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创新生物技术公司Berkeley Lights登录纳斯达克，CEO三天完成180多场会谈
文章编译自 CNN Business: https://www.cnn.com/2020/08/12/investing/berkeley-lights-ceo-ipo/index.htmlBerkeley Lights公司CEO，Eric Hobbs博士在疫情间负责一家生物技术公司绝不是一件轻松的工作——去问问Berkeley Lights公司CEO Eric Hobbs博士就知道了。在三天半的时间里他通过Zoom跟180多位投资者进行会谈，整个过程中体重掉了9斤多。在当下，即使不去参加网络路演，在制药公司工作也已经忙到不可开交。世界上主要制药公司都在争相开发COVID-19疫苗。但是Hob
来源：Berkeley Lights
时间：2020-09-16
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腺相关病毒的包装容量太小？四种方法帮你解决问题
腺相关病毒（AAV）的许多功能使其成为良好的病毒载体，但它只能容纳4.7 kb左右的外源DNA片段，容量仅为慢病毒和腺病毒载体的一半。尽管许多基因都在此范围内，但有些酶的确不合适。那么，如何将大片段放入AAV载体中呢？人们的应对措施是将转基因切割成较小的片段。2008年，意大利的研究人员直接将大约9 kb的超大基因组包装到AAV中。他们发现，这个AAV载体在体外和体内成功介导了全长转基因的转导和表达。但在不久后，三个研究小组尝试重现这些结果，并发现即使包装了更大的片段，基因组的物理大小仍为4.7 kb。尽管如此，转导后仍然产生了较大的功能产物。这是怎么回事？研究人员推测，在包装时，过大的AAV
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上海交大生命科学技术学院何亚文课题组在新型代谢产物农药研发方面取得重要进展
近日，国际合成生物学领域权威期刊《ACS Synthetic Biology》在线发表了上海交通大学生命科学技术学院何亚文课题组的研究论文《利用一个受群体感应调控的高效温敏启动子生物合成新型代谢产物农药吩嗪-1-酰胺》（Identification of a strong quorum sensing- and thermo-regulated promoter for the biosynthesis of a new metabolite pesticide phenazine-1-carboxamide in Pseudomonas strain PA1201）。生命科学技术学院博士研究
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Nature：找到快速分裂的癌细胞，而不伤害健康细胞的新方法
约翰霍普金斯大学医学院和牛津大学的一组研究人员表示，他们已经找到了一种新方法，可以通过选择性攻击细胞分裂机制的核心来杀死某些正在增殖的乳腺癌细胞。迄今为止，这一技术已经在实验室培养和患者衍生的癌细胞上进行了测试，有助于寻找能够杀死一部分患者的乳腺癌细胞，并使健康细胞不受损害的药物。这一发现公布在9月9日的Nature杂志上。约翰霍普金斯大学医学院分子生物学和遗传学副教授Andrew Holland说：“一些使用广泛的抗癌药物能杀死快速分裂的细胞。但是，大多数这些药物都有明显的缺点，比如在杀死癌细胞的同时伤害健康细胞，包括快速繁殖的骨髓细胞。”最研究的研究重点是哺乳动物（包括人类）的细胞分裂，他
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四分之三的DNA序列如何被激活？Nature新论文报道人工智能获得的重要突破
科学家们早就知道，人类基因会依照我们DNA的精确顺序传递的指令付诸行动，这些指令由四种不同类型的单个的碱基分别编码：A，C，G和T。众所周知，将近25％的基因被类似于TATAAA的序列（称为“ TATA框”）转录，那其它75％的基因是如何开启的呢？这依然是一个谜。最新一项研究中，加州大学圣地亚哥分校的研究人员确定了一种DNA激活码，他们称其为下游核心启动子区域（downstream core promoter region，DPR），这一发现最终可用于控制生物技术和生物医学应用中的基因激活。相关成果公布在9月9日的Nature杂志上。文章深作者James T. Kadonaga说：“DPR的鉴
