• 综述：冉冉升起的新星：植物NLR免疫信号传导的统一机制

  侯东月|刘宇辰|林汉波|顾佳洁|钱俊成|王少飞|陈宇宗|Ju殿文|曾宪复旦大学上海免疫治疗工程研究中心药学科学学院，中国上海201203摘要微生物群与活性物质之间的广泛相互作用与健康和疾病密切相关。从基因组角度理解这些相互作用的机制及其潜在影响对于生物医学和药物研究非常重要。然而，现有的数据存储库往往缺乏系统的基因组整合。本文介绍了MASI微生物群-活性物质相互作用数据库的更新内容。此次更新包括：(1) 来自基因组的166,766个微生物群-药物相互作用和205,505个微生物群-食物相互作用的数据，这些数据通过415个生物合成基因簇（BGCs）、59个代谢基因簇（MGCs）以及约1200种微

  来源：Journal of Molecular Biology

  时间：2025-12-17

• 血基质和样本制备对血液标志物检测的影响

  该研究系统评估了不同血液基质类型与样本制备方法对蛋白质组学分析的影响，为临床生物标志物检测提供了关键参数参考。研究包含三个核心发现：第一，血液基质类型显著影响蛋白质检测能力，其中EDTA血浆结合Mag-Net制备法可实现最高蛋白质鉴定数量；第二，样本制备方法对数据完整性和重复性具有决定性作用， bead-based技术（如Mag-Net和ENRICH-iST）在提高检测灵敏度的同时需注意抗凝剂对目标蛋白的干扰；第三，血液样本前处理流程需标准化，特别是离心速度（2315g）和抗凝剂选择（EDTA优于柠檬酸）直接影响实验结果。实验采用五重交叉设计，选取三种健康志愿者的混合血液样本，涵盖血清（带/不

  来源：Journal of Proteome Research

  时间：2025-12-17

• 一种基于四聚体生物素-亲和素骨架的抗CD19（FMC63）Traptavidin融合蛋白，能够实现高亲和力的CAR-T细胞在白血病治疗中的应用

  CAR-T细胞疗法作为血液系统恶性肿瘤治疗的重要进展，近年来在实体瘤和复发/难治性癌症领域持续突破。本研究创新性地提出四聚体CAR-T（tCAR-T）系统，通过生物素-辅因子蛋白（TAv）的模块化设计，在保持传统CAR-T疗效的基础上显著提升治疗效能。该研究采用跨学科技术整合，涵盖抗体工程学、分子生物学和免疫学等多领域，为下一代细胞治疗产品开发提供了新范式。一、技术突破与系统创新研究团队构建了基于TAv（ truncated streptavidin）的四聚体抗体平台，通过基因编辑技术将CD8 hinge、CD8跨膜区、4-1BB共刺激域和CD3ζ信号域整合到TAv载体中。这种设计创新性地将四

  来源：Bioconjugate Chemistry

  时间：2025-12-17

• DIS3L2介导的RNA监控和细胞外囊泡包装机制可防止异常细胞RNA激活先天免疫系统

  外泌体在维持细胞RNA稳态中的关键作用及与干扰素通路的关联性研究一、研究背景与核心发现外泌体（EVs）作为细胞分泌的纳米级囊泡，其功能不仅限于细胞间通讯，更承担着重要RNA质量控制机制。本研究通过系统性分析EVs的RNA组分，揭示了其作为异常RNA"清道夫"的双重作用机制：一方面通过包裹异常RNA实现细胞外释放，另一方面与胞内DIS3L2酶解通路形成互补调控网络，共同维持细胞RNA稳态。二、关键实验发现1. **异常RNA的富集特征**：- EVs中tRNA前体、非编码RNA（ncRNA）加工中间体占比达68%，显著高于细胞质总RNA- 发现特异性富集的异常RNA类型： * 3'未延伸的tR

