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DNA如此危险？基因组中的隐藏势力
生物通报道：基因组中还有隐藏的序列？这些序列会非常危险、无法与生命兼容？一个研究组这样认为。与大多数的基因组测序计划不同（主要目标是寻找自阿种间保守的基因）这个研究组的目标是确定出对生命的存在有威胁的DNA序列和氨基酸链。博伊西大学遗传学教授Greg Hampikian表示，这就好比大海里捞针的工作。他认为，必定有一些DNA或者蛋白质序列与生命不兼容，其原因或许是因为它们能与某种关键的细胞成分结合，从而比剔除循环之外。还可能，一些序列在某些物种中是致命性的，但是在另外一些物种中则无害。研究人员正是在寻找这些序列。为了找到这些序列，Hampikian和同事Tim Anderson还开发出了一种能
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本期《自然》《科学》精选
生物通综合：1月4日《Nature》生命史的生物化学记录化石传统上被用来追踪随着时间的推移而发生的演化变化。但我们也可以将自己的历史保存在生物化学中。Claudia Acquisti等人已经发现了各种生物将氧吸收进跨膜蛋白中的方式所发生的系统变化。真核生物中的膜蛋白和腔室化的原核生物往往要比更简单的原核生物含有更多的氧。这可能反映了早期地球上所发生的事件，当时大气中低含量的氧正在上升至其今天的含量。研究已灭绝动物饮食习惯的新方法古生物学家希望能够重建已灭绝动物的饮食，将其作为它们生活方式的一种指示。这通常需要将化石牙齿与可比的现存动物的牙齿进行非常细致的比较。现在有了一种新方法，它建立在一个虚
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大鼠终于“投身”AIDS药物研发
生物通报道：大鼠和小鼠对HIV有天然的免疫力，因此长期以来，AIDS研究人员一直找不到合适的小型动物模型。最近，研究人员得到一种HIV易感的遗传工程大鼠，可用于检测一些AIDS药物的疗效。许多研究小组尝试通过向大鼠基因组中添加使人类易受病毒感染的基因，构建疾病易感性遗传工程大鼠（Science, 10 August 2001, p. 1034），但研究过程曲折。四年前，病毒学家Oliver Keppler带领的研究小组，将两个常被病毒用来感染人类免疫细胞的关键分子——CD4和CCR5插入大鼠基因组中，这些病毒在大鼠中不会自我复制，导致HIV的水平比在人体中明显偏低。复制过程是许多抗HIV药物（
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《科学》三篇华人第一作者文章摘要
生物通报道：1 Differential Transmission of Actin Motion Within Focal Adhesions细胞迁移过程中，肌动蛋白（actin）核骨架产生的动力通过粘着斑（focal adhesions）蛋白向胞外传递。加拿大Scripps研究所细胞生物系胡可（音译）和季林(音译)研制出一种荧光散斑显微镜(fluorescent speckle microscopy)，用于分析粘着斑蛋白与肌动蛋白微丝的偶联。研究人员发现不同结构的粘着斑、调节分子与肌动蛋白微丝之间的相关运动的程度不同，暗示肌动蛋白运动通过粘着斑分级传播。vinculin（纽带蛋白）、tal
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一种新老结合的寻药思路
生物通报道：通过研究17世纪荷兰人古籍中关于太平洋小岛上一种能治疗疾病的植物提取物的记载，美国Mayo Clinic发现了一种新型抗菌药物。研究组在这12月23日的《新英格兰医学杂志》上公布了这一发现。 这项新的研究结果表明，这些由Atun树的提取物衍生而来的物质能有效地控制引发痢疾的细菌。早在1650年，Georg Eberhard Rumpf就在他的著作《Ambonese Herbal》中记载了这种传统的治疗方法。研究人员指出，利用古籍中的数据来寻找新药物可能是一种很有效地新方法。
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反常道的基因组测序计划——寻找不存在的基因
