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华中农大CRISPR疗法综述刊登国际期刊
生物通报道:近期,来自华中农业大学、中科院武汉病毒研究所、巴基斯坦医学科学研究所以及华中科技大学同济医学院的研究人员,在国际著名学术期刊《Oncotarget》发表题为“CRISPR/Cas9 therapeutics: a cure for cancer and other genetic diseases”的综述文章。这项研究的通讯作者是华中农业大学动物科学技术学院、动物医学院的张淑君教授。近年来,可用的癌症治疗方法已经发展到改善病人的预后。化疗、放疗和手术被结合起来使用,以减少癌细胞复发,并使寿命最多增加了五年。然而,有害的副作用和毒性提高了死亡率,同时也大大降低了患者生活的质量。对癌症
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Cancer discovery:CRISPR筛选存在假阳性
生物通报道:基因筛选是经典的生物学研究方法,常用于鉴定在生物学过程中起作用的基因。十多年来,RNAi一直是这个领域的王者。不过,CRISPR-Cas9正在逐渐瓦解RNAi的统治地位。Cancer discovery杂志最近发表的一项研究显示,CRISPR-Cas9能够更全面的评估癌细胞弱点,筛选出更多的癌细胞必需基因。不过CRISPR筛选也会产生假阳性结果,需要设立对照谨慎分析。RNAi主要是引入siRNA或者shRNA,让细胞降解相应的mRNA,通过功能缺失表型来进行基因筛选。不过RNAi比较容易出现错误,siRNA/shRNA的脱靶效应会引起假阳性结果,siRNA/shRNA缺乏活性会引起
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Cancer Discovery:细胞对CRISPR的应答不容忽视
生物通报道:这两年几乎人人都在谈论CRISPR基因组编辑,那么细胞对这个系统的闯入作何感想呢?Cancer Discovery杂志最近发表的一项研究指出,细胞会对CRISPR-Cas9产生一种不容忽视的应答。细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争,为此它们演化出了多种防御机制,CRISPR-Cas适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合,可以在引导RNA的指引下,靶标并切割入侵者的遗传物质。这种特性使CRISPR系统成为了基因组编辑和基因功能研究的实用工具。CRISPR-Cas9能够很方便的在哺乳动物细胞中进行体细胞遗传筛选。但哈佛大学Dana-Far
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顶尖干细胞专家:让骨髓移植更安全的方法
生物通报道:最近,哈佛大学干细胞研究所(HSCI)的科学家们,开发出了一种使骨髓——造血干细胞——移植更安全的疗法,因此,可能更广泛适用于数以百万计患有血液疾病(如镰状细胞性贫血、地中海贫血和艾滋病)的人。目前,骨髓移植是治疗这些血液疾病唯一有效的疗法。但是,对于新的、移植的干细胞来说,要发挥它们的作用,首先必须“驱逐”或杀死有缺陷的干细胞。要做到这一点,就需要病人忍受化疗和辐射——对身体的恶性攻击,会产生终生的影响。最近在《Nature Biotechnology》杂志上发表的一项研究中,HSCI和马萨诸塞州总医院(MGH)的研究人员,与波士顿儿童医院以及Dana Farber癌症研究所合作
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两篇Nature Biotechnology聚焦CRISPR基因组编辑新工具
生物通报道 在2015年发表于Cell杂志上的一项研究中,哈佛-麻省理工Broad研究所的张锋及其同事们报告称发现了一种不同的CRISPR系统:CRISPR–Cpf1,其有潜力实现更简单、更精确的基因组工程操作。自此之后,这一CRISPR基因组编辑新型工具吸引了世界各地实验室的广泛注意(张锋Cell:新一代CRISPR基因组编辑系统 )。2016年4月20日,来自哈尔滨工业大学、清华大学的研究人员报告称,他们获得了Cpf1/CRISPR RNA复合物的晶体结构。这一重要的研究成果发布在Nature杂志上(哈尔滨工业大学Nature发表CRISPR研究重要成果 )。同日,德国马克思普
