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首次解析欧洲花楸转录组:开启森林树种遗传研究新篇
在广袤的森林生态系统中,野生欧洲花楸(Sorbus torminalis (L.) Crantz)是一位低调却意义非凡的 “成员”。它广泛分布于欧洲、小亚细亚、高加索和西北非地区,在生态系统中扮演着重要角色,不仅是森林生物多样性的重要组成部分,还对维持生态平衡有着关键作用。同时,其木材耐用,具有较高经济价值,在医学和营养领域也有应用。然而,与那些广泛研究的森林树种相比,欧洲花楸的基因组研究面临着重重困境。长期以来,公开可用的分子资源极为匮乏,仅局限于叶绿体基因组,这使得深入了解其遗传特性和适应潜力变得困难重重。就好比在探索一座神秘的城堡时,缺少关键的地图和工具,研究人员难以深入其内部一探究竟。
来源:BMC Research Notes 2.8
时间:2025-04-03
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藜麦不同品种甜菜碱醛脱氢酶(BADH)基因的计算机分析:揭示其在抗盐胁迫中的关键作用
藜麦(Chenopodiumquinoa)是一种新兴的盐生植物,近年来因其高营养价值和对环境胁迫的耐受性,受到研究人员的广泛关注,它可作为水稻和小麦的优质替代品。然而,目前对藜麦的研究有限,许多基因尚未被鉴定。本研究旨在识别基因模式,并在多个领域进行生物信息学分析。研究人员利用 PlantCARE 和 PlantPan 等生物信息学软件预测了甜菜碱醛脱氢酶(BADH)基因的表达序列。研究结果显示,不同品种的藜麦在 MYB 转录因子结合位点、激素响应区域,以及包含 32 个顺式调控元件的启动子和增强子区域的抗性方面,提供了有价值的信息,这突出了BADH基因在应对非生物胁迫中的作用。此外,研究还发
来源:Functional & Integrative Genomics 3.9
时间:2025-04-03
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槲皮素经枯草芽孢杆菌生物转化及其抗癌活性评估:体外与计算机模拟研究 —— 解锁黄酮类化合物抗癌潜能新路径
在生命的化学舞台上,黄酮类化合物一直是备受瞩目的 “明星分子”。它们广泛存在于日常的蔬菜、水果和药用植物中,就像隐藏在食物里的宝藏,拥有着诸如抗菌、抗炎、抗癌等多种神奇功效 。然而,尽管天然黄酮类化合物潜力巨大,但如何进一步挖掘它们的价值,提升其生物活性,成为了科研人员亟待攻克的难题。与此同时,癌症,这个全球健康的 “头号杀手”,每年都无情地夺走无数生命。肺癌和结直肠癌更是其中的 “重灾区”,现有治疗手段在它们面前常常显得力不从心,急需寻找新的、更有效的抗癌药物。在这样的背景下,来自开罗大学(Department of Pharmacognosy, Faculty of Pharmacy, C
来源:AMB Express 3.5
时间:2025-04-03
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温带粳稻淀粉糊化特性的全基因组关联研究与转录组分析揭示OsGLUTN基因调控食味品质的分子机制
稻米作为全球主粮,其食味品质(EQ)日益受到消费者关注。淀粉糊化特性是决定EQ的关键因素,但除已知Wx基因外,其遗传机制仍不明确。温带粳稻因其独特口感成为研究焦点,然而淀粉与蛋白质互作如何影响糊化特性尚待揭示。首尔国立大学的研究团队通过多组学整合分析,为这一领域带来突破性进展。研究采用284份温带粳稻种质(含171个改良品种和113个地方品种),通过两年重复实验测量快速粘度分析(RVA)参数,包括峰值粘度(PKV)、最低粘度(HPV)等7项指标。利用Illumina HiSeq X平台进行全基因组测序(平均深度>10×),采用Fast-LMM进行GWAS分析,结合极端表型材料的RNA-s
来源:Rice 4.8
时间:2025-04-03
