• 港大学者最新发文：发现保持基因组完整性的关键所在

          研究揭示了RIF1-PP1阻止BLM解开超细DNA桥由香港大学(港大)生物科学学院Gary Ying Wai CHAN博士领导的研究小组发现了一种新的机制，可以确保细胞分裂过程中DNA正确分离，而细胞分裂不当会导致癌症的发生。该团队的研究结果发表在《细胞报告》杂志上，重点研究了两种蛋白质，RIF1和蛋白质磷酸酶1 (PP1)在解决超细DNA桥（ultrafine DNA bridges）的作用。当姐妹染色单体在有丝分裂过程中通过DNA关节分子连接时，这些桥就形成了。如果这些DNA桥不能被正确地解决或移除，它们最终会断裂，并在子细胞中

  来源：AAAS

  时间：2023-03-07

• 基因编辑技术被认为可能是气候变化的“救世主”

  一项对基因编辑技术的综述表明，CRISPR/Cas(聚集规律间隔短回文重复序列/Cas)方法可能成为受气候变化和高粮食需求威胁的水稻作物的“救世主”。这项发表在《CABI评论》上的研究强调，虽然水稻是全球消费量最大的谷物之一，养活了大约30亿人，但气候引起的非生物和生物压力已经影响了水稻作物的产量和质量。巴西佩洛塔斯联邦大学的主要作者Antonio Costa de Oliveira博士和一组科学家发现，CRISPR/Cas工具在与产量、对生物和非生物胁迫的耐受性以及稻米品质相关的研究中是有效的基因编辑。然而，这篇试图描述不同基因编辑技术及其在水稻育种中的应用的综述认为，CRISPR/Cas方

  来源：AAAS

  时间：2023-03-04

• 想要预测基因组编辑的成功率？Nature Biotechnology最新研究论文做到了！

  Sanger研究院的研究人员开发了一种新工具：利用一种称为prime editing的技术，可以预测成功将基因编辑的DNA序列插入细胞基因组的几率。作为CRISPR-Cas9基因编辑技术的演化，prime editing编辑在治疗从癌症到囊性纤维化等人类遗传疾病方面具有巨大潜力。但到目前为止，决定编辑成功的因素还没有得到很好的解释。这项研究2月16日发表在《自然生物技术》杂志上，评估了使用prime editors引入基因组的数千种不同的DNA序列。然后，这些数据被用于训练机器学习算法，帮助研究人员为特定的遗传缺陷设计最佳修复方案，这有望加快将主要编辑技术引入临床。CRISPR-Cas9于20

  来源：Nature Biotechnology

  时间：2023-02-20

• 表观基因组编辑，不改变自身基因治疗Rett综合征

           生长因子:用表观基因组编辑器(右)处理后，Rett样神经元(中、右)的细胞体膨胀到与野生型神经元(左)相匹配。一项对人类神经元的新研究发现，经过改良的CRISPR工具的组合可以在不改变基因本身的情况下，调节在Rett综合征中突变的MECP2基因的表达。这种方法作用于表观遗传因素，使患有这种疾病的人的一个基因副本沉默。这种疾病的特征是自闭症样的特征，包括重复运动、运动协调能力受损和社交退缩。重新激活该基因可能会抵消MECP2突变的影响，为一种新的治疗方法带来希望。“这是表观基因组工程作为未来基因疗法潜力的一个杰出例子，”加州斯

  来源：Science Translational Medicine

  时间：2023-02-17

• 体内基因组编辑，有效，可预防肥厚性心肌病

  心肌肌球蛋白重链的显性错义致病变异导致肥厚性心肌病(HCM)，这是一种目前无法治愈的疾病，会增加中风、心力衰竭和心源性猝死的风险。在这项研究中，我们评估了两种不同的遗传疗法——腺嘌呤碱基编辑器(ABE8e)和由AAV9传递的强效Cas9核酸酶——来预防携带杂合HCM致病变异肌球蛋白R403Q的小鼠患病。一剂双载体，每个载体携带一半RNA引导的ABE8e，纠正了≥70%的心室心肌细胞的致病性变异，并保持持久、正常的心脏结构和功能。额外的剂量提供了更多的心房编辑，但也增加了旁观者的编辑。AAV9递送RNA引导的Cas9核酸酶有效地灭活了致病等位基因，尽管具有剂量依赖的毒性，需要一个狭窄的治疗窗口来

