• Nature发布单细胞DNA测序新技术：癌细胞能在肿瘤生长过程中继续积累遗传变化

  德州大学安德森分校癌症中心的研究人员克服了单细胞DNA（scDNA）测序的技术挑战，开发了一种以单分子分辨率进行scDNA测序的新方法。这项技术首次揭示了三阴性乳腺癌在染色体不稳定的最初爆发后会经历连续的基因拷贝数变化。这一发现发表在Nature杂志上，为测序数百种癌细胞提供了一种准确而有效的新方法，同时也为癌症发展提供了新的见解。这些见解可以解释为什么治疗并不总是有效的，以及为什么研究人员不能在实验室中产生同质的细胞培养物。生物信息学与计算生物学副教授Nicholas Navin博士说：“这代表了我们在单细胞DNA测序中重大进步，新方法显著提高了通量，准确性和易用性。” “我们现在能够以以前

  来源：生物通

  时间：2021-03-25

• 关于召开“科学仪器技术产业学院成立大会暨广州市仪器行业协会2020年年会”第四轮通知

  尊敬的各会员单位及仪器同行：为响应五中全会主旨以开拓创新为基础，与国家同一大方向共同进步，把科技自立自强作为国家发展的战略支撑，强化国家战略 科技力量，提升企业技术创新能力，激发人才创新活力，“科学仪器技术产业学院成立大会暨广州市仪器行业协会2020年年会”将于 2021年4月17日在广州颐和大酒店国际会议中心召开。本届会议以 “助力创新、大耕未来"为主题，围绕“国际化仪器制造商眼中的中国市场"、“仪器行业如何发挥移动互联网裂变优势'‘和“髙效团队建设“、“广州市社会组织助力四川省甘孜藏族自治州脱贫攻坚项目介绍“等内容就仪器营销面临的新格局、新机遇和新挑战共同探讨仪器行业未来的新思路和新路径。

  来源：组委会

  时间：2021-03-25

• 《食品科学与技术趋势》加工食品的分类系统需要清晰

  在这项独特的研究中，来自萨里大学和欧洲食品信息委员会(EUFIC)的研究人员审查了100多篇科学论文，以检查在发展加工食品分类系统中是否存在不同的标准，如果存在，是什么区别它们。根据“加工程度”对食品进行分类的分类系统，已被用于预测饮食质量和健康结果、为指导方针提供信息，以及用于产品开发。研究人员发现，大多数分类系统的标准与现有的营养和食品加工的科学证据不一致。人们认为，这可能源于某些分类系统发展背后的不同视角和意图。研究人员还指出，一些系统中没有包括营养成分的测量，这可能会让消费者感到困惑。作者们将其与诸如nutrition -score之类的营养分析方案进行了对比，后者将产品的营养价值转化

  来源：Trends in Food Science & Technology

  时间：2021-03-25

• 超声波读心术:一种侵入性较小的解码大脑意图的技术

        图像:非人类灵长类动物大脑血管系统的细节，使用功能性超声波非侵入性成像。资料来源:S. Norman /加州理工学院当你滚动网页时，你的大脑发生了什么?换句话说，你大脑的哪些区域是活跃的，哪些神经元在和其他神经元交流，它们向你的肌肉发送了什么信号?将神经活动映射到相应的行为是神经科学家开发脑机接口(brain-machine interface, BMIs)的一个主要目标:这种设备可以读取和解释大脑活动，并向计算机或机器发送指令。虽然这看起来像是科幻小说，但现有的BMIs已经可以实现，例如，用机械手臂连接瘫痪的人;该装置可以解释人的神经活动和意图，

  来源：Neuron

  时间：2021-03-25

• 蒋超研究员在Nature Protocols上发表个体生物和化学空气暴露组组分的研究方法

       2021年1月13日，我院蒋超研究员在Nature Protocols上在线发表题为：“Decoding personal biotic and abiotic airborne exposome”的方法学文章。该文章从设备开发、试验流程以及生信分析角度系统的描述了揭秘个体水平空气暴露组组分的研究方法。    人类疾病是由个体遗传和环境因素共同决定的。而环境的影响可归因为生物、化学、物理甚至是心理等因素（图1）。不正常的环境暴露，特别是在幼儿时期，会大大增加各种急性和慢性疾病，包括癌症、过敏/哮喘和自身免疫性疾病的发生。环境暴露组(E