生物通报道：基因组中是否有被禁止的序列，是否有对有机体有害的序列？与大多数寻找种内或种间保守基因的基因组测序计划不同，一支研究小组突发奇想，开始寻找“primes”——对有机体有致命作用、在基因组中不存在的DNA序列或者氨基酸链。 “这如同海底捞针，而且这针还不一定存在，”爱达荷Boise州立大学遗传学教授Greg Hampikian说，“一定有一些不适合生命的DNA/蛋白序列，比如它们会与重要的细胞成分结合，才被淘汰掉。也许还存在一些对某些物种有致命作用但对其它物种没有致命作用的DNA/蛋白序列。”Hampikian 与其同事 Tim Anderson合作，研制出一种可以计算出给定
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亚细胞定位特殊的MicroRNA
生物通报道：约翰霍普金斯研究人员发现一种与众不同的microRNAs，此microRNAs在其内部元件的带领下迁移到细胞核中。研究结果刊登于1月5日《Science》。MicroRNAs在癌症和正常发育过程中都发挥重要作用，附着、破坏携带蛋白编码序列的长链RNA上，这也是MicroRNAs常出现在蛋白加工厂（核糖体）附近的原因。但是在一次对200多个已知的人类MicroRNAs进行普查时，霍普金斯医学院Joshua Mendell副教授率领的研究小组发现一种MicroRNA“离群索居”。文章第一作者Hun-Way Hwang（研究生）说，这种MicroRNA出现的时间和出现的地点与预期的不同。
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中国科技大学校友《自然》文章发现关键蛋白结晶结构
生物通报道：来自华盛顿大学生物结构系的研究人员得到了一种异三聚体（heterotrimeric）蛋白磷酸酶2A全酶的结晶结构，这对于理解PP2A聚合体，底物聚集和调控提供了关键的基础性资料。这一研究成果公布在2007年1月4日《Nature》杂志上。这一研究文章的通讯作者是华盛顿大学的徐文清（Wenqing Xu，音译），早年毕业于中国科技大学（1985年），在中科院生物物理所获得硕士学位（1988年），之后赴美（麻省理工生物学系）获得博士学位，目前也经常回国进行相关学科学术报告。原文摘要：Nature 445, 53-57 (4 January 2007) | doi:10.103
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重大成果：巧妙设计分子让癌细胞自毁
生物通报道：通过结合一种短链脂肪酸化合物，约翰·霍普金斯的研究人员发明了一种双叉分子“武器”。这种杂交分子在实验室中能够杀死癌细胞。当然，研究人员也提醒说，这种“双拳”分子目前尚未在动物或人体中进行过检测。不过，他们认为这种分子代表了一种抗击癌症的有潜力的新策略。研究人员在2006年12月的Chemistry & Biology杂志上描述了这种分子。霍普金斯生物医学工程系的博士后Gopalan Sampathkumar指出，在很长的一段时间里，癌症研究人员都没有注意到糖在抗癌方面的潜力。但是，这个研究组发现，当将正确的糖链接到正确的化学搭档上时，它就能够给予癌细胞双重打击。Sampat
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《细胞》子刊揭示新型肌肉
生物通报道：在2007年的第一期《Cell Metabolism》杂志上，一篇文章报道说发现了一种新型肌肉纤维。在这篇文章中，研究者们发现一个重要的分子开关，它可以促使肌体合成一种新型的肌肉。另外，他们还发现这种“IIX型纤维”武装的动物将会跑得更为持久，载荷能力也越强。研究人员认为，这项发现可能会被应用到新药开发，进而改变肌肉的组成。这种治疗将给患有肌肉萎缩症的病人带来新的福音，帮助增强他们肌肉的物理强度和持续性。 来自哈佛大学医学院的Bruce Spiegelman发现，在增强PGC-1â基因活性后，小鼠的骨骼肌会填满IIX型肌
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控制基因表达的新途径
