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RNA-Seq数据预处理对膀胱癌亚型分类的重要性
在癌症研究领域,精准的分子亚型分类对于疾病预后和治疗响应至关重要。膀胱癌作为一种常见的泌尿系统恶性肿瘤,其亚型分类与预后和治疗效果密切相关。然而,RNA-Seq数据预处理方法的选择对分子亚型分类的准确性和一致性有着显著影响。为此,西班牙巴塞罗那医院德尔马研究所和巴塞罗那瓦尔德希布伦肿瘤研究所的研究人员开展了一项研究,旨在评估不同RNA-Seq预处理工具和方法对膀胱癌亚型分类的影响,以期为标准化RNA-Seq流程提供科学依据,从而提高膀胱癌分子亚型分类的可靠性。研究背景部分指出,尽管单细胞RNA测序和多组学方法等新技术为癌症分类带来了新的机遇,但RNA测序(RNA-Seq)仍然是一个强大且具有成
来源:BMC Research Notes
时间:2025-02-11
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微生物多营养源生物量产率的奥秘:拓展模型揭示营养互作新机制
在自然界中,微生物的生长环境复杂多样,营养源的种类、浓度和可利用性都在不断变化。微生物利用营养源来生成生物量并进行复制,当只有单一营养源时,其产生的生物量与该营养源的初始量通常呈线性关系,“黑箱模型”(black box models)能很好地预测这种情况。但在自然环境里,微生物往往面临多种营养源,以往研究却常忽略不同营养源类型的差异,且多聚焦特定生长阶段,无法全面捕捉整个生长曲线的生物量变化。同时,对微生物生长建模面临诸多挑战,如准确估计动力学参数、整合热力学原理以及处理计算复杂性等问题。因此,深入研究多种营养源对微生物生物量产率的影响至关重要,这能帮助人们更好地理解微生物在自然环境中的生长
来源:npj Systems Biology and Applications
时间:2025-02-11
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miR398靶向水稻中的含铜硒结合蛋白(SBP)及其在植物中的系统发育分析揭示了新的调控模块
随着全球气候变化加剧,植物频繁面临热、冷、干旱和盐碱等非生物胁迫,这些胁迫导致活性氧(ROS)过量积累,进而损伤细胞机制。超氧化物歧化酶(SODs)是抵御ROS积累的主要防御酶,而miR398通过靶向Cu/Zn超氧化物歧化酶(CSDs)在转录后水平调控SOD表达,维持ROS水平平衡。然而,除了CSDs,miR398是否还靶向其他Cu2+蛋白以及这种靶向关系在植物中的保守性尚不清楚。为此,美国俄克拉荷马州立大学生物化学与分子生物学系的David Payne和Ramanjulu Sunkar团队开展了相关研究,旨在揭示miR398是否靶向硒结合蛋白(SBP)以及这一模块在植物中的保守性。研究人员首
来源:BMC Plant Biology
时间:2025-02-11
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铁纳米颗粒增强甜椒耐碱胁迫能力:从光合作用到抗氧化防御的调控机制
碱胁迫(Alkaline Stress, AS)对植物生长和营养品质具有显著的负面影响,尤其是对甜椒(Capsicum annuum L.)等经济作物。近期,一项发表在《BMC Plant Biology》上的研究通过施用铁氧化物纳米颗粒(FeNP)显著缓解了碱胁迫对甜椒的不利影响,增强了其生长和代谢功能。该研究由国外研究机构主导,揭示了FeNP在提高甜椒耐碱性方面的潜在机制,为农业生产中应对碱胁迫提供了新的策略。甜椒作为一种重要的经济作物,不仅富含维生素、黄酮类化合物和类胡萝卜素等营养成分,还在食品、化妆品和制药行业中有着广泛应用。然而,碱胁迫(Alkaline Stress, AS)作为一
来源:BMC Plant Biology
时间:2025-02-11
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己糖激酶i直接与线粒体VDAC1和VDAC2的带电膜埋谷氨酸结合
探秘 HKI-VDAC 复合体组装机制:结构与功能的新洞察德国奥斯纳布吕克大学分子细胞生物学系的 Sebastian Bieker、Michael Timme 等研究人员在《Communications Biology》期刊上发表了题为 “Hexokinase-I directly binds to a charged membrane-buried glutamate of mitochondrial VDAC1 and VDAC2” 的论文。该研究揭示了己糖激酶 I(HKI)与线粒体电压依赖性阴离子通道(VDAC1 和 VDAC2)相互作用的关键机制,为理解细胞代谢调控、肿瘤发生和神经退行
