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利用基因芯片检测尿液游离DNA样本是测定膀胱尿路上皮癌基因组复杂性的最佳方法
膀胱尿路上皮癌具有复杂多样的特征，其中一部分原因是基因组多样化所致。1,2Togneri等在《European Journal of Human Genetics》上发表的文章中称，尿液样本上清液中的游离DNA（cfDNA），与从制成颗粒的尿液细胞材料或传统肿瘤组织样本中获得的DNA相比，检测基因组肿瘤标记物的能力更强。3该研究结果对于扩展全基因组肿瘤分析在UBC中的应用，在无需进行有创活检的前提下，疾病监控和临床决定具有重要意义。所有样本均使用Affymetrix OncoScan FFPE芯片进行试验与数据分析，并通过OncoScan 3.01软件找到与临床相关的拷贝数变异（CNV）和杂合
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Nature：诺奖分子再获重要突破
生物通报道：G蛋白偶联受体（GPCR）是一个备受瞩目的蛋白大家族，这些蛋白位于细胞膜中，负责将激素和神经递质等外部信号传入细胞，触发一系列的生化反应。GPCR与人类健康密切相关，据统计约有30%的现代药物都以这类蛋白为靶标。正因为这类蛋白非常重要，GPCR的相关研究获得了2012年的诺贝尔化学奖。 虽然人们已经破解了许多GPCR的分子结构，但还不清楚它们是如何传递信号的。本期Nature杂志发表的一项研究阐明了GPCR与药物结合时发生的结构改变，以及这种结构改变将信号传递到细胞内的具体机制。 Basel大学的Stephan Grzesiek领导研究团队通过核磁共振（NMR）
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科学家通过多种方法探究长链非编码RNA
2013年，一群研究人员决定更加深入地挖掘一种名为H1的人类胚胎干细胞系，并且获得了一些惊喜。H1是最著名的干细胞系之一，但该团队还是成功发现了2000多个此前未被阐明的RNA片段。更重要的是，其中有146个为人类胚胎干细胞所独有，从而为研究多能性——变成体内任何细胞类型的能力——提供了诱人线索。然而，这些转录并未受到关注，因为它们含有往往会被序列分析器过滤掉的重复性编码片段。这是一个巨大的盲点。其他实验室曾发现了富含重复性编码并且在人类干细胞中非常重要的RNA存在的初步证据。在主要来自美国加州斯坦福大学的研究人员分析结果时，他们意识到，自己正好找到了此类RNA。团队成员Vittorio Se
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AGENA BIOSCIENCE 与达瑞生物合作
为中国分子诊断市场带来MASSARRAY核酸质谱技术
中国广州，2016年2月1日，达瑞生物（股票代码：832705）与美国Agena Bioscience 2月1日联合宣布，合作开发基于MassARRAY® 核酸质谱系统的癌症和遗传病体外诊断技术。 “中国市场对于Agena Bioscience来说是一个巨大的机会，中国Agena实现了我们在全球20%的业务份额。刚刚过去的2015年，我们在上海设立了分公司（基纳生物），并获得超过50%的强劲业务增长，”Agena的CEO，Pete Dansky先生说道，“为了继续我们的努力，我们寻求在临床诊断市场拥有丰富经验的战略合作伙伴。” Agena
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2015国家科技奖：陈洪俊-转基因产品检测技术
生物通报道：2015年度国家科学技术奖励大会8日在北京举行，此次国家科学技术奖共授予295项成果和7位外籍科技专家。其中国家自然科学奖42项，国家技术发明奖66项，国家科学技术进步奖187项，授予7名外籍科技专家国际科学技术合作奖。2015年的国家自然科学奖、技术发明奖、科技进步奖受理项目和评审通过项目总数也进一步减少，较2011年减少21%。进步奖减少近100项，减幅近35%。其中“国境转基因产品精准快速检测关键技术及应用”荣获国家技术发明奖二等奖，由中国检验检疫科学研究院，辽宁出入境检验检疫局检验检疫技术中心等处完成，主要完成人包括陈洪俊，黄新，曹际娟，俞晓平，林祥梅，高宏伟。项目介绍：我
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复旦大学发表蛋白质组学新技术
生物通报道 复旦大学现代色谱分离分析实验室的研究人员设计出一种基于芯片的二维液相色谱系统，可在质谱分析之前去除血浆样品中的高丰度蛋白。这项成果于近日发表在《Analytical Chemistry》上。对于血浆样品的质谱分析，一个重大挑战是高丰度蛋白往往占据了主要信号，而掩盖了人们感兴趣的低丰度蛋白的信号，比如疾病的生物标志物。考虑到这个问题，质谱流程通常需要处理血浆样品，在分析前去除丰度最高的蛋白。人们通常使用免疫亲和柱来处理血浆样品，这种方法利用抗体来选择高丰度蛋白，从而将其去除。然而，据文章作者介绍，低丰度蛋白往往与附着在较高丰度的蛋白上，因此在这一步中损失。另外，这种亲和柱只能去除一小
