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《自然遗传学》：丹尼索瓦人通过多次不同的杂交事件传递了基因
科学家们认为，最近发现的与现代人杂交的“古人类”（丹尼索瓦人）个体通过多次不同的杂交事件传递了他们的一些基因，这些事件帮助塑造了早期人类的历史。2010年，尼安德特人基因组的第一份草稿发表了，与现代人基因组的比较显示，尼安德特人和现代人过去曾有过杂交。几个月后，对西伯利亚阿尔泰山脉丹尼索瓦洞穴中出土的指骨进行的基因组测序分析显示，这块骨头碎片来自一个新发现的古人类群体，我们现在称之为丹尼索瓦人，他们也与现代人杂交。“这是过去十年中人类进化中最令人兴奋的发现之一，”都柏林三一学院遗传与微生物学院博士后研究人员琳达·昂加罗博士说，她是国际领先杂志《自然遗传学》上发表的一篇引人入胜的新评论文章的第一
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谷歌DeepMind公布蛋白质预测程序AlphaFold3代码
迟到总比不到好：谷歌DeepMind今天向GitHub社区公布了其最新人工智能（AI）蛋白质预测软件的计算机代码。许多科学家对这一举措感到高兴，尽管有些人仍然对该公司花了6个月才做到这一点感到不满。当DeepMind在5月8日发表在《自然》杂志上的一篇论文中宣布AlphaFold3时，研究人员称赞这项技术不仅能够预测蛋白质的结构，还能预测它们如何与DNA、RNA和其他蛋白质相互作用，这对药物发现和其他领域来说是一个福音。但是他们批评了公告本身：尽管《自然》杂志的编辑指南指出，计算代码必须与已发表的研究一起提供，但这篇新论文只包含了“伪代码”——一个程序运行的步骤列表，以及一个在线门户网站的链接
来源：sciencemag
时间：2024-11-12
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克利夫兰诊所：预防三阴性乳腺癌疫苗的新进展
克利夫兰诊所（Cleveland Clinic）的研究人员公布了一种预防三阴性乳腺癌疫苗的最新研究结果，三阴性乳腺癌是乳腺癌中最具侵袭性和致命性的一种。研究小组发现，研究疫苗通常耐受性良好，并在大多数患者中产生免疫反应。该小组描述了疫苗的副作用，显示了迄今为止最高的耐受剂量，并介绍了疫苗的免疫效果。研究结果将在癌症免疫治疗学会年会上发表。该临床试验于2021年启动，由美国国防部资助，正在评估疫苗的安全性并监测免疫反应。这项i期临床研究由克利夫兰临床中心与Anixa Biosciences， Inc.合作开展，迄今已纳入26名患者，分为三个队列：1a期-在过去三年内完成早期三阴性乳腺癌治疗，目前
来源：Cleveland Clinic
时间：2024-11-12
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靶向铁死亡克服N种消化道肿瘤化疗耐药
消化道肿瘤的全球负担是沉重的，这些癌症占全球所有恶性肿瘤的近一半。尽管内窥镜诊断方法取得了进步，使早期发现和治疗成为可能，但仍有很大一部分患者在晚期才得到诊断。对于这些患者，化疗、放疗和免疫治疗通常是唯一可行的选择，但对治疗的耐药性仍然很常见，导致高复发率和死亡率。越来越多的研究表明，铁死亡可能是逆转治疗耐受的关键机制。铁死亡以铁介导的脂质过氧化为特征，具有通过选择性靶向癌细胞防御机制来对抗耐药性的潜力，为新的治疗策略铺平了道路。铁死亡与肿瘤治疗抵抗铁死亡是一种独特的细胞死亡途径，由铁代谢、ROS产生和脂质过氧化调节。铁死亡的主要诱因涉及细胞膜内脂质过氧化物的过度积累，特别是在富铁环境中。这种
来源：Xia & He Publishing Inc.
