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2023年度全球十大空间生物学公司
空间生物学如今正成为炙手可热的技术。根据DeciBio咨询公司的数据，2022年全球空间生物学技术的市场规模约为3.2亿美元，未来五年将以30%的复合年增长率增长，到2027年将达到12亿美元。新加坡科技研究局（A*STAR）也十分看好空间生物学的潜力。它旗下的新加坡基因组研究所于今年10月与NanoString Technologies和Next Level Genomics公司建立了一个联合实验室，其目标是利用空间生物学来鉴定生物标志物，并预测疾病进展和治疗应答。GEN网站近日更新了全球十大空间生物学公司的名单，包括五家上市公司和五家私营公司。有意思的是，五大上市公司的营业收入正在迅速增长
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Cell子刊：利用MALDI质谱成像和原位荧光标记观察宿主-微生物相互作用的新方法
作为共生体或寄生虫生活在动物宿主体内的细菌的迷人世界对研究人员来说仍然是一个谜。基尔大学(CAU)和不来梅的马克斯普朗克海洋微生物研究所正在通过研究微生物与宿主之间的相互作用来解决这个难题。在中国农业大学农业与营养科学学院代谢组学系主任Manuel Liebeke教授和马克斯普朗克海洋微生物研究所代谢相互作用研究小组的领导下，一个研究小组取得了突破性进展，为这个神秘的微观世界提供了见解。通常，细菌不能在实验室中培养，研究人员必须依靠从环境样本中获得的细菌基因组信息来获得对微生物代谢的理论见解。然而，人们一直缺乏对它们在自然环境中实际活动的了解。为了解决这个难题，科学家们开始研究所谓的细菌代谢组
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提前8年确诊炎症性肠病的无创新技术
弗朗西斯克里克研究所和哥本哈根奥尔堡大学的研究人员已经证明，在克罗恩病的诊断前8年和溃疡性结肠炎的诊断前3年，血液检查就可以检测到这些变化。这意味着炎症性肠病的开始在症状出现之前很长一段时间就开始了，未来可能会为医生提供一个机会，在症状出现之前采取预防措施，或者在最有效的时候开药。克罗恩病和溃疡性结肠炎统称为炎症性肠病(IBD)。这是一种无法治愈的疾病，涉及肠道过度炎症，导致腹痛和腹泻等症状。早期诊断和治疗是改善结果的关键，但在英国每年确诊的2.5万人中，有近四分之一的人等待了一年以上。在他们发表在《Cell Reports Medicine》上的研究中，研究小组使用了丹麦人的电子健康记录，将
来源：Cell Reports Medicine
时间：2023-11-09
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3美元血液检测可以更快地检测出常见的致命癌症
大多数癌症由于保持低调而变得致命，只有在病情严重到无法治疗时才会出现症状。卵巢癌和胃食道癌是最臭名昭著的这种狡猾的疾病进展，往往导致晚期诊断。现在，一个国际研究小组，包括来自洛克菲勒大学细胞和结构生物学实验室的研究人员，已经开发出一种高灵敏度的血液检测方法，能够检测出癌细胞产生的一种关键蛋白质，这种蛋白质有望被早期发现。研究结果最近发表在《Cancer Discovery》杂志上。与许多范围有限、昂贵或依赖侵入性组织取样的癌症检测不同，这种新方法是一种低成本的多癌检测方法，可以在不到两小时的时间内检测出微量血液中被称为LINE-1-ORF1p的告密蛋白的存在。洛克菲勒实验室的负责人Michae
来源：Cancer Discovery
时间：2023-11-08
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QIAGEN与Element Biosciences合作提供NGS解决方案
近日，QIAGEN和Element Biosciences公司宣布，双方已达成战略合作伙伴关系，为Element AVITI™台式系统提供新一代测序（NGS）工作流程。对于使用AVITI系统的客户来说，QIAGEN将提供全面的NGS工作流程，包括QIAseq Panel以及CLC LightSpeed和QCI Interpret等生物信息学方案。QIAGEN高级副总裁、生命科学业务负责人Nitin Sood表示：“QIAGEN和Element Biosciences之间的合作为全球客户提供了各种基因组应用的见解。研究人员越来越多地寻找Sample to Insight完整解决方案和
