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阐明在温度变化过程中,相容性溶质对嗜热蓝细菌Mastigocladus sp. TA-8的生长保护作用及其对氧化应激的缓解作用
摘要本研究探讨了三种相容溶质(蔗糖、海藻糖和脯氨酸)对嗜热蓝细菌 sp. TA-8因温度引起的细胞损伤的保护作用。该菌株在低于其最适温度(45°C)和高于最适温度(50°C)的条件下进行实验,实验过程中分别添加和未添加这些溶质。研究人员分析了其形态、生理、生化和转录水平的变化。在25°C时,生长受到最大程度的抑制,同时伴随着活性氧种类的增加、丙二醛含量的上升以及氧化还原平衡的紊乱。在25°C时,氮代谢也显著受损,表现为总氮含量减少、谷氨酰胺合成酶活性下降以及α-酮戊二酸水平的变化。在50°C时,光合作用效率明显降低,其中蔗糖在提供保护方面更为有效,这可能是由于其增强了活性氧的清除能力、提高了抗
来源:Extremophiles
时间:2025-11-06
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半胱氨酸介导的四聚体GlpF结构稳定性机制及其对膜蛋白稳定性的普适意义
膜蛋白在细胞膜中扮演着“守门人”的角色,负责选择性运输溶质,但其寡聚化组装和稳定性机制仍是未解之谜。以水甘油通道蛋白GlpF为例,这种来自大肠杆菌的膜蛋白以四聚体形式存在,每个单体形成独立的孔道,负责水分子和甘油等小分子的跨膜运输。尽管科学家已经解析出GlpF的高分辨率结构,但维持其四聚体稳定性的分子机制尚不清楚。更棘手的是,膜蛋白的稳定性不仅取决于蛋白质自身的结构特征,还受到脂质环境、离子浓度和底物分子等多种因素的影响。理解这些因素如何共同维持膜蛋白的稳定性,对于揭示其结构与功能关系至关重要。以往研究表明,水通道蛋白家族成员的稳定性与其寡聚化状态密切相关。例如,GlpF和AqpZ等膜蛋白在单
来源:European Biophysics Journal
时间:2025-11-06
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血小板裂解液能否激活冻存的人类组织?
摘要血小板裂解物是富血小板血浆的衍生物,用作体外细胞培养基的补充剂。目前已有多种制备该物质的方案。然而,其在临床应用方面的潜力尚未得到充分研究。在本研究中,比较分析了不同制备方案对细胞增殖的影响。此外,还研究了不同浓度血小板裂解物对骨骼和血管组织的影响。实验中使用了类人成纤维细胞来测试这些制备方案。解冻后的颅骨和动脉碎片与血小板裂解物共同孵育后,作为外植体接种到培养皿中。首次实验通过细胞计数定量评估细胞生长情况,第二次实验通过观察生长中的细胞群落来定性评估细胞生长。研究发现,用于制备血小板裂解物的原材料中白细胞的存在与较高的细胞增殖率相关。在所有来自动脉的培养样本中均检测到了存活细胞,在来自骨
来源:Cell and Tissue Banking
时间:2025-11-06
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人类DDR2基因一种可变剪接新转录本的鉴定及计算机模拟分析
摘要 DDR2(Discoidin Domain Receptor 2)是一种受体酪氨酸激酶,通过触发下游信号级联反应来调节细胞增殖、分化、侵袭和迁移等基本过程。DDR2位于1号染色体的长臂上,已被发现与多种恶性肿瘤有关,包括肺癌、卵巢癌、乳腺癌和前列腺癌。本研究采用生物信息学和实验相结合的方法,旨在识别并表征DDR2基因的一种新型可变剪接转录本。序列分析发现,在编码外显子1和2之间存在一个先前未报道的内含子区域,其中包含一个起始密码子,这表明该区域有可能编码一种不同的N端变体。通过RT-PCR和Sanger测序技术在前列腺和肺组织中验证了这种
来源:Cell Biochemistry and Biophysics
时间:2025-11-06
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TAX基因的表达与HTLV-1感染者中的Western blot检测结果及高病毒载量相关
摘要背景Western blot(WB)是检测HTLV-1感染的传统确认试验;然而,结果不确定的WB检测结果仍然是一个值得关注的问题。TAX是HTLV-1病毒的关键调控蛋白,能够增强病毒基因产物的表达。本研究旨在比较WB检测结果为阳性及不确定的个体中TAX的表达情况,并评估其与HTLV-1病毒载量之间的关联。材料与方法本研究对象为2021年至2023年间被转诊至伊朗输血组织(IBTO)的HTLV-1 WB检测结果为阳性或不确定的个体,共纳入60名受试者。为确认样本中是否存在HTLV病毒,采用Ficoll梯度分离外周血单核细胞(PBMCs),并对提取的DNA进行嵌套PCR(nPCR)检测。TAX
来源:Brazilian Journal of Microbiology
时间:2025-11-06
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从Acinetobacter ursingii中克隆并表征一种新的油酸水合酶,该酶可用于未活化烯烃的不对称水合反应
