• 王国栋研究员应邀撰写“植物萜类多样性：从途径解析到生态功能”综述文章

      中医药作为中华民族的文化瑰宝与智慧结晶，不仅是我国独特的卫生健康资源，更承载着潜力巨大的经济价值、具有原创优势的科技内涵、底蕴深厚的文化属性以及至关重要的生态意义。为系统挖掘药用植物的核心价值，推动中医药现代化与国际化发展，2024年发起的“千种本草基因组计划”已正式启动。该计划以中国及海外主流药典收录的药用植物物种为核心基础，通过系统性的资源普查、收集与整理，构建标准化的药用植物实体资源库；同时，计划完成1000种以上药用植物的全基因组测序与解析，在此基础上深入开展基因功能验证、优质品种遗传育种、活性成分合成生物学重构

  来源：中国科学院遗传与发育生物学研究所

  时间：2025-12-13

• 王国栋研究组揭示大豆异黄酮6-羟化酶调控代谢平衡赋予大豆抗疫霉病的分子机制

      大豆作为重要的粮食作物和经济作物，其种子中富含的异黄酮类化合物不仅对人体健康有益，还在植物防御病原体过程中发挥关键作用。其中，glycitein型异黄酮因其独特的生物活性备受关注。然而，其生物合成途径长期存在争议，尤其是催化关键反应步骤的酶一直未被明确。尽管已有研究推测glycitein可能来源于黄烷酮6-羟基化途径，但其确切合成路线及生理功能始终缺乏直接实验证据。     针对这一科学难题，中国科学院遗传与发育生物学研究所王国栋研究组通过代谢组-全基因组关联分析（mGWAS），在大豆自然群体中鉴定到一个细胞色素P450

  来源：中国科学院遗传与发育生物学研究所

  时间：2025-12-13

• 生命学院葛亮课题组与合作者揭示TMED蛋白家族选择性调控非经典分泌的分子机理

  蛋白质分泌是一种进化上十分保守的细胞间通讯机制，关于信号肽导向的经典蛋白分泌已有深入的研究, 其关键内容已经被写入细胞生物学教科书。但在经典分泌途径被发现的三十多年后，研究人员才开始逐步认识到多种不具有信号肽的蛋白可通过不依赖内质网-高尔基体经典膜泡运输系统的方式释放到细胞外，统称为非经典蛋白分泌（Unconventional Protein Secretion, UcPS）。这些非经典分泌货物参与多种生物学过程，与多种人类重大疾病的发生发展密切相关。然而，细胞内上千种非经典分泌蛋白是如何选择性地进入细胞内膜泡载体进而释放到细胞外的这一关键科学问题仍不清晰。 2025年12月9日，清华大

  来源：清华园生命学院

  时间：2025-12-13

• 生命学院李栋课题组与合作者开发无需真值数据的自监督深度学习框架，实现生物友好型…

  近年来，深度学习结构光照明显微镜技术在长时程超分辨活细胞成像中展现出巨大潜力，为揭示亚细胞结构的动态过程与相互作用提供了强大工具。然而，现有方法严重依赖大量高质量“真值”图像进行监督训练，这些数据在光敏感、快速变化的生命过程中极难获取，限制了该技术的普适性。此外，主流端到端神经网络往往忽视超分辨成像物理模型，导致在低信噪比条件下重建保真度与分辨率下降。 针对上述挑战，2025年12月12日，清华大学李栋课题组、华中科技大学谭山课题组和复旦大学刘妍君课题组在《自然·方法》（Nature Methods）上联合发表题为“基于自监督重建的生物友好型高精度结构光超分辨显微成像”（Bio-frie

  来源：清华园生命学院

  时间：2025-12-13

• 广州健康院合作发现“NANOG-新生转录本-UTP15”调控轴在激活细胞多能性中的核心作用

  2025年12月8日，中国科学院广州生物医药与健康研究院RNA分子生物学研究组联合广州国家实验室和山东理工大学在Nature Communication 在线发表题为“Monitoring rapid degradation of NANOG reveals UTP15 maintains pluripotency by regulating nascent transcripts” 的研究论文。该研究通过应用5-乙炔基尿苷（EU）代谢标记与点击化学反应技术，系统绘制了小鼠胚胎干细胞（mESC）中NANOG蛋白快速降解条件下新生转录本及其互作RBP的动态变化图谱。我们发现经典

