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华大9位科学家入选2019年度“高被引科学家”名单
2019年11月19日，路透社旗下科睿唯安学术研究事业部公布了2019年度“高被引科学家”名单。全球近60个国家的6216人次来自各领域的高被引科学家入榜，其中，凭借在生命科学领域的前沿性研究成果，华大共有9名科学家入选该榜单。入选“高被引科学家”名单，要求名单中的自然科学家和社会科学家均发表了多篇高被引论文， 其被引频次位于同学科前1%，彰显了他们在同行之中的重要学术影响力。2019年度“高被引科学家”名单中，美国高被引科学家数量依旧领先，共计2737人次入选。中国内地取代英国成为第二大“高被引科学家”所在地区，共有636位科学家上榜，而2018年这一数字为482人次。2018年，华大有汪建
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汤富酬研究组与付卫研究组合作揭示家族性腺瘤性息肉病的发病机制
结直肠癌在全球范围内是发病率第三、致死人数第四的恶性肿瘤(Beattie et al., 2005)(Carey, 2017; Church, 2016)。结直肠腺瘤是结直肠癌的癌前病变，根据组织学形态可以分为低级别腺瘤和高级别腺瘤，从低级别腺瘤到腺癌的序列发生需要10年以上时间。因此，深入解析低级别腺瘤向腺癌转化的分子机制对于结直肠癌的预防、早筛和治疗都有重要意义。家族性腺瘤性息肉病（Familial adenomatous polyposis, FAP)约占全部结直肠癌的1%，FAP的遗传与APC抑癌基因密切相关，APC基因的胚系突变启动了大肠癌沿正常粘膜—低级别腺瘤—高级别腺瘤—癌的多阶
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结构蛋白与天然无规蛋白的分子力场研究方向取得重要进展
蛋白质是生命的物质基础，蛋白质有结构蛋白和天然无规蛋白两种类别。天然无规蛋白是一类在生理条件下没有稳定三级结构的蛋白质，这类蛋白在真核生物蛋白质组中的含量超过40%，与肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病以及糖尿病等复杂疾病的发生发展密切相关。结构蛋白的序列结构功能范式已经被大家广泛接受，但天然无规蛋白的序列无规功能范式迫切需要建立。与结构蛋白相比，天然无规蛋白构象多样性等特点导致难以用X-ray、NMR等传统实验方法来研究。分子动力学模拟是研究天然无规蛋白的序列无规功能范式的重要方法，分子力场是分子动力学模拟的基础，但现有的分子力场尚不能同时模拟结构蛋白与天然无规蛋白。因而，依赖于高性能计算的分
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Brain：GRIN2D基因突变与儿童癫痫脑病的机制研究
发育性癫痫病是一组临床常见的儿童难治性癫痫综合征，其病因复杂、表型多变、治疗困难，预后较差，目前已发现数十种基因突变与该病相关。北京大学第一医院姜玉武教授团队与美国Emory大学医学院Hongjie Yuan/Stephen F. Traynelis教授团队联合在BRAIN (IF=11.814) 期刊发表了题为“Heterogeneous clinical and functional features of GRIN2D-related developmental and epileptic encephalopathy”的Original Article文章。本文是继2016年首次发现G
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曹雪涛团队再发Nature子刊论文：揭示新型非编码RNA调控网络
先天性免疫反应可保护宿主免受病原体感染，并向病原体施加进化压力，以减弱这些反应并确保其存活和复制的策略。这些不断变化的压力导致了跨宿主-病原体相互作用的先天性免疫稳态的复杂机制，但尚未得到全面了解。尤其是，更好地了解控制宿主与病原体相互作用并促进入侵病原体清除或逃逸的调节剂，可以确定传染病和慢性炎症的治疗靶标。非编码RNA（ncRNA）调节各种先天和适应性免疫过程。 MicroRNA（miRNA）是研究最深入的ncRNA，通常在免疫反应中充当基因表达的转录后调节剂，而长链非编码RNA（lncRNA）已成为各种生理学中基因表达的其他关键调节因子。 lncRNA通过多种机制调节免疫反应和炎症中的信
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遗传发育所韩方普研究组在植物着丝粒研究取得进展
植物着丝粒结构非常复杂，含有大量重复序列。非常难以进行着丝粒区的测序及其功能解析。着丝粒区的组蛋白发生变异，部分H3组蛋白被H3变异体（植物中称为CENH3，人类中称为CENPA）替代，CENH3也是着丝粒区的功能分子标记。植物着丝粒区的组蛋白H3核小体部分被CENH3核小体取代，但在有丝分裂前期及早中期染色体上，着丝粒区的CENH3核小体与H3核小体是混合在一起，没有区域或是位置的专化性。但染色体进入中期准备开始完成取向分向两极时，着丝粒区内侧（inner centromere）是H3T3核小体形成的区域；而外侧是以CENH3核小体分布为主，这可能是和spindle的正确连接及功能动粒形成密
来源：中科院遗传与发育研究所
时间：2019-11-20
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中科院学者NAR发文：开发单细胞空间转录组数据分析可视化平台
单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年《Science》杂志评选的十大科学突破之首。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息，而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相互作用以及细胞所处的微环境，将成为发育生物学、神经生物学、免疫生物学、肿瘤微环境等领域的研究利器。2019年11月12日，Nucleic Acids Research在线发表了中科院生物物理所高通量