时间：2024-11-12
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这位科学家用自己在实验室培养的病毒治疗自己的癌症
一位科学家通过向肿瘤注射实验室培养的病毒成功治疗了自己的乳腺癌，这引发了关于自我实验伦理的讨论。2020年，49岁的Beata Halassy在之前切除乳房的地方发现了乳腺癌。这是她左乳房切除后的第二次复发，她无法再接受化疗了。Halassy是萨格勒布大学的病毒学家，她研究了文献，决定用一种未经证实的治疗方法来解决这个问题。8月发表在《Vaccines》杂志上的一份病例报告概述了Halassy是如何自我实施一种名为溶瘤病毒疗法（OVT）的治疗来帮助治疗她自己的3期癌症的。她现在已经摆脱癌症四年了。在选择自我实验时，Halassy加入了一长串科学家的行列，他们参与了这种不为人知的、被污名化的、充
来源：Vaccines
时间：2024-11-12
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在手术中“看见”癌细胞:Lumicell的实时视图助力清除手术残余癌细胞
乳腺癌是美国第二大最常见的癌症类型，也是导致女性癌症死亡的原因，每8名女性中就有1人患有乳腺癌。大多数患有乳腺癌的妇女都接受乳房肿瘤切除术，切除肿瘤和肿瘤周围的健康组织。手术后，切除的组织被送到病理学家那里，在被评估的组织边缘寻找疾病的迹象。不幸的是，大约20%的乳房肿瘤患者必须接受第二次手术以切除更多的组织。现在，麻省理工学院的一个分支机构正在为外科医生提供手术过程中癌变组织的实时视图。Lumicell开发了一种手持设备和一种光学显像剂，当它们结合在一起时，外科医生可以扫描手术腔内的组织，以“看见”残余的癌细胞。外科医生在监视器上看到这些图像，可以指导他们在手术过程中切除额外的组织。在357
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Nature：南非会成为第一个接受有争议的人类基因组编辑技术的国家吗？
在南非更新了其卫生研究伦理指南，包括关于可遗传（或种系）人类基因组编辑的新章节之后，科学家们表达了担忧。科学家们说，这可能使国家离接受这项有争议的技术更近了一步。这项技术涉及对精子、卵子或胚胎进行基因改变，从而使这些改变能够代代相传。研究伦理准则于5月更新，但这一消息在上个月才广为人知。目前，没有一个国家明确允许在临床环境中进行可遗传的人类基因组编辑。目前尚不清楚这些变化在多大程度上听取了南非科学界的意见。《自然》杂志要求南非卫生部和国家卫生研究伦理委员会发表评论。南非卫生部发布了修订后的指导方针，而国家卫生研究伦理委员会是国家卫生法下的一个法定机构，起草了这些指导方针。到本文发表时，尚未收到
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麻省理工学院团队创造了识别因果基因关系的有效技术
通过研究基因表达的变化，研究人员了解细胞在分子水平上的功能，这可以帮助他们了解某些疾病的发展。但是，人类有大约2万个基因，它们可以以复杂的方式相互影响，因此，即使知道要针对哪一组基因，也是一个极其复杂的问题。此外，基因在相互调节的模块中协同工作。麻省理工学院的研究人员现在已经建立了理论基础，可以确定将基因聚合到相关组的最佳方法，这样他们就可以有效地了解许多基因之间潜在的因果关系。重要的是，这种新方法仅使用观测数据就完成了这一任务。这意味着研究人员不需要进行昂贵的、有时是不可行的干涉性实验来获得推断潜在因果关系所需的数据。从长远来看，这项技术可以帮助科学家以更准确、更有效的方式识别潜在的基因目标
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HMGB1在肝脏疾病发病机制中的重要作用
由于发病率和死亡率高，急性和慢性肝病继续构成重大的临床挑战。对乙酰氨基酚（APAP）过量引起的急性肝损伤（ALI）、肝缺血再灌注损伤（HIRI）以及非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）和酒精相关性肝病（ALD）等慢性疾病均受HMGB1介导的途径的影响。HMGB1从受伤或坏死的肝细胞中释放出来，引发炎症反应。它的循环水平与肝脏疾病的严重程度有关，标志着它是一个有前途的生物标志物和治疗靶点。HMGB1的结构和功能HMGB1是一种非组蛋白核蛋白，具有三个不同的结构域，负责DNA结合和调节功能。在细胞核内，HMGB1有助于DNA修复、染色体维持和细胞周期调节。一旦在细胞外释放，它就会与RAGE和TLR4等
来源：Xia & He Publishing
时间：2024-11-12
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循环肿瘤细胞作为肝细胞癌早期检测的工具