  来源：中国科学院广州生物医药与健康研究院

  时间：2025-12-13

• 营养与健康所武爱波研究组构建多模态多任务酶筛选平台CACLENS

  12月8日，中国科学院上海营养与健康研究所武爱波研究组在国际学术期刊Advanced Science在线发表了题为“CACLENS: A Multitask Deep Learning System for Enzyme Discovery”的研究论文。该研究建立了端到端筛选目标酶的多任务计算框架，大幅提高了功能酶的预测与发现效率，并成功应用于真菌毒素降解酶的挖掘。近年来，深度学习在酶的结构、功能与性质的大规模预测领域取得了显著进展。然而，由于缺乏面向多模态输入和多任务输出的统一建模能力，现有方法仍难以满足高性能功能酶筛选的需求。针对这一挑战，研究团队

  来源：中国科学院上海营养与健康研究所

  时间：2025-12-13

• 细菌厌氧生长新机制：核糖体RNA低氧诱导修饰激活肽酰转移酶中心

  在自然界中，细菌需要不断应对氧气浓度变化的环境挑战。当氧气供应受限时，大肠杆菌等微生物会启动复杂的适应机制来维持生存。传统观点认为，细菌主要通过调控基因表达和代谢通路来适应缺氧环境，然而近年来研究发现，核糖体作为蛋白质合成的核心机器，其本身也存在着精细的功能调控机制。核糖体RNA（rRNA）上的化学修饰可能扮演着关键角色，但这一领域的研究长期以来存在空白。特别是在肽酰转移酶中心（PTC）——核糖体催化肽键形成的活性区域，已知存在多种rRNA修饰，然而这些修饰在不同氧气条件下的动态变化及其功能意义尚未明确。理解细菌在缺氧条件下如何通过rRNA修饰优化翻译效率，不仅能够揭示微生物适应环境的新机制，

  来源：Molecular Cell

  时间：2025-12-12

• 基于可解释无监督学习的通用细胞形态分析框架MorphoGenie

  在细胞生物学研究领域，显微镜技术的飞速发展使得研究人员能够以前所未有的细节观察细胞的结构特征。然而，海量的细胞图像数据也给分析工作带来了巨大挑战。传统的细胞形态分析方法严重依赖人工特征提取，不仅耗时耗力，还容易引入人为偏见。虽然深度学习技术为自动特征提取提供了可能，但现有方法往往面临可解释性差、依赖标注数据等瓶颈。如何开发出既能自动学习细胞形态特征，又能让研究人员理解模型决策过程的计算方法，成为该领域亟待突破的关键问题。近日，香港大学电子工程系的研究团队在《Nature Communications》上发表了一项创新研究，提出了名为MorphoGenie的无监督深度学习框架，为解决上述挑战提供

  来源：Nature Communications

  时间：2025-12-12

• 人源葡萄糖-6-磷酸转运蛋白结构解析揭示其通过反向转运机制驱动G6P与Pi交换的分子基础

  在人体维持血糖稳定的精密调控网络中，内质网膜上的葡萄糖-6-磷酸转运蛋白1（G6PT1）扮演着至关重要的角色。它负责将细胞质中的葡萄糖-6-磷酸（G6P）转运至内质网腔内，由葡萄糖-6-磷酸酶（G6Pase）将其水解为葡萄糖和无机磷酸（Pi），葡萄糖随后被释放到血液中以供全身使用。这一过程在饥饿状态下防止低血糖的发生至关重要。G6PT1的功能缺陷会导致一种名为糖原贮积症1b型（GSD1b）的罕见遗传病，患者表现为空腹低血糖、肝肿大、中性粒细胞减少及免疫功能受损等严重症状。尽管G6PT1的生理重要性早已明确，但其如何特异性识别底物G6P和Pi，以及如何利用Pi的浓度梯度驱动G6P反向转运的分子机

  来源：Nature Communications

  时间：2025-12-12

• B细胞-IgA-上皮轴通过增强抗肿瘤免疫力改善HPV相关阴茎鳞状细胞癌预后

  阴茎鳞状细胞癌（Penile Squamous Cell Carcinoma, PSCC）是一种罕见但侵袭性强的恶性肿瘤，其中人乳头瘤病毒（HPV）感染驱动约50%的病例。令人困惑的是，与HPV阴性患者相比，HPV阳性PSCC患者往往表现出更好的临床预后，但其背后的免疫学机制一直未被阐明。近年来，肿瘤微环境（Tumor Microenvironment, TME）的研究成为癌症免疫治疗的热点，然而由于PSCC的罕见性和样本获取难度，其TME的细胞组成和功能特征仍属未知领域。为破解这一临床谜题，中国科学技术大学研究团队在《Nature Communications》上发表了最新研究成果。研究人员

