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Parkin 诱导 HMGB1 的泛素化及大量细胞外囊泡的释放,从而激活抗肿瘤免疫
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摘要 Parkin(PRKN)是一种与线粒体相关的E3泛素连接酶,参与调控线粒体自噬和细胞器质量控制。最近的研究表明,PRKN还与刺激抗肿瘤免疫以及重塑肿瘤免疫微环境有关。在本研究中,我们发现PRKN主要通过K48连接方式将警报分子高迁移率族盒蛋白1(HMGB1)的Lys146位点(K146)进行泛素化。通过分子建模分析,PRKN的中间环结构域(Gln
来源:Cancer Research
时间:2025-12-16
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在弥漫大B细胞淋巴瘤中,预处理外周血中的独特细胞和分子特征与CAR T细胞的治疗效果相关
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摘要 嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法彻底改变了复发性/难治性B细胞恶性肿瘤的治疗格局。尽管取得了成功,但仍有约60%的患者治疗失败,这凸显了需要更好地理解响应和抵抗的决定因素。我们对57例弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者的治前外周血样本和抗CD19 CAR T细胞产品进行了单细胞RNA测序,将分子和细胞特征与临床结果进行了关联。在白细胞分离术时,响应者的
来源:Cancer Research
时间:2025-12-16
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大规模T细胞受体库分析揭示了用于诊断性质不明的肺结节的肿瘤特异性信号
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该研究通过整合临床数据、影像学特征和TCR受体谱分析,开发了新型诊断模型TCRnodseek plus,显著提升了肺部结节良恶性鉴别能力。研究构建了包含6059份血液样本和988份肿瘤样本的LungTCR数据库,发现肺癌相关TCR克隆在恶性结节和肿瘤组织中显著富集,且外周血中特异性TCR序列丰度与肿瘤分期、突变负荷(TMB)呈正相关。通过多组学数据融合分析,该模型在1,107例IPN患者中达到AUC 0.84的诊断效能,优于传统影像学评估(AUC 0.62)和单一生物标志物检测。### 关键发现与技术创新1. **TCR数据库构建** - 收集7,047份样本(健康人群2,699份,肺
来源:Cancer Research
时间:2025-12-16
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微生物胆汁酸代谢产物3-氧-LCA可抑制结直肠癌的进展
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摘要 胆汁酸(BA)不仅影响肠道微生物群的组成,还会被肠道细菌代谢生成多种微生物胆汁酸。其中,3-氧代石胆酸(3-oxo-LCA)和异阿洛-LCA已被报道能够调节宿主免疫、抑制肠道病原体,并具有抗衰老作用,这表明它们也可能影响肠道上皮细胞和结直肠癌的进展。为了研究3-oxo-LCA对肠道肿瘤发生的影响,我们在小鼠和人类结直肠癌细胞系、原代小鼠肠道类器官
来源:Cancer Research
时间:2025-12-16
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定量分析巨噬细胞和肿瘤共同进化过程中特定细胞类型的免疫肽谱,揭示了胶质母细胞瘤中的治疗性MHC-I肽
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摘要 免疫检查点抑制剂在治疗多种类型的实体瘤方面表现出色。然而,它们对胶质母细胞瘤(GBM)无效,部分原因是由于GBM相关的巨噬细胞(GAM)创造的免疫抑制性肿瘤微环境。为了发现用于靶向免疫治疗的MHC-I肽抗原,我们在共培养系统中对原代巨噬细胞和GBM肿瘤细胞进行了细胞类型特异性的免疫肽组分析,以描绘肿瘤-巨噬细胞界面处的MHC-I相关抗原呈递情况。共培养肿
来源:Cancer Research
时间:2025-12-16
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手术诱导的中性粒细胞细胞外陷阱通过重新编程癌细胞的脂质代谢促进肿瘤转移