  来源：nature medicine

  时间：2023-02-17

• CRISPR筛选发现巨型病毒竟然来自小病毒！

  大多数病毒都很小，携带最简单的基因组。即使是最大的小型病毒之一，牛痘病毒，也只有花粉粒的五十分之一大小，只含有270个基因。巨型病毒藐视这些规则。它们的大小可与小型细菌相媲美，基因组包含数千个基因，其复杂性堪比细胞生命。这些病毒如何变得如此庞大一直是争论的主题。现在，科学家们终于准备好解开它们的进化起源之谜，这要归功于《Nature Communications》1月份一篇论文中描述的一套基于CRISPR/Cas9的工具。法国艾克斯-马赛大学的病毒学家Chantal Abergel说:“我们遇到第一个巨型病毒是偶然的。它是Mimivirus，实际上它被误认为是一种细菌。”在这一发现之后的20年

  来源：Nature Communications

  时间：2023-02-15

• 肺修复的关键代谢过程

                 气道上皮的电子显微照片显示专门的粘液产生和纤毛细胞，帮助捕获和清除外部颗粒弗朗西斯克里克研究所(Francis Crick Institute)的科学家们发现了肺气道内的细胞是如何改变新陈代谢的，以及这一过程是如何帮助肺部在感染或损伤后愈合的关键。联合第一作者和共同通讯作者Stefania Crotta说:“到目前为止，人们对代谢在肺上皮再生中的作用知之甚少。但是转换到脂肪酸氧化是有意义的，因为肺部有丰富的氧气和可用的脂肪。我们认为，这种开关释放出葡萄糖，用于其他重要过程，如特化细胞

  来源：Nature Communications

  时间：2023-02-15

• 冯越教授在《Cell》发文揭示噬菌体抑制和逃逸细菌CBASS免疫系统的分子机制

  基于环状寡核苷酸的抗噬菌体信号系统（cyclic-oligonucleotide-based antiphage signaling system），简称CBASS，是细菌的重要免疫系统。噬菌体感染细菌后将遭遇细菌免疫系统的抵抗，但噬菌体同时也采用多种策略对抗细菌的免疫系统，目前研究最清楚的是噬菌体可编码多种蛋白质以抑制宿主免疫系统如CRISPR-Cas以及限制性修饰系统，但目前尚不清楚噬菌体是否有抑制或逃避CBASS免疫系统的机制。 2023年2月6日，北京化工大学冯越课题组与美国加州大学旧金山分校Joseph Bondy-Denomy课题组合作在Cell在线发表了题为Bacter

  来源：北京化工大学

  时间：2023-02-11

• Nature新论文带来下一个CRISPR？打开和关闭免疫通路所需的相同核心机制

  根据科罗拉多大学博尔德分校的一项新研究，在对抗入侵者时，细菌的运作方式与人类细胞非常相似，都拥有打开和关闭免疫通路所需的相同核心机制。这项研究发表在2月8日的《自然》杂志上，也阐明了这种共享的、古老的机制：一组被称为泛素转移酶的酶是如何工作的。作者说，更好地理解，以及重新编程这台机器，最终可能为治疗一系列人类疾病的新方法铺平道路，从类风湿性关节炎和克罗恩病等自身免疫性疾病到帕金森病等神经退行性疾病。“这项研究表明，我们与细菌并没有太大的不同，”生物化学系助理教授、通讯作者Aaron Whiteley说。“通过研究这些细菌过程，我们可以了解关于人体是如何工作的新见解。”下一个CRISPR?这项研

  来源：Nature

  时间：2023-02-10

• 免疫系统预防疾病的“弹药库”

  免疫系统已经发展出对抗病原体的强大武器。现在，柏林Max Delbrück中心的科学家们发现了一种新的机制，可以在不影响免疫反应效率的情况下平衡这种武器库。他们的研究证明了γ干扰素如何利用四种氨基酸与结缔组织的细胞外基质结合，结缔组织在单个细胞之间形成一张网，从而介导细胞间接触。该研究结果发表在《Nature Immunology》杂志上。研究人员写道:“γ干扰素 (IFNγ)是细胞免疫反应的重要中介，但这种细胞因子的全身高水平与免疫病理有关。IFNγ通过四个带正电荷的C端氨基酸(KRKR)， ECM结合域(EBD)与其受体(IFNγR)和细胞外基质(ECM)结合。在进化过程中，IFNγ并不是