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CRISPR牛人:利用CRISPR发现未知基因功能
生物通报道:自2012年底CRISPR/Cas9最初被用于基因编辑之后,这个前途光明的技术已经被应用到了许多研究领域,而且随着技术的改良,越来越多的研究团队利用CRISPR进行大规模的遗传筛选,比如用于识别导致癌症抵抗治疗的突变,或者加速药物靶标评估。RNA干扰,相比于CRISPR/Cas9 在遗传筛选方面的作用,无论是效率和特异性方面,目前都难以望其项背了。上篇:CRISPR领衔科学家探讨CRISPR遗传筛选张锋解析如何利用CRISPR发现未知基因功能CRISPR 系统的一大亮点在于导向RNAs的特异性,张锋说,这样一来我们就能生成靶向每个基因或某个基因多个位点的CRISPR导向慢病毒库。然
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CRISPR遗传筛选:eSpCas9 突变
生物通报道:基因编辑,尤其是CRISPR/Cas9系统,从某种意义上来说就像是一辆正在生产的闪亮新车,在构建主要框架的同时也开始启动,而且还准备开始一路飚车。自2012年底CRISPR/Cas9最初被用于基因编辑之后,这个前途光明的技术已经被应用到了许多研究领域,而且随着技术的改良,越来越多的研究团队利用CRISPR进行大规模的遗传筛选,比如用于识别导致癌症抵抗治疗的突变,或者加速药物靶标评估。RNA干扰,相比于CRISPR/Cas9 在遗传筛选方面的作用,无论是效率和特异性方面,目前都难以望其项背了。同时,譬如MD安德森癌症中心等处的研究人员也开始进一步了解CRISPR/Cas9的特性和局限
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张锋Science文章:靶向RNA的新型CRISPR系统
生物通报道 来自麻省理工学院-哈佛大学Broad研究所、麻省理工学院、美国国立卫生研究院、罗格斯大学新布朗斯维克分校和俄罗斯Skolkovo理工学院的研究人员,确定了一个靶向RNA而非DNA的新型CRISPR系统的特征。研究结果发表在《科学》(Science)杂志上。这种新方法有潜力开辟一条强大的细胞操控途径。鉴于DNA编辑会造成细胞基因组永久性的改变,这一基于CRISPR的RNA靶向方法能允许研究人员生成可以上调或下调的短暂改变,相比现有的RNA干扰技术具有更大的特异性和功能。Broad研究所核心成员张锋(Feng Zhang)博士以及NIH进化基因组学课题组负责人Eugene
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张锋、庄小威发表新的CRISPR标记系统
生物通报道:5月27日,Nature子刊《Scientific Reports》在线刊登了美国霍华德休斯医学研究所、哈佛大学、麻省理工大学(MIT)-哈佛Broad研究所、MIT McGovern脑研究所的一项最新研究成果,题为“An RNA-aptamer-based two-color CRISPR labeling system”。这项研究提出了一种基于RNA-适配子的双色CRISPR标记系统。MIT-哈佛Broad研究所的CRISPR先锋——张锋博士、哈佛大学华裔女科学家、美国国家科学院院士庄小威,都是这项研究的共同作者。本文通讯作者是哈佛大学、霍华德休斯医学研究所的Siyuan Wa
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中山大学等开发RNA编辑新工具
生物通报道:CRISPR-Cas9系统使用一段引导RNA(其与Cas9蛋白结合起来才能发挥作用)来靶定一段DNA,并裂解双链DNA。这一现象提出了一个问题:由一个Dicer结合RNA元件和一段反义RNA组成的一种人造小RNA(asRNA,是否也能用来诱导Dicer处理和降解一段特定的RNA呢?为此,5月25日在国际肿瘤期刊《Oncotarget》发表的一项研究中,来自中山大学、深圳大学第一附属医院、汕头大学等处的研究人员开发出一种新的方法——命名为DICERi,用于基因沉默或RNA编辑。中山大学生命科学学院的张勇教授、深圳大学第一附属医院的Weiren Huang和Zhiming Cai是这篇
