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  • 血红素运输及其整合到细胞色素c中的机制与调控

    近年来,关于细胞色素c(cyt c)生物合成途径的研究取得了显著进展,这为理解其结构和机制提供了新的视角。细胞色素c在所有生命领域中广泛存在,其主要功能是在呼吸和光合作用的电子传递链(ETC)中作为电子载体。这些蛋白质依赖于与之共价结合的血红素,通常通过CXXCH结构域进行连接。在过去的五年中,研究人员揭示了三种主要的细胞色素c生物合成途径(系统I、II和III)的结构基础,其中系统I和II在细菌中发挥重要作用,而系统III则在真核生物的线粒体中存在。这些研究不仅加深了我们对细胞色素c如何在不同生物体中合成的理解,还揭示了其在抗菌药物开发中的潜在应用价值。细胞色素c的生物合成是一个高度协调的过

    来源:Annual Review of Microbiology

    时间:2025-10-31

  • 引言

    这期期刊标志着我与《年度微生物学评论》(Annual Review of Microbiology)合作的转折点:我将在2025年底卸任主编职务,将这份我非常热爱的审稿工作交给副主编安德鲁·古德曼(Andrew Goodman,现任副主编)和吉塞拉·斯托尔茨(Gisela Storz)。至于这样的“导言”专栏是否就此终结——这些专栏曾让我有机会探讨各种科学话题——这将由未来的副主编们来决定。 在我撰写的最初几篇“导言”中,我曾提到读者在翻阅期刊时可能会发现的那些隐藏的宝藏文章,这些文章涉及他们原本认为不需要的知识领域。如今情况依然如此。尽管搜索引擎和人工智能在筛选相关论

    来源:Annual Review of Microbiology

    时间:2025-10-31

  • 人类胰岛素受体mRNA内蕴核糖体进入位点的功能验证与机制探索

    在真核生物中,mRNA的翻译通常依赖于5'端帽子结构识别机制,但在应激条件下某些基因能够通过内部核糖体进入位点(Internal Ribosome Entry Site, IRES)实现非帽依赖的翻译起始。这一机制在病毒基因表达和细胞应激反应中已有深入研究,然而在人类重要受体基因中的存在与否仍存争议。胰岛素受体(Insulin Receptor, IR)作为代谢调控的核心分子,其表达异常与2型糖尿病和多种癌症密切相关。传统理论认为IR表达主要受转录水平调控,但研究人员发现即使在整体翻译抑制的应激状态下,IR蛋白仍能维持一定表达水平,这提示可能存在非经典翻译调控机制。为验证这一假设,Keith

    来源:Nucleic Acids Research

    时间:2025-10-31

  • DNA聚合酶β和λ拓展底物谱:非核苷三磷酸类似物的模板指导掺入研究

    在生命科学的核心领域,DNA的复制与修复是维持遗传信息稳定性的基石。这一过程的执行者——DNA聚合酶,其精确识别和催化标准核苷酸底物的能力早已被熟知。然而,科学探索的脚步从未停歇,一个更深层次的问题随之浮现:这些分子机器能否突破自然界的设定,接纳并利用结构迥异的“非天然”构建单元?这不仅是对酶学极限的挑战,更关乎新型分子工具的开发和对DNA合成机制的根本理解。在DNA损伤修复等关键生物学过程中扮演重要角色的DNA聚合酶β(Pol β)和λ(Pol λ),因其独特的酶学特性,成为解答这一问题的理想模型。传统观点认为,DNA聚合酶对底物具有高度专一性。但Emmanuele Crespan等研究人员

    来源:Nucleic Acids Research

    时间:2025-10-31

  • VPS35突变通过增强LRRK2激酶活性来抑制PINK1/parkin介导的线粒体自噬

    摘要 VPS35基因中的p.D620N突变通过目前尚不完全清楚的机制导致常染色体显性帕金森病。PINK1和parkin这两种蛋白质在常染色体隐性帕金森病中功能丧失,它们共同参与线粒体自噬过程,这是一种选择性清除受损线粒体的质量控制途径。然而,LRRK2突变会破坏由PINK1/parkin介导的线粒体自噬,而LRRK2突变正是最常见的常染色体显性帕金森病致病原因。 在本研究中,我们探讨了p.D620N VPS35突变是否会对PINK1/parkin介导的线粒体自噬产生影响。我们发现了一个由p.D620N VPS3

