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Nature: 张锋、程金泉入选2014转化领域Top研究者
生物通报道 8月20日，Nature Biotechnology杂志公布了2014年度转化领域最顶尖的20名研究者排名，并列出了2010-2014年引用率最高的专利及焦点领域。此次的研究者排名是根据专利分析公司IP Checkups对2014年申请专利最活跃的科学家进行分析统计的结果。此外，还列出了过去五年来每位研究人员引用率最高的专利和他们的H指数。在这20位顶尖研究者中不乏我们熟知的科学家，如Broad研究所的张锋（Feng zhang）博士，南佛罗里达大学的程金泉（Jin Q. Cheng）教授及诺贝尔奖得主David Baltimore。张锋博士作为近两年大热的CRISPR
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中国农科院用CRISPR实现大豆基因组编辑
生物通报道：作为一种新的基因编辑技术，CRISPR/Cas系统已经迅速而广泛地用于各种生物的基因组工程。八月十八日，来自中国农业科学院的研究人员，在国际著名学术期刊《PLOS ONE》发表的一项研究中，成功地应用II型CRISPR/Cas9系统，在大豆靶基因中获得并评估了高效的基因组编辑。这项研究的通讯作者，是中国农科院作物科学研究所的研究员、博士生导师侯文胜博士。延伸阅读：我科学家用CRISPR实现大豆定向诱变。大豆（Glycine max（L.）Merrill.）是一种古老的多倍体植物，是具有重要经济价值的豆科作物。大豆为食物生产和动物饲料提供了丰富的蛋白质和油。近年来，各种各样的遗传方法
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顶级医学期刊：CRISPR基因组编辑可以逆转肥胖
生物通报道：肥胖症是二十一世纪人类健康面临的最大挑战之一，会引发心血管疾病、二型糖尿病、癌症等致命疾病。MIT和哈佛医学院的研究团队发现了一个控制人体代谢的重要通路，操纵这一通路可以改变脂肪细胞的功能。这项研究发表在顶级医学期刊《新英格兰医学》上，为人们提供了一条预防和治愈肥胖的新途径。“传统理论认为肥胖是食量与运动量失衡的结果，但这种观点忽视了遗传学因素对个体代谢的影响，”文章的通讯作者Manolis Kellis教授说。发现新机制FTO基因突变被认为是最强的肥胖风险因子，这一区域一直是科学家们研究的重点。不过迄今为止人们还不清楚FTO突变是如何导致肥胖的。“不少研究试图将FTO与大脑回路关
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Science：DNA断链如何保存基因组完整性？
生物通报道：为了复制和修复目的的基因组编辑，是通过内切酶来操作的，它能在非常特异的位点切割DNA链。这些位点被称为“限制性位点”，是由核苷酸的回文序列组成。断裂DNA叉的修复还没有得到完全理解；此外，科学家想确定断裂诱导的复制（BIR）——一种基因组重排修复机制，如何避免基因组不稳定性（可导致快速进化、适应性和肿瘤发生）。 双链断裂对于细胞来说，是特别危险的，因为它们可能会导致基因组重排。研究真核细胞DNA的科学家们，在本周的《Science》发表的一项研究，发现了有力的实验证据表明，引起双链断裂的一种内切酶（称为Mus81），可抑制与基因组不稳定性相关的模板转换。这一研究与人类遗传学研
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Nature子刊发表CRISPR新成果：一步法制备新型gRNA文库
生物通报道：CRISPR-Cas9系统是一种强大的基因组编辑工具，如风暴一般席卷了整个基因组工程领域。最近人们开始探索这一系统在其他方面的应用，而这样的应用往往需要同时表达一对gRNA，比如用Cas9切口酶进行大片段删除。纪念斯隆-凯特琳癌症中心的研究团队开发了一种简单又便宜的文库制备方法，可以快速有效的将配对gRNA克隆到表达载体上，用于体内和体外的功能筛选。这一成果发表在八月十七日的Nature Communications杂志上，文章的通讯作者是纪念斯隆-凯特琳癌症中心的Andrea Ventura。CRISPR-Cas9是细菌在漫长的进化过程中演化出的重要防御机制。这个监控体系能够根据
