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“蛋白质结构计划”进入快速生成阶段
生物通报道:美国的蛋白质结构计划(PSI,Protein Structure Initiative)计划在十年内确定出一万个蛋白质的三维立体结构。随着10个新的研究中心的加入,这个项目也宣告进入了第二阶段。这种结构信息将有助于揭示出蛋白质在健康和疾病中的作用,并且有助于指引出设计新药物的途径。 这些新中心的选择(被选出的中心将会在未来的5年内接收到大约3000万美元的研究经费)标志着研究进入了十年计划的第二个阶段。这项计划主要由NIGMS资助,部分由NIH资助。 PSI于2000年建设自己的“引航”中心时,其目的有两个:开发出新的方法和工具,如能简化和加速产生蛋白质结构步骤
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PNAS:双胞胎如何分道扬镳
生物通报道:双胞胎拥有同一套遗传物质,本来应该长得一摸一样的,而且在小的时候双胞胎的确让人难以区分。但是长大后很多就会明显长得不一样了,这种差异到底是如何来得一直不是十分清楚。最近发表在《美国国家科学学报》(PNAS)的一项研究结果表明在外界影响下基因组在表达水平上的不同导致了双胞胎分道扬镳。 以往人们总是猜测双胞胎的不同是由于外界环境对DNA和镶嵌在DNA里的组蛋白的影响使双胞胎包括外貌、性格都各自不同了。来自西班牙国家癌症中心的Mario F. Fraga和他的同事通过对160名3到74岁的双胞胎进行分析第一次在实验上证实了这点。他们对基因组上的两种修饰作用进行了检测,将双胞胎的
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韩国将建世界首家干细胞治疗医院
韩国His-tostem医疗公司声称,他们计划开设世界上首家专门用从脐带血中提取的干细胞治疗的医院。如今已经与欧洲一家不便透露名称的投资公司接近达成最后协议,将于2007年上半年在韩国南方旅游胜地济州岛开办这一专门医院。该公司介绍说,根据协定,His-tostem公司和欧洲投资者将联合投资8000万美元建立一家拥有100个床位的医院。负责Histostem公司的韩宏(音译)自豪地说:“这将是世界上首家专门用脐带血提取的干细胞对病人进行治疗的医院。”两年多来,韩宏医生一直用干细胞疗法治疗其他方法无法治愈的病人。他和他的研究人员们自2003年7月开始已经实施了250多例干细胞治疗手术,包括脊髓细胞
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DNA扫描让肺癌基因无所遁形
生物通报道:通过使用探测最小的遗传秘密片段的装置,Dana-Farber癌症研究院的研究人员与其他一些研究机构合作发现更大的一些东西:肺癌细胞中的可能与癌症有关的基因所在的染色体部分。这项研究的结果公布在7月1日的Cancer Research上。研究人员利用单核苷酸多态性(SNP)芯片技术来探测基因遗漏或过度扩增的染色体区域,而这些错误常常与癌症有关。在这项研究中SNP芯片被用于寻找肺癌细胞中的基因拷贝错误。在先前的研究中,研究人员证明SNP芯片提供了一种定位细胞染色体中拷贝数变化和确定一对染色体上的基因被错配的时间的独特途径。最新的研究则证明高分辨率的SNP技术有足够的能力确定出肺癌细胞中
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我们有自己的microRNA
生物通报道:6月19号Nature Genetics网络版报道说以色列科学家鉴别出的microRNAs可能是首批灵长类动物特有的microRNA。新鉴别出的89个新microRNA使已经测序的人类microRNA的数量增加了一倍。罗赛塔基因组学协会(Rosetta Genomics in Rehovot)的研究组领导人Isaac Bentweich 表示:“这些灵长类特异的基因簇对于研究生物进化有着重要意义,并且也有重要的诊断和治疗潜景。” 他们认为这些新的microRNAs意味着在人类基因组中还有数以百记的未知microRNA等待发掘。 近年来成为研究最热点之一的microRNAs