生物通报道：《Cell》一篇文章报道说，费城Thomas Jefferson大学Kimmel癌症中心发育生物学家发现了一个在发育过程中控制基因表达的新途径，如果被证明正确，并且在高等生物中（包括哺乳动物）也存在的话，将有助于治疗一系列包括儿童癌症在内的疾病。Jefferson医学院生化和分子生物学家Alexander Mazo博士所在的研究小组重点关注非编码（non-coding ，nc）RNA。人体基因组的2/3由nc RNA构成，但它们的功能还不大清楚。此次，研究人员对nc RNA控制HOX基因（指导有机体发育基本模式）功能的机制进行了简要描述。Mazo博士说：“我们认为这种新机制操纵胚胎
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杂交分子引起癌细胞自我毁灭
生物通报道：通过将糖于短链脂肪酸连接，约翰霍普金斯研究人员得到了一个尖端分叉的分子武器，可以杀死实验室培养的癌细胞。研究结果刊登于06年12月份《Chemistry & Biology》杂志。尽管所描述的双尖分子还没有经过动物和人体试验，但研究人员对这种分子的抗癌效果充满信心。 “很长一段时间内，癌症研究人员都忽视了糖在抗癌过程中的作用，”文章首要作者、霍普金斯医学院生物医学工程博士后Gopalan Sampathkumar说，“但我们发现当合适的糖连接合适的化学搭档后，可以对癌细胞传递双重轰击。”Sampathkumar及其同事发现短链脂肪酸butyrate可以减慢癌细胞的扩散速度。
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2007年第一期《Nature》文章精选
封面故事：“土卫六”上存在大量液体有了可信证据土星卫星“土卫六”上存在液态甲烷海或湖是20多年前预测的。但由于该星球上一层浓雾使得人们无法就近观测，所以一直没有可能确认其存在。当然，这是“卡西尼”探测器2006年7月22日掠过该星球之前的情况。本期Nature发表的本次掠过时获得的雷达成像数据，为该星球上大量液体的存在提供了可信证据。本期封面所反映的是“卡西尼”看到的东西。该图像上的强度（图像是着色的，只不过其颜色并不表示人类眼睛看到的颜色）与雷达反向散射界面的对数成比例。湖泊的颜色比周围陆地要暗一些，图像上通过将低反向散射区域染成蓝色、将雷达亮度大的地区染成褐色来突出湖泊。雷达图像的条纹大约
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2006年生命科学造假事件
生物通综合：每逢岁末，《科学》杂志的编辑们会评选年度科学新闻和来年的热点领域，但与过去不一样的是，在2006年12月，他们突破常规评出了年度科学欺诈事件——韩国科学家黄禹锡和其研究小组伪造在《科学》杂志上发表的论文。这一事件动摇了科学大厦的诚实根基，学术期刊也开始面临如何反欺诈的挑战。2006年生命科学造假事件也不单单出现在论文当中，在学术简介，经济腐败方面也屡见不鲜，让我们回顾一下过去的一年当中重要的学术不端事件，敲起学术警钟。三大顶级杂志“造假”：科学，自然和细胞来自11月14日The Scientist杂志的消息，密苏里州大学在今年2月发表的《Science》杂志上的一篇有关早期胚胎发育
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发现长寿基因还有兼差
生物通报道：来自Yeshiva大学艾伯特爱因斯坦医学院的研究人员发现一种使人长寿的突变基因——CETP VV，还可以帮助老年人清晰思路，保持记忆。这项研究结果刊登于12月26日的Neurology中。 这项研究是由爱因斯坦医学院衰老研究所的Nir Barzilai博士率领的。研究人员针对158名95岁以上的东欧犹太血统的老年人及之前证实没有此突变基因的老年人进行标准的认知能力测试，发现脑功能良好的老年人中，带有此突变基因的老年人是没有此突变基因的老年人的二倍。接着研究人员评估124名75－85岁的犹太血统老年志愿者，发现未患痴呆症的老年人，具有此突变基因的老年人数量是不带有此突变基因老年人数量
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瘦人脾气坏？研究给出答案