    来源:Brain

    时间:2025-10-31

  • QSProteome:社区驱动的蛋白质复合体结构预测与评估平台推动蛋白质组规模结构生物学发展

    在结构生物学领域,AlphaFold和ColabFold等人工智能工具的突破性进展,使得蛋白质三维结构预测的准确性达到了接近实验水平的程度。特别是AlphaFold-Multimer扩展版本的出现,让研究人员能够以前所未有的规模预测蛋白质复合体的四级结构。然而,这些预测模型通常以静态坐标文件的形式散落在补充数据或孤立存储库中,缺乏统一的注释、验证指标和生物学背景信息,严重限制了它们的科学价值和应用潜力。现有的数据库如AlphaFoldDB主要关注单体蛋白质结构,对寡聚化复合体的支持有限;而ModelArchive虽然提供计算模型的存档功能,但交互性和生物学背景整合不足。更关键的是,预测得到的蛋

    来源:Nucleic Acids Research

    时间:2025-10-31

  • 利用祖先重组图研究奠基者群体中罕见变异的历史

    摘要基因谱系代表了样本的共同祖先,通常以祖先重组图(ARGs)的形式进行编码。最近,已经可以从测序或基因分型数据中推断出这些基因谱系,并将其应用于许多进化和统计遗传学研究。在这里,我们使用了ARG推断软件ARG-needle和系谱推断软件ISGen来推断和追踪奠基人群中疾病变异的传播情况,其中长共享单倍型有助于准确确定亲缘关系的时间。我们将这些方法应用于魁北克人群,该人群经历了多次奠基事件,导致致病变异在地区间的分布不均,并且通过BALSAC项目可以获得详尽的人口系谱信息。我们使用萨格奈-拉克-圣让地区的九个奠基突变来验证这种方法,证明了其在突变年龄、变异推断和区域频率估计方面的高准确性。我们

    来源:AJHG

    时间:2025-10-31

  • BRCA1-、BRCA2-和PALB2相关的范可尼贫血:扩展疾病表型特征的潜力以及预测杂合子患乳腺癌风险的可能性

    摘要隐性范可尼贫血(Fanconi anemia, FA)表型用于将BRCA1(FANCS)、BRCA2(FANCD1)和PALB2(FANCN)变异体与显性遗传性乳腺癌-卵巢癌综合征进行分类。我们通过研究携带双等位基因BRCA1、BRCA2或PALB2致病变异体的个体的表型特征,并探讨癌症表现与基于变异分子特征的等位基因严重程度评分之间的关系,来评估其实用性。我们使用包含158个人类表型本体(Human Phenotype Ontology, HPO)术语的数据收集工具,记录了来自已发表文献和/或前瞻性收集的FA患者的临床特征(总人数n = 172,其中43例之前未发表)。对不同的FA相关变

    来源:AJHG

    时间:2025-10-31

  • 前列腺癌原位自体疫苗接种:瘤内注射病毒模拟物poly-ICLC重塑“冷肿瘤”微环境

    前列腺癌是男性常见的恶性肿瘤,对于高危局部前列腺癌患者,根治性前列腺切除术(RP)后仍有较高复发风险。传统免疫疗法在前列腺癌中疗效有限,主要因其肿瘤微环境(TME)呈现“冷肿瘤”特征:T细胞浸润不足、肿瘤突变负荷低、免疫抑制性细胞富集。如何将“冷肿瘤”转化为“热肿瘤”成为免疫治疗突破的关键。为此,Sujit S. Nair团队在《Med》发表了首个前列腺癌瘤内免疫治疗临床试验结果,探索了病毒模拟物poly-ICLC(Hiltonol®)通过序贯瘤内(i.t.)和肌肉(i.m.)注射作为新辅助治疗的可行性。研究通过多组学分析证实,poly-ICLC能够激活先天与适应性免疫系统,诱导三级淋巴结构(

    来源:Med

    时间:2025-10-31

  • 中低收入国家社会接触模式对传染病传播的影响:一项四国人群研究

    在全球范围内,传染病几乎占儿童死亡总数的半壁江山,而这一负担主要集中在中低收入国家(LMIC)。人与人之间的接触互动是呼吸道和肠道病原体传播的重要桥梁,然而由于社会文化规范的差异,不同国家的接触模式可能存在显著差异。尤其令人担忧的是,目前大多数社会接触数据都来自高收入国家,而占全球人口85%的LMIC却缺乏本地化的行为学数据,这严重制约了传染病传播模型的准确性。以往具有里程碑意义的POLYMOD研究虽然提供了欧洲国家的接触模式数据,并被引用超过3000次,但其对LMIC的适用性一直备受质疑。更棘手的是,针对5岁以下儿童这一传染病易感群体的接触数据在LMIC中几乎空白。这些数据缺口使得针对特定年