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上海交大Cell发表CRISPR/Cas9新文章
生物通报道 来自上海交通大学、哥伦比亚大学医学中心的研究人员报告称，他们利用CRISPR/Cas9技术使得CTCF结合位点(CBSs)发生倒位，证实了CBSs的定向可以影响基因组的拓扑结构及增强子/启动子功能。这一重要的研究发现发布在8月13日的《细胞》（Cell）杂志上。上海交通大学特聘教授吴强（Qiang Wu）及哥伦比亚大学医学中心的Tom Maniatis教授是这篇论文的共同通讯作者。吴强教授长期从事神经系统、药物代谢系统和肿瘤基因家族的表达调控和在体功能研究，在Science、Cell、PNAS、Molecular Cell等期刊上发表了多项重要的研究成果。作为基因表达调
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基于PCR评估sgRNA特异性的方法
生物通报道：CRISPR/Cas9已经成为一种通用的基因组工程工具，依赖于一个单导向RNA（sgRNA）和Cas9酶进行基因组编辑。研究人员可以用简单、快速和经济的方法来产生sgRNAs，因此能够在培养细胞、小鼠、斑马鱼和其他模型系统中进行靶向诱变。为了靶向效率，预先筛选sgRNAs，对于成功诱变和减少动物饲养成本，都是可取的。八月七日在国际学术期刊《Nucleic Acids Research》发表的一项研究中，来自美国国立卫生研究院的研究人员，提出了一种简单、快速和具有成本效益的荧光PCR为基础的方法——CRISPR Somatic Tissue Activity Test (CRISPR
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华裔牛人Nature Methods发布基因组编辑优化新技术
生物通报道 来自哈佛大学、麻省总医院的研究人员开发出了一项能推动基因组工程领域的新技术。这一技术可显著提高科学家们靶向特定缺陷基因，然后“编辑”它们，用健康DNA替代这一受损遗传密码的能力。这一重要的研究成果发布在《自然方法》（Nature Methods）。论文的通讯作者是哈佛大学化学及化学生物学教授，霍华德休斯医学研究所研究员David R. Liu。据称这位教授是一位从来没有做过博士后的年轻教授，他早年毕业于哈佛大学，1999年在加州大学伯克利校区攻读博士学位，在Peter Schultz教授指导下从事核糖核酸研究，并自主首次开始活细胞遗传密码的研究。之后就被哈佛大学任命为助
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李晓江：用CRISPR构建大型神经变性病动物模型
生物通报道：动物模型对于帮助我们了解神经退行性疾病的发病机制、并找到治疗方法，是非常有价值的。因为相比较啮齿动物来说，大型动物更接近于人类，它们为确定人类中所看到的重要病理事件，提供了很好的模型；大型动物对于验证有效的治疗方法或确定治疗靶标，也是非常重要的。由于缺乏来自大型动物的胚胎干细胞系，我们很难用传统的基因打靶技术，来构建神经退行性疾病的大型动物模型。近年来，CRISPR/Cas9已被成功应用于不同物种基因组的遗传修饰。最近，中科院遗传与发育生物学遗传研究所的李晓江博士，在国际学术期刊《Molecular Neurodegeneration》（影响因子6.563）发表综述文章，讨论了用C
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Nature：风口浪尖上的CRISPR基因编辑
生物通报道 “扯淡！”，这是哈佛医学院生物工程师Kevin Esvelt看到去年发表在《科学》（Science）杂志上的一篇研究论文时，口中冒出来的第一个词。这项研究工作描述利用一种基因编辑技术将突变插入到了果蝇中，并且这种突变可以传递给几乎所有的果蝇后代。尽管有趣，这份研究报告却让Esvelt感到不安：如果基因工程果蝇从实验室中逃出，突变有可能会在整个野生种群中迅速传播。但这却让加州大学欧文分校的分子生物学家Anthony James感到极为兴奋。他在给研究作者的信中写道：“天哪！我们能将之应用于蚊子吗？”7月30日，美国国家科学院(NAS)首次召开了一系列会议，旨在寻找一些方法
