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人类基因组进化新理论
生物通报道:路易斯安那州立大学一个由Mark Batzer领导的研究组揭示出了人类基因组中 一个2500万年的进化过程的详细内容。他们的研究集中在基因组中的可转座因子的起源和传播上,已经知道其中一些可转座因子与一些遗传疾病如血友病有关。研究人员构建了一个能够解释将近一半的人类基因组的起源的理论。他们的发现公布在近期的Genome Research杂志上。Batzer和他的研究组发现一些似乎在很长的一段时间内都处于非活性状态的特殊的DNA序列可能并不是简单地躺在那里不动。相反,研究组发现这些成分通过秘密“繁殖”极度活跃的拷贝,产生了人类基因组中最大量的可转座因子家族Alu因子,并因此在人类进化中
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Science:死亡寄生虫基因组被破译
生物通报道:一项划时代的南北合作研究为研制出治疗或者预防“东海岸热”(East Coast fever)的新方法奠定了基础。这项研究的结果公布在7月1日的Science杂志上。在东部和中部非洲,东海岸热病一年杀死100万头牛,因此这种病对那些以牛为生活和经济支柱的农村地区产生了破坏性的影响。这种热病由一种叫做牛泰勒原虫引起。发表在Science中的文章对这种寄生虫的基因组进行了分析。这项研究由美国和非洲的两个有名的实验室进行为期5年的合作才完成。这两个研究机构分别是马里兰Rockville基因组研究院(TIGR)和肯尼亚内罗毕国际家畜研究院(ILRI)。这种寄生虫基因组分析的完成是迈向开发出一
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六月聚焦:猪之歌
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千万别失灵!细胞死亡的“主控开关”
生物通报道:细胞死亡在正常工作时是一种有益且正常的过程,但是当这种过程失灵时就可能导致癌症的发生。现在,美国德州大学西南医学中心的研究人员发现了一种对细胞死亡早期阶段的控制至关重要的酶。研究人员现在正在检测癌症患者的组织以试图确定这种酶基因的突变与癌症的关系。研究人员认为这种基因将成为研究的一个热点。细胞的生死是一个复杂的反应过程,并且由处于生化“金字塔”顶上的一些分子控制着。这种新发现的酶(研究人员将其命名为Mule)能够破坏这个金字塔顶上的一个关键分子,并因此导致细胞的崩溃。这些发现还意味着找到了一种控制肿瘤形成的新的药物靶标。研究人员之一,德州大学西南医学中心的生化教授、霍华德休斯医学院
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蛋白结构分析进入第二阶段
生物通报道:随着十家研究中心的宣告成立, 美国NIH发起研究发现蛋白广谱3D结构的第二个阶段。这将有助于揭示蛋白结构在健康与疾病中扮演的角色,并且为研究设计新的药物提供途径。 大量研究蛋白质构造远比大量DNA序列测序来得困难的多,因为DNA只是由四个碱基组成而产生的直线序列,而蛋白质则是由二十种氨基酸组成而在立体空间上折叠产生复杂之席状(sheets) 和弯曲(loops) 构造。如果想直接从DNA序列而去预测蛋白质立体构造,即使利用计算机辅助,就算是只是一个最简单的蛋白质,也是一项相当艰难的事。基于蛋白质三度空间立体结构的确定如此不容易,因此自1957年第一个蛋白质myoglobi
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科学家构建出果蝇基因组物理图谱
生物通报道:由Universitat Autònoma de Barcelona的Alfredo Ruiz教授领导的一个国际研究组在6月的Genome Research上公布了果蝇Drosophila buzzatii染色体的第一个详细的物理图谱。这种果蝇在全世界被用作进化遗传学的一个研究模型。这项研究包括两个步骤。首先,研究人员构建了一个基因组库。这个文库包含了超过18000随机被插入细菌细胞中的这种果蝇基因组片段。每个细菌克隆携带这些DNA片段的其中一个(长度大约为150000个核苷),并且能够在实验室中扩增以增加果蝇的DNA。研究人员的第二步是按照这些片段在完整的染色体中的顺序和位置来排
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抗艾滋病毒的新药候选
生物通报道:Göteborg大学Sahlgrenska研究院的研究人员开发出了治疗HIV感染的一种新候选药物。这种叫做alphaHGA的新物质将在今年进行人体测试。到2004年底,大约有4000万人感染了HIV病毒,并且其中的大部分人在南非。每年,大约有300万人死于这种感染,其中很多都是年轻人。尽管人们已经进行了大量的研究,但是却一直没有成功研制出一种HIV疫苗。但是却有一些药物被用于治疗感染HIV的个体。这些药物虽然不能至于感染个体,但是却能够缓解这种病的恶化。目前大约有20种商业化的药物用于这种疾病的治疗,但是这种并对却能产生抗性并且这些药物会产生副作用,因此现在急需研制出新的