    来源:Nature Communications

    时间:2025-10-31

  • 将封装蛋白重编程为模块化固碳纳米隔室:构建合成二氧化碳浓缩机制的新策略

    在全球人口持续增长和气候变化加剧的背景下,提高作物光合效率已成为保障粮食安全的关键挑战。C3作物如小麦、水稻和大豆的光合作用效率受到Rubisco酶固有缺陷的严重制约——该酶不仅催化速率缓慢(kcatc仅为2-5 s-1),还对O2具有竞争性亲和力,导致光呼吸作用造成大量能量浪费和碳损失。自然界中,藻类蛋白核和蓝细菌羧酶体等二氧化碳浓缩机制(CCM)能通过区室化作用显著提升Rubisco周围的CO2浓度,然而将这些复杂系统导入植物面临巨大技术障碍。针对这一挑战,悉尼大学和澳大利亚国立大学的研究团队在《Nature Communications》上发表了一项突破性研究,提出了一种基于细菌封装蛋白

    来源:Nature Communications

    时间:2025-10-31

  • 群体智能的涌现机制与机器人系统仿生设计:从动物集体行为到智能物质

    在自然界中,从蜂群采蜜到鸟群迁徙,动物群体展现出令人惊叹的协调能力。这些集体行为往往能产生超越个体能力的群体智能,但其中的奥秘一直困扰着科学家。与此同时,传统机器人系统在复杂环境中的适应性和鲁棒性存在局限,急需新的设计范式。正是基于这样的背景,德国康斯坦茨大学的Iain D. Couzin团队在《Nature Communications》上发表了这项跨学科研究,揭示了动物集体智能的涌现机制及其在机器人系统中的创新应用。研究人员通过整合理论建模、机器人实验和生物观察等多种方法,建立了集体行为的研究框架。在技术方法上,该研究主要运用了:1)分布式传感与局部协调算法,通过微型机器人集群验证理论模型

    来源:Nature Communications

    时间:2025-10-31

  • 淋病奈瑟菌脂寡糖结构变异体通过GMMA外膜囊泡调控功能性免疫应答的机制研究

    随着全球淋病发病率持续攀升及耐药菌株的扩散,世界卫生组织(WHO)已将淋病奈瑟菌(Neisseria gonorrhoeae)列为亟需新型防控手段的高优先级病原体。尽管历经数十年探索,淋病疫苗的研发仍因病原体抗原变异及免疫逃避机制而步履维艰。一项关键转折来自回顾性研究:基于脑膜炎球菌外膜囊泡(OMV)的疫苗MeNZB和4CMenB(Bexsero)意外显示出31%–40%的淋病交叉保护效果,重新点燃了通过OMV技术攻克淋病的希望。然而,其保护机制尚未明晰,尤其是表面最丰富的抗原——脂寡糖(Lipooligosaccharide, LOS)在激发功能性免疫应答中的作用亟待系统解析。在此背景下,来

    来源:npj Vaccines

    时间:2025-10-31

  • 海洋变暖威胁着南极60%冰架的生存能力

    摘要南极冰盖的浮动边缘——即冰架的消失,将极大地加速南极对海平面上升的贡献。13冰架的消失将导致南极冰盖向海洋的流动不受约束,进而加速海平面上升。46在气候变暖的背景下,研究冰架的生存能力已成为重要课题,众多研究关注大气变暖对冰架的影响。810在这里,我们全面重新审视了冰架的生存能力,考虑了大气和海洋对冰架质量损失的影响,以预测冰架何时几乎无法维持其当前形态。我们发现,在全球变暖幅度控制在2°C以下的情景下,到2300年只有1/64的冰架可能不再具备生存能力;而在全球变暖达到近12°C的情景下,当全球变暖超过4.5°C时,许多冰架将失去生存能力,这种损失主要源于海洋引起的融化作用。到2150年

    来源:Nature

    时间:2025-10-31

  • 综述:糖基化RNA在疾病中的潜在功能

    ABSTRACT糖基化RNA(glycoRNA)作为RNA表观遗传修饰的新形式,近年来受到广泛关注。本文综述了glycoRNA在疾病中的潜在功能,重点讨论其两种修饰类型(N-糖基化和O-糖基化)的分布特征及作用机制。研究表明,glycoRNA广泛存在于多种组织和细胞表面,能够特异性结合siglec受体、P-选择素和RNA结合蛋白(RBPs)等分子,通过介导细胞间相互作用参与肿瘤增殖转移、心脑血管炎症反应及免疫调节等病理过程。修饰类型与分子特征glycoRNA主要包括N-连接糖基化和O-连接糖基化两种修饰形式。N-糖基化通过寡糖链与RNA碱基的酰胺氮原子共价连接,而O-糖基化则与羟基直接结合。这