  来源：Proceedings of the National Academy of Sciences

  时间：2025-12-17

• 海洋硅藻内代谢组对温度及一种模型细菌的动态重组

  本文聚焦海洋浮游植物甲藻（*Thalassiosira pseudonana*）在不同温度与细菌共存条件下内代谢物（endometabolome）的动态变化及其对海洋碳循环的影响。研究通过代谢组学、转录组学和细菌吸收实验的多维度分析，揭示了环境参数对浮游植物代谢物组成调控的复杂性。### 一、研究背景与科学问题海洋表面溶解有机碳（DOC）的输入主要源于浮游植物细胞破裂释放的代谢物，而这一过程受温度和细菌群落协同影响。尽管已有研究认识到DOC对细菌碳源的重要性，但浮游植物代谢物如何随环境变化而动态调整，以及细菌如何反向调控代谢物释放仍不明确。本文通过温度梯度（14°C、20°C、28°C）和细菌

  来源：mSystems

  时间：2025-12-17

• 一种小鼠冠状病毒感染模型揭示了SARS-CoV-2辅助蛋白7a的病毒增殖活性和促炎作用

  ### 研究解读：SARS-CoV-2 7a蛋白的促病毒效应与炎症调控机制#### 1. 研究背景与核心问题冠状病毒 accessory proteins（辅助蛋白）在病毒复制和宿主免疫逃逸中发挥关键作用。SARS-CoV-2 编码的 ORF7a 基因产物 7a 蛋白具有独特的膜定位特征和潜在的功能多样性。此前研究认为 7a 通过干扰素信号通路（如抑制STAT2磷酸化）发挥抗病毒作用，但这一结论多基于体外过表达模型。本研究的核心目标在于：通过构建重组小鼠冠状病毒（rMHV），在完整病毒感染体系中解析 7a 的真实功能，特别是其与病毒复制和宿主炎症反应的关联。#### 2. 7a蛋白的分子特征与

  来源：Journal of Virology

  时间：2025-12-17

• 两种抗甲病毒双特异性单结构域抗体的体内疗效验证、冷冻电镜（cryo-EM）表位鉴定及其作用范围研究

  委内瑞拉马脑炎病毒（VEEV）是一种通过蚊虫传播的阿拉夫拉病毒属（Alphavirus）成员，其引发的脑炎在动物和人类中均可能导致高死亡率。尽管VEEV自20世纪70年代起被用作生物威胁剂，但至今仍缺乏FDA批准的疫苗或特效疗法。近年来，单域抗体（sdAb）因其独特的优势成为抗病毒治疗的研究热点。这类仅含重链可变区的纳米抗体具有小分子特性，可穿透组织屏障，且不易引发免疫反应。2023年的一项重要研究通过构建双价sdAb，在体外和体内实验中验证了其对抗VEEV及多种阿拉夫拉病毒的多价效应对策。### 研究背景与科学意义阿拉夫拉病毒属包含引发脑炎（如VEEV、西尼罗河病毒、 Eastern equ

  来源：Journal of Virology

  时间：2025-12-17

• WSSV IE1蛋白对宿主Src-PI3K-Akt信号通路的劫持抑制了凋亡和自噬防御机制，从而促进了病毒的增殖

  白斑综合征病毒（WSSV）通过劫持宿主PI3K-Akt信号通路实现免疫逃逸的分子机制研究摘要 白斑综合征病毒（WSSV）作为全球甲壳类水产养殖中最具破坏性的病原体之一，其感染机制研究具有重要应用价值。本研究首次揭示了WSSV通过即时早期蛋白IE1激活宿主PI3K-Akt信号通路的关键机制，阐明了该病毒抑制宿主凋亡和自噬的分子路径，为抗病毒药物研发提供了新靶点。一、研究背景与意义 白斑综合征病毒主要感染对虾等甲壳类生物，导致养殖损失超过80%。尽管已有研究证实PI3K-Akt通路在病毒增殖中的重要作用，但其具体激活机制及关键调控因子仍不明确。本研究通过多维度实验技术，首次解析了WSSV IE