  来源：浙江大学生命科学研究院

  时间：2021-03-25

• Genome Biology | 张泽民课题组发表单细胞数据整合新方法

  ?2月18日，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）、生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心（ICG）、生命科学联合中心（CLS）张泽民实验室联合百奥智汇在期刊《Genome Biology》上发表了题为 “iMAP: integration of multiple single-cell datasets by adversarial paired transfer networks”的生物信息方法学论文，提出了基于深度自编码器和生成式对抗神经网络的单细胞数据整合的新方法iMAP。利用单细胞RNA测序技术产生可靠新发现的重要途径是整合多来

  来源：北京大学生物医学前沿创新中心

  时间：2021-03-23

• 郭雪峰课题组与合作者设计开发氨基酸手性识别的单分子技术

  氨基酸是生物功能大分子蛋白质的基本组成单位，是构成动物营养所需蛋白质的基本物质，同时也是许多药物分子的重要组成片段，在生命体中起着至关重要的作用，比如有氨基酸组成的蛋白酶具有高度专一的催化活性。因此，氨基酸的高灵敏检测与精准分析不仅仅可以加深对氨基酸在生命体内发挥作用机制的理解，同时在食品工业、天然产物和医药等领域都发挥着重要的作用。然而，氨基酸种类繁多，结构相似，且具有手性对映体，比如人体内的氨基酸都是L型。传统方法对氨基酸结构鉴定和手性识别存在着巨大挑战。最近，北京大学化学与分子工程学院郭雪峰课题组、中国科学技术大学杨金龙课题组以及东京大学Jun Terao课题组合作发展了一种独

  来源：北京大学新闻网

  时间：2021-03-23

• Nature Metabolism找到了一种扭转高血糖和肌肉流失的方法

  莫纳什大学的一项研究发现，肥胖相关的2型糖尿病患者的肝脏代谢紊乱，导致高血糖和肌肉损失，这也被称为骨骼肌萎缩。莫纳什生物医学发现研究所的Adam Rose博士领导的一项合作研究通过人体试验和小鼠模型发现，肥胖相关的2型糖尿病患者的肝脏氨基酸丙氨酸代谢发生了改变。他们利用选择性沉默肝细胞中分解丙氨酸的酶，发现可以通过恢复骨骼肌蛋白合成来逆转高血糖和肌肉损失，骨骼肌蛋白合成是肌肉大小和强度的关键决定因素。这项研究发表在Nature Metabolism杂志上，研究表明改变肝脏代谢直接影响肌肉大小和强度,这背后的机制是由水平升高的激素皮质醇和胰高糖素提高肝脏和骨骼肌的氨基酸循环，使肌肉变得越来越弱。

  来源：生物通

  时间：2021-03-22

• 从SARS-CoV-2蛋白出发，改善大分子的三维重建的新方法

   由马德里康普顿斯大学（UCM）领导的一项国际研究提出了新的计算图像处理方法，可以改进生物大分子的分析和三维重建。目前，确定诸如蛋白质的大分子的组成（即氨基酸序列）相对简单；然而，确定它们以三维结构排序的形状并不容易。发表在Nature Communications上的新方法改进了通过低温电子显微镜获得的3D重建的可视化以及它们的质量。UCM光学系Ramóny Cajal研究员Javier Vargas解释说：“这项研究有助于我们扩大对支持基本生命过程的蛋白质和其他大分子的理解，为结构生物学家提供新的工具以更高的可靠性解释更多。”这些方法应用于具有生物医学相关性的各种生物大分子，包括

  来源：Nature Communications

  时间：2021-03-22

• Plos Biology∣汤富酬课题组与合作者开发出单细胞转录组三代单分子测序新方法

  　　 2009年首个单细胞转录组测序技术问世，开启了单细胞组学时代（scRNA-seq）（Tang et al., 2009）。过去十余年间单细胞测序技术的不断发展极大地加速了生物医学领域的相关研究，帮助科研人员克服了稀有生物样本以及生物样本内生异质性等重大挑战，一系列模式生物及人类自身的单细胞转录组图谱也由此诞生。然而目前的单细胞测序技术几乎全都是基于二代测序平台，测序读长短一般在150bp左右，即使采用双端测序技术，测得的有效读长也不超过500bp。而人类转录组中转录本的长度普遍在1000bp以上，有些转录本长度甚至超过100kb（Piovesan