  来源：Nature Communications

  时间：2025-12-12

• Lypd6b缺失通过PI3K/mTOR/LDHA通路介导的CD8+T细胞代谢重编程增强抗结直肠癌免疫

  在当今全球癌症负担日益加重的背景下，结直肠癌(Colorectal Cancer, CRC)作为第三大常见恶性肿瘤和第二大癌症致死原因，其治疗策略的创新尤为迫切。尽管免疫检查点抑制剂(Immune Checkpoint Inhibitors, ICIs)如抗PD-1抗体在肿瘤治疗中展现出巨大潜力，但仍有相当部分患者对现有免疫疗法不敏感，且常伴随免疫相关不良反应。因此，探索新的免疫调控靶点，揭示肿瘤微环境中T细胞功能失调的深层机制，成为当前肿瘤免疫研究的重要方向。近日发表在《Nature Communications》的一项研究，由北京交通大学张金华团队主导，首次系统揭示了淋巴细胞抗原6/尿激酶

  来源：Nature Communications

  时间：2025-12-12

• 基于图像的可解释人工智能突破传统 dysplasia 识别局限，精准诊断骨髓增生异常肿瘤

  在血液肿瘤的诊断领域，骨髓增生异常肿瘤（MDS）一直是一个挑战。这种克隆性髓系恶性肿瘤以无效造血、血细胞减少、骨髓增生异常（dysplasia）和 recurrent 遗传事件为特征。准确评估骨髓细胞形态对于MDS的初始诊断、疗效评估以及向急性髓系白血病（AML）转化的监测至关重要。然而，与相对容易计数的原始细胞不同，dysplasia 的迹象更为细微，其准确识别高度依赖于经验丰富的血液学专家。即便如此，这种识别过程也常常充满挑战：它既费时费力，又容易受到观察者间变异的影响——即使是资深形态学家之间也可能得出不同结论。此外，本地诊断与中心实验室复核结果之间也常存在差异。这种诊断上的不确定性，直

  来源：npj Precision Oncology

  时间：2025-12-12

• 肿瘤内皮细胞与淋巴细胞密度在晚期肝细胞癌免疫治疗中的差异意义：AI驱动的肿瘤微环境分析

  在肝癌治疗领域，晚期肝细胞癌（HCC）的治疗曾长期局限于索拉非尼等酪氨酸激酶抑制剂，患者获益有限。近年来，以atezolizumab联合bevacizumab（Atezo-Bev）为代表的免疫联合治疗方案显著改善了部分患者的生存，成为一线治疗新标准。然而，并非所有患者都能从这种联合治疗中同等获益，疗效存在显著异质性。因此，临床迫切需要一个可靠的生物标志物，能够像“指南针”一样，精准指引不同生物学特征的HCC患者选择最适合的治疗方案，避免无效治疗和资源浪费。传统的预测标志物，如PD-L1表达或肿瘤突变负荷（TMB），在HCC中的预测价值有限。这使得研究人员将目光投向了肿瘤内部更为复杂的“生态系统

  来源：npj Precision Oncology

  时间：2025-12-12

• 应变调控的边缘转角双层石墨烯：结构重构与电子态签名

  当两层石墨烯以微妙的角度重叠时，会形成令人着迷的摩尔图案，从而衍生出奇特的物理性质。近年来，魔角转角双层石墨烯（TBG）因其强关联和拓扑态而备受关注，然而，对于远小于1°的极小转角（ marginally twisted bilayer graphene, m-TBG）体系，其独特的结构和电子性质却鲜有实验探索。在如此小的转角下，强烈的晶格弛豫会显著重构局部原子几何结构：AA堆叠区域（原子垂直对齐）收缩，AB/BA区域（伯纳尔堆叠）扩展为三角形畴，并形成畴壁（Domain Wall, DW）网络。这些独特的结构为探索相关性和拓扑现象提供了新机遇，例如，畴壁处可形成手性一维拓扑通道，甚至在量子霍

  来源：National Science Review

  时间：2025-12-12

• 基于石笋钙同位素的定量古水文重建揭示4.2千年事件对长江中游新石器社会的影响

  在人类文明发展史上，适宜且稳定的降雨是支撑社会繁荣的基石。然而，当降雨模式发生剧烈波动，尤其是出现极端降水事件时，往往会给古代社会带来毁灭性打击。大约在4200年前（4.2 kyr BP），全球多个地区，包括中东、南亚和东亚，都经历了显著的气候变化，这一时期被称为“4.2千年事件”。在中国，与之相对应的是长江中游地区高度发达的石家河文化的衰落。石家河文化以其宏大的城址（如面积达1.8平方公里的石家河古城）、先进的玉器与陶器制作技术以及复杂的水利管理系统而闻名，是新石器时代晚期技术最先进的文明之一。然而，从约4300年前开始，该文化走向衰落，并在约3900年前崩溃。关于其崩溃原因，学术界长期存在