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摘要 癌症手术是一把双刃剑,因为它可能引发炎症反应,从而促进肿瘤的复发和进展。在这项研究中,我们探讨了手术诱导的中性粒细胞胞外陷阱(NETs)对重新编程癌细胞代谢以促进转移性肿瘤生长的影响。为了模拟手术对肿瘤进展的影响,携带皮下肿瘤的小鼠接受了30分钟的中线剖腹术并进行了肠系膜探查。接受手术的小鼠表现出原发性皮下和肺部转移性肿瘤的加速生长。使用DNA酶、GSK484或肽基精氨酸脱亚胺酶4敲除小鼠在手术期间抑制NETs的形成,可以防止手术诱导的肿瘤生长;而在接种前体外用NETs处理癌细胞则会增加
来源:Cancer Research
时间:2025-12-16
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数学建模量化了结肠直肠癌发生所需的“恰到好处”的APC失活程度
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The study presents a comprehensive analysis of the role of APC gene mutations in colorectal cancer (CRC) progression, challenging the traditional view that complete APC loss is sufficient for tumorigenesis. Instead, it proposes a "just-right" model where intermediate levels of APC inactivation—retai
来源:Cancer Research
时间:2025-12-16
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用于高效装载和功能性递送mRNA的混合细胞外囊泡
外泌体-脂质纳米颗粒融合载体的开发与功能递送研究摘要:本研究创新性地提出通过低pH诱导的外泌体(EVs)与脂质纳米颗粒(LNPs)的融合制备杂交外泌体(HEVs),成功解决了EVs递送mRNA的两大核心挑战:高效负载与功能递送。实验表明,HEVs在保持天然外泌体生物特性的基础上,整合了LNPs的靶向递送能力,实现了mRNA在细胞内的有效递送并触发端粒逃逸机制。动物实验进一步证实HEVs具备显著的器官特异性递送特征,其功能递送效率优于传统LNP,且展现出优异的细胞相容性。研究背景:外泌体作为天然纳米载体,凭借其低免疫原性、器官靶向特性和细胞间递送能力备受关注。然而,天然外泌体负载大分子(如mRN
来源:Journal of Extracellular Vesicles
时间:2025-12-16
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流式细胞仪的校准使得细胞外囊泡浓度的测量具有可重复性,并有助于确定参考范围
外泌体(EVs)作为新型生物标志物,在癌症、心血管疾病等重大疾病诊断与治疗中展现出重要潜力。然而,EV浓度测量的可比性问题长期阻碍其临床转化。本文通过国际多中心实验室对比研究,提出了一套完整的EV浓度标准化测量方法,并基于该方法建立了健康人群EV浓度的参考范围,为EV临床应用奠定基础。### 一、研究背景与意义外泌体作为细胞分泌的纳米级膜泡颗粒,其浓度与疾病状态高度相关。当前EV浓度测量存在两大核心问题:(1)不同流式细胞仪(FCMs)因硬件差异导致信号不可比;(2)实验室操作标准不统一。据行业报告预测,EV技术市场规模将在2032年突破30亿美元,但标准化缺失导致大量研究结果无法横向比较。本
来源:Journal of Extracellular Vesicles
时间:2025-12-16
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Cancer Cell:脑胶质瘤的多组学分析为治疗提供线索
脑胶质瘤(gliomas)是最致命的癌症之一,但治疗选择却不多。斯坦福大学医学院领导的研究团队近日对成人和儿童脑胶质瘤患者的样本进行空间组学分析,鉴定出不同亚型和疾病阶段的肿瘤抗原、微环境及其他特征。这项研究成果于12月11日发表在《Cancer Cell》杂志上,为脑胶质瘤的靶向、分类和结局预测提供了框架。“这些发现表明,脑胶质瘤的免疫景观可能随肿瘤类型和分级而变化,强调了在脑胶质瘤治疗中采用个性化免疫靶向策略而非统一方案的潜在价值,” 作者在文中写道。研究人员采用Nanostring GeoMx数字空间分析系统(DSP)、MIBI-TOF质谱以及MALDI-MSI技术,对677份肿瘤样本中
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H5N1禽流感病毒对牛细胞适应潜能的进化动态研究