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因Xenium原位分析表现强劲，10x Genomics上调全年收入预期
10x Genomics公司上周表示，由于空间生物学仪器（特别是Xenium）的销售在第三季度表现强劲，公司计划上调2023年全年收入预期。10x目前预计2023年收入在6.10亿美元至6.25亿美元之间，与2022年全年相比增长18%到21%。新的预测是基于第三季度收入同比增长17%，这是由Xenium仪器的销售推动的。10x公司第三季度的营业收入为1.54亿美元，高于2022年第三季度的1.31亿美元，也超出华尔街平均预期的1.51亿美元。10x第三季度的仪器收入为3490万美元，与去年同期的2090万美元相比增长了67%，其中空间仪器的销售额为2270万美元，同比增长三倍多。耗材收入为1
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PacBio推出三款Kinnex RNA试剂盒，将显著提高RNA测序的通量
测序公司PacBio近日宣布，它已经开始接受Kinnex RNA试剂盒的订单。这种突破性的试剂盒能够在PacBio长读长测序系统上提高全长RNA、单细胞RNA和16S rRNA测序的通量，推动大规模的研究。Kinnex试剂盒是基于MAS-Seq方法，将较小的DNA片段连接成较长的可用于HiFi测序的文库。短读长测序难以覆盖整个转录本，而对一条转录本进行长读长测序往往会导致测序能力闲置。有了Kinnex试剂盒，客户可以将转录本连接成长文库进行HiFi测序，从而提高通量，使长读长RNA测序更具成本效益。新推出的Kinnex单细胞RNA试剂盒以现有的MAS-Seq for Single Cell 3
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Illumina推出先进的液体活检检测，实现实体肿瘤的全面基因组分析
Illumina Inc.(纳斯达克股票代码:ILMN)是DNA测序和阵列技术的全球领导者，今天宣布其用于基因组分析的新一代分布式液体活检测定。新的TruSight Oncology 500 ctDNA v2 (TSO 500 ctDNA v2)是一种研究分析方法，可在无法进行组织检测时对血液中的循环肿瘤DNA (ctDNA)进行无创全面基因组分析(CGP)，或作为组织检测的补充。关键改进包括更快的样品到答案的周转时间(不到4天)，更高的灵敏度和更低的无细胞DNA (cfDNA)输入要求，以及更简化的工作流程，这些将在2024年上半年进一步实现自动化。Illumina肿瘤学总经理Kevin K
来源：illumina
时间：2023-11-02
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《Immunity》创新抗体方法针对深层癌症突变
长期以来，癌症治疗一直是一把双刃剑——旨在杀死癌细胞的治疗方法往往也会对健康细胞造成严重破坏。但是，10月30日发表在《Immunity》杂志在线版上的一项新研究揭示了一种治疗癌症的方法，研究人员称这种方法比目前的治疗方法更精确、更持久、毒性更小。这项工作由杜克大学医学院免疫学研究员Jose Ramon Conejo-Garcia博士领导，主要研究IGA抗体的创新使用，以靶向和杀死癌细胞深处的促肿瘤分子，这些分子长期以来一直逃避现有的治疗选择，包括IGA抗体治疗。“这是一项概念验证研究，但结果非常有希望，”杜克大学综合免疫生物学系的科技学者Conejo-Garcia说。“我们相信这种治疗方法可
来源：Immunity
时间：2023-11-01
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PacBio Q3收入大涨77%，上调全年收入预期
Pacific Biosciences公司本周一表示，在第三季度收入同比增长77%之后，该公司上调了2023年全年收入预期。公司预计2023年总收入在1.95亿美元到2.00亿美元之间，与2022年相比增长52%到56%。在截至9月30日的三个月里，PacBio的营业收入为5570万美元，高于2022年第三季度的3230万美元，也超出华尔街平均预期的4880万美元。其中，产品收入为5160万美元，与去年同期的2750万美元相比大涨87%；服务及其他收入为410万美元，比去年同期的410万美元下降14%。在产品收入中，仪器收入达3470万美元，与去年同期的1140万美元相比增长了三倍多，耗材收入