  来源：北京大学生物医学前沿创新中心

  时间：2021-03-22

• 袁道军团队在棉花遗传改良研究中有新突破

  南湖新闻网讯（通讯员 王敏）近日，我校棉花团队袁道军副教授与爱荷华州立大学、美国农业部合作研究成果发表，研究对643份异源四倍体棉花深度重测序了，综合已发表的1000余份棉花重测序资源，构建了异源四倍体棉花的系统发生树，量化了其遗传多样性和瓶颈，获得了驯化选择和遗传改良的基因组选择区间，确定了陆地棉、海岛棉驯化起源和扩散的平行路径，并揭示了两个栽培棉种间的相互渗透规律，为棉花遗传改良提供了理论指导和丰富的遗传资源。棉花(Gossypium spp.)是世界上最重要的经济作物之一，是天然可再生纤维、食用油和蛋白质的重要来源。目前世界上广泛种植的棉花是两个异缘四倍体棉种：陆地棉(G. hirsut

  来源：华中农业大学植物科学技术学院

  时间：2021-03-20

• 赵方庆研究员团队建立基于纳米孔测序的环形RNA识别和重建新技术

  　　在国家自然科学基金项目（批准号：32025009、91940306、31722031）等资助下，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员团队开发了一种高效测定分析环形RNA的方法,相关成果以“利用纳米孔测序和CIRI-long技术对环状RNA进行综合分析（Comprehensive profiling of circular RNAs with nanopore sequencing and CIRI-long）”为题，于2021年3月11日以长文形式在《自然 生物技术》（Nature Biotechnology）上在线发表。论文链接：https://www.nature.com/arti

  来源：国家自然科学基金委员会

  时间：2021-03-19

• Nature Communications | 张泽民课题组发表单细胞类群纯度评估新方法

  　　6月22日，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）、生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心（ICG）、生命科学联合中心（CLS）张泽民实验室联合百奥智汇在期刊《Nature Communications》上发表了题为“An entropy-based metric for assessing the purity of single cell populations“的生物信息方法学论文，正式发布了基于单细胞转录组数据进行无监督基因选择和细胞类群纯度评估的新工具ROGUE。　　单细胞转录组测序为发现和鉴定各种细胞类型提供了重要途径，但是

  来源：北京大学生物医学前沿创新中心

  时间：2021-03-19

• Nature Communications：单细胞转录组数据检索新方法和参考数据库

  　　作为细胞异质性研究的重要工具，单细胞转录组测序技术近年来蓬勃发展，并积累了大量研究数据。若能有效利用现有的单细胞数据进行检索与推断，研究者便能更好地进行新测序单细胞的注释，以及综合多数据集的研究。然而，精确的单细胞转录组数据检索和注释需要克服两个挑战：一、数据集之间的批次效应（batch effect）会显著影响细胞检索的可靠性；二、目前缺少跨物种和平台、具有高质量注释的单细胞转录组数据库。　　　　日前，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）、北京未来基因诊断高精尖创新中心（ICG）、北京大学生命科学学院生物信息中心（CBI）、蛋白质与植物基

  来源：北京大学生物医学前沿创新中心

  时间：2021-03-19

• 深研院化生学院杨世和课题组在卤化钙钛矿材料制备及其钙钛矿X射线探测器成像领域取得突破性进展

  近日，深圳研究生院化学生物学与生物技术学院杨世和课题组在国际知名期刊 Cell 的姊妹刊 Matter 上，发表了题为“An aerosol-liquid-solid process for the generalsynthesis of halide perovskite thick films for direct-conversion X-ray detectors”的论文。首次报道了一种新颖的ALS（aerosol-liquid-solid process）方法合成高质量的卤化钙钛矿材料厚膜，并以此为基础进行了X射线探测器的设计和制备，展现了其生物成像应用的潜力。X射线