  来源：Nature Immunology

  时间：2023-02-09

• 利用CRISPR检测癌症生物标志物

  大多数癌症诊断技术依赖于不舒服的侵入性程序，如活组织检查、内窥镜检查或乳房x光检查。血液样本可能是一个不那么令人不快的选择，尽管目前只有少数几种疾病可以用这种方法诊断。但是现在，研究人员在ACS传感器上报告了一种易于使用的方法，可以检测血浆外泌体中少量的癌症相关分子，并有效区分恶性和良性样本。外泌体是一种小泡，从宿主细胞中分离出来，在里面携带核酸、脂质和蛋白质等货物。这意味着它们提供了一扇了解其起源细胞状况的窗口。因此，癌细胞独特的胞内环境将通过微rna (miRNAs)等生物标志物反映在其外泌体中。这些是非常小的核酸，只有几个核苷酸长度，在细胞中调节蛋白质表达，在肿瘤中可能会失调。因此，有可

  来源：ACS Sensors

  时间：2023-02-03

• 复旦大学Nature子刊发文：实现TadA重编程与高精度迷你碱基编辑器的开发

  2016年以来，哈佛大学David Liu实验室分别将胞嘧啶脱氨基酶APOBEC1蛋白及定向演化后的腺嘌呤脱氨酶TadA与CRISPR-Cas9系统融合，开发出了可实现C·G--T·A碱基对高效转换的胞嘧啶碱基编辑器（CBE）以及实现A·T--G·C碱基对高效转换的腺嘌呤碱基编辑器（ABE）【1-2】。考虑到单碱基点突变在所有致病遗传变异中的占比超过60%【3】，CBE和ABE的出现极大推动了点突变功能研究和人类遗传病的治疗研究，也开启了碱基编辑器工具研发的热潮。近年来研究者发现早期碱基编辑器存在多种缺陷与不足。其中两大核心问题是脱靶效应导致的安全风险和体积过大导致的体内递送困难。脱靶效应导致

  来源：复旦大学

  时间：2023-02-02

• 复制自然来抵御病毒

          图片:温室里的植物    资料来源:Kyoka Kuroiwa - INRAE数千年来，作物一直在驯化过程中形成。农民杂交和选择新品种，以适应不断变化的环境。虽然效率很高，但这个过程很耗时。此外，所期望的性状必须存在于要改进的物种多样性的某个地方。因此，将一种机制从一个物种复制到一个具有农艺价值的物种中成为一个新的挑战。在现有的技术中，新的植物基因组编辑技术自2012年以来已经可用。CRISPR-Cas9技术经常被比作分子剪刀，它可以以有针对性和精确的方式修改植物DNA的某个区域。在许多作物品种中，如辣椒和豌豆

  来源：Plant Biotechnology Journal

  时间：2023-02-02

• Nature：这一次我们也许走对了！增强抗癌T细胞的CAR-T疗法

  Crystal Mackall还记得，当她第一次听到有关利用T细胞识别和杀死癌症的方法的讲座时，她所持的怀疑态度。1996年，在德国的一次会议上，这位儿科肿瘤学家坐在观众席上，转向她旁边的人说:“不可能。这太疯狂了。”今天，情况不同了。Mackall说，“我已经被驯服了，”她现在在斯坦福大学工作，开发这种细胞来治疗脑瘤。2017年，美国食品和药物管理局批准了第一批被称为嵌合抗原受体(CAR)-T细胞的修饰T细胞，用于治疗一种白血病。这些治疗方法已经改变了几种癌症的游戏规则。五种类似的产品已获批准，超过2万人接受了这种治疗。一个曾经只有少数顽强的研究人员在推动的领域，现在在学术界和工业界拥有数百

  来源：nature

  时间：2023-02-01

• 《自然》：2023年有望改进科研的七大技术

   从单分子蛋白质测序到体电子显微镜，英国《自然》杂志网站在近日的报道中，列出了有可能在2023年改进科学研究方式的七大技术。单分子测序曙光初现可对样本中的许多蛋白质进行测序的单分子技术可能即将问世。美国得克萨斯大学正在研究一种“荧光测序”方法，美国生物技术公司“量子硅”则描述了使用荧光标记的“黏合剂”来识别蛋白质末端特定氨基酸序列的技术。其他研究人员正在开发模仿基于纳米孔的DNA测序技术的单分子测序技术，其能根据多肽通过微小通道时引起的电流变化来分析氨基酸。以色列理工学院团队正在研究由硅基材料制造的固态纳米孔器件，其可同时对多个蛋白质分子进行高通量分析。韦布望远镜再接再厉詹姆斯·韦布