  来源：Journal of Virology

  时间：2025-12-17

• 棘球绦虫抗原B在体外具有清除脂多糖（LPS）的作用，从而阻止树突状细胞通过TLR4途径被激活

  Echinococcus granulosus sensu lato抗原B（EgAgB）是一种由包虫幼虫分泌的寄生虫脂蛋白，广泛存在于包虫囊液（HF）中。近年来，学者们发现EgAgB具有免疫调节功能，能够抑制宿主对脂多糖（LPS）等病原相关分子模式（PAMPs）的过度炎症反应。然而，其作用机制尚不明确。本研究通过原代EgAgB（nEgAgB）和重组EgAgB8/1（rEgAgB）对骨髓来源的树突状细胞（BMDC）的影响，结合分子动力学模拟和功能实验，揭示了EgAgB通过捕获并干扰LPS与TLR4/MD2复合物的结合，抑制炎症信号通路的关键作用。### 研究背景与核心问题包虫幼虫在宿主体内形成囊

  来源：Infection and Immunity

  时间：2025-12-17

• BRAP通过破坏癌细胞周期调控并增强免疫逃逸机制，促进肝细胞癌的肿瘤发生

  肝细胞癌（Hepatocellular Carcinoma, HCC）作为全球第三大常见癌症死亡原因，其发病机制和诊疗策略仍存在重大挑战。近年来，关于BRAP（BRCA1相关蛋白）在HCC中的功能研究逐渐成为热点。本研究通过多组学整合分析、细胞实验和动物模型验证，系统揭示了BRAP在HCC演进中的双重作用：既促进肿瘤细胞增殖，又重塑免疫抑制微环境。这些发现为HCC的早期诊断、预后评估及免疫联合治疗提供了新靶点。### 一、BRAP在HCC中的临床表型特征研究发现，BRAP在HCC组织中的表达水平显著高于正常肝组织及癌旁组织（p<0.001）。免疫组化（IHC）数据显示，BRAP蛋白主要定位于细

  来源：Journal of Hepatocellular Carcinoma

  时间：2025-12-17

• 对于伴有I-II型门静脉血栓的肝细胞癌患者，肝切除术与靶向治疗联合PD-1抑制剂的治疗效果比较研究

  肝细胞癌合并门静脉肿瘤血栓（PVTT）的治疗选择长期存在争议。本研究通过回顾性分析53例PVTT分型为I-II期的患者，比较肝切除术（LR）与靶向治疗联合PD-1抑制剂（TT+PD-1）的疗效差异，为临床决策提供依据。研究采用多中心数据收集方法，纳入2019-2024年间接受LR（23例）或TT+PD-1（30例）治疗的HCC患者。所有病例均经过病理学或影像学确诊，排除存在肝静脉血栓或远处转移的病例。PVTT分型依据Cheng分类系统，其中I型表现为段分支血管受累，II型涉及主门静脉，这两种类型占全部PVTT病例的76.9%。治疗策略方面，LR组采用开放式或腹腔镜手术，其中82.6%患者接受主

  来源：Journal of Hepatocellular Carcinoma

  时间：2025-12-17

• 慢性心力衰竭患者血清TNFAIP3和NLRP3水平作为重大不良心血管事件的新生物标志物：一项队列研究

  慢性心力衰竭（CHF）的炎症机制与生物标志物预测价值研究进展一、研究背景与临床需求CHF作为全球性心血管疾病负担，其5年死亡率高达50-70%（欧洲心脏病学会2021年报告）。传统评估体系主要依赖NT-proBNP等生化指标及超声心动图参数，对早期风险分层存在局限性。近年来炎症介导的心肌损伤和纤维化机制逐渐被揭示，其中TNFAIP3作为NF-κB信号通路的负调控因子，与NLRP3炎症小体激活存在双向调节关系。本研究通过多维度分析，首次系统验证了血清TNFAIP3/NLRP3组合在CHF预后评估中的临床价值。二、研究设计与方法创新研究采用严谨的队列设计，纳入2024年5月至12月期间Q医院确诊的