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利用猪单个胚胎建立高效快速的CRISPR/Cas9打靶位点检测方法
生物通“核心刊物”迎来了新期刊:科学通报,中国科学C辑:生命科学,这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的,我国学术期刊中的知名品牌,被国内外各主要检索系统收录,如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI,英国的SA,日本的《科技文献速报》等。目前针对每期的重点内容,生物通将展开详细推荐,欢迎读者共同参与……生物通报道:基因工程猪可作为动物模型研究人类疾病, 也是异种器官移植最合适的供体. CRISPR/Cas9系统是高效特异的基因编辑工具. 近期来自温州医科大学检验医学院, 生命科学学院的研究人员通
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华人女科学家:更快、更有效的CRISPR编辑方法
生物通报道 加州大学伯克利分校的科学家们开发出了一种更快、更有效的方法采用CRISPR-Cas9来改造小鼠基因,由于这一新的基因编辑工具易于使用,简化了一个越来越受到欢迎的研究程序。由于其有潜力纠正人类的简单遗传疾病,CRISPR-Cas9已引起全世界的广泛关注,基础研究人员对于CRISPR-Cas9有能力帮助他们了解更复杂的疾病,包括癌症和痴呆症的病因并开发出新疗法感到非常兴奋。要做到这一点,他们需要去敲除或改造实验室动物,尤其是小鼠的一些特异基因,看看是什么地方出了错。当前构建这些“基因敲除”或“基因敲入”小鼠的金标准是,在小鼠胚胎干细胞中编辑这些基因,利用这些细胞构建出嵌合小
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齐磊博士Cell发布CRISPRi研究新成果
生物通报道 来自斯坦福大学、加州大学旧金山分校的研究人员报告称,他们利用CRISPR干扰(CRISPRi)技术,对枯草杆菌的必需基因进行了全面的功能分析。这项研究发布在5月26日的《细胞》(Cell)杂志上。斯坦福大学的齐磊(Lei S. Qi)博士、Kerwyn Casey Huang博士,以及加州大学旧金山分校的Carol A. Gross博士是这篇论文的共同通讯作者。齐磊早年毕业于清华大学,当前的主要研究方向是应用基因组工程和CRISPR技术研究与细胞分化、增殖、表观遗传调控和疾病相关的遗传互作网络。已经在Cell、Nature Biotechnology、Nature Me
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Nature子刊:CRISPR打造强大成像系统
生物通报道:纽约大学的研究团队在CRISPR-Cas9的基础上开发了一个定向检测基因组区域的活体成像系统。该系统能够精确观测基因组位点和细胞核结构,揭示细胞核改变在基因表达调控和其他细胞过程中的重要作用。这一研究成果发表在五月二十五日的Nature Communications杂志上。CRISPR-Cas9原本是细菌在漫长的进化史中演化出的重要防御机制。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合,可以在sgRNA的指引下,靶标并切割入侵者的遗传物质。 2012年研究者们利用这一特点,将CRISPR系统发展成了强大的基因组编辑工具。现在CRISPR-Cas9基因组编辑系统的应用延
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Science发布CRISPR技术应用新突破
生物通报道 根据发表在《科学》(Science)杂志上的一项新研究,通过采用基因编辑工具CRISPR来构建独特的遗传“条形码”,就可以在活体生物内追踪细胞谱系。这一技术进展可能加深我们对一系列细胞过程的认识。尽管当前存在几种不同的追踪细胞谱系的方法,每一种均有局限性。例如,研究者们可以利用染料来追踪子细胞的产生,但却无法认识这些后代细胞之间的关系。领导这一研究的是华盛顿大学基因组科学教授、霍华德休斯医学研究所研究员Jay Shendure博士,及哈佛大学-麻省理工学院Broad研究所的Alexander F. Schier。立即索取Clontech CRISPR相关产品的详细技术资