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玉米籽粒灌浆期杂种优势的转录组学解析:揭示籽粒发育调控的遗传与分子机制
杂种优势指杂交种相较于其亲本表现更优的现象,是植物育种策略的基础。但杂种优势的分子机制仍不明确。本研究聚焦玉米杂种优势杂交种豫单 132,它在农艺性状上优于亲本,如穗和籽粒大小、籽粒重量以及总产量等。值得注意的是,豫单 132 的储存物质积累增加,包括淀粉、蛋白质含量和籽粒灌浆速率,这些共同促进了籽粒重量的增加。通过基因表达谱分析,研究人员鉴定出豫单 132 及其亲本在籽粒发育四个不同阶段(授粉后 12、20、28 和 40 天)的差异表达基因(DEGs)。这些 DEGs 呈现出加性和非加性表达模式,均对玉米籽粒的杂种优势有贡献。京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析显示,这些基因参
来源:Plant Molecular Biology 3.9
时间:2025-04-03
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解析棉花耐盐及耐盐碱分子机制:GhGDH2D03成为关键调控枢纽
盐胁迫和盐碱胁迫显著抑制植物的正常生长发育。了解棉花对这些胁迫的分子响应机制,对于提高棉花产量和纤维品质至关重要。在这项研究中,研究人员综合分析了盐和盐碱胁迫条件下的转录组动态变化,他们整合了 11 项先前研究中的 234 个 RNA 测序(RNA-seq)数据集。在系统评估并校正批次效应后,研究人员观察到,在不同的胁迫处理和时间点下,根转录组的聚类比叶转录组更具一致性。对 123 个根转录组进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)后,确定了三个关键模块,这些模块的枢纽基因与棉花的耐盐和耐盐碱能力显著相关。病毒诱导的基因沉默实验和 RNA-seq 分析表明,GhGDH2D03(Gohir.D0
来源:Plant Molecular Biology 3.9
时间:2025-04-03
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揭秘兰花菌根真菌 Tulasnella sp. SV6 的共生前响应:转录组与代谢组学的新发现
在神秘的植物世界里,植物与微生物的共生关系一直是科学家们热衷探索的领域。其中,菌根(mycorrhiza)作为植物与真菌形成的共生体,对植物的生长、健康和生态系统的稳定起着至关重要的作用。兰花菌根(Orchid Mycorrhiza,ORM)更是独特,兰花种子在自然环境中萌发和早期生长依赖于真菌共生,因为其种子几乎没有储存能量,需要真菌提供营养 。尽管植物 - 微生物共生的研究已取得不少成果,但对于 ORM 共生前阶段,也就是真菌与兰花根系物理接触之前发生的分子变化,我们知之甚少。大多数研究集中在已建立的菌根中植物和真菌代谢的调节上,而共生前阶段的化学信号、细胞组织和代谢变化等方面的研究还很匮
来源:Mycorrhiza 3.3
时间:2025-04-03
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综述:基于 γ- 环糊精的拓扑交联水凝胶
一、引言在材料科学领域,仿生策略愈发受到关注,科研人员期望借此改进或研发新型材料。拓扑结构在自然界中普遍存在,对生物系统的正常运作起着关键作用。例如,DNA 和蛋白质的拓扑结构精准调控着细胞的生物学功能与健康状态。然而,将机械互锁基团引入合成材料颇具挑战。轮烷(rotaxanes)作为一种典型的机械互锁分子(MIM),可用于构建拓扑凝胶,为材料赋予独特性能,如增强韧性和拉伸性等。环糊精(cyclodextrins,CDs)是构建轮烷的常用环状分子,其中 α-CD、β-CD 和 γ-CD 是最为常见的同系物,分别由 6、7 和 8 个葡萄糖单元组成。γ-CD 因其较大的空腔尺寸,能够实现双线程拓
来源:Communications Chemistry 5.9