肝细胞癌（HCC）是一个重大的全球健康问题，特别是在亚太等地区，慢性病毒性肝炎和肝脏疾病导致其高发病率和死亡率。尽管医学进步，HCC的晚期诊断仍然是一个重大挑战，这强调了更有效的早期检测策略的必要性。循环肿瘤细胞（CTCs）是从原发肿瘤部位释放到血液中的肿瘤细胞，为非侵入性癌症诊断提供了一条有希望的途径。本文综述了CTC检测方法及其与HCC进展的关系，以及它们在预后和治疗监测中的作用。CTC检测和富集方法CTCs的检测可大致分为两种主要方法：基于生物性质的分离和基于物理性质的分离。基于生物学特性的方法：这些技术依赖于CTCs表面特定生物标志物的表达，如EpCAM、CK8/18/19和间充质标志
来源：Xia & He Publishing Inc
时间：2024-11-12
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液体活检检测胰腺偶发瘤的进展
在最近发表在eGastroenterology杂志上的研究中，J-Matthias Löhr博士及其同事对胰腺偶发瘤的诊断方法进行了深入的回顾。在其他情况下的成像扫描中经常发现的偶然发现。这些胰腺病变，其严重程度各不相同，有时可以作为胰腺癌早期的信号。然而，传统的方法，包括MRI和CT扫描，受到侵入性、成本和对早期胰腺变化的敏感性的限制。这项研究强调了液体活检的潜力，液体活检是一种微创检测，可以分析血液中循环肿瘤DNA、遗传易感性和癌症特异性生物标志物。J-Matthias Löhr说：“液体活检有希望用于筛查，特别是在无症状的个体中，因为它打开了检测遗传标记和循环癌细胞的
来源：eGastroenterology
时间：2024-11-12
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解开身体BMI、代谢健康和衰老之间的联系
随着全球人口老龄化以及肥胖和代谢紊乱患病率的上升，了解身体质量指数（BMI）、代谢健康和衰老之间的复杂关系变得越来越重要。卡罗林斯卡医学院医学流行病学和生物统计学系的Peggy Ler在一篇新论文中试图解开这些联系，重点关注BMI和代谢健康如何与生物衰老和全因死亡率相关联，同时考虑到BMI和年龄差异的非线性效应。通过采用包括功能（功能性衰老指数，FAI）、生理（脆弱指数，FI）和细胞（表观遗传年龄加速，EAA）水平在内的生物衰老测量方法，她旨在提供BMI、代谢健康和生物衰老之间联系的全面检查。“这篇论文的一个关键结论是，身体质量指数的高低，以及代谢不健康的状态，都与生物衰老和死亡风险的增加有关
来源：Karolinska Institutet
时间：2024-11-12
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《Science》什么驱动了你的摄食行为？节律性肝脏
所有生命王国都进化出了计时机制，以预测光环境的日常变化，并优化营养机会。在哺乳动物中，下丘脑视交叉上核的中央生物钟与外界光线同步。然而，身体的其他细胞、组织和器官都有自己的生物钟。例如，肝脏有一个分子钟，它可以被喂食-禁食周期所干扰。松弛训练的视交叉上核和食物携带的肝脏之间的不同步会带来不良的健康后果，包括增加心脏代谢疾病或2型糖尿病的风险；然而，这些时钟是如何失调的仍不得而知。Woodie等报告了从肝脏到大脑的神经连接，传递错位信号，驱动饮食行为、体重维持和能量代谢的变化。这揭示了一个潜在的治疗靶点，以减轻昼夜节律中断的代谢影响。哺乳动物的昼夜节律是由启动转录-翻译反馈回路的线索设定的，该回
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同期三篇《Nature》：“无关紧要”的染色体外DNA在癌症中的关键作用
斯坦福大学医学研究人员及其国际合作者的三篇研究论文改变了科学家对小DNA如何循环的理解，直到最近，过去被视为无关紧要的它们是多种人类癌症的主要驱动因素。这两篇论文将于11月6日同时发表在《Nature》杂志上，详细介绍了在近15,000种人类癌症中，被称为ecDNA（染色体外DNA）的圆圈的患病率和预后影响；强调一种新的遗传模式，它推翻了遗传学的基本规律；并描述一种针对已经在临床试验中的恶性肿瘤的抗癌疗法。该团队共同被称为eDyNAmiC，是由病理学教授Paul Mischel博士领导的一组国际专家。2022年，Mischel和eDyNAmiC团队从癌症大挑战计划获得了2500万美元的资助，以
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Science：为什么湿狗会抖干自己？神经科学给出了答案
当一只狗抖掉皮毛上的水时，它的动作不仅仅是随机的一阵乱舞，也不是故意把站在旁边的人弄湿。许多毛茸茸的哺乳动物都有这种本能反射，包括小鼠、猫、松鼠、狮子、老虎和熊。这一举动有助于动物从难以触及的地方去除水、昆虫或其他刺激物。但是，颤抖背后是一种复杂的神经机制，而这在以前是神秘的。现在，研究人员已经确定了触发小鼠典型的“湿狗”颤抖行为的神经回路，这涉及到一类特殊的触觉感受器，以及连接脊髓和大脑的神经元。他们的研究结果发表在11月7日的《Science》杂志上。德克萨斯州休斯顿贝勒医学院的神经科学家Kara Marshall说：“触觉系统是如此复杂和丰富，以至于它可以区分出爬行昆虫的水滴和爱人的温柔