  来源：中国科技网

  时间：2023-02-01

• 《Neuron》挑战教条：没有爱情，只有亲情才是田鼠家庭幸福的原因

           草原田鼠(Microtus ochrogaster)以其对家庭的强烈承诺而闻名，这归因于催产素系统。不起眼的草原田鼠(Microtus ochrogaster)长期以来因其对家庭的不同寻常的承诺而受到尊敬。成对的伴侣们挤在一起，一起抚养幼崽，至少大多数时候都是这样。把另一对夫妇的幼崽放进一对草原田鼠的笼子里，成年田鼠通常会把这些幼崽当作自己的孩子抚养——这对啮齿动物来说是极不寻常的行为。但是1月27日发表在Neuron上的一项研究挑战了几十年的研究，该研究表明，一种检测“爱情荷尔蒙”催产素的蛋白质是田鼠家庭幸福的原因。研究人

  来源：Neuron

  时间：2023-01-30

• CRISPR技术迎来十岁生日:基因组编辑的发展历程

  自CRISPR- cas9作为基因组编辑技术发表以来的十年里，CRISPR工具箱及其应用深刻地改变了生物学研究，通过在植物、动物和人类中的应用实现了进步。在一篇综述中，Joy Wang和Jennifer Doudna强调了CRISPR基因组编辑的10年，讨论了该技术的重要进展、当前的局限性和未来的巨大潜力。利用细菌免疫系统的核心组成部分，包括CRISPR-Cas9在内的CRISPR基因组编辑工具的开发，使研究人员能够精确地编辑和重写几乎任何生物体的遗传密码。CRISPR技术的应用不仅为治疗包括镰状细胞病在内的罕见和难治性疾病的临床试验奠定了基础，还推动了农业进步，如开发出更有营养的CRISPR

  来源：Science

  时间：2023-01-20

• Nature Biotechnology：可以将整个基因插入基因组的新一代CRISPR技术！

  研究亮点：研究人员已经开发出一种改进的方法，可以更准确地将大片段的DNA序列(如整个正常的替代基因)插入细胞中这一进展可能会导致具有广泛临床应用技术的发展，修复不同的致病突变许多遗传疾病是由散布在整个基因上的不同突变引起的，为每个患者的突变设计基因组编辑方法是不切实际的，而且成本高昂。麻省总医院(MGH)的研究人员最近开发了一种优化方法，可以提高将大DNA片段插入基因组的准确性。这种方法可以用来插入一个完整的正常或“野生型”替代基因，这可以作为一种疾病的全面治疗，而不考虑患者的特定突变。这项工作涉及对一类新技术的优化，即CRISPR相关转座酶（CAST），这是一种很有前途的工具，用于大规模的D

  来源：Nature Biotechnology

  时间：2023-01-19

• 一种基于CRISPR，更安全的基因驱动“黑客”系统

          荧光果蝇:表达红色眼睛和绿色身体荧光标记的果蝇证明了一种新系统的可行性，可以安全地将分裂的基因驱动转换为完整的基因驱动。    来源:加州大学圣地亚哥分校比尔实验室科学家们继续拓展CRISPR的技术前沿，以及它的巨大潜力，涉及从人类健康到全球食品供应等领域。基于CRISPR的基因驱动就是这种情况，这是一种基因编辑工具，旨在影响遗传元素如何从一代传递到下一代。为蚊子设计的基因驱动有可能遏制疟疾感染的传播，疟疾感染每年导致数十万人死亡，但由于这种驱动可以迅速传播并主导整个种群，因此安全性问题也随之提出。科学家们通过

  来源：Nature Communications

  时间：2023-01-19

• Science：首次利用CRISPR-Cas9碱基编辑治疗心脏病

  一项针对小鼠的研究表明，一种新的CRISPR-Cas9方法可以靶向心脏中的有害信号通路，从而防止缺血/再灌注损伤。研究结果表明，基因编辑可以为治疗心脏病提供一种永久性和先进的策略，心脏病是全球发病率和死亡率的主要原因，研究表明这种方法可以作为心脏病发作后立即修复心脏损伤的干预措施。CRISPR-Cas9基因编辑正在成为基因组突变的一种前瞻性疗法。然而，目前的编辑方法主要是针对具有特定突变的相对较小的患者群。最新研究描述了一种可能适用于广泛的心脏病患者的心脏保护策略。研究人员使用碱基编辑来消除CaMKIIδ的氧化激活位点，这是心脏疾病的一个主要驱动因素。通过来自人类诱导多能干细胞的心肌细胞中显示

  来源：生物通

  时间：2023-01-16

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