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《Cell》捕捉肺部活细胞的先进方法
Calgary大学的科学家发现了捕捉肺部免疫细胞的“活体”图像的方法。在全球范围内，Cumming医学院Snyder慢性病研究所首次发现了实时记录免疫系统如何对抗影响小鼠肺泡或气囊的细菌的方法。这一发现为免疫系统的清洁剂肺泡巨噬细胞提供了新的见解。曾经被认为是静止的巨噬细胞，现如今科学家们观察到它们实际上是在肺泡间隙中爬行，寻找细菌和病毒。“巨噬细胞移动是有道理的，但我们只能假设这一点，因为我们看不到它们在动。现在我们可以了，”首席研究员Paul Kubes博士说。“肺部的肺泡比巨噬细胞多得多，巨噬细胞在每个气囊都必须高效工作。”研究人员说巨噬细胞的工作非常简单。想象一家酒店，房间比清洁工多，
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《Science Advances》发布新方法，快速测一测你的端粒长度
鞋带末端的塑料头可以防止鞋带磨损。端粒这种重复的DNA（脱氧核糖核酸）序列，在染色体末端起着类似的作用，保护其伴随的遗传物质不受基因组不稳定性的影响，预防癌症和调节衰老过程。每当我们体内的细胞分裂时，端粒就会变短，因此就像细胞的分子“时钟”一样，随着年龄的增长，端粒逐渐缩短。准确测量这些端粒的数量和长度，可以提供重要的信息，比如一个细胞正在正常衰老，或异常衰老，如癌症。为了找到一种诊断端粒异常的创新方法，由新加坡国立大学卫生创新与技术研究所（iHealthtech）助理教授Cheow Lih Feng领导的研究团队开发了一种新方法，可以在不到3小时内测量单个端粒的绝对长度。这种独特的端粒分析方
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美国麻省总医院：新型成像技术有望改善肝脏疾病的诊断与监测
随着生活方式的转变，我国非酒精性脂肪肝(NAFLD)的患病率也日益上升，并已成为重大的公共卫生问题。有数据显示，我国非酒精性脂肪肝的患病率已经超过29%，而且按照目前的发病率，到2030年，患者人数可能达到3.15亿。非酒精性脂肪肝是一种慢性肝脏疾病，指除酒精和其他明确的损肝因素外所致的临床病理综合征，其主要特征为肝细胞内脂肪的过度沉积。除了会引发肝脏严重病变乃至癌化之外，非酒精性脂肪肝还可能引发心血管及代谢疾病，或者加快它们的病程。然而目前，非酒精性脂肪肝的诊断和监测仍很困难。近日，来自美国麻省总医院和麻省理工学院的研究团队开发了一种无创成像技术，有望解决这两个临床上的难题。 肝脏
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三种RNA测序技术怎么选？Nature子刊综述讲明白了！
在过去的十年中，RNA测序（RNA-seq）成为差异基因表达、mRNA差异剪接等研究场景不可或缺的重要手段。随着高通量测序技术的不断发展，RNA-seq的研究技术、分析方法也在不断发展。现在RNA-seq用于研究RNA相关的各方面生物学问题，包括单细胞基因表达、RNA翻译、RNA结构、空间转录学、全转录组、RNA-蛋白互作等。早前 Nature Reviews Genetics 发表了一篇综述，全面介绍了RNA-seq的发展。转录本是非常多样和复杂的，绝大多数基因不符合“一基因一转录本”的模式，这些基因往往存在多种剪切形式。而基于短读长测序平台的转录组测序，首先把RNA打断成小片段进行测序，然
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中国学者Nature Methods原创开发可克隆电镜标记技术实现细胞中的单分子定位
近50年来，细胞的电镜成像领域依赖基于传统的抗体免疫金标记技术识别细胞中的蛋白质分子。传统免疫金标记技术，受到抗体及抗原的稳定性和特异性、化学固定剂、细胞切片渗透性，胶体金颗粒大小等因素影响，通常标记效率很低（低于10%），甚至无法标记，因此，多数情况只能标记上细胞切片表面的极少部分抗原 。此外， 传统免疫标记需要标记每一个切片，对于细胞组织样品大尺度的标记是十分费钱、费时、费力的工作，比如对神经组织样品的系列切片三维分子水平成像需要对数以千计以上切片进行免疫标记。尽管目前超分辨率荧光显微学成像技术已经可以对细胞中的分子进行单分子水平的成像，但因无法对没有标记的多数分子甚至细胞器成像，通常需要