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“编写遗传密码子”公司开张
生物通报道:一家新型的打算以发展合成生物学业务的公司于6月29号正式营业。合成基因组学公司(Synthetic Genomics Inc.)打算利用一个固定了的模式让改造过的细胞作为生物因素去执行特定的功能。这些特定功能现在暂时指生产乙醇和氢。现在我们已经拥有许多基因组序列数据库,公司想利用这些数据去设计、建立新的生物体,并测试看一下合成的生物体是否有预期的目标进行生产。 J. Craig Venter博士是这家公司的主席与首席执行官,他称:“DNA的高通量测序与合成以及计算机运算能力和生物信息学的高速发展使合成新型的光合作用、其它代谢途径成为可能。从这300个已测的全基因组中,我们
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猪体细胞核抑制重构胚的体外发育
生物通报道:在第五届国际转基因动物学术研讨会上,来自上海市农业科学院畜牧兽医研究所、上海市农业遗传育种重点实验室和上海第二医科大学的研究人员公布了他们合作进行的有关猪克隆研究的进展(论文的作者为张德福、王英、陈茵等)。 研究人员以卵丘细胞为核供体细胞组成重构胚,卵裂率达到56.7%,发育至桑椹胚达11.7%、囊胚率为6.7%,显著高于成纤维细胞重构胚。他们还研究了卵母细胞的采集方法、激活程序和卵龄对卵丘细胞核移植重构胚体外发育的影响。以血清饥饿法将卵丘细胞诱导至G0/G1期,抽吸法/解剖法采集卵母细胞,体外培养33/44h,将卵丘细胞放至去核卵母细胞的卵周隙中,重构胚以钙离子载体A2
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Nature:红火蚁间的雌雄大战
生物通报道:我们常说孩子集合了父亲的优点和母亲的优点于一身,但是在自然界中这种法则就不一定对了。最近研究人员发现雄性的红火蚁有种特殊的方式把雌性在卵子中的DNA剔除出去,从而使他的孩子完全像他。从这种意义上说,雌、雄火蚁拥有不同的两套遗传体系,更像两个不同的物种。这项研究结果发表在最近的Nature杂志上。 红火蚁属于昆虫纲膜翅目蚁科家蚁亚科火蚁属,是高度分化的社会性昆虫,常见工蚁大小约3-6mm,红褐色,形状与家里常见的小黄家蚁相似,但比小黄家蚁大。红火蚁螫叮人后会产生火灼伤般疼痛感,可出现红肿、白色的小脓泡,少数可引起继发性感染,极个别会出现过敏反应。前一排广东因为在进口货物海关
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抗真菌药物都能治疗癌症?
生物通报道:最近,一项国际性研究的结果表明一种已经有40年使用历史的皮肤真菌治疗药物可能成为一种癌症治疗药物。加州大学生化和药理学教授Leslie Wilson指出这种抗真菌药物——灰黄霉素(griseofulvin)被证明能够抑制实验室中的癌细胞的生长。这些研究结果公布在6月29日的PNAS(Proceedings of the National Academy of Sciences)的网络版上。这项研究由加州大学Wilson实验室和孟买印度理工学院的生物学和生物工程学校的一个实验室合作进行。这种药物的副作用非常小,并且能够使用较长的时间。Griseofulvin是一种口服药物,几十年来一
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启动子定位,人类基因组计划V2.0?
生物通报道:美国加州大学圣地亚哥分校、Branch of the Ludwig癌症研究所和NimbleGen System的研究人员开发出一种确定人类基因中数千调节序列的有效方法。这项研究的内容公布在6月29日的Nature杂志上。基因根据它们产生的功能性产物的能力来定义。因此,控制基因产物制造时间的DNA序列——启动子是区别基因与“垃圾DNA”的关键成分。利用NimbleGen的一整套DNA芯片,这个研究组能够跟踪与每个基因的启动子结合的关键蛋白质,并因此确定出了10567个启动子,而且其中的6091个是先前未知的。LICR的Bing Ren博士指出,尽管研究人员已经发现了人类基因组中的大多
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DNA生物科学公司提供种族化验服务!
生物通报道:DNA Bioscience是一家专业的DNA检测公司。今天,这个公司宣布将提供它的种族划分检测服务。DNA Bioscience是应着1989年的Children Act的号召发展起来的,这个儿童行动号召收养孩子的家庭应该与所收养的孩子的种族血统尽可能接近。DNA Bioscience是英国唯一一家提供AncestryByDNA检测的公司。AncestryByDNA是DNA检测的一种先进的自动化检测,它能根据一个简单的口腔液体揭示出一个人的完整的生物地域祖先。在不知道一个家族的任何历史的情况下,化验人员能够利用一个口腔液体来揭示出他们的欧洲、非洲和亚洲血统比例。这一点对想收养孩子
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P53肿瘤抑制基因调节理论被质疑!
