志《Genomic Medicine》,为人类和医学基因组学(medical genomics)相关报告和发现提供一个论坛。这种有专业同行审评的杂志覆盖面广泛,反应基因组学领域的快速进步。新杂志的面世,增强了Springer不断发展的生物医学科学出版能力。《Genomic Medicine》包括原稿、学术论文、已经被证实的和对今后临床医学和公众健康可能有重要意义的基因组学领域的新发现,重点关注基因组学在复杂医学疾病、常见癌症、精神疾病和传染病等疾病以及药物研发等方面的应用,当然还包括一些介绍医学基因组学在公众健康、医学教育、伦理、法律和社会等
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各大媒体生命科学新闻纵览
科技日报:欧洲细菌系统生物学计划正式启动 新华社巴黎12月1日电 由欧盟资助、法国国家农艺学研究所牵头的“欧洲细菌系统生物学计划”1日正式启动。来自法国、德国、英国、西班牙等欧洲国家的15个研究所和澳大利亚的纽卡斯尔大学将参与这项历时4年、耗资1200万欧元的挑战性研究计划。 该计划总协调人努瓦罗在此间举行的启动仪式上指出,细菌系统生物学研究涉及多个学科,耗资巨大,这是欧澳多家机构首次联手向这一领域发起挑战。 法国国家农艺学研究所的专家介绍说,实施该计划的第一步是集中力量以枯草芽孢杆菌为研究对象,解析在不同条件下这种细菌所有基
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中科院华南植物园发表《科学》文章
生物通报道:来自中科院华南植物研究所(South China Botanical Garden),以及美国国际科学应用公司(SAIC)的研究人员就老龄林(old growth forest,或称熟林,原始林)对环境碳含量的影响这一生态学问题提出了不用于传统观点的新见解,为研究生态碳循环过程提供了重要的新思路。这一研究报告以“Brevia”的形式发表的新出版(12月1日)《Science》杂志上。这一研究的第一作者和通讯作者是来自中国科学院华南植物园生态系统生态学研究方向首席科学家周国逸博士,参予研究的还有刘曙光博士及生态系统管理研究组首席研究员莫江明博士等。原文摘要:Science 1 Dec
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林咏峰《PNAS》文章揭开细菌未解之谜
生物通综合:来自美国密西根韦纳州立大学(Wayne State University)医学院生物化学和分子生物学系,以及杜伦大学(Durham University)生物及生物医学系的研究人员找到细菌内一种能够携带三价砷的蛋白ArsD,这是有史以来首度在原核的细菌中找到金属伴侣蛋白(metallochaperone),ArsD本身能够与三价砷结合,并且携带三价砷送至ArsA蛋白(ArsAB pump的次单元)帮助蛋白折叠使ArsAB形成特殊的帮浦立体结构,进而排出除体内的砷。这一研究成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。领导这一研究的是来自韦纳州立大学的Dr. Barry Ros
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发现干细胞分化的又一新基因
生物通报道:Baylor研究所的研究人员Brendan Lee在发表在近期的《美国科学院院刊》杂志上的一篇文章中指出,当一个关键基因抑制另一条途径时,骨胳的祖细胞可以分化成软骨细胞。 骨胳是由骨头和软骨制成的,这两者都是由相同的多功性干细胞分化而成的。相同的干细胞会分化成骨头、软骨、脂肪和成纤维细胞。但是目前研究人员要解决的最大的问题是,到底是什么基因让干细胞走了其中一条分化路径?已经知道,SOX9 和RUNX2 是参与骨头和软骨分化过程的主要转录因子。蛋白质SOX9会指导骨胳祖细胞形成软骨,而另一种蛋白质RUNX2,则会指导这种干细胞分化成骨头。研究人员在进行了小鼠和人类细胞的研究后发现,S
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本期《自然》《科学》精选
生物通综合;11月30日《Nature》封面故事:中心体组装方式的实验观测中心体是杆状的细胞器,对多数真核生物和动物细胞中的复制至关重要,它们有一个9-重的对称结构和一个谜一样的复制模式。虽然科学家对成熟中心体的结构进行了广泛研究,但对它们是怎样组装的却知之甚少;尽管很多中心体蛋白已经被识别出来,但它们的功能却很模糊。现在,研究人员利用电子断层扫描方法对线虫中中心体的组装进行了超微结构跟踪分析。组装是从一个中心管的形成开始的,通过该管的伸长向前进行,以微管单体组装进该中心管中结束。研究人员还提出了中心体复制的一个路径,在该路径中SPD-2, ZYG-1 和SAS蛋白是依次发挥作用的。这些蛋白中
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糖尿病治疗的新途径
生物通报道:糖尿病是一种常见、复杂的疾病,主要分为I型糖尿病和II型糖尿病。尽管目前市面上有许多治疗糖尿病的药物,但是由于已知的糖尿病相关蛋白质非常少,因而靶向这种糖尿病相关蛋白的药物就更少见。研究人员认为,由于糖尿病有许多起因,所以瞄准几种不同的蛋白质可能是最有效的治疗方法。纽约大学和Scripps 研究所的研究人员发现了一种叫做GAPDH的酶与糖尿病有关,该酶负责调控胰岛素途径。这一发现提供了一个新的糖尿病治疗方向。这项研究的发现发表在最新一期的Nature Chemical Biology中。 医学界之前并不知道GAPDH酶与糖尿病的发展有关。在这项研究中,研究人员还发现抑制GAPDH会
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摆动理论能解释生物学秘密
生物通报道:发表在2006年12月的BioScience上的一篇文章指出,对摆动(oscillating)的生物群体之间的相互作用进行新的数学研究可以为解决生态学中一些最棘手的难题提供重要线索。这篇由密歇根大学的John Vandermeer撰写的文章阐述了已有的理论的拓展如何同步揭示出许多动物和植物群体的摆动,因为它们作为捕食者和被捕食的相互作用。这种同步性能够产生深远影响。Vandermeer认为,几种水生生态系统中几种被低估了多样性的浮游生物能够利用这种方法给予解释。物理学家知道,即使是摆动系统之间的一个弱的偶联也能产生同步的摆动,即一种在17世纪由荷兰数学家Christiaan Huy
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本期CELL封面:诺贝尔奖获得者揭开RNA聚合酶高保真之谜
生物通报道:上个月,斯坦福大学Roger Kornberg因揭示真核转录的分子基础,独得今年诺贝尔化学奖。真核转录主要是指酶指导真核细胞的遗传信息从DNA转录到RNA,再转移到细胞质翻译蛋白质的过程。最近,Kornberg及其同事在12月1日Cell杂志发表文章,对真核转录尚无人知的另一个问题:“聚合酶Ⅱ(polymerase II )是怎样区分不同的核糖核酸单体,保证转录过程的精确性的?”进行了阐释。 研究人员发现聚合酶II中一个叫做trigger loop的部分,作用如同暗门(trap door),在与模板匹配的三磷酸腺苷(nucleoside triphosphate,NTP)下活动,关