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BioTechniques：2015最受欢迎的技术文章
生物通报道：BioTechniques杂志日前评出了2015年最受欢迎的十篇技术文章，涵盖了对PCR、DNA提取、无细胞蛋白表达等常规技术的改良，以及CRISPR/Cas9、Hi-Plex、微图案化等新技术的应用。1. Visual detection of isothermal nucleic acid amplification using pH-sensitive dyes我们都曾在化学课上根据pH试纸的颜色判断过溶液的酸碱度。NEB公司的研究团队以同样的理念（基于pH值的颜色改变）为基础，开发了一种对pH敏感的变色染料，给DNA扩增赋予了肉眼可见的颜色改变。这一技术可以帮助人们直接用眼
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基因编辑技术成功精确修饰人类T细胞
科技日报华盛顿8月3日电 （记者何屹）美国加州大学旧金山分校的研究小组利用基因编辑技术CRISPR/Cas9精确修饰了人类T细胞。由于T细胞在人体免疫系统中作用十分重要，这一研究成果将为治疗糖尿病、艾滋病及癌症等提供全新的手段。CRISPR/Cas9是最新出现的一种由RNA指导的Cas9核酸酶对靶向基因进行编辑的技术。新的方法能使T细胞表面一种称为趋化因子受体CXCR4的蛋白质失去功能。这种蛋白可被艾滋病病毒利用感染T细胞，进而引发艾滋病。在癌症免疫疗法中，科学家发现，新方法还可成功关闭 PD-1分子，进而诱导T细胞攻击肿瘤。科学家对CRISPR/Cas9方法抱有极大的希望，因为其简单又不昂贵
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华人学者Cell子刊发表CRISPR重要成果
生物通报道：人类消化道中居住着大量的微生物，它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起到了重要的作用。许多人类疾病都与微生物组失衡有关。科学家们正在尝试对肠道微生物进行基因工程改造，以实现各种各样的应用，比如调节肠道生态环境和治疗人类疾病。多形拟杆菌（Bacteroides thetaiotaomicron）是普遍存在于人类肠道微生物组的一种高丰度共生菌，很适合用来进行这类研究。不过，对非模式生物进行改造并不容易。遗传学元件的缺乏，使人难以构建复杂的多基因通路。日前，麻省理工的研究人员开发了可以改造多形拟杆菌的多种遗传学元件，包括组成型启动子、诱导型启动
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Cell：CRISPR解答细胞代谢谜题
生物通报道 众所周知，线粒体是我们细胞中的发电厂，它利用呼吸作用来释放我们食物中的能量，捕获三磷酸腺苷（ATP）分子中的能量。在发表于7月30日《细胞》（Cell）杂志上的两篇研究论文中，来自麻省理工学院的研究人员揭示出了增殖细胞，包括肿瘤细胞需要线粒体呼吸作用的原因。尽管有许多其他的途经可以生成ATP，得不到呼吸作用提供的电子受体细胞无法进行增殖。上接：两篇Cell文章揭示惊人发现：至关重要的氨基酸 在同期的Cell杂志上，麻省理工学院生物学教授、Whitehead研究所和Koch研究所成员David Sabatini报告称，他利用一种不同的方法确定了天冬氨酸和细胞呼吸作用之间的
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CRISPR技术牛人Science热议基因驱动技术
生物通报道：在7月出版的Science杂志上，几位著名的CRISPR技术研究人员发表了题为“Safeguarding gene drive experiments in the laboratory”的评述文章，探讨了以CRISPR为基础的基因驱动技术系统（gene drive systems，生物通译），指出在实验室中进行此种另类的转基因技术的时候，需要慎之又慎。 今年3月，科学界出现了一个传言，称中国学者已成功地编辑了人类胚胎的基因，以一种人类无法完成的方式改变了他们的DNA。当然这一说法并不全面，但是已经非常火热的CRISPR/Cas9 基因组编辑方法又一次被放到了舆论的最前沿，还有以其