来源:Communications Biology
时间:2025-02-11
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通过基因组学和宏基因组学探索DNA原位降解和博物馆储存
探究考古骨骼 DNA 在不同环境下的降解与微生物群落作用:对博物馆藏品保存的启示近期,丹麦国家博物馆环境考古与材料科学部门的研究人员安妮・玛丽・赫伊耶・埃里克森(Anne Marie Høier Eriksen)等人,在《Communications Biology》期刊上发表了题为 “Exploring DNA degradation in situ and in museum storage through genomics and metagenomics” 的论文。该研究通过对格陵兰岛出土驯鹿肋骨的分析,深入探讨了骨骼 DNA 在原位和博物馆存储条件下的降解情况,以及微生物群落对骨骼的
来源:Communications Biology
时间:2025-02-11
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多组学分析揭示脊髓衰老过程中的基因表达特征
浙江大学医学院领导的研究团队近日在《Communications Biology》期刊发表了题为 “Multiomics identify the gene expression signature of the spinal cord during aging process” 的论文。这项研究通过多组学技术系统地揭示了脊髓衰老过程中的基因表达特征,为理解脊髓衰老的分子机制提供了重要依据,有望为开发干预脊髓衰老相关疾病的策略奠定基础,对神经科学和老年医学领域意义重大。一、研究背景随着全球人口老龄化加剧,与年龄相关的长期残疾问题日益突出。脊髓作为中枢神经系统的重要组成部分,其衰老会影响运动、感
来源:Communications Biology
时间:2025-02-11
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融合认知框架:为言语产生研究开辟新方向
言语产生(Word production)是将想法转化为产生口语单词的运动动作的过程。传统上,研究该过程有两种方法,即心理语言学方法(psycholinguistic approach)和运动言语方法(motor speech approach),它们聚焦于产生过程的不同阶段。本视角文章强调了这两种方法的优势,并将其与更广泛的行动和认知框架理论相结合,为语言产生研究开辟新方向。文章探讨了关于说话者如何评估言语产生是否顺利(监测,monitoring)、如何应对困难(控制)以及如何纠正错误(修复)的模型。每个模型都将语言产生研究与其他认知领域的见解相结合,证明了将更广泛的认知框架更紧密地整合到言
来源:Nature Reviews Psychology
时间:2025-02-11
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综述:卤化物钙钛矿中的八面体单元
八面体单元:卤化物钙钛矿的功能核心金属卤化物钙钛矿(ABX3)凭借其独特的八面体[B-X6]单元(尺寸5−6 Å),成为光电器件领域的新星。这一由B位金属阳离子与X位卤素阴离子构成的八面体,直接决定了材料的带隙、激子结合能和载流子迁移率等关键参数。构型调控与性能关联通过旋转、扭曲或化学取代(如Sn2+/Pb2+替换)改变八面体倾角(tilt angle),可显著调控钙钛矿的相变温度和缺陷态密度。例如,CsPbI3中八面体收缩会诱导从立方相到正交相的结构转变,进而影响其光伏转换效率(PCE)。先进表征与设计策略同步辐射X射线吸收谱(XAS)和冷冻电镜(cryo-EM)能精准解析八面体局部畸变。通
来源:Nature Reviews Chemistry
时间:2025-02-11
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十年狩猎数据揭秘西班牙野生有蹄类与赤狐分布,为生物多样性保护提供关键支撑
在欧洲,依据《栖息地指令》(Habitats Directive)和《鸟类指令》(Bird Directive 2009/147/CE),各成员国需每六年汇报一次栖息地和物种的保护状况。然而,西班牙却面临着挑战。一方面,对于那些没有被欧盟列为重点关注对象的物种,西班牙尚未建立起国家级的哺乳动物监测项目,这使得评估这些物种的分布范围和数量变得困难重重。另一方面,要想在大尺度上对哺乳动物进行监测并非易事,公民科学虽然在鸟类和蝴蝶等生物的监测中发挥了重要作用,但由于哺乳动物大多在夜间活动,难以被发现,且需要特定的观察技术,导致通过公民科学进行的哺乳动物监测相对较少。在这样的背景下,狩猎产量数据的价值