    来源:Wiley Interdisciplinary Reviews-RNA

    时间:2025-10-31

  • GroEL及其线粒体和叶绿体同源物的C端尾部采用多聚脯氨酸II螺旋结构

    ### 研究背景与意义在生物体内,蛋白质的正确折叠对于其功能实现至关重要。然而,许多蛋白质在折叠过程中会经历复杂的构象变化,这些变化通常受到多种因素的调控,包括环境条件、与其他分子的相互作用以及自身的结构特征。Chaperonins(分子伴侣)是一类在所有生物界中广泛存在的蛋白质折叠机器,它们通过隔离新生多肽链在空心的内部腔室中,并利用ATP驱动的构象变化来促进蛋白质的正确折叠。GroEL是大肠杆菌中最著名的分子伴侣之一,其结构由七个亚基组成,每个亚基包含三个折叠的结构域。在GroEL的C端,存在一个约25个残基的延伸部分,该部分在X射线晶体学和冷冻电镜(CryoEM)分析中常被描述为无序结构

    来源:Protein Science

    时间:2025-10-31

  • 通过一种与人类胰岛淀粉样多肽相关疾病的突变体,对加速淀粉样蛋白形成的机制进行了实验和计算分析

    摘要 野生型。能量分解计算用于探讨在现有IAPP淀粉样纤维模型中用Gly以及D和L-氨基酸替换Ser-20所产生的空间效应。实验数据和计算分析表明,S20G突变导致淀粉样蛋白形成加速的原因是多种因素共同作用的结果,而不能仅仅归因于纤维状态下不利侧链空间相互作用的消除,或仅仅是需要形成主链二面角ϕ为正值的构象。限制主链构象以偏好正ϕ角似乎是主导因素。 利益冲突声明 作者声明没有竞争性财务利益。

    来源:Protein Science

    时间:2025-10-31

  • 解析Caveolin-1在乳腺癌细胞形态多样性和自我更新中的作用

    细胞的几何形态与其功能密切相关。在肿瘤发展过程中,癌细胞不仅会改变其表型和生物学行为,还会经历细胞形态的显著变形。然而,目前尚不清楚癌细胞形态的多样性是否与其表型存在关联,以及形态变化在癌细胞功能演变中的具体机制。本研究通过简化细胞形态,利用二维细胞形态特征将癌细胞划分为三个类别,揭示了细胞形态演变与细胞功能之间的关系。研究发现,caveolin-1(Cav-1)的沉默能够再现癌细胞的形态演变过程,这一过程与上皮-间质转化(EMT)类似。同时,研究还表明,背侧应力纤维的减少、粘附连接的组装以及横向弧状纤维的紊乱及其调控信号是癌细胞形态演变的主要工具。此外,一种改良的顶点模型从理论上验证了细胞形

    来源:Cell Proliferation

    时间:2025-10-31

  • IL10 rs1800896基因变异可预测接受生物制剂治疗的炎症性肠病患者实现生化缓解

    摘要 遗传因素,包括单核苷酸变异(SNVs),可能会影响炎症性肠病(IBD)患者的疾病进程和治疗效果。我们研究了四种细胞因子基因中的SNVs与临床表型以及患者对分子靶向药物的反应之间的关系。共有197名IBD患者(142例克罗恩病[CD],55例溃疡性结肠炎[UC])参与了这项研究,这些患者均接受了靶向治疗。研究的SNVs包括:TNFAA)、TGFBT)、IL6C)和IL10A)。12个月时的生化缓解标准为:C反应蛋白水平<5.0 mg/L且粪便钙卫蛋白水平<250 μg/g,同时患者未继续使用皮质类固醇治疗。在所分析的SNVs中

    来源:Immunology

    时间:2025-10-31

  • 嵌入硫元素的纯绿色多共振TADF发光体:优化光物理和电致发光性能

    本研究报道了两种具有硫原子连接于咔唑单元3位碳原子的苯并噻吩咔唑基团,从而设计并合成了纯绿色的多共振热激活延迟荧光(MR-TADF)发射体,分别命名为Th-Cz-BN3和Th-Cz-BN6。尽管它们的分子结构相似,但其在单重态和三重态激发态之间的能量分裂以及自旋-轨道耦合(SOC)效应存在显著差异,这些差异源于不同的立体构型及由此引发的电子结构变化。基于这两种发射体的器件实现了纯绿色发射,并且其色度坐标(CIE)y值超过0.7,最大外部量子效率(EQE)超过了34.0%。其中,Th-Cz-BN3基的非敏化器件在100和1000 cd/m²亮度下表现出显著的效率滚降抑制,分别仅为0.3%和16.

    来源:Advanced Science

    时间:2025-10-31


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