时间:2025-04-03
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森林冠层覆盖对土壤侵蚀的影响:基于人工降雨模拟的Marganai森林实验数据库
在森林生态系统中,土壤侵蚀是威胁生态系统可持续性的关键问题。传统矮林作业(coppicing)因其周期性采伐特性,常被质疑会加剧土壤流失风险。意大利撒丁岛的Marganai森林作为持续数个世纪的矮林经营区,近年因公众对采伐引发侵蚀的担忧而中断管理计划,这一争议亟需科学数据支撑。为此,萨萨里大学农学院Nuoro林业学校的Filippo Giadrossich团队开展了这项结合水文工程与生态学的前沿研究。研究团队创新性地采用配对样地设计,在2018年(采伐后四年)建立8组对比样地(冠层覆盖W组vs无覆盖WO组),通过标准化人工降雨系统(强度43 mm/h,相当于当地年发生1-2次的极端事件)模拟自
来源:Scientific Data 5.8
时间:2025-04-03
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评估多模态大语言模型在皮肤镜图像皮肤病识别中的性别和年龄偏差:开拓精准医疗新视野
在当今科技飞速发展的时代,人工智能(AI)已逐渐渗透到医疗领域的各个角落。其中,大语言模型(LLMs)的出现,如 OpenAI 的 Chat Generative Pre-trained Transformer(ChatGPT),为医疗诊断带来了新的可能。然而,随着其在医疗场景中的应用逐渐增多,诸多问题也浮出水面。一方面,人们对其在医疗应用中的可靠性存在担忧,毕竟医疗诊断关乎患者的生命健康,任何错误都可能引发严重后果;另一方面,公平性问题也备受关注,例如模型在不同性别、年龄群体中的表现是否一致,是否会对某些群体存在偏见,这些都是亟待解决的重要问题。在此背景下,为了探索多模态 LLMs 在皮肤疾
来源:Health Data Science
时间:2025-04-03
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大语言模型在牙科入学考试中的表现评估:潜力与局限探索
在当今数字化时代,教育领域正经历着前所未有的变革,大语言模型(Large Language Models,LLMs)的出现为教育带来了新的可能性。它们被广泛应用于各个领域,在医疗教育方面,也展现出了如个性化学习、互动辅导等多种应用潜力。然而,在像牙科入学考试(Dental Admission Test,DAT)这样重要的高风险考试中,LLMs 的表现究竟如何,其能力边界在哪里,一直是教育者、学生和相关研究人员极为关注的问题。DAT 作为众多牙科院校评估申请者的关键指标,其成绩与学生入学后的表现密切相关。但以往对于 LLMs 在 DAT 评估中的研究较少,这使得人们难以确定如何在 DAT 备考中
来源:Health Data Science
时间:2025-04-03
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无标记富集高转移性肿瘤起始细胞至单克隆状态:开启癌症研究新征程
### 研究背景癌症干细胞(Cancer Stem Cells,CSCs)是癌细胞中的特殊亚群,具备自我更新、启动肿瘤生长以及分化的能力,在肿瘤的发展、转移和复发过程中扮演关键角色。耗尽肿瘤中的 CSCs 能够抑制癌症转移,因此,靶向 CSCs 成为预防肿瘤扩散的关键。不过,CSCs 没有标准的生物标志物,且与正常干细胞标记大多重叠,导致识别和分离困难,现有分离技术也难以保证细胞纯度。本文提出一种无标记方法,旨在富集具有高侵袭性的 TIC 群体,推动癌症研究进展。材料和方法细胞培养:非小细胞肺癌 TS32 细胞(TS32-R0),由 Dr. Bing Lim 合作提供,使用含多种成分的标准培养
来源:BIOMATERIALS RESEARCH
时间:2025-04-03