2024年初,H5N1高致病性禽流感病毒意外在美国奶牛场引发疫情,这是首次发现禽流感病毒在牛群中大规模传播,立即引起全球公共卫生界的警惕。传统认知中,牛并非流感病毒的天然宿主,尽管早期研究曾发现牛血清中存在流感抗体,且实验显示牛对人和禽流感病毒易感,但从未发生过自然疫情。此次疫情由H5N1病毒2.3.4.4b分支的B3.13基因型引起,该分支自2021年以来在全球鸟类中广泛传播,并感染了多种哺乳动物,包括水貂、臭鼬、浣熊、猫、熊、狐狸以及海豹和海狮等海洋哺乳动物。要制定有效的防控策略,关键问题是:对牛细胞的适应能力是H5N1病毒的普遍特征,还是仅限于2.3.4.4b分支病毒,或进一步局限于该分
来源:Nature Communications
时间:2025-12-16
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YenTc全毒素完整结构揭示几丁质酶整合入ABC毒素的进化基础及其成孔机制
在微生物与宿主的军备竞赛中,细菌演化出多种精巧的分子武器来攻击真核细胞。其中,ABC毒素(ABC toxin)作为一类由昆虫病原菌和部分哺乳动物病原体产生的毒素-易位孔形成蛋白,以其独特的“注射器”式工作机制备受关注。这类毒素通常由三个核心组分构成:负责细胞识别的TcA、形成毒素容器的TcB和携带毒性酶域的TcC。然而,人们对这些巨型蛋白复合体的精确组装机制和结构多样性仍知之甚少。作为ABC毒素家族的特殊成员,Yersinia entomophaga产生的YenTc毒素复合体展现出独特的分子架构:其TcA组分由四条独立多肽链构成,其中两条为功能性几丁质酶,这与经典ABC毒素的单链TcA结构截然
来源:Nature Communications
时间:2025-12-16
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化疗重塑肠道菌群-骨髓轴:吲哚-3-丙酸通过调控髓系生成诱导转移抗性状态
化疗是结直肠癌治疗的重要手段,但其在杀伤肿瘤细胞的同时,也会对正常组织造成损伤,尤其是肠道黏膜。这种化疗引起的肠道黏膜炎(mucositis)长期以来被视为一种令人困扰的副作用。然而,一个更深层次的问题逐渐浮出水面:这种治疗相关的组织损伤,是否会以一种我们尚未认知的方式,影响机体对肿瘤转移的长期防御能力?具体而言,为什么某些部位的转移(如肝转移)在化疗后似乎受到了抑制?这背后是否存在一种超越化疗直接细胞毒作用的、由机体自身诱导的全身性保护机制?传统观点聚焦于化疗对癌细胞的直接杀伤,而化疗如何通过重塑机体的内在环境,特别是免疫系统,来间接影响转移进程,仍是一个未被充分探索的领域。为了回答这一关键
来源:Nature Communications
时间:2025-12-16
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AAV介导的Ant1基因部分恢复线粒体功能可保护Ant1-/-联合mtDNA突变小鼠免于扩张型心肌病
在生命科学的广阔图景中,线粒体扮演着细胞“能量工厂”的关键角色。当这座工厂出现故障,便会引发一系列被称为原发性线粒体病(Primary Mitochondrial Disease, PMD)的遗传性代谢障碍。PMD是影响儿童和成人最常见的遗传代谢疾病之一,发病率约为1/5000。其中,心肌病是PMD患者一个尤为凶险的并发症,约20-40%的PMD患者会在出生至27岁间发展为心肌病。数据显示,伴有心肌病的PMD患儿十年死亡率高达67-71%,远高于不伴心肌病患儿的18-26%。因此,开发有效治疗线粒体心肌病的方法,对于挽救这些最脆弱患者的生命至关重要。本研究聚焦于一种由核基因突变引起的特定PMD
来源:Nature Communications
时间:2025-12-16
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脊椎动物原肠胚形成过程中表现基因组的空间模式化:连接染色质梯度与胚胎轴向特化的新机制
在发育生物学的核心领域,一个经久不衰的谜题是:胚胎细胞如何在发育早期"感知"自身在胚胎中的位置,并据此决定分化命运?半个多世纪前,Lewis Wolpert提出的"位置信息"理论为理解这一过程提供了框架,认为形态发生素梯度为细胞提供了空间坐标。然而,这些短暂的信号梯度如何转化为稳定、精确的基因表达模式,始终是未解之谜。近年来,科学家们逐渐意识到表观遗传调控可能在这一过程中扮演关键角色。正如Wolpert早年预测,位置信息的建立可能需要基因组空间反应坐标系的参与。但由于技术限制,我们一直难以在早期胚胎中直接观察染色质景观的空间组织。现在,这项发表在《Nature Communications》上
来源:Nature Communications
时间:2025-12-16