生物通报道:P53肿瘤抑制基因是细胞分子信号级联指导发生致死性DNA损伤的细胞进行自我毁灭的关键。如果p53基因失活(一如在一半以上的人类癌症中见到的那样),细胞生长的检测和平衡都会无法进行,并且体细胞开始积累突变以至于最终导致癌症的发生。虽然这种基因的调节已经研究的比较多,但是大部分研究都是在组织培养或离体模型中进行的。Salk生物研究所的研究人员创造出的一个新小鼠模型显示研究人员从离体研究获得的有关p53活性调节的信息可能不适用于生活着的、呼吸着的生物体。这项研究的结果公布在Proceedings of the National Academy of Sciences杂志上。到目前为止,研
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对付癌症,病毒站在我们这边
生物通报道:提起病毒总让我们咬牙切齿,许多病毒如:艾滋病病毒、埃博拉病毒、冠状病毒都让大家闻风丧胆。但是这次病毒站在我们这边,它帮助我们消灭恶性肿瘤细胞。加拿大Oncolytics Biotech Inc.研发的药物Reolysin?利用的就是这种原理。Reolysin中含有理奥病毒(reovirus,又称呼肠孤病毒),它在被激活Ras路径的恶性肿瘤细胞中可以复制,从而破坏恶性肿瘤,但是在正常的细胞中并无明显毒害作用。Reolysin已经在加拿大、美国、英国进入了临床实验,治疗包括恶性神经胶质瘤、胰腺癌、前列腺癌等各种通过Ras路径激活的癌症。近期,它将会在纽约的Montefiore医疗中心进
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疫苗使猴子免“发热”
生物通报道:美国和加拿大的研究人员组成的一个研究组开发出了一种预防拉沙热的疫苗——它能完全地保护非人类灵长类的猴子不受致死剂量的拉沙热病毒的感染。研究最终将导致开发出一种人类使用的疫苗。这项研究的结果公布在PloS Medicine杂志上。拉沙热是发生在西非的一种常见疾病,它导致大量的死亡和瘫痪案例。到目前为止,除了对感染区域的啮齿动物控制外,人类还没有其他能够防止拉沙热扩散的可用的预防性措施。最近,这种疾病被旅行者传入了美国和欧洲。而且这种拉沙热病毒还被认为是一种可能的生物恐怖剂。研究人员利用VSV(vesicular stomatitis virus)病毒的一种非致病性的形式作为载体,将从
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饱和脂肪+遗传特征=糖尿病?
生物通报道:Alberta大学的一些研究人员发现2000万摄入高脂肪饮食或肥胖的加拿大人,如果他们携带常见遗传特征的一种特殊类型时,其发生Ⅱ型糖尿病的风险会增加。这项研究的结果公布在6月28日的Diabetes杂志上。药理学教授Peter Light和研究生Michael Riedel发现饱和的直链脂肪酸是胰腺中一种特殊的钾离子通道的更为有效的活化因子:当这种通道被活化时会减少胰腺的胰岛素分泌并增加血糖水平。这种作用在多态性的钾离子通道中被放大了。有趣的是,看起来多不饱和脂肪酸是这种钾离子通道的很弱的活化因子。研究显示携带有这种特殊的钾离子通道多态性的人如果同时采用高脂肪饮食或肥胖,那么他们会
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让DNA来控制RNA的折叠
生物通报道:伊利诺斯州大学的研究人员最近开发出了一种操控高分子的新方法。这种技术利用双链DNA来指导其他分子的行为。在先前的DNA纳米技术研究中,双链DNA被用作一个静止点阵(static lattice)以构建三维几何物体。在新的研究中,研究人员不是单独操作DNA,而是利用DNA来控制RNA的折叠和最终的结构。最终,他们想要构建出由弯曲的DNA双链控制的超分子机器。研究的结果将公布在Journal of the American Chemical Society上。Silverman和研究生Chandrasekhar Miduturu从一段未折叠的RNA着手研究。通过特殊的化学反应,他们附着
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维生素C只钟爱“运动狂”
生物通报道:如果你是一个极端的滑雪爱好者或登山爱好者,那么增加维生素C的摄入量将对抵御常见的感冒有重要意义。对55项研究的归纳总结表明每天预防性地使用这种维生素基本没有任何作用。 这一发现冲击了许多人的“维生素C添加剂改善免疫系统并抵御疾病”的观点——这一观点因为著名的化学家和诺贝尔获奖者Linus Pauling而在上世纪70年代非常流行。 Palling认为摄入大量的维生素C对身体有益。他指出,与大部分动物不同,人类不能自己制造维生素C。在包括美国在内的许多国家,日常服用维生素C的推荐剂量在60到90毫克。但是,Pauling计算的成人平均每日摄入量应该为1000毫克或
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降低脊髓灰质炎病毒的抗药性
在7月份出版的《自然—遗传学》上,Scott Crowder 和Karla Kirkegaard描述了一种确定抗病毒化学疗法靶标的新方法。通过对药物敏感病毒进行基因工程改造并与其它病毒混合,新方法展示了降低病毒出现抗药性的可能性。 脊髓灰质炎病毒是一种RNA病毒,它是脊髓灰质炎的病原体,病毒侵犯脊髓前角运动神经细胞,导致弛缓性肢体麻痹,多见于儿童,故亦称小儿麻痹症病毒。研究人员对病毒蛋白质中的变异进行了筛选。他们选择出呈显性、能有效抑止没有发生变异的蛋白质活性的变异。将这些拥有显性变异的病毒与具有抗药