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有机半导体中巨量非线性拉曼响应的发现与调控
有机半导体凭借分子链中π电子(π-electron)离域特性展现出独特光电行为,但其较低的光学损伤阈值长期制约着非线性光学应用。最新研究通过刺激发射(stimulated emission)的光谱增益调控,突破传统光学腔限制,将分子振动放大效率提升至新高度——实现~10–50 μJ cm−2的超低拉曼阈值,功率密度仅需~2–10 kW cm−2,性能超越现有拉曼激光器四个数量级。该技术产生的非线性拉曼响应呈现泵浦依赖的级联发射特征:发射效率随泵浦强度动态变化,非线性系数达3.8,110 nm宽光谱范围内仍保持30.9 dB高信噪比。这项突破为开发基于有机半导体的微型化拉曼放大器/激光器奠定基础
来源:Nature Materials 37.2
时间:2025-04-03
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基于人体测量和生物电阻抗参数的小儿代谢综合征机器学习预测模型的开发与验证:开辟精准筛查新路径
代谢综合征(MS)是心血管疾病的一个风险因素,在儿童和青少年中的患病率正不断上升。本研究开发了一种机器学习模型,利用人体测量数据和生物电阻抗分析(BIA)参数来预测 MS。与传统的逻辑回归等方法相比,该模型能更有效地处理复杂的非线性变量关系。研究纳入了来自韩国国家健康与营养检查调查(KNHANES)的 359 名青少年(其中 16 名患有 MS,343 名正常)以及来自真实临床数据的 174 名青少年(66 名患有 MS,108 名正常)。模型 1 使用人体测量数据,模型 2 使用 BIA 参数,模型 3 则结合了两者的数据。利用极端梯度提升算法(eXtreme Gradient Boosti
来源:International Journal of Obesity 4.2
时间:2025-04-03
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子痫前期后长期微血管和血压失调:揭示内皮糖萼关键作用及对心血管疾病风险的影响
子痫前期(PE)是一种以全身内皮损伤为特征的妊娠疾病,会导致长期心血管并发症。内皮糖萼(EG)覆盖在内皮腔表面,在血管内稳态中起关键作用。本研究旨在评估有 PE 病史的女性与正常血压妊娠女性的 EG 厚度和血压(BP)变化趋势。55 名女性参与研究(18 名对照组,34 名 PE 患者,3 名妊娠高血压患者)。产后 6 年,通过侧流暗视野显微镜评估舌下微循环,并在坐姿和直立位测量血压。随访时发现,与健康对照组相比,PE 女性直径≥8μm 血管的 EG 厚度减小,表现为灌注边界区域(PBR)增加(中位数分别为 3.14μm 和 2.88μm,p = 0.002)。PE 患者直径≥10μm 血管的
来源:Hypertension Research 4.3
时间:2025-04-03
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不同垫料对番鸭行为模式、生长性能、福利指标及胴体性状的影响研究
在全球家禽养殖领域,鸭子养殖占据重要地位,番鸭更是埃及等发展中国家农村养殖的宝贵资源。在番鸭养殖的室内环境中,垫料的选择至关重要,它不仅影响鸭子的生长和健康,还与养殖效益紧密相关。传统常用的垫料如木屑和麦秸,由于家禽养殖规模的不断扩大、自然资源的日益匮乏、与其他经济领域的竞争加剧以及在生物燃料生产和动物饲料中的应用等原因,其供应逐渐减少。因此,寻找可替代的垫料材料成为当务之急。与此同时,虽然已有研究关注不同垫料对其他鸭种的影响,但针对番鸭的相关研究却极为罕见。在这样的背景下,本研究应运而生。本研究由埃及本哈大学兽医学院的研究人员开展,他们旨在评估不同垫料材料(木屑、沙子、切碎的稻草和麦秸)对番
来源:BMC Veterinary Research 2.3
时间:2025-04-03