摘要 目标 通过基于序列的基因组挖掘结合靶向氨基酸替换,扩大通用油酸水解酶(OAHs)在不对称水合未活化烯烃方面的应用范围。 结果 从100种筛选出的OAHs中,选出了13种候选酶,所有这些酶都对油酸具有水解活性。这些酶对1-癸烯(2 mM)也表现出显著的活性,其中AuOAH、CkOAH、AiOAH和CeaOAH分别以822、603、495和461 μM的浓度生成(S)-2-癸醇。AuOAH、CeaOAH和CkOAH还对短链1-庚烯(2 mM)表现出明显的活性,生成(S)-2-庚醇的浓度分别为156、115和133 μM。AuOAH来源于Acinetobacter
来源:Biotechnology Letters
时间:2025-11-06
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综述:信息最优性与染色质的几何结构
摘要我们探讨了如何利用广义信息原理来研究DNA-蛋白质复合体(即染色质)的大尺度几何结构。从系统层面来看,最优性要求不仅自然过程的所有子部分都必须达到最优状态,而且包含符号抽象的更高层次结构在展开过程中也应保持最优性。遗传密码数据的信息论几何特性,结合最大熵原理,能够解释编码子(密码子)与不同氨基酸之间的对应关系及其背后的自相似结构。这一分析方法被用于探究物理和生物空间的基本几何特征,这些空间的维度为e(这一特性体现在与基因组DNA相关的聚合体中)。该分析结果与染色质的分形维数一致,但同时也存在其他维度较低的非最优结构。我们探讨了如何利用广义信息原理来研究DNA-蛋白质复合体(即染色质)的大尺
来源:Biophysical Reviews
时间:2025-11-06
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在环丙沙星(CIP)污染土壤中种植的大麻的生理生化变化及其植物修复潜力:一项开创性且具有持久价值的解决方案
摘要大麻(Cannabis sativa L.)是一种重要的天然纤维,常用于可持续材料的增强材料。由于其丰富的生物量、广泛的根系以及在恶劣环境中的抗污染能力,它成为多污染物植物修复的理想选择。本研究旨在在受控的温室环境中,评估不同浓度环丙沙星(0、50、100、150和200毫克/千克)对大麻生长、气体交换特性、抗氧化潜力及植物修复能力的影响。结果表明,大麻能够耐受高达150毫克/千克的环丙沙星浓度,而不会导致生物量和生长参数显著下降;然而,当环丙沙星浓度达到200毫克/千克时,植物的生物量和生长会受到显著影响。随着土壤中环丙沙星含量的增加,大麻叶片的气体交换特性和光合色素水平也会下降。此外,
来源:Biodegradation
时间:2025-11-06
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感染豌豆(Pisum sativum)的尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)中“分泌到木质部4”(Six4)基因的分子特性分析及计算机模拟研究
摘要Fusarium oxysporum是一种土传真菌,通过引发诸如菜豆(Pisum sativum)等作物的维管束萎蔫病,对世界农业构成了严重威胁。本研究深入探讨了Six4基因在F. oxysporum致病性中的作用。首次对从菜豆中分离出的F. oxysporum菌株的Six4基因进行了全序列测定,发现了该基因在不同菌株间的保守区域和变异情况。通过疾病严重程度及进展的研究验证了该菌株的致病性,证明了其毒力,并符合科赫法则(Koch’s postulates)。半定量PCR检测结果显示Six4基因在受感染的菜豆植株中处于活跃表达状态。对Six4基因的分子和系统发育分析表明,该菌株与FOSC属于
来源:Archives of Microbiology
时间:2025-11-06
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基于吉兰胶(Gellan gum)的培养基能够从土壤样本中恢复更多样化的微生物群落
摘要土壤微生物群落中包含大量无法用标准微生物培养基培养的微生物,这些微生物只能通过分子生物学方法进行研究。这些无法培养的微生物可能包含能够产生对医学、生物技术和农业具有重要价值的生物活性化合物的菌株。开发针对这类微生物的培养方法至关重要。在本研究中,我们成功验证了先前的观察结果:用吉兰胶(gellan gum)替代琼脂(agar)作为凝胶剂,并使用营养贫瘠的培养基,可以更频繁地分离和富集那些稀有且难以培养的微生物类群。此外,我们还发现改变培养箱内的气体混合物有助于分离特定的微生物类群。因此,建议用吉兰胶替代琼脂作为培养新微生物物种的策略。土壤微生物群落中包含大量无法用标准微生物培养基培养的微生
来源:Archives of Microbiology
时间:2025-11-06
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胆汁和短链脂肪酸盐会影响源自贻贝的产气克雷伯菌(Klebsiella Oxytoca)的存活能力和毒力
摘要产气克雷伯菌可引起人类的胃肠道感染。在肠道内,这种细菌会接触到多种宿主来源的信号物质(尤其是胆盐)以及由微生物群产生的次级代谢产物(如短链脂肪酸盐)。然而,关于产气克雷伯菌对胆盐和短链脂肪酸盐应激反应的机制的研究却很少。最近,我们在14种水生食用动物中发现了产气克雷伯菌,其中来自贻贝的产气克雷伯菌7-7-27具有强烈的生物膜形成能力,并携带许多与毒力相关的基因。本研究探讨了正常生理浓度的胆盐(0.2%–2.2%)和短链脂肪酸盐(0.4%–2.0%)对产气克雷伯菌7-7-27存活能力和毒力的影响。结果表明,主要类型的胆盐(0.2%胆酸钠或0.8%甘胆酸钠)及短链脂肪酸盐(0.4%乙酸钠或0.