  来源：Journal of Inflammation Research

  时间：2025-12-17

• 揭示类风湿性关节炎中的环状RNA特征：新型生物标志物及其临床意义

  该研究聚焦于类风湿性关节炎（RA）患者外周血单核细胞（PBMCs）中环RNA（circRNAs）的表达特征及其临床意义。研究采用双阶段设计，首先通过高通量RNA测序筛选出RA患者与健康对照（HCs）间差异表达的157个circRNA，其中91个上调，66个下调。随后通过独立队列的实时荧光定量PCR（RT-qPCR）验证，最终确定6个具有显著诊断价值的circRNA：hsa_circ_0001394、hsa_circ_0001998、hsa_circ_0009172、hsa_circ_0006732、circRNA2842和circRNA8330。这些circRNA的血浆或细胞质稳定特性使其成为

  来源：Journal of Inflammation Research

  时间：2025-12-17

• ITGB7 调节胰腺癌中的炎症和免疫微环境，并增强基于检查点抑制剂的免疫疗法效果

  本研究首次系统揭示了整合素β7（ITGB7）在胰腺导管腺癌（PDAC）中通过调控炎症微环境和免疫细胞浸润影响免疫治疗响应的机制。通过整合临床样本分析、蛋白质组学、免疫学实验和生物信息学方法，研究发现ITGB7在PDAC组织中的过表达与患者对PD-1抑制剂治疗敏感度提升及预后改善显著相关，同时发现ITGB7通过多重分子网络调控肿瘤免疫微环境。**1. ITGB7与免疫治疗疗效的关联性**临床队列分析显示，ITGB7高表达组患者的客观缓解率（ORR）达47.1%，显著高于低表达组的22.7%（p=0.032）。生存分析表明，ITGB7高表达患者无进展生存期（PFS）延长至18.9个月，较对照组提高

  来源：Journal of Inflammation Research

  时间：2025-12-17

• 综述：病毒致癌机制：人类癌症中的DNA病毒和RNA病毒

  病毒致癌机制的多维度解析与临床干预策略摘要部分指出，全球13%的恶性肿瘤与病原体相关，其中每年新增的2.2百万例肿瘤病例中约与病毒感染直接相关。已确认的人类致癌病毒包括EB病毒、HBV、HCV、KSHV、HPV等，另有SV40、JCV等虽未列入但存在潜在致癌风险的病毒。研究系统性地比较了DNA和RNA肿瘤病毒的致癌机制，揭示了其通过干扰肿瘤抑制蛋白、诱导慢性炎症和免疫逃逸等共同通路促进肿瘤形成的特征，为开发精准治疗和预防策略提供了理论依据。一、病毒致癌机制的共性特征1. 病毒遗传物质整合机制DNA病毒通过直接整合宿主DNA基因组，如HPV的E6/E7蛋白可分别抑制p53和Rb蛋白功能，破坏DN

  来源：Journal of Inflammation Research

  时间：2025-12-17

• 系统性硬化症新型生物标志物及潜在治疗靶点的鉴定：基于血浆蛋白质组学与转录组学的全方位孟德尔随机化分析

  系统性硬化症（SSc）是一种以皮肤和内脏器官纤维化为特征的复杂自身免疫性疾病。近年来，随着组学技术和因果推断方法的进步，研究者们开始从多维度探索SSc的分子机制及潜在生物标志物。本文基于一项最新研究，从血浆蛋白组学、单细胞转录组学及药物网络分析等角度，系统阐述了SSc的致病机制并提出了新的诊断和治疗靶点。### 一、研究背景与核心问题SSc的病理机制涉及免疫异常、血管病变和细胞外基质（ECM）过度沉积三个关键环节。尽管已有研究关注到IFN-α信号通路和TGF-β通路的作用，但现有生物标志物（如抗拓扑异构酶I抗体）在早期诊断和疾病分期中的局限性仍亟待解决。当前临床治疗主要依赖免疫抑制剂和抗纤维化