  来源：National Science Review

  时间：2025-12-12

• m6A RNA甲基化在早期胚胎谱系中维持X染色体失活和X-常染色体剂量补偿的作用

  在哺乳动物中，雌性个体通过一条X染色体的失活来平衡两性间X连锁基因的剂量，这被称为X染色体失活。然而，这又带来了新的问题：仅剩一条有活性的X染色体，其上的基因表达量如何与拥有两个拷贝的常染色体基因相匹配？这就是著名的X-常染色体剂量补偿问题。数十年来，关于哺乳动物是否通过上调活性X染色体的表达来实现剂量补偿的争论一直存在。近年来，随着单细胞等位基因分辨转录组分析技术的发展，证据表明在早期胚胎发生过程中，伴随着失活X染色体上基因的沉默，活性X染色体确实发生了协调性的上调。但维持这种精妙平衡的分子机制，尤其是新兴的表观转录组调控因子——N6-甲基腺嘌呤（m6A）RNA甲基化在其中扮演的角色，仍是一

  来源：Stem Cell Reports

  时间：2025-12-12

• SUMO特异性蛋白酶SPF1与SPF2通过介导WRI1去SUMO化负调控种子油脂合成

  种子是植物繁衍后代的重要器官，也是人类获取食用油和工业用油的主要来源。提高种子含油量一直是作物遗传改良的重要目标。在模式植物拟南芥中，WRINKLED1（WRI1）作为APETALA2/EREBP转录因子家族的成员，是调控种子油脂合成的关键主效因子，直接控制脂肪酸合成途径多个关键基因的表达。然而，科学家们对WRI1蛋白自身的转录后调控机制，特别是蛋白质翻译后修饰如何影响其稳定性和活性的认识仍不完善。SUMO化是一种重要的蛋白质翻译后修饰过程，类似于泛素化，但功能迥异。它通过E1（激活酶）、E2（结合酶）、E3（连接酶）级联反应将SUMO（小泛素样修饰物）共价连接到靶蛋白的特定赖氨酸残基上，从而

  来源：Plant Communications

  时间：2025-12-12

• OsWRKY47-OsMYB30/OsWRKY39模块通过协调物理和化学防御增强水稻稻瘟病抗性

  水稻作为全球主要粮食作物，其生产安全一直受到稻瘟病的严重威胁。由稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)引起的这种毁灭性病害，每年导致水稻产量大幅损失，堪称水稻的"癌症"。稻瘟病菌的侵染过程颇具策略性：首先通过附着孢产生巨大膨压穿透植物表皮细胞壁，完成初期入侵；随后在植物组织内扩展蔓延，最终形成典型病斑。面对这一多阶段侵染过程，植物进化出了相应的防御机制——早期通过强化细胞壁等物理屏障阻止病原菌入侵，后期则激活化学防御物质抑制病原菌扩展。然而，科学家们一直困惑的是：是否存在一个"总指挥"基因，能够协调这两道防线的有序激活？这种协同防御机制背后的分子调控网络又是怎样的？针对这一科学难题，

  来源：Plant Communications

  时间：2025-12-12

• 算法平台管理的双刃剑效应：基于认知评价与持久认知理论的外卖骑手风险行为机制研究

  在数字经济的浪潮中，外卖骑手已成为城市生活中不可或缺的风景线。然而，这群"与时间赛跑"的劳动者却面临着令人担忧的安全隐患——闯红灯、逆行、超速等风险行为屡见不鲜。数据显示，近96.21%的骑手认为自己面临严重的意外伤害风险，外卖行业已成为工伤高发区。这背后隐藏着一个深刻的社会问题：在算法平台高效管理的表象下，骑手们为何会陷入"沉默顺从"式的风险行为？以往研究对算法平台管理的影响存在明显分歧。部分学者强调算法的"赋能"作用，认为路线规划、订单匹配等决策支持工具提升了骑手的自主性；另一些研究则聚焦算法的"控制"本质，指出实时监控和严格奖惩规则削弱了骑手自主权，使其陷入"订单竞赛"。这种学术争议恰恰

  来源：iScience

  时间：2025-12-12

• 内侧颞叶中嗅内皮层与嗅周皮层在情景记忆提取中的互补作用：整合与分化的平衡机制

  当我们回忆过去时，大脑不仅能提取出特定事件的独特细节（比如上周三午餐吃了什么），还能将共享同一背景的多个事件整合成一个连贯的整体（比如记住那家餐厅里所有见过的装饰）。这种既保持特异性又实现泛化的能力，是情景记忆系统的核心特征，其神经基础主要依赖于内侧颞叶（Medial Temporal Lobe, MTL）的协同工作。然而，MTL内的不同亚区——如海马体（Hippocampus, HP）、嗅内皮层（Entorhinal Cortex, EC）、嗅周皮层（Perirhinal Cortex, PrC）和海马旁皮层（Parahippocampal Cortex, PhC）——是如何通过互补的计算机

  来源：iScience

  时间：2025-12-12

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