来源:Archives of Microbiology
时间:2025-11-06
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综述:使用PMA-qPCR进行微生物活力评估:挑战、机遇及未来发展方向
摘要由于分子分析方法无法有效区分活细胞和死细胞,容易导致错误的结果,而且死细胞也会复制其DNA/RNA,因此需要一种能够提供更敏感检测结果的方法。PMA(丙啶单氮化物)是一种用于防止死细胞DNA对实验结果产生负面影响的活性指示剂,它仅与受损细胞的DNA结合,从而阻止这些细胞通过PCR进行复制。该技术首次被引入是在2006年。近年来,人们在微生物组学、宏基因组学研究、环境微生物学、食品微生物学、抗生素和消毒剂效果测试、临床微生物学与诊断以及细胞培养和生物技术等领域对PMA的应用兴趣显著增加。因此,人们对其使用目的、原理、在不同领域的应用及其局限性进行了深入研究。这篇关于这种活性标记物的综述虽然历
来源:Archives of Microbiology
时间:2025-11-06
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通过高效的进化富集系统,对一种高产量虾青素的Xanthophyllomyces dendrorhous菌株TP-4进行筛选和特性分析
摘要Xanthophyllomyces dendrorhous(Phaffia rhodozyma的异形菌)是工业生产虾青素的关键微生物宿主,其产量取决于生物合成途径的效率以及整体的代谢稳定性。为了培育出更优秀的工业菌株,我们建立了一个高效的进化富集系统和加速进化工作流程,将虾青素的产生与在优化氧化应激条件下的细胞生长相结合。这一策略使得能够富集出同时具有高虾青素产量和强工业适应性的突变体。利用这种方法,我们选用了高产虾青素的X. dendrorhous菌株A06作为进化起点。经过多轮筛选(共2000个菌落),我们成功鉴定出了表现最佳的突变体TP-4。与亲本菌株相比,TP-4的虾青素产量稳定了
来源:Archives of Microbiology
时间:2025-11-06
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全基因组测序用于评估从腌萝卜中分离出的Pediococcus pentosaceus L1的安全性及其作为益生菌的潜力
摘要本研究旨在通过全基因组测序分析和体外评估,对从腌萝卜中分离出的Pediococcus pentosaceus L1的安全性及益生菌潜力进行评估。Pediococcus pentosaceus L1的基因组长度为1,751,467 bp,鸟嘌呤-胞嘧啶(GC)平均比为37.41%,编码区域包含1739个基因。对该菌株的功能分析表明,它具有优异的益生菌潜力及促进健康的特性,其中许多基因与碳水化合物代谢系统、抗逆性和环境适应性相关。毒力因子及抗菌耐药性的分析结果显示,Pediococcus pentosaceus L1中不存在任何与毒力或抗生素耐药性相关的基因,进一步提升了其安全性。体外实验表明
来源:Archives of Microbiology
时间:2025-11-06
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综述:食品和农业中的霉菌毒素:从存在到经济后果
摘要丝状真菌(霉菌)会产生一种称为霉菌毒素的次级代谢产物,这些毒素可能具有危险性。这些微小的分子(通常质量小于1000道尔顿)在自然界中几乎无处不在。曲霉、青霉、镰刀菌和链格孢菌等真菌种类都能产生霉菌毒素。如果这些次级代谢产物进入食物链和生产过程,它们将造成严重危害。在像尼日利亚这样的非洲国家,由于人们主要依赖谷物、粮食和坚果等主食,霉菌毒素污染尤为严重。霉菌毒素因其对人类健康的影响、巨大的经济损失以及国内外贸易的干扰而引起了国际社会的关注。尽管目前已发现超过400种霉菌毒素,但大多数研究仍集中在黄曲霉毒素、赭曲霉毒素A、伏马菌素、玉米赤霉烯酮和镰刀菌毒素上。因此,了解与气候变化相关的非生物因
来源:Archives of Microbiology
时间:2025-11-06
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比较转录组学分析揭示了拉卡东姜(Curcuma longa L.)根茎中姜黄素生物合成的分子机制
摘要几个世纪以来,姜黄一直是印度家庭不可或缺的一部分,它不仅作为一种烹饪原料受到重视,还因其药用价值而备受推崇。姜黄常被称为“印度的黄金香料”,在印度次大陆广泛种植。在已知的30个姜黄品种中,Lakadong品种因其极高的姜黄素含量而脱颖而出。虽然阿萨姆姜黄(作为对照品种)的姜黄素含量约为3%,但Lakadong品种的姜黄素含量却高达约7%。为了揭示这种高姜黄素产量的分子机制,研究人员进行了转录组分析,以识别Lakadong姜黄与标准品种之间差异表达的基因(DEGs)。富集分析表明,这些差异表达基因与多种关键生物过程相关,包括对盐胁迫的响应以及茉莉酸和乙烯信号通路的调控。通过对姜黄素生物合成基