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治疗性疫苗:T细胞的繁殖能力是关键
生物通报道:近年来,研究人员对开发治疗性疫苗的兴趣在不断的增长。治疗性疫苗是使用在已经发生了慢性感染的病人身上的疫苗,如HIV或肝炎感染。这些治疗性疫苗的目的是提高免疫系统抵御感染病原的能力。研究人员还在研制能够用于治疗各种癌症的治疗性疫苗。但是许多实验性的疫苗的前景并不看好。现在,Wistar研究院和Emory大学的研究人员提供了有关阻止免疫系统对治疗性疫苗作出有效反应的物质的细节内容。他们的发现揭示出研究人员如何改进治疗性疫苗方法以使免疫系统反应的更好。这项研究公布在7月1日的Journal of Viology上。他们发现发生慢性感染的小鼠的T细胞对这种疫苗的反应很差。 这些T
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玩失踪的癌前病变
生物通报道:宫颈癌是妇女的一种常见癌症,但是宫颈癌前病变在一些妇女中会消失掉而在另外一些妇女中则不会。约翰霍普金斯Kimmel癌肿中心的一项新研究在这个问题上获得了新的发现:这些损伤持续的原因是因为HPV病毒株和妇女的个体免疫系统的一种不稳定的混合。研究的结果公布在7月1日的Clinical Cancer Research上。几十年来,研究人员已经知道HPV导致几乎所有的宫颈癌病例。但事实上,只有少数的癌前病变会发展成成熟的癌症。为了找出原因,Cornelia Trimble博士密切监控了200名患有高级的癌前病变宫颈损伤的妇女(未对异常组织进行切除手术)。一些损伤(约28%)在手术前的一段时
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癌细胞的逃跑新路线
生物通报道:南加州大学Keck医学院的研究人员发现癌细胞可能能够通过活化一种pro-survival蛋白GRP78的细胞压力反应来避过抗血管和抗血管生长药物的破坏作用。这一发现为一些药物无法如预料的那样抵御恶性肿瘤的生长和扩增给出了一种新的解释。这项研究的结果公布在7月1日的Cancer Research杂志上。南加州的研究组与美国癌症研究院和MannKind公司合作研究证明靶向血管形成和维持的抗血管生成药物能够增加一种叫做葡糖调节蛋白78(GRP78)的水平,这种蛋白能够阻止细胞的死亡或凋亡。GRP78由细胞的内质网(ER)合成并主要存在于内质网中。由于抗性的发展,一些原本疗效很好的抗癌药物
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微生物进化让它满脸横纹
生物通报道:最近,EBI的研究人员改变了我们对40亿年的微生物进化的观点。Christos Ouzounis和他的同事对基因家族如何迁移有了新的、定量的认识:这种迁移不但包括由亲代向后代传递的“垂直转移”,而且还包括亲缘关系较远的生物之间的遗传物质的交换即水平转移。这种对生命树的新解将帮助我们更好地了解致病细菌如何能在我们抗击抗生素抗性的战争中处于领先地位。从达尔文时代开始,生物体间的进化关系用一棵树来表示。微生物学家长时间一直认为这种描述并不适用于微生物,因为不同种的微生物经常进行基因的交换。他们认为微生物的进化应该用一个网络来代表。但不幸的是,没有人确切地知道这个网中应该在哪里画下水平线。
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新靶标:让孩子不再“失神”