  来源：北京大学新闻网

  时间：2021-03-19

• 物理学院高鹏课题组发展电镜新技术在纳米分辨率下绘制声子色散分布图

  声子在凝聚态体系的热学、电学和纳米光学等性质中起着重要作用。然而，对单个纳米结构或晶体缺陷等的局域声子色散进行实验测量在技术上具有很大困难。非弹性中子散射、X射线散射等手段由于空间分辨率不足只能测量块体材料的声子色散，针尖增强拉曼散射等光学方法则不具有足够的动量探测范围。为了测量局域声子色散，必须同时实现纳米级空间分辨率、足够的动量探测范围和分辨率、meV级能量分辨率、极高的探测灵敏度，这些是传统实验手段无法兼顾的。北京大学物理学院量子材料科学中心和电子显微镜实验室高鹏研究员课题组利用扫描透射电子显微镜发展了四维电子能量损失谱技术（4D-EELS），首次实现了单个纳米结构中不同

  来源：北京大学新闻网

  时间：2021-03-19

• 南海陆缘同裂陷期的岩浆作用研究取得新突破

  　　近日，中国科学院南海海洋研究所边缘海与大洋地质重点实验室（OMG）构造演化与模拟研究团队张翠梅副研究员、孙珍研究员，联合法国斯特拉斯堡大学的Gianreto Manatschal教授和中海石油有限公司庞雄地质总师等，在南海北部陆缘同裂陷期岩浆作用方面取得新进展，研究成果发表在《Gondwana Research》上。  　　被动陆缘依据岩浆活动的表征划分为贫岩浆型和富岩浆型两种类型。但这种端元划分模式对于理解陆缘形成演化过程中复杂的岩浆作用非常有限，不能说明岩浆作用形式以及岩浆量在时空上的演化规律。  　　研究人员利用国际大洋钻探IODP钻井资料，结合深反射和折射地震资

  来源：中国科学院南海海洋研究所

  时间：2021-03-19

• 南海地幔演化统一模型取得重要突破

  　　中国科学院南海海洋研究所边缘海与大洋地质重点实验室深海地球动力学研究团队张旭博助理研究员与林间特聘研究员，联合美国波士顿学院Mark Behn教授，利用最新的国际大洋钻探数据，结合海洋地球物理、地球化学与先进的地球动力学手段，在南海地幔演化动力学方面取得重要进展，研究成果近日发表于国际著名期刊《Journal of Geophysical Research: Solid Earth》（《地球物理研究杂志：固体地球》）。  　　南海是西太平洋最大的边缘海，是攻关地球边缘海形成演化过程重大科学问题的突破口。近年来通过国际大洋钻探、基金委重大研究计划“南海深部过程演变”资助的深拖地磁与

  来源：中国科学院南海海洋研究所

  时间：2021-03-19

• 朱正江课题组发表基于离子淌度质谱的多维代谢物鉴定技术和数据库

  中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心朱正江研究员课题组在Nature Communications杂志在线发表了题为“Ion Mobility Collision Cross-Section Atlas for Known and Unknown Metabolite Annotation in Untargeted Metabolomics”的研究论文（https://www.nature.com/articles/s41467-020-18171-8）。该工作发展了基于离子淌度质谱的碰撞截面积数据库（AllCCS），并开发了基于离子淌度质谱的多维代谢物分析技术用于生命体内已知

  来源：中国科学院生物与化学交叉研究中心

  时间：2021-03-19

• Nature重大突破：从皮肤细胞生成了人类早期胚胎的第一个模型

  一个国际研究团队在澳大利亚墨尔本建立了人类胚胎皮肤细胞模型，这将彻底改变流产，不育症和人类早期发育方面的研究。这一重大突破公布在Nature杂志上，由Jose Polo教授领导完成，在这项研究中，研究小组已成功地将成纤维细胞或皮肤细胞重编程为3D细胞结构（iBlastoids），该结构在形态和分子上与人胚泡（blastocyst，囊胚）相似。作者表示，这一成就是对人类早期发育和不育的未来研究的重大突破。迄今为止，研究这些早期胚胎的唯一方法是使用难以获得且稀少的IVF手术胚泡。Polo教授说，“iBlastoids可使科学家研究人类发育的早期步骤，以及不育，先天性疾病，还有毒素和病毒对早期胚胎的

  来源：生物通

  时间：2021-03-18

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