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PNAS发表胃肠道间质瘤恶性进展新机制，华大测序平台助力发文
胃肠道间质瘤恶性进展发现了新机制！该研究由中国科学院上海营养与健康研究所-长征医院联合转化医学中心王跃祥研究员带领研究团队庞裕智、谢飞飞等完成，研究成果于北京时间2019年10月22日在国际学术期刊《PNAS》在线发表。其中，全外显子测序和转录组都由华大完成（转录组测序由BGISEQ平台独立完成）。文章标题：《Mutational inactivation of mTORC1 repressor gene DEPDC5 in human gastrointestinal stromal tumors》期刊名称：《PNAS》研究单位：中国科学院上海营养与健康研究所-长征医院联合转化医学中心、上海
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华中科技大学Nature子刊取得肿瘤免疫治疗活化研究新进展
近年来，以CTLA-4 、PD-1/PD-L1通路为代表的免疫检查点抑制剂和CAR-T 的成功，让免疫治疗真正登上了肿瘤治疗的舞台。免疫检查点阻断（ICB）疗法已成为肿瘤治疗的一种重要方法，但对免疫细胞浸润数量不足的“冷肿瘤”效果不佳。将“冷肿瘤”转化为“热肿瘤”的治疗策略是当前ICB疗法研究的前沿热点。原位微温光热治疗（MPTT）则是一把双刃剑，虽然可以有效激活机体免疫，但同时也会上调肿瘤微环境中PD-L1的水平，使肿瘤产生免疫抑制，促进肿瘤生长。华中科技大学生命学院罗亮教授课题组发表了题为“Mild-photothermal therapy potentiates anti-PD-L1 t
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Cell Death Differ ：微管靶向药物引起程序性细胞死亡的分子机制
国际学术期刊Cell Death and Differentiation在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）孙丽明研究组的最新合作研究成果“Membrane-bound TNF mediates microtubule-targeting chemotherapeutics-induced cancer cytolysis via juxtacrine inter-cancer-cell death signaling”。该研究揭示了MTAs通过膜定位TNF引起相邻细胞发生程序性细胞死亡的分子机制，为肿瘤治疗提供了新的策略。 微管靶向药物（mic
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中国抗癌新药在美国获批上市 系本土自主研发
中新网客户端北京11月15日电(记者 张尼)日前，美国食品药品监督管理局(FDA)宣布，创新药企业百济神州自主研发的抗癌新药“泽布替尼”，以“突破性疗法”的身份，“优先审评”获准上市。“泽布替尼”预计在未来几周内在美国进行销售，该药成为第一个在美国获批上市的中国本土自主研发抗癌新药。据百济神州官网发布的消息，此次获批的“泽布替尼”(英文商品名：BRUKINSA™，通用名：泽布替尼)已获得美国食品药品监督管理局加速批准，用于治疗既往接受过至少一项疗法的成年套细胞淋巴瘤患者。据百济神州高级副总裁、全球药政事物负责人闫小军介绍，“泽布替尼”作为一款布鲁顿氏酪氨酸激酶(BTK)小分子抑制剂
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北京大学，广州医科大学发表Cell：儿童结肠炎及炎症性肠病的致病机制
2019年11月14日，北京大学白凡研究员团队与广州医科大学附属广州市妇女儿童医疗中心儿科研究所张玉霞研究员，国家临床重点专科儿科消化团队（杨敏、耿岚岚及龚四堂主任医师）合作在《Cell》以长文形式发表了题为“Mucosal profiling of pediatric-onset colitis and IBD reveals common pathogenic and therapeutic pathways”的研究论文，报道了这一儿童疾病研究领域的重大进展。1. 队列特征与单细胞转录组图谱研究团队回顾了2016 ~ 2019年广州医科大学附属广州市妇女儿童医疗中心消化内科招募的306名患
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哈工大张岩教授：超级增强子数据库SEAv.3.0
超级增强子（Super-enhancer，SE）是基因组中大量增强子富集的转录调控区域，能够大幅度地激活基因的表达，且具有较高的组织特异性，在发育、肿瘤等过程中均扮演着重要的角色。哈尔滨工业大学生命科学与技术学院张岩教授课题组近期发表了题为“SEA version 3.0：a comprehensive extension and update of the Super-Enhancer”的文章，开发了最新版本的超级增强子数据库SEAv.3.0（http://sea.edbc.org），集超级增强子查询，下载，可视化，分析于一体的综合平台，提供标准查询、基因组浏览器、个性化分析工具和SEs数据
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许琛琦研究员受邀发表Advances in Immunology综述