生物通报道:威克森林大学的一项新研究揭示出了治疗最常见的儿童癫痫病形式的新颖治疗靶标,这种靶标治疗产生的副作用远比传统疗法要小。研究人员将他们的发现公布在7月的Journal of Neurophyiology上。通过动物研究,研究人员对与失神、或者癫痫小发作有关的大脑途径进行了更多的了解,并且检测了一种能够在癫痫扩大化之前靶向一种有潜力的新靶标以阻止癫痫发作的新药。目前的一些药物作用于整个神经系统并会产生许多副作用如失眠、晕眩和增加发育性副作用等。由于这种新的治疗药物能够抑制可能造成癫痫发作扩大化的途径,因此它会更有效并且副作用非常小。失神性癫痫在6到12岁的儿童中最常见。发病时,儿童患者暂
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PNAS:不需要阳光的光合作用
生物通报道:6月号美国国家科学院院刊(PNAS)报道:有些光合细菌也许能在没有太阳光的环境下生长,它们利用的是来自热流的热辐射作为能量来源――温哥华英属哥伦比亚大学(the University of British Columbia)的J. Thomas Beatty所领导的研究小组发现了存在于在离海面一英里的深海火山热泉处的一种特殊的光合绿硫菌(photosynthetic green sulfur bacteria)。印第安纳大学的Carl Bauer表示,“它们在没有太阳光的地方进行光合作用,这真是令人惊讶!”海底火山热泉(Submarine hydrothermal vents),常
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禽流感vs.美元
生物通报道:来自联合国的卫生与家畜方面的专家最近表示,在未来的三年里亚洲要控制好禽流感仍需要一亿美元的资金。联合国的的专家称要帮助疾病正在缓慢传播的越南,帮助中国的农民都吃合格正规的药物,让可以携带H5N1病毒的鸭子都接种疫苗,这些都是需要资金的。 来自世界卫生组织(WHO)、食品农业组织(FAO)和世界动物卫生组织(OIE)的官员从星期一开始在马来西亚举行一个为期两天的会议,会议主要讨论如何阻止病毒在动物与人类之间进行传播。 FAO的主管Joseph Domenech预测亚洲从现在到2008年需要大约一亿美元的资金去控制禽流感病毒,而美国、欧洲、澳大利亚只承诺支援3千万美
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康奈尔大学:失聪人士新福音
生物通报道:来自康奈尔大学的研究人员最近利用一种普通的鱼研究它是如何同时发声和听到外界声音的。这是科学家第一次研究脊椎动物大脑控制肌肉发生系统的部分是如何与听觉部分相互沟通的。这项研究发表在6月22号的神经系统科学杂志上,它揭示了耳朵与大脑听觉、发声系统间的关系,有助于科学家对人类耳聋的机理进行研究。 这项研究中用到的鱼是住在美国加州北部海岸线附近的人都知道的一种平鳍美洲蟾鱼(Plainfin Midshipman),每逢繁殖季节雄鱼就会找一个栖息的水塘,在涨潮的夜晚它能持续一个多小时发出低沉的声音,用音乐来吸引雌鱼。住在海边的人时常会抱怨这种声音,因为它听起来像海底开来了一架高速摩
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MicroRNA研究驱动力,比较功能基因组学
生物通报道:microRNA是近年发现的一大类小的、非编码基因。每种动物都含有数百种这种基因,已经证明它们能够通过与mRNA中特定的互补位点结合来调节蛋白编码基因的表达。但是,到目前为止,人们对这些微小基因的功能还知之甚少。在过去15个月内分别发表在Nature、Nature Genetics、Developmental Biology和PloS computational Biology中的四篇系列文章中,纽约大学比较功能基因组学中心的研究人员已经弄清了一些基因组中的microRNA的功能和进化。他们的最新发现公布在PloS Computational Biology上。通过比较七种近期测序
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Science:细菌蛋白会“走路” !