来源:Plant Molecular Biology Reporter
时间:2025-11-06
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甘蓝中对黑腐病致病菌(Xanthomonas campestris pv. campestris)具有抗性的基因位点鉴定
摘要由Xanthomonas campestris pv. campestris引起的黑腐病是卷心菜的一种重要病害,对全球卷心菜的生长产生了严重影响。为了鉴定对该病原体具有抗性的基因位点,研究人员从January King Sel. Improved(抗性亲本)和Golden Acre(感病亲本)的杂交后代中培育出了200个F2代个体,并在温室条件下评估了它们对目标病原体的抗性。这些F2代个体的平均病情严重程度为43.49%。病情严重程度与症状评分之间的相关系数为0.986。利用RAPD和SSR标记技术,构建了一张覆盖1538 cM距离的连锁图谱。在连锁群c1、c2和c3中分别鉴定出4个与症状
来源:Plant Molecular Biology Reporter
时间:2025-11-06
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综述:糖响应基因转录调控的顺式和反式元件:从当前认知到未来应用
植物分子生物学领域近年来对糖信号转导机制的研究取得了显著进展。糖类物质不仅作为能量来源和代谢底物,更作为关键信号分子调控着植物从胚胎发生到果实发育的全生命周期过程。这篇综述系统梳理了糖响应基因转录调控的核心元件——顺式调控元件(CREs)和反式作用因子(转录因子,TFs),为理解植物如何感知和响应糖信号提供了分子框架。糖信号导通路的核心组件植物通过多种糖传感器感知细胞内糖水平变化,包括葡萄糖传感器HEXOKINASE1(HXK1)、膜相关蔗糖传感器SUCROSE TRANSPORTER 2(SUT2)以及能量状态传感器SnRK1和TOR激酶复合物。这些传感器通过协同作用,最终调控转录因子活性,
来源:Plant Molecular Biology
时间:2025-11-06
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Grona styracifolia 中差异表达基因 GsC3H30 的功能分析
摘要Grona styracifolia是一种具有显著药用价值的草本植物,含有多种生物活性成分,尤其是黄酮类化合物。“Guangyaoda No. 1”是Grona styracifolia的一个新品种。其直立的生长特性有利于田间收割,并减少了农业用地的面积。本研究旨在探讨GsC3H30基因在Grona styracifolia中黄酮类化合物和木质素生物合成中的作用,并分析其对“Guangyaoda No. 1”独特植株形态的影响。研究中利用生物信息学工具对GsC3H30进行了序列和结构分析,通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术分析了Grona styracifolia中GsC3H30
来源:Plant Cell, Tissue and Organ Culture (PCTOC)
时间:2025-11-06
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Ascophyllum nodosum(海带)和绿色合成的银纳米颗粒对Paulownia elongata(泡桐)腋芽增殖及其生化特性的影响
摘要Paulownia elongata是一种生长迅速的树木,具有药用、观赏和木材价值,但通过传统方法进行繁殖存在困难。体外培养为大规模繁殖提供了一种解决方案。本研究探讨了海藻(Ascophyllum nodosum)提取物(SWA)和银纳米颗粒(AgNPs)对P. elongata体外腋芽再生及其再生芽生化特性的影响。P. elongata的芽尖在添加了不同浓度SWA(0.25–6% v/v)和AgNPs(20, 40 mg L⁻¹)的Murashige和Skoog (MS)培养基上培养了四周。20 mg L⁻¹的AgNPs显著促进了芽的增殖(每个外植体产生3.23个芽,17.69片叶子),
来源:Plant Cell, Tissue and Organ Culture (PCTOC)
时间:2025-11-06