  来源：Journal of Inflammation Research

  时间：2025-12-17

• 后COVID-19时代儿童支原体肺炎感染中的年龄特异性细胞因子谱分析：一项回顾性研究

  ### 研究解读：儿童肺炎支原体肺炎（MPP）的年龄特异性免疫响应与COVID-19抗体关联性分析#### 一、研究背景与意义肺炎支原体（Mycoplasma pneumoniae, MP）是儿童社区获得性肺炎（CAP）的主要病原体，其感染率在不同年龄段存在显著差异。研究显示，学龄儿童（6-12岁）的MP感染率显著高于婴幼儿（0-2岁）和学龄前儿童（3-5岁）。这一现象不仅与接触环境相关，更与儿童免疫系统发育的阶段性特征密切相关。例如，婴幼儿的免疫反应以先天性免疫为主，而学龄儿童的适应性免疫更为成熟。然而，现有研究多聚焦于单一年龄段或仅分析血清指标，缺乏对全年龄段儿童系统性免疫（血清）与局部肺

  来源：Journal of Inflammation Research

  时间：2025-12-17

• 鞘氨醇烷基胺作为原发性干燥综合征肺部病变中可能具有相关性的代谢物

  干燥综合征（pSS）是一种以唾液腺和泪腺等外分泌腺体损伤为特征的自身免疫性疾病，其肺部并发症（如间质性肺病）的发生率高达8%-38%，但具体机制仍不明确。近年来，代谢组学技术为解析疾病多器官共病机制提供了新视角。本研究通过整合文献计量学、靶向代谢组学、动物模型及化学蛋白质组学技术，系统揭示了鞘脂类代谢物sphinganine在pSS相关肺部损伤中的核心作用，并首次提出其通过激活内质网应激通路（ER stress）调控非肌肉肌轻链IIA（Myh9）蛋白表达，从而驱动多器官损伤的新机制。### 一、研究背景与意义pSS患者常伴随肺部纤维化等全身性并发症，但现有研究多聚焦于免疫学机制，对代谢层面的调

  来源：Journal of Lipid Research

  时间：2025-12-17

• DDR1通过激活NF-Kappa B调控下肢动脉疾病中的股动脉钙化

  该研究聚焦于下肢动脉疾病（LEAD）中的 medial arterial calcification（MAC）机制，通过整合患者样本、动物模型及细胞实验，揭示了DDR1蛋白通过激活NF-κB信号通路驱动MAC的关键作用。研究显示，MAC在LEAD中具有显著的血管床特异性，下肢动脉（尤其是股动脉）的钙化程度远高于颈动脉，且其分子调控机制存在独特性。**核心发现与机制解析** 1. **血管床特异性钙化差异** - 人类样本分析表明，股动脉MAC发生率（72%）显著高于颈动脉（约40%），且MAC评分与下肢截肢风险呈正相关。动物实验进一步验证，在西方饮食（WD）喂养的 Apoe−/−小鼠

  来源：Acta Physiologica

  时间：2025-12-17

• 综述：基因的“破坏”与“创造”：植物新性状的起源

  基因融合在植物进化与适应中的机制与功能研究植物在应对全球气候变化和农业需求压力时，通过基因融合这一分子机制实现快速进化与功能创新。本文系统梳理了植物基因融合的分子机制、功能演化及其检测技术，揭示了这一过程在作物改良中的潜在应用价值。一、基因融合的生物学意义1. 遗传多样性构建基因融合作为非同义重组的重要形式，能够打破传统基因边界。在水稻中，约6.8%的剪接异构体为融合转录本，而 chromosome 3区域融合基因占比高达47%（Zhang等，2013）。拟南芥基因组中17%的基因存在串联排列特征，其中约30%由不等交换重组形成（Hagel等，2017）。2. 代谢功能创新融合基因通过多效性蛋

  来源：New Phytologist

  时间：2025-12-17

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