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四川大学国际期刊发表CRISPR文章
生物通报道：工程重组核酸酶的进展，为基因组编辑提供了简便可靠的方法。特别是CRISPR/Cas9系统的发展，科学家们已经发现了各种版本的Cas9蛋白和传递载体，可将所需的突变导入基因组，以校正疾病相关的突变，或激活/抑制感兴趣的基因。表观遗传调控因子在癌细胞中经常受到干扰，对于正常细胞到癌细胞的转化是至关重要的。肿瘤相关的表观遗传学改变或表观遗传学因子突变，在致癌过程的各个步骤中起主要作用，并影响各种各样癌症相关基因和各种癌性表型。因此，表观遗传学调控酶可能是癌症治疗的候选靶点。最近，四川大学生物治疗国家重点实验室的陈崇研究员在国际学术期刊《Human Gene Therapy》发表一篇评论文
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检测CRISPR/Cas9脱靶效应的简单方法
生物通报道：CRISPR/Cas系统目前被广泛应用于各种研究中，而将来更有望用于临床，但脱靶效应的存在始终是个问题。七月二十四日，来自意大利国家研究委员会（Consiglio Nazionale delle Ricerche）和意大利人类临床和研究中心的研究人员，提出了一种基于荧光原位杂交（FISH）的简单策略，可让我们对一个给定质粒的非特异性整合进行检测和频率评估，相关研究结果发表在Nature旗下子刊《Scientific Reports》。CRISPR/Cas9系统是一种创新、特异而有效的基因编辑方法。然而，它应用于人类研究，还需要进一步调查其他基因位点的额外修饰（所谓的“脱靶”事件）。
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清华汪小我等人开发CRISPR sgRNA设计工具
生物通报道：CRISPR/Cas9系统，是最近开发的一种强大而灵活的靶向基因组工程技术，包括基因组编辑和基因调控。这些应用需要设计高效、特异的单向导RNA（sgRNA）。然而，这仍然是具有挑战性的，因为它需要考虑许多标准。已有研究开发出了一些sgRNA设计工具用于基因编辑，但是目前还没有设计出用于基因调控的sgRNA设计工具。延伸阅读：专家指南：CRISPR实验中如何选择sgRNA[心得点评]。七月二十三日，清华大学自动化系的汪小我和美国斯坦福大学的Lei S Qi博士带领的研究小组，在国际权威杂志《Bioinformatics》发表了题为“CRISPR-ERA: a comprehensiv
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CRISPR先驱重大成果：实现CRISPR/Cas9医学应用的重要一步
生物通报道 在由加州大学旧金山分校的研究人员牵头的一个研究项目中，科学家们设计出了一种新策略利用基因组编辑系统CRISPR/Cas9来精确改造人类T细胞。由于这些免疫系统细胞在糖尿病、艾滋病到癌症等广泛疾病中都发挥着重要作用，这一研究成果为开展T细胞功能研究提供了一个万能的新工具，并为开发出基于CRISPR/Cas9的疗法来治疗许多严重的健康问题提供了一条途径（延伸阅读：张锋参与Cell发布CRISPR重要新成果）。利用他们的新方法，科学家们能够使得T细胞表面的CXCR4蛋白丧失功能——HIV利用了这一蛋白来感染T细胞引起艾滋病。研究小组还成功地关闭了PD-1——这一蛋白在新兴的癌
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张锋参与Cell发布CRISPR重要新成果
生物通报道 一直以来研究人员都无法在哺乳动物细胞中实现高通量的靶向基因编辑，CRISPR-Cas9系统的应用标志着遗传筛查一个重大的突破。现在，来自哈佛-麻省理工Broad研究所的研究人员将这一筛查技术应用于小鼠骨髓源性树突状细胞，研究了PAMPs触发的免疫反应的调控机制。通过综合分析基因敲除结果及蛋白质和mRNA表达改变，他们利用CRISPR筛查以前所未有的分辨率剖析了免疫调控网络。这一重要的成果发布在7月16日的《细胞》（Cell）杂志上。哈佛-麻省理工Broad研究所的Aviv Regev博士和Nir Hacohen博士是这篇论文的共同资深作者。著名华人科学家、CRISPR-
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