生物通报道:Science 报道,加利福尼亚州斯坦福大学Dale Kaiser和他的同事已经发现第一例通过直接接触,细菌细胞表面蛋白会“走路”的现象。这一蛋白来自Myxococcus xanthus(粘球菌属之一),可以帮助易变细菌得到稳定突变。 “Myxococcus xanthus基因组测序最近已经完成了,结果表明这种生物有大量的外膜脂蛋白。”Kaiser在《科学家》杂志(The Scientist)中提到,“但仍有一些可传递的蛋白未知。” Myxococcus xanthus是一种棒状的土壤细菌。它可以利用两种机制去移动,第一就是在拖走中,Myxococcus xan
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展望:蛋白激酶组RNA干扰试剂盒
生物通报道:最近美国一家提供世界上最大的保真全长cDNA克隆库而闻名公司OriGene科技公司获得了美国国立卫生研究院(NIH)颁发的小型企业创新研究(Small Business Innovative Research,SBIR)资助一期奖金。资金将用于研发全蛋白激酶组RNA干扰试剂盒。 在真核细胞中,蛋白激酶负责调控细胞内大部分的信号传导。通过对底物的修饰改变它的活性,激酶通过这种方式控制着转录、新陈代谢、细胞移动、细胞增殖、分化和调亡。它们除了在癌症发生中起到重要作用外,在许多人类代谢系统、免疫系统和中枢神经系统的疾病也与它有着千丝万缕的关系。 OriGene公司构建
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斯坦福大学:截肠,保心脏
生物通报道:许多人认为通过手术把肠子截去一段减肥是非常疯狂的事,可是最近斯坦福大学的专家研究表明对于那些医学定义的肥胖者来说这样做可以大大减轻他们心脏的负担,减小患心脏病的几率。6月30号,由Brandon Williams博士领导的研究小组将他们的研究结果发表在美国社会肥胖治疗手术学术年会上。 目前流行的减肥手术有下列3种:内置胃气球(Intragastric Balloon)、胃箍(Gastric Banding / Lap Band)、胃绕道(Gastric Bypass)。胃绕道手术的原理是:减小胃体积,使进食量减小;把长约20英尺小肠割去超过35英寸,由于小肠缩短,吸收面减
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Nature Medicine:为何老化
生物通报道:2002年戛纳电影节有一部集合了11位世界上最有原创力的电影导演各自10分钟以时间为主题的短篇的电影,片名是《十分钟,年华老去》。片名是很浪漫的,可是在现实中,许多人承受着过早地年华老去的痛苦。最近科研人员已经发现了这种过早老化现象的原因,并且希望利用这种让细胞过早老化的机理去消灭癌症细胞。由香港大学Zhou Zhongjun展开的这项研究发表在七月份的Nature Medicine上。 有一些婴儿还在嗷嗷待哺的时候就开始衰老了。这种病称为Hutchinson-Gilford 早衰综合症(Hutchinson-Gilford progeria syndrome,HGPS)
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Cell:原始造血干细胞标记的确定
生物通报道:密歇根大学医学院的研究人员在小鼠的原始造血干细胞上发现了一种生物“条形码”。这种造血干细胞能够产生血液中的不同类型的特化细胞。通过阅读这种条形码,研究人员能够将它的更高级的后代——祖细胞与这些干细胞区分开来。鉴别的秘诀就在于由SLAM基因家族表达的细胞表面受体蛋白的有无。研究人员知道SLAM家族中的10个或11个基因有助于调节淋巴细胞的发育和活化,但是之前没有人知道它们还与造血干细胞有关。研究的结果公布在7月1日的Cell杂志上。目前,研究人员需要寻找一些不同的标记并利用复杂的步骤来分离稀有的造血干细胞(HSCs)。利用SLAM标记则能明显简化这个过程。Kiel和Yilmaz利用芯
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Science:基因的“慢性子”开关
生物通报道:犹他州大学Huntsman癌症研究院的研究人员发现一种被认为只是开启和关闭基因的蛋白质还可能是一种分子“变光器开关”。这项研究的结果公布在7月1日的Science杂志上。研究人员首次证明当一种蛋白分子的特定部分被修饰时,它们就变得在基因的开启和关闭中很重要,但是却是以一种类似变光器开关的方式而不是一个简单的开关工作。基因携带制造生物体所需的蛋白质的密码。这些蛋白的其中一些还有助于控制基因执行其功能的时间和位置。这项新的研究则着重分析了一种叫做Ets-1的这类蛋白开启或者关闭基因的机制。转录因子Ets-1蛋白充当一个细胞的“图书管理员”——帮助找出正确的遗传指令。这个管理员提供的信息