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首创新型颗粒疫苗
格里菲斯大学(Griffith University)的研究人员即将在疫苗开发方面取得技术突破，可能开发出一种新的疫苗模式。格里菲斯大学的研究人员已经开发出一种潜在的新疫苗模式，目前正处于概念验证阶段。这种稳定的颗粒疫苗由Bernd Rehm教授和Shuxiong Chen博士首创，与一种有前景的甲型链球菌疫苗一起进行了测试。这项创新技术对大肠杆菌细胞进行了重新编程，以生产大量疫苗颗粒。这些疫苗在室温下是稳定的，使它们成为发展中国家的理想选择。测试和开发这种新型疫苗正处于概念验证阶段和早期研制阶段。为了证明这种疫苗方法，用一种更成熟的针对甲型链球菌（Strep A）的格里菲斯疫苗进行了测试，该
来源：npj Vaccines
时间：2023-11-01
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遗传方法可以使用化石脂质作为产氧原始细菌的生物标志物
蓝藻是地球历史上的一个关键物种，因为它们第一次引入了大气中的氧气。因此，对它们进化的分析为现代有氧生态系统的形成提供了重要的见解。长期以来，某种类型的化石脂质，即所谓的2-甲基藿烷，被认为是沉积物中蓝藻的重要生物标志物，其中一些已经有数亿年的历史。然而，当事实证明不仅蓝藻菌，而且阿尔法变形菌在基因上能够产生这些脂质时，这一点受到了质疑。由GFZ德国地球科学研究中心的Yosuke Hoshino和不来梅大学MARUM海洋环境科学中心的Benjamin Nettersheim领导的一个国际研究小组现在研究了基因的系统发育多样性和分布，包括负责2-甲基藿烷亲本脂合成的HpnP:研究人员已经解读了这些
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突破性的T细胞发现对工程定制免疫反应具有巨大的潜力
T细胞是人类免疫系统前线的战士。它们扮演着许多重要的角色，包括攻击病毒或细菌感染的细胞和某些癌细胞，以及免疫记忆——记住最初触发T细胞的特定病原体或癌症特征。到目前为止，了解T细胞如何形成特定的作用，例如细胞杀伤(细胞毒性)T细胞或记忆T细胞，一直困扰着我们。在将于10月25日发表在《细胞报告》(Cell Reports)网站上的一篇论文中，ISB的研究人员取得了突破性的发现，即人类在儿童早期发育的遗传编码T细胞受体(TCR)序列决定了T细胞的功能。该论文的第一作者Daniel Chen说:“受体序列是主要的决定因素，而不是信号蛋白，如细胞因子或其他血液成分。”“正是受体序列——T细胞上与外来
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成都生物所在野外生物多样性调查方法和模型开发上取得新进展
生物多样性关系着人类福祉，是人类赖以生存和发展的重要基础。当前，在全球气候变化的背景下，我们目睹着全球物种灭绝速度加快，生态系统不断恶化，生物多样性急剧流失，所以生物多样性的保护工作迫在眉睫。为了更好地推动生物多样性的保护工作，必须进行持续的野外调查，以获取全面精准的生物多样性本底调查资料。但传统的走样线方法获取信息要耗费大量的人力，物力，时间成本巨大。因此，为了实现生物多样性保护战略目标，优化野外调查方法，设计最优抽样策略是极有必要的。 基于上述研究背景，中国科学院成都生物研究所生物多样性建模团队以优化野外生物多样性调查策略，降低调查成本，节约调查时间为
来源：中国科学院成都生物研究所
时间：2023-10-28
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中科院PNAS发文，使用定制基因组组装和编辑方法来改善羊草
我国各类天然草原草地约占国土面积的41%，是耕地面积的三倍。草种业被认为是国家战略性产业，也是确保草地生态与草牧业可持续发展的关键。随着国内经济水平的不断提高，我国对高质量蛋白质来源如肉、蛋、奶等的需求逐渐增加，对牧草的需求也相应增长。因此，研究和发展国内草地的乡土草种，对推动草种业的发展具有重要意义。 羊草，一种属于禾本科小麦族的优质牧草，被誉为“禾草之王”，也是我国重要的乡土草种和欧亚草原上的优势草种之一。羊草以发达的根状茎而著称，具备耐寒、耐旱、耐盐碱、防风固沙等特点。同时，羊草具有高营养价值和适口性而成为优质牧草，具有重要的生态价值和经济价值。然而，由于羊草基因组庞大且存在