来源:Scientific Data
时间:2025-02-11
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高性能多组分环氧树脂固化过程中热机械性能演变的分子动力学模拟研究
在航空航天领域,高性能环氧树脂(如TGDDM/DGEBF/PES/33DDS体系)是聚合物基复合材料的关键基体,但其固化过程中伴随的热机械性能演变会引发残余应力,直接影响复合材料强度。传统实验表征耗时昂贵,而分子尺度模拟能揭示性能演化机制,但多组分体系的力场选择、温度敏感性及凝胶行为仍是未解难题。为解决这些问题,美国密歇根理工大学Sagar Umesh Patil团队通过LAMMPS软件,采用PCFF-IFF(谐波键)和IFF-R(莫尔斯键)两种力场,对16,611原子模型进行混合、交联(φ=0-0.8)和热-机械加载模拟。研究结合REACTER反应模块和NEMD(非平衡分子动力学)方法,系统
来源:Polymer Journal
时间:2025-02-11
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加热石墨后相合成六方金刚石:解锁高压下碳材料转变新路径
摘要:天然和合成的金刚石大多具有立方晶格,而一种罕见的六方结构 —— 被称为六方金刚石(HD),由于大多数获得的样品纯度低且尺寸极小,在很大程度上尚未被深入探索。HD 的合成仍然是一个挑战,甚至其存在也存在争议。在这里,研究人员报道了通过加热高度压缩的石墨来合成结晶良好、近乎纯净的 HD,这种方法适用于块状和纳米尺寸的石墨前驱体。实验和理论分析表明,压缩石墨中石墨后相的形成以及温度梯度促进了 HD 的生长。利用这种方法,获得了一个毫米级、高度取向的 HD 块体,它由堆叠的类似单晶的 HD 纳米层组成。这种 HD 在高达 1100°C 的温度下表现出高的热稳定性,并且具有 155 GPa 的极高
来源:Nature Materials
时间:2025-02-11
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锗基超导邻近量子点中的可控Yu-Shiba-Rusinov态与自旋分裂研究
在量子计算领域,超导-半导体混合器件是实现拓扑量子比特和安德烈夫自旋量子比特的关键平台。然而,传统III-V族材料因核自旋干扰和压电效应限制了量子相干性。锗(Ge)作为IV族材料,兼具同位素纯化优势和低阻欧姆接触特性,但其二维异质结构中的超导邻近效应研究仍存在临界磁场低(约50 mT)、耦合强度调控困难等挑战。丹麦哥本哈大学尼尔斯·玻尔研究所(Niels Bohr Institute, University of Copenhagen)的Lazar Lakic团队在《Nature Materials》发表研究,通过铂锗硅化物(PtSiGe)超导电极与Ge/SiGe量子点的集成,构建了SC-QD
来源:Nature Materials
时间:2025-02-11
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肯尼亚西部农村地区全球早期发展量表(GSED)工具的验证:助力儿童早期发展评估的新突破
在孩子成长的最初几年,大脑发育极为关键,这一时期被称为儿童早期发展(Early child development,ECD)阶段,尤其是从出生到 3 岁。在这个阶段,孩子们开始掌握各种关键技能,这些技能为他们日后的人生发展和幸福奠定基础。然而,全球范围内,约 43% 的低收入和中等收入国家(Low- and middle-income countries,LMICs)的幼儿由于贫困和其他早期生活困境,无法充分发挥其发展潜力。为了改变这一现状,全球对促进儿童早期发展的项目和政策的投资不断增加。但在这一蓬勃发展的领域中,存在一个关键挑战:缺乏适用于 LMICs 的可行、可靠且有效的测量工具。大多数
来源:BMC Public Health
时间:2025-02-11
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综述:灵活资助计划:一项系统性范围综述
一、引言在公共卫生及相关领域的发展进程中,政府的资金支持至关重要。传统的政府资助模式在应对复杂的健康和社会挑战时,暴露出诸多局限性。例如,其资金使用往往被严格限定于特定、狭窄的目标、人群或结果,缺乏对当地实际情况变化的适应性,难以融入新的理念和思路。同时,繁杂的行政要求虽然在一定程度上保障了财务和项目的问责性,但却给受资助方带来了沉重的行政负担,尤其是那些接受多项资助的组织,管理难度剧增。为了突破传统资助模式的束缚,灵活资助计划(Flexible Funding Schemes,FFS)应运而生。FFS 旨在给予受资助方更多在资金使用、项目时间安排以及目标设定方面的灵活性,以更好地适应其实际需