中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）许琛琦研究员受邀在Advances in Immunology发表了题为“Ionic protein–lipid interactions at the plasma membrane regulate the structure and function of immunoreceptors”的综述论文，系统总结了膜脂环境下离子型蛋白质-脂质相互作用对免疫受体结构与功能的调控机制。 淋巴细胞是适应性免疫系统的主要功能细胞，其表面表达诸多活化型和抑制型免疫受体。磷脂是细胞膜的主要成分，但其功能不仅限于构成膜脂双层；尤其是
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PNAS最新文章揭示小胶质细胞发育的调控机制
小胶质细胞是脑中固有的免疫细胞，是脑中重要的免疫防线，保护大脑免受病毒细菌的入侵和破坏。小胶质细胞也在大脑的损伤、炎症和神经退行性疾病方面扮演着重要角色。小胶质细胞除了在成年生理病理条件下发挥作用外，还在脑发育的整个阶段都发挥着重要作用。小胶质细胞的这些重要作用与其在胚胎大脑皮层中特定的时空分布有关，但是在神经发生过程中小胶质细胞在脑中是如何发育的，神经干细胞是否会影响小胶质细胞的发育目前还不清楚。中国科学院动物研究所焦建伟研究组通过对不同时期小鼠胚胎大脑进行切片染色观察发现，小胶质细胞在早期胚胎大脑中大量分布于神经干细胞丰富的室管膜区和室管膜下区（VZ/SVZ），而皮层板区域几乎没有分布。同
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华南农大最新文章：新的水稻环境敏感型不育分子机制
两系杂交水稻使用可育条件下的环境敏感型不育系作为保持系和不育条件下的环境敏感型不育系作为不育系，几乎所有的正常水稻都可以作为恢复系，最大限度的利用了杂种优势，当前我国两系杂交水稻种植面积已占杂交水稻种植面积的一半。但是，环境敏感型不育系的育性容易受环境波动的影响，有可能出现自交结实，导致杂交种子纯度不高，从而影响杂交水稻产量。因此，选择不同的环境敏感型不育基因，阐明其分子机制，综合利用这些基因有利于提高两系杂交水稻育种的安全性。环境敏感型不育包括光敏不育、温敏不育和湿敏不育。湿度敏感雄性不育是一类在高湿条件下正常结实，而低湿条件下不结实的不育类型。来自华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国
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NAR：非编码RNA相互作用数据库NPInter v4.0
非编码RNA对生物分子的调控作用，一直是RNA功能研究的前沿。在以往的研究中，非编码RNA被发现可以和蛋白质、RNA以及基因组相互作用，调控复杂生物过程。比如经典的长非编码RNA Xist可以和X染色体相互作用并影响剂量补偿效应。理解非编码RNA和生物分子的相互作用对于研究非编码RNA的功能以及生物分子调控网络的构建是非常重要的。10月31日，Nucleic Acids Research在线发表了中科院生物物理所健康大数据研究中心题目为“NPInter v4.0: An integrated database of ncRNA interactions”的论文，发布了最新版的NPInter（N
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Cell Rep：STING负反馈调节DNA病毒识别受体IFI16分子机制
病毒感染性疾病一直严重危胁着人类的健康与生命安全。研究宿主在抗病毒免疫反应中如何实现精确调控，在有效清除入侵病原的同时，避免过度免疫应答导致的自身免疫病，可以为感染性疾病的预防和治疗提供理论依据。中国医学科学院系统医学研究所马烽课题组一直致力于探讨病毒感染性疾病的免疫应答及精确调节，围绕cGAS和STING这两个识别DNA病毒过程中重要的上游分子，阐明了相关的转录调控及正反馈调控机制。近期，这一研究组发表了题为“STING-mediated IFI16 degradation negatively controls type I interferon production”的文章，发现了STI
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上海交大教授受邀发表综述：细胞代谢与代谢组学未来发展
著名杂志Mass Spectrometry Reviews （2018影响因子为9.068）为纪念主编 Dominic M. Desiderio教授卓越贡献Proteomics, Mass Spectrometry, Neurobiology 等领域30年，推出2019 Honorable Issue，特邀上海交通大学吕海涛研究员结合课题组近年来的代谢组学实践研究和未来创新规划，起草题为：“FUNCTIONAL METABOLOMICS DECIPHER BIOCHEMICAL FUNCTIONS AND ASSOCIATED MECHANISMS UNDERLIE SMALL-MOLECUL
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武大生科院Nature子刊：精细解析亚洲棉基因组转录全景
棉花是一种重要的天然纤维作物，也是研究细胞分化、伸长和细胞壁发育调控的重要模式植物，但缺乏全面、高分辨率的基因图谱，棉花转录组的不完整性阻碍了各种生物过程分子机制的研究。近期，来自武汉大学生命科学学院的研究人员发表了题为“Multi-strategic RNA-seq analysis reveals a high-resolution transcriptional landscape in cotton”的文章，通过多RNA组学策略精细解析了亚洲棉基因组转录全景，这是迄今为止科学家对亚洲棉基因组的复杂转录所进行的最准确的注释。这一研究发现公布在Nature Communications杂志
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