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探究奇亚籽和抹茶对雄性新西兰白兔青春期相关基因表达的影响:解锁动物生殖奥秘
在埃及,兔子养殖是解决肉类短缺问题的重要产业。然而,青春期的启动以及辅助生殖技术受到遗传、营养和环境等多种因素的复杂调控,其中营养因素对动物的生理参数、性成熟和生育能力的影响至关重要。但目前,关于奇亚籽和抹茶这两种抗氧化植物对雄性动物生育激素分泌和生育相关基因通路的影响,相关研究却非常匮乏。为填补这一知识空白,来自埃及新谷大学、阿里什大学以及中国西北农林科技大学的研究人员展开了一项研究,相关成果发表在《Tropical Animal Health and Production》杂志上。研究人员采用了多种关键技术方法。首先,精心设计实验分组,将 18 只断奶后的雄性新西兰白兔随机分为三组,分别给
来源:Tropical Animal Health and Production 1.7
时间:2025-04-03
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埃及尼罗河三角洲地区小反刍兽疫病毒血清流行率及风险因素分析:对防控策略的启示
这项研究系统评估了埃及尼罗河三角洲地区小反刍动物(绵羊和山羊)中小反刍兽疫病毒(Peste des Petits Ruminants Virus, PPRV)的血清流行状况及其风险因素。通过对780份样本的抗体检测发现,整体血清阳性率达30.5%,其中雌性动物(32.5%)、成年个体(43.8%)和大规模畜群(62.3%)呈现显著高感染率。研究采用逻辑回归分析证实,年龄、性别、畜群规模和疫苗接种状态与PPRV感染存在显著相关性。特别值得注意的是,未接种疫苗的动物及共享水源的畜群表现出更高的血清阳性风险。这些发现为制定针对性防控措施提供了科学依据,包括优化疫苗接种计划、改进畜群管理规范以及加强水
来源:Tropical Animal Health and Production 1.7
时间:2025-04-03
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钙离子与一氧化氮调控环糊精诱导胡萝卜细胞中植物甾醇的生物合成
科学家们像侦探般破解了胡萝卜细胞的"固醇密码"!当用50 mM甲基-β-环糊精(M-β-CD)刺激胡萝卜悬浮培养细胞时,这些"微型工厂"开始大量生产植物甾醇。研究团队通过"分子开关"实验发现:细胞需要从外界"偷运"钙离子(Ca2+)才能启动生产,就像需要钥匙打开保险箱;蛋白质的"磷酸化舞蹈"也至关重要——既要酪氨酸磷酸酶"踩刹车",又需要丝氨酸/苏氨酸激酶"加油门"。更有趣的是,信号分子一氧化氮(NO)也悄悄参与了这场"代谢狂欢",而过氧化氢(H2O2)则像个"局外人"未起作用。这项研究揭示了植物细胞如何通过精密信号网络调控次级代谢,为生物活性物质生产提供了新思路。
来源:Theoretical and Experimental Plant Physiology 2.2
时间:2025-04-03
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气候变化下,冰岛 - 东格陵兰 - 扬马延毛鳞鱼觅食地变迁引发的表型响应研究
在广袤的海洋世界里,毛鳞鱼作为一种重要的小型中上层鱼类,其生存与海洋环境变化息息相关。近几十年来,全球气候变化的浪潮席卷海洋,冰岛 - 东格陵兰 - 扬马延地区的海洋环境也随之发生显著改变。海水温度不断攀升、盐度波动变化、海冰范围缩减,这些环境因子的改变犹如一双双无形的大手,推动着毛鳞鱼的分布范围逐渐向高纬度地区转移。过去,毛鳞鱼常出没于冰岛北部海域觅食,如今却在秋季的摄食季大量聚集于东格陵兰大陆架。面对这样的变化,一个关键问题浮出水面:毛鳞鱼的生命史特征是否也发生了改变?此前,虽然已有研究关注到毛鳞鱼分布范围的变化,但对于其生命史特征在这一过程中的长期变化,仍存在知识空白。而这些生命史特征的
来源:Reviews in Fish Biology and Fisheries 5.9
时间:2025-04-03