来源:BMC Public Health
时间:2025-02-11
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新冠疫情期间私营企业白领病假情况研究:探寻病假变化及相关因素
在新冠疫情的冲击下,全球各个领域都发生了巨大变化,劳动市场也不例外。疫情带来的不仅是新冠病毒感染本身,还有一系列防控措施,这些都可能影响人们的病假模式。此前,针对更广泛劳动市场或特定职业领域的研究不少,但对于私营企业白领这一庞大且重要的群体,在疫情期间的病假情况却鲜有关注。而且,虽然知道社会人口因素会影响病假,但它们对因 COVID - 19 或 COVID 样诊断导致的病假影响程度仍不明确。正是在这样的背景下,来自瑞典卡罗林斯卡学院(Karolinska Institutet)的研究人员开展了一项重要研究,其成果发表在《BMC Public Health》上。这项研究有助于深入了解疫情期间私
来源:BMC Public Health
时间:2025-02-11
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南非德班备孕女性的性传播感染(STI)伴侣通知偏好与实践的定性探索及意义
在全球范围内,性传播感染(Sexually Transmitted Infection,STI)的发病率一直居高不下。2020 年,全球有 3.74 亿新的可治愈性传播感染病例被确诊。在南非,2017 年的估计数据显示,15 - 49 岁的女性中,梅毒患病率为 0.5%,淋病患病率为 7%,衣原体感染率为 15% 。性传播感染不仅给成年人带来高发病率,甚至可能导致死亡。对于孕妇或备孕人群而言,性传播感染的危害更为严重,它可能引发不孕不育、早产、低出生体重、新生儿残疾,甚至死胎等问题 。世界卫生组织和南非卫生部都建议,通知并治疗性传播感染患者的伴侣是 STI 治疗和治愈的重要环节,其目的在于防止
来源:BMC Public Health
时间:2025-02-11
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基于整数投资组合优化探寻可再生能源发电专业化路径:全球化电力市场下的关键洞察
在全球能源转型的浪潮中,可再生能源逐渐成为主角,但这一转型过程面临诸多挑战。未来能源市场的三大特征 —— 可变可再生能源技术(VRE)发电占主导、能源市场跨国整合以及能源存储技术的发展,相互交织,使得能源市场的格局变得极为复杂。在这样的背景下,政策制定者和能源相关利益者面临着一个关键问题:如何在确保能源供应稳定、可持续的同时,实现向可再生能源的高效转型?为了解决这一问题,来自哥伦比亚瓦莱大学工业工程学院的 Orlando Joaqui-Barandica、Diego F. Manotas-Duque 以及西班牙巴塞罗那大学经济与商业学院的 Jorge M. Uribe 开展了相关研究,其研究成
来源:Energy, Sustainability and Society
时间:2025-02-11
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利用 ChatGPT 撰写医院住院出院小结的探索:传染病住院服务视角下的意义与潜力
在医疗工作中,医院住院出院小结是医护人员之间沟通的关键工具,它详细记录了患者住院期间的各种情况,包括病情发展、治疗过程以及后续的随访计划,对患者的连续治疗起着不可或缺的作用。然而,撰写一份高质量的出院小结并非易事,它要求撰写者具备较强的书面沟通能力,能够从大量的医疗记录中提取关键信息,并进行有效的整合和简洁的呈现 。但在实际的医学培训中,这种技能往往没有得到足够系统的传授。对于传染病住院服务而言,患者的临床过程通常较为复杂,且很多患者需要长期随访,这使得初级医生在撰写这类患者的出院小结时面临更大的挑战。为了解决这些问题,新加坡国立大学医院(National University Hospita
来源:BMC Health Services Research
时间:2025-02-11
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研究表明,避孕药有助于降低患卵巢癌的风险
南澳大学2025年2月10日 这是一颗肩负重大责任的小药丸。但是,根据南澳大利亚大学的一项新研究,尽管避孕药的主要作用是预防怀孕,但它也有助于降低患卵巢癌的风险。通过人工智能筛查卵巢癌的风险因素,南澳大学的研究人员发现,口服避孕药使曾经服用过避孕药的女性患卵巢癌的风险降低了26%,45岁以后服用避孕药的女性患卵巢癌的风险降低了43%。该研究还确定了
来源:news-medical
时间:2025-02-11