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新加坡团队开发数字PCR新方法来测量端粒长度
端粒长度的异常往往与多种衰老相关疾病有关，比如糖尿病、神经退行性疾病和心血管疾病，还与多种癌症的预后相关。目前，测量端粒的金标准方法需要大量的起始DNA，而且操作繁琐，不适合临床使用。新加坡国立大学的研究人员近日设计了一种名为单端粒绝对长度快速分析（STAR）的新方法，能够快速测量端粒的绝对长度。他们在《Science Advances》杂志上报告称，该方法准确灵敏，并且能够测定癌细胞中的染色体外端粒重复序列（ECTR）。“我们希望这种简单而全面的检测方法将被广泛地采用，作为端粒检测的标准方法，”研究人员在论文中写道。图1. STAR分析的流程（图片来自原文）研究人员指出，评估端粒长度的现有方
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海鲜卖不动了？《自然》唯有政策和技术可以力挽狂澜
俄勒冈州立大学领导的一个研究表明，政策改革和技术进步可能在未来30年内推动海产品产量增长75%。发表在《自然》杂志上的这项发现很重要，因为到2050年，地球将有98亿人需要进食海鲜，比2020年增加了20亿人。研究人员说，海鲜有可能满足人们对蛋白质和营养日益增长的需求。海洋生态学家Jane Lubchenco与来自美国、中国、智利、墨西哥、日本、南非、西班牙、挪威、阿根廷和马来西亚的科学家，分析了30年后海洋可以持续生产多少食物。研究人员考察了海洋的主要粮食生产部门——野生渔业金枪鱼、鲷鱼等有鳍鱼以及蛤蜊和牡蛎等双壳类的海水养殖，确定了考虑到生态、经济、监管和技术限制的“可持续供应曲线”的估计
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Cell发现另一种全新液体活检方法，可以用于检测癌症
由于在早期发现癌症时更容易成功进行治疗，因此癌症研究的一大主要目标是开发新的方法，以便在肿瘤开始扩散之前及早发现它们。其中一种正在研究的方法是液体活检（liquid biopsies）。这些检测方法一般是通过检测血液样本中的生物标志物（肿瘤掉入血液中的物质）来发现和诊断人体内的癌症。最近，纪念斯隆•凯特琳癌症中心和康奈尔大学的研究人员发现由肿瘤释放的称为EVP（extracellular vesicles and particles）的微小包囊可以用于在早期阶段检测多种不同类型的癌症。这一发现公布在8月13日的Cell杂志上。文章的通讯作者，Willia
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大脑组织清除术技术综述（二）
2.软和硬组织同时清除法开发者：德州农工大学的Hu Zhao团队问题：现有的清除方案不能同时清除软组织，如脑和脊髓，以及钙化的硬组织，如骨。这使得想象中枢和外周神经系统之间完整的连接变得很困难，因为脊髓中的外周神经与脊椎相连，而且椎骨太不透明而无法成像。方法：Zhao和他的团队开发了一种程序，他们将其命名为PEGASOS（聚乙二醇相关溶剂系统），以同时清除软组织和硬组织（Cell Rese，28:803–18，2018）。这一过程与其他清除方案类似，只是它使用聚乙二醇（PEG）增强荧光保存，并包含两个附加步骤：硬组织脱钙和有色组织（如肝脏）的脱色，因为肝脏含有高水平的铁，所以看起来是红色的。对
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大脑组织清除术技术综述（一）
哺乳动物的大脑由数十亿个神经元组成，这些神经元通过不同的电路连接在一起，每个神经元都参与特定的生理功能。为了更好地了解这些不同的神经元和电路是如何与精神活动和疾病联系在一起的，研究人员正在重建神经网络的详细的三维地图。然而，哺乳动物大脑的三维成像具有挑战性。光在通过组织层时会散射，这些组织被水、脂类和蛋白质等各种分子分散。这会降低图像分辨率。提高分辨率的一种方法是减少散射。研究人员首先去除组织中的水分和脂质，接下来，引入具有折射率的化学物质，折射率是指在蛋白质范围内，分子对通过它们的光的弯曲程度。在填充组织环境的分子中建立近乎均匀的折射率，可以使光线会聚以提高图像分辨率。这是大多数组织清除方法
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BioTechniques：成像技术如何追上3D培养的脚步