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生命科学学院庞尔丽教授课题组在Briefings in Bioinformatics上发表无参可变剪切的预测方法
2023年10月13日，庞尔丽教授课题组在Briefings in Bioinformatics（五年影响因子10.6）发表题为“MkcDBGAS: a reference-free approach to identify comprehensive alternative splicing events in a transcriptome”的研究论文，提出了在无参考基因组的情况下，识别可变剪切的方法。 可变剪切（alternative splicing）
来源：北京师范大学生命科学学院
时间：2023-10-27
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开创性的新方法解锁大脑去甲肾上腺素系统
除了这些发现之外，同样重要的是，研究人员开发了一种开创性的方法，可以记录标准临床电极的实时化学活动，这种电极通常被植入用于癫痫监测。周一(10月23日)发表在《当代生物学》(Current Biology)网络版上的这项研究，不仅提供了对大脑化学的新见解，这可能对广泛的医疗状况产生影响，而且还强调了从活人大脑中获取数据的非凡新能力。“我们的团队正在描述第一个通过伏安法从有意识的人类中记录的‘快速’神经化学，”该研究的共同通讯人和高级作者Read Montague说，他是弗吉尼亚理工大学VTC Vernon Mountcastle研究教授，也是VTC人类神经科学研究中心和Fralin生物医学研究
来源：Current Biology
时间：2023-10-26
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Nature综述：利用基因组监测技术的新进展可以帮助发现致命的“超级细菌”
澳大利亚的一项新研究表明，利用基因组监测技术的新进展，可以帮助发现致命的“超级细菌”的兴起，减缓它们的进化和传播，从而改善全球健康状况。当细菌、病毒、真菌和寄生虫随着时间的推移发生变化，不再对我们用来杀死它们的药物和化学物质产生反应时，就会出现抗微生物药物耐药性。这些“超级细菌”使感染更难治疗，并增加了疾病传播、严重疾病和死亡的风险。如果不采取重大干预措施，到2050年，全球每年因抗微生物药物耐药性而死亡的人数估计将达到1000万，其中低收入和中等收入国家负担最重。发表在《自然评论遗传学》上的这项新研究题为《抗微生物药物耐药性的基因组监测——一个健康的视角》，强调需要采用多方面的“一个健康”方
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治疗转移和化疗耐药的突破性解决方案
转移性扩散和化疗耐药是癌症患者治疗失败和死亡的主要原因。上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)使癌细胞能够脱离邻近细胞并获得侵袭性。这种转变在转移发展和癌症治疗耐药性的出现中起着关键作用。到目前为止，还没有针对EMT的癌症治疗方法。EMT的突破性研究在著名的《Nature》杂志上发表的一项研究中，研究人员表明，Netrin-1是一种由不同类型癌症的肿瘤细胞表达的分子，可以刺激肿瘤细胞的上皮-间质转化(EMT)，一种靶向Netrin-1的药物可以阻断癌症的EMT。 &nb
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吃杏仁减肥?突破性新研究揭示了真相
南澳大利亚大学的一项研究表明，如果将杏仁纳入减肥饮食中，它可以帮助减肥，并提供潜在的长期心脏代谢优势。在减肥讨论中，坚果经常面临批评，因为尽管富含蛋白质，但坚果的脂肪含量很高，导致许多人为了减肥而不吃坚果。然而，南澳大利亚大学最近的研究表明，吃杏仁也可以减肥。在同类研究中规模最大的一项研究中，研究人员发现，在限制能量的饮食中加入杏仁不仅能帮助人们减肥，还能改善他们的心脏代谢健康。比较添加杏仁和不添加坚果的饮食研究人员检查了能量限制饮食加上加州杏仁或富含碳水化合物的零食的效果，发现这两种饮食都成功地减少了约7公斤的体重。在全球范围内，超过19亿成年人超重(6.5亿人患有肥胖症)。在澳大利亚，三分
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