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全基因组筛选揭示断裂诱导复制依赖多个不同检查点的新机制及其在基因组稳定性维持中的意义
当DNA双链发生断裂时,细胞会启动多种修复机制,其中断裂诱导复制(Break-Induced Replication, BIR)是修复单端双链断裂的重要途径。这种修复方式虽然能挽救断裂的染色体,但同时也是一把双刃剑——其修复过程极易引入基因突变、导致杂合性丢失和大规模染色体重排,这些正是癌症细胞的典型特征。因此,深入理解BIR的调控机制对于揭示基因组不稳定性起源和癌症治疗靶点开发具有重要意义。长期以来,科学家们对BIR机制的认识主要基于对单个候选基因的功能研究,这种零敲碎打的方式难以全面揭示BIR的复杂调控网络。为了突破这一局限,Liping Liu、Rosemary S. Lee等研究人员在
来源:Nature Communications
时间:2025-12-16
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单细胞蛋白质组学揭示人胶质母细胞瘤中中性粒细胞功能状态的异质性图谱
在恶性程度最高的原发性脑肿瘤——胶质母细胞瘤(GBM)的复杂微环境中,中性粒细胞作为数量最丰富的免疫细胞群体,其功能状态一直充满争议。传统观点认为这些细胞可能发挥抗肿瘤作用,但近年研究显示它们更常促进肿瘤生长、血管生成和免疫抑制。由于中性粒细胞存在显著的mRNA-蛋白质表达解离现象,单细胞转录组测序(scRNA-seq)难以准确反映其真实功能状态。更关键的是,单个中性粒细胞仅含约60皮克蛋白质,远低于常规蛋白质组学分析所需样本量,导致其功能异质性研究长期处于空白状态。为突破这一技术瓶颈,来自爱丁堡大学和维也纳生物中心的Pranvera Sadiku、Alejandro J. Brenes等研究
来源:Nature Communications
时间:2025-12-16
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PvMYB26基因突变降低普通菜豆荚果开裂揭示美洲农业起源
在人类文明发展史上,植物驯化是一个革命性的转折点,它将野生植物转化为支撑现代社会的粮食作物。然而,这一转化过程如何发生,特别是关键性状的遗传基础,一直是科学家们探索的热点。普通菜豆(Phaseolus vulgaris L.)作为全球最重要的食用豆类之一,其驯化历史尤为引人关注。研究表明,这种作物曾在中美洲和南美洲安第斯山脉地区被独立驯化,形成两个主要的基因池。但一个长期悬而未决的问题是:古人是如何驯化菜豆,使其失去野生祖先那种成熟的荚果自动开裂散播种子的特性?荚果开裂是豆科植物普遍存在的种子传播机制,干燥的荚果在成熟时会产生巨大的扭力使果皮突然开裂。这种特性在野生环境中有利于物种繁衍,但在农
来源:Molecular Plant
时间:2025-12-16
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mRNA-1010流感疫苗相较于佐剂灭活疫苗引发独特且增强的体液免疫应答
流感病毒每年在全球造成约10亿人感染、50万例死亡,尽管现有疫苗对高危人群有一定保护效果,但其对感染和疾病的预防能力仍有限(有效率仅26-56%)。传统灭活疫苗面临株系匹配难题和免疫应答广度不足的挑战,而mRNA疫苗技术在新冠疫情期间展现出快速研发、强免疫原性和多价抗原搭载等优势,但其在流感领域的应用潜力尚待深入解析。为明确mRNA平台能否突破现有疫苗局限,Moderna公司的研究团队在《npj Vaccines》发表论文,直接对比其研发的季节性流感mRNA疫苗mRNA-1010与已上市的佐剂灭活疫苗FLUAD(二者均含2022/2023北半球推荐的四价HA抗原)。研究通过多时间点(接种后第1
来源:npj Vaccines
时间:2025-12-16
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异源组合VSV-GP与天然样三聚体在兔体内诱导自体Tier 2 HIV抗体
人类免疫缺陷病毒(HIV)的疫苗研发是科学界面临的最严峻挑战之一。尽管抗逆转录病毒疗法能够有效控制病毒复制,但全球每年仍有超过130万新发感染病例,凸显了预防性疫苗的迫切需求。然而,HIV病毒的高突变率、其包膜蛋白(Env)的复杂结构以及免疫系统的逃逸机制,使得传统疫苗策略屡屡受挫。一个核心难题在于,自然感染中出现的广谱中和抗体(bnAbs)通常需要数年时间才能成熟,而疫苗需要在短时间内诱导出类似的保护性免疫反应。在此背景下,模拟天然Env三聚体结构的抗原设计成为焦点。这些“天然样”三聚体被稳定在病毒入侵细胞前的预融合构象,能更有效地展示中和抗体表位,同时减少非中和抗体的产生。另一方面,疫苗递
来源:npj Vaccines
时间:2025-12-16