如今，研究似乎正朝着快速发展的3D培养领域转移，这让研究人员能够重建微型化的器官，从而深入研究疾病机制，并开发治疗药物。对于组织和疾病研究以及药物发现和分析领域而言，3D细胞培养都代表了巨大的进步。尽管3D培养的应用潜力大大增加，但与之相关的成像和分析方法却有些滞后。随着3D细胞模型变得越来越复杂，它们也需要更强大的工具对其进行分析。如今的大多数分析技术都是为2D培养而开发的，因此向3D转换的过程并不理想。这篇文章介绍了研究人员如何开发更先进的技术以面对这些挑战。不要标记文章指出，共聚焦荧光显微镜是目前研究3D培养体系的金标准。不过，这项技术仍然存在一些局限性。常规的共聚焦显微镜是半定量的，需
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Bio-Techne将RNAscope技术扩展到miRNA检测
Bio-Techne公司近日宣布以RNAscope平台为基础，推出可检测小分子RNA的miRNAscope™ Assay。RNAscope技术是一种先进的RNA荧光原位杂交检测，能够显示单分子RNA在完整组织中的位置，且具有单细胞分辨率。RNAscope技术由Bio-Techne旗下品牌ACD研发，其特异性的双Z探针设计避免了传统长链RNA探针的弊端，配以自身级联放大检测原理，可以灵敏地检测完整细胞中的目标RNA。miRNAscope Assay代表了RNAscope技术的延伸，能够在原位检测17-50个核苷酸的小分子核酸目标，包括小的非编码RNA（miRNA），以及合成的寡核苷酸
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2020免疫治疗：通用/现货技术、抗体免疫、肿瘤疫苗、溶瘤病毒等重点品类的热点与难点解析
免疫疗法已成为未来癌症治疗的主流趋势，细胞疗法、溶瘤病毒、肿瘤疫苗以及新型抗体等全球化研究布局掀起了免疫治疗的革命性浪潮。2020年，哪些免疫疗法值得关注？IGC China，集结50+国内外免疫及病毒学界专家学者、领先企业研发科学家9月汇聚北京，针对行业前沿热点与实践难点做精彩分享！ 【秋意至，福利临】8月11-14日期间注册可享立减500优惠！2人同行享9折优惠，3人同行享8折钜惠！院士领衔王福生，中国科学院院士，解放军第302医院肝病生物治疗研究中心主任引领浪潮：对抗实体瘤新靶点细胞疗法实体瘤上的应用一直难以突破，原因是靶点难寻。实体瘤的异质性等因素为在实体瘤中寻找靶点带来不小挑战，那么
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Immunity：多种技术发现罕见自身免疫性疾病的病因
对于罕见病患者而言，诊断本身就是一件困难的事，更别提治疗了。大约只有一半的患者能明确病因，而有药可治的还不到10%。新一代高通量测序技术的出现，拓展了罕见病的研究手段，加快了致病基因的探索进程。近日，美国西奈山伊坎医学院的研究人员通过新一代的基因组、分子和多参数免疫学分析工具，帮助一名多年遭受疾病折磨的自身免疫性疾病患者找到了致病突变，并幸运地找到了治疗方法。这项成果于8月3日发表在《Immunity》杂志上。该患者是一名18岁的女孩，她被转诊到西奈山的未确诊疾病项目。这个女孩自出生后就表现出自身炎症性疾病的症状。她出生后出现大量的皮疹，一岁时反复出现腹泻和呕吐，三岁时出现水肿和尿蛋白，而肾脏
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《Nature》子刊：一个简单的方法人工干预细胞内“相分离”
杜克大学的生物医学工程师证明了一种控制一类新兴蛋白质相分离的方法，从而在人类细胞内创造出人工无膜细胞器，为工程合成结构创造了机会，以调节现有的细胞功能或在细胞内创造全新的行为。这项研究结果发表在8月3日的《Nature Chemistry》杂志上。蛋白质需要折叠成与不同生物分子结构相互作用的特定三维形状。研究人员先前认为蛋白质必须有这些固定的形状才能发挥作用。但是在过去的二十年里，人们发现了一大类新的内在无序蛋白质（IDPs），它们的大区域是“松软的”——也就是说，它们不会折叠成一个明确的三维形状。现在人们了解到这些区域在控制各种细胞功能中起着重要的、前所未知的作用。IDPs在生物医学应用中也
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