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Cancer Cell发现了一些癌症对免疫治疗没有反应的关键原因：代谢机制阻碍免疫反应
免疫系统是癌症治疗的主要目标。免疫检查点抑制剂和CAR-T细胞疗法可以显著改善许多癌症的预后。但对大约70%的患者来说，这些疗法不起作用。密歇根大学Rogel癌症中心的研究人员发现了一些癌症对免疫治疗没有反应的关键原因：肿瘤微环境中的代谢物转运体阻断了免疫反应不可或缺的一种关键类型的肿瘤细胞死亡。“肿瘤细胞调整它们的代谢机制来逃避免疫基础疗法。了解这些免疫抵抗机制是如何工作的，可以为改进免疫治疗提供新的目标，使更多的患者受益。我们的发现是朝着这个方向迈出的一步，”资深研究作者、医学博士、医学博士、Rogel癌症中心癌症免疫学和免疫治疗卓越中心主任Weiping Zou说。研究人员发现SLC13
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Science：防御还是生长——植物如何分配资源
一项新的研究表明，一种植物在防御上投入的越多，它的生长潜力就越小。开放科学使研究成为可能，为植物适应和种间变异提供了新的见解。病原体可以显著削弱宿主的适应性，有时甚至导致宿主死亡。然而，物种之间在疾病防御方面的投入存在相当大的差异。进化理论预测，分配成本调节着这种投资，但验证这一假设一直具有挑战性。在《科学》杂志上发表的一项研究中，来自赫尔辛基大学的博士后研究员Michael Giolai和植物生物多样性教授Anna-Liisa Laine使用开放数据库识别了184种植物的植物防御基因和生长性状。他们发现不同种类的植物在防御基因的数量上有惊人的差异，从44个到2256个不等。例如芦笋，它只有7
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科学家们发现了一种免疫分子，这种分子可以保持新陈代谢的协调和准时
最近的研究表明，免疫系统与人体内部时钟相互作用，影响脂肪储存和温度调节。这些见解对受现代生活需求驱动的工作、饮食或睡眠模式不规律的个人具有重大意义。关键的发现是，脂肪组织中的一种免疫分子，被称为白细胞介素- 17a (IL-17A)，在脂肪储存中起着调节作用，在解决肥胖、防止消耗和减轻其他代谢紊乱方面具有重要的治疗潜力。通过靶向这种分子，药物开发人员可能会获得一种有价值的新途径来创造针对这些疾病的治疗方法。昼夜节律是一种以24小时为周期的生物过程，确保关键的生物功能在一天中的特定时间发生，以使身体与外部环境线索同步。最突出的例子是睡眠-觉醒周期，它与太阳的自然明暗周期一致。免疫系统按照昼夜节律
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首个来自庞贝尸体DNA鉴定反转了死者性别
从意大利庞贝城出土的人骨碎片中提取出了维苏威火山喷发期间死者的DNA，这些基因数据正在挑战关于受害者身份和关系的旧假设。研究人员从火山喷发中死者的石膏模型中获得了骨头碎片。公元79年，火山喷发将这座城市掩埋在火山灰和浮石之下。这是第一个从模型中提取的DNA，它揭示了五个人的性别、祖先和家庭关系的细节。今天发表在《当代生物学》（Current Biology）杂志上的一篇被基因数据揭穿的文章，讲述的是一位长期以来被认为是在抱着孩子时死亡的母亲的受害者。他的一只手臂上戴着一个复杂的金手镯，这表明这个人是女性。相反，最新DNA分析显示，这名抱着孩子死亡的“母亲”其实是男性，与孩子没有家族关系。研究报
来源：Current Biology
时间：2024-11-11
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新研究发现了41个与腰椎间盘突出症相关的基因位点
腰椎间盘突出症（LDH）是腰椎最常见的结构性病变之一，往往会导致腿部放射性疼痛或坐骨神经痛。随着生活方式的改变，这种疾病的发病率呈逐渐增高的趋势，但对其遗传基础的研究却相对较少。最近，芬兰奥卢大学领导的研究团队探索了椎间盘突出症的遗传风险因素。他们于2024年11月7日在《Nature Communications》杂志上发表了研究成果。研究人员分析了芬兰数据库（FinnGen）、爱沙尼亚生物样本库和英国生物样本库的数据，包括近83万名参与者的遗传和健康数据。他们开展了全基因组关联研究（GWAS），然后开展了全基因组荟萃分析以综合分析结果。除了之前发现的23个区域外，研究人员还发现了41个与椎
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