生物通报道：可能很多人都注意到，瘦人的脾气普遍来说要比较急躁些。现在一项新的研究给出了答案。这项研究发现，一种叫做食欲激素A（orexin A）的物质可能是造成这些人吃不胖且容易焦躁的关键。 在2005年，研究人员发现瘦人相对于胖的人每天多花了两个小时从事行走、站立或焦躁等非计划性运动，这种运动是身体自发性的活动（可消耗约350大卡的热量）。为了了解这种行为上的差异是否是造成肥胖的一个原因，研究人员让这些瘦人增胖，或是胖人减重。结果发现，即使瘦人增胖后，仍然会多花两个小时进行非计划性的运动。所以这些行为并不会随体型而改变——这意味着行为上的差异可能与身体内部的分子调控机制有关。虽然胖瘦会受行为
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2006胚胎干细胞研究备忘录（下）
生物通报道：胚胎干细胞（embryonic stem ，ES)是一个诱人的研究课题，因为这种全能干细胞具有形成完整个体的分化潜能，可以无限增殖并分化成为全身200多种细胞类型，从而可以进一步形成机体的任何组织或器官，这对于器官移植等临床医学来说无疑个福音。在这方面胚胎干细胞如何能发育成数百种体细胞的全能性，一直是当前研究干细胞的学者全力想解开的谜团之一。 2006胚胎干细胞研究成果汇总（上） 7月 控制胚胎干细胞分化的关键分子生物通报道：霍华德休斯医学院研究人员研究毛囊干细胞，发现了控制胚胎干细胞分化的关键因子——Lhx2。Rhee和Fuchs利用一系列遗传和分子标记，将毛发前体细胞
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细胞凋亡蛋白的一个重要发现
生物通报道：美国伊利诺伊大学Urbana-Champaign分校的研究人员指出，一种在细胞凋亡中扮演重要角色的蛋白质也参与了记忆的形成过程。研究人员对灰头文鸟如何学会唱歌进行了深入研究。对这种鸟的研究结果却意外地会有助于找出治疗神经退化疾病如老年痴呆症和阿尔茨海默症的方法。研究的负责人Graham R. Huesmann 和David F. Clayton表示，当酶caspase-3被活化时，会引起记忆存贮必须的突触神经机制。他们的这篇文章发表在12月21 日的国际权威杂志《神经元》（Neuron）中。Caspase-3会引起一连串的化学事件而引发细胞凋亡。这些新研究结果显示，在不同的情况下，
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Affymetrix、454和Quantum Genomics三大公司最近动态
生物通报道：2006年12月初，Affymetrix聘用现年51岁的Kevin King 为生命科学部总裁和行政部副总裁。King早年工作于 Thomson 有限公司，2005.2－2006.6担任Thomson Healthcare总裁和CEO；1997－2004，效力于 GE Healthcare，2000.6－2004.11任职于global clinical systems 副总裁和总经理。根据美国证券交易委员会档案记载，King 年基本收入包括45万美元以及1百万美元的签约奖金（ signing bonus）。2007年，King从 Affy得到的奖金有可能为年基本工资的65％。 4
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Nature新闻：美认可克隆动物食品安全性
生物通报道：在美国食品和药品管理局对克隆动物或克隆动物的后代来源的食品安全性进行长达5年的检测后，美国政府去年12月24日颁布的一项草案，宣称克隆猪、牛、羊来源的食品与天然的猪、牛、羊来源的食品一样安全。这项提议将接受为期90天的公众意见调查，之后FDA将正式批准一些克隆动物食品上市（据说，还没有关于克隆羊的足够数据）。奶制品和肉制品加工业已经对这项草案期待多年。早在2003年，FDA就将摘要颁布，但是行政部门制定全文则花费了3年多的时间，引用的科学证据也不够充分。FDA收集的数据包括同行审视的研究和克隆公司尚未发表的报告，结果刊登于2007年1月《Theriogenology》杂志（目前已可
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