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遗传学大牛Nature Methods发布CRISPR重要成果
生物通报道 CRISPR-Cas9系统使得研究人员能够编辑许多生物体和细胞类型的DNA序列。然而,科学家们也日益认识到可以利用它来激活基因的表达。为此,他们构建出了大量可激活Cas9蛋白的合成基因来研究基因功能或在潜在的治疗方法中弥补不充足的基因表达。哈佛大学Wyss生物启发工程研究所核心教员、系统生物学平台负责人、哈佛医学院遗传学教授George Church博士说:“利用CRISPR-Cas9系统的各种工程变体来选择性激活基因,这种可能性令许多研究人员询问,到底哪种可获得的合成Cas9激活蛋白可以用来实现他们的目的。独特地设计出所有的合成Cas9激活蛋白,并在不同的环境中测试它
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CRISPR先驱发表研究新成果
生物通报道:细菌和古生菌一直在与入侵者做斗争,为此它们演化出了多种防御机制,CRISPR-Cas适应性免疫系统就是其中之一。Cas1-Cas2蛋白复合体会捕获30–40bp的外源DNA,将它们整合到CRISPR的间隔区,形成自己的免疫记忆。如果这种外源DNA再次入侵,细菌就能够及时将其剪切,从而保护自身安全。加州大学伯克利分校的研究团队前不久在Molecular Cell杂志上发表文章,揭示了CRISPR介导免疫记忆的一个重要机制。这篇文章的通讯作者是著名CRISPR先驱Jennifer A. Doudna。Doudna教授是CRISPR技术的共同开发者,曾因这一技术获得了“生命科学突破奖”(
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CRISPR:让寨卡病毒无所遁形
■记者 袁一雪近日,一种快速检测寨卡病毒的试纸诞生,它的出现或许能够降低小头症婴儿的出生率。这种神奇的方法来自CRISPR技术。这个自2013年以来风靡世界的基因编辑技术正在生物医学研究领域引起一场巨变。寨卡病毒肆虐全球,为了对抗它,科学家一边积极寻找预防的方法,一边也在开发快速检测的方法。近日,一个由美国哈佛大学维斯生物启发工程研究所合成生物学家James Collins博士领导的国际合作小组开发出一种低成本的基于试纸的快速诊断系统,该系统能够毒株特异性地检测寨卡病毒,而且它可能很快被用来在现场筛查血液、尿液或唾液样品。相关研究结果于2016年5月6日在线发表在Cell期刊上。这种试纸的灵感
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CRISPR突破性成果:首次在活体动物中除掉HIV
生物通报道:艾滋病在世界范围内广泛传播,严重威胁着人类健康和社会发展,一直受到人们的高度重视。近十年来HIV的治疗和预防已经取得了巨大的进步,HIV携带者的寿命大大延长,新HIV感染者已经从2002年的三百三十万减少到了2012年的两百三十万。但人们仍未找到治愈这种疾病的有效途径,也没有开发出相应的疫苗。HIV-1是引起艾滋病的主要病原体。Temple大学的研究人员首次使用CRISPR-Cas9基因编辑技术,成功从活体动物基因组中切除了HIV-1 DNA。这一突破性研究发表在Gene Therapy杂志上,是通过基因编辑治疗HIV的关键一步。细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争,为此它们演化出了
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5月6日《科学》杂志精选
在人体内能促进HIV免疫反应的抗体两项新的研究揭示,给予一种能与HIV结合的强效广谱中和抗体可在人体内激发强效免疫反应,它甚至能加快清除被感染的细胞。首先,Till Schoofs等人分析了一个临床试验的结果,在该试验中,15名感染HIV患者得到了一种广谱中和抗体(bNAb)的单次注射,这些人几乎都经历了病毒载量的短暂减少。在6个月的过程中,对照组中的抗体中和活性没有显示在广度和效力上的持续改善。相反,在15名HIV阳性者中,除一人外的其他所有输注bNAb 3BNC117者都在24周时显示了抗病毒的广度或功效,其功效范围的排布为从弱小至显著。值得注意的是,该病毒在24周时似乎对3BNC117产