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人类干细胞培养又有新方法
生物通报道：人类多能干细胞（hPSCs）能够自我更新并转换成为体内其他任何类型的细胞，使其成为细胞移植疗法、药物开发、细胞分化和发育研究的一种很有前途的材料来源。然而，众所周知，干细胞是很难维持和培养。像所有的真核细胞一样，它们对养分的有效性、pH值、温度、氧气和二氧化碳的含量都很敏感，而且它们也易于分化，留给研究人员的细胞往往不同于他们打算在实验中使用的细胞。在国际干细胞领域, hESCs的培养方案已经初步规范化并且随着hESCs 的自我更新和分化调控机制上新发现的不断涌现, 细胞维持方案也在随之发展和改进。过去十年来，科学家们开发了各种各样的hPSC培养方法。2014年5月，巴西的一个研究
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Nature发布突破性双RNA测序技术
生物通报道 由来自德国、奥地利和美国的研究人员组成的一个研究小组发现，采用一种允许在感染过程中同时研究细菌与宿主小RNA的新技术，可以揭示出两者转录谱的改变。在发表于《自然》（Nature）杂志上的研究论文中，这一研究小组描绘了他们的技术，为什么这一技术对于更多地了解细菌感染机制非常有用，以及在研究中获得重要发现。Eunice Kennedy Shriver国家儿童健康与人类发育研究所的Matthias Machner和Gisela Storz，在同一期的Nature杂志上发表了一篇“新闻与观点”(News and Views)文章介绍这项研究工作。Machner和Stortz指出
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赛默飞发布大体积进样技术气质联用测定五氯苯酚解决方案
赛默飞世尔科技（以下简称：赛默飞）近日发布测定五氯苯酚的解决方案，通过使用Thermo Scientific™ TRACE™ 1310 气相色谱和Thermo Scientific™ ISQ™ 系列四极杆 GC-MS 系统，实现检测效率和精度的显著提升。五氯苯酚（PCP）是一种使用广泛，毒性很大，污染严重的化合物，作为一种防腐、防霉、防蛀剂使用于染料、纺织品、皮革等行业中。它会通过皮肤在人体内产生生物积蓄而危害人体健康，具有致畸致癌性。此外，五氯苯酚十分稳定，自然降解过程长，对环境有害。目前，国内颁布了GB/T 24166-2009 对染料中的五
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华人学者开发超快的精确DNA分析技术
生物通报道：Rice大学的科学家们开发了一种超快的精确DNA分析技术，可以大大加快分子诊断工具的设计，更好的识别病原体DNA和RNA。这一成果发表在本期Nature Communications杂志上，文章的通讯作者是Rice大学的助理教授张宇（David Yu Zhang）。张宇团队的这项技术将DNA和RNA的精确热力学分析，从几个月时间缩短到了几小时。人们可以在此基础上建立一个遗传学分子生物物理特性的通用数据库。研究特定DNA序列的行为一般需要加热和冷却分子，观察它们在不同温度下的荧光强度，这就是熔解曲线分析。研究人员随后根据熔解曲线推测DNA在其他温度下的属性。然而这样的方法是不准确的，
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Cell：创新技术捕捉细胞的DNA指纹
生物通报道 当细胞死亡时，它们不会消失得无影无踪，而会以游离DNA 的(cfDNA)形式留下它们的指纹。在人体内，可在血液中找到这些微小的DNA片段。近年来，对于cfDNA的研究促成了一种叫做“液体活检”的测试方法，通过简单的采血这种方法可以诊断及监测某些癌症，鉴别胎儿异常，及评估移植器官的健康。2015年，香港中文大学的卢煜明教授就报道称研发出了一种新的无创检测方法，可以通过全基因组甲基化测序绘制DNA组织图谱，从而利用血浆中游离的DNA来检测基因组突变的组织来源，这种液体活检的方法能减少诊断的创伤性，用于癌症诊断检测，无创产前诊断，以及移植后的监测（延伸阅读：专访卢
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埃博拉病毒研究中取得重大突破
埃博拉病毒是引起人和灵长类动物发病且致死率很高的生物安全四级（Biosafety Level 4）烈性病毒。据世界卫生组织统计，自1976年首次被发现至今，埃博拉病毒已经在非洲肆虐了近40年；2014年3月开始，一场以几内亚、利比里亚和塞拉利昂为中心的扎伊尔型埃博拉病毒疫情迅速在整个西非蔓延开来，共导致了28000多人感染，死亡人数接近11000人。 2016年1月15日，国际学术期刊Cell 在线发表中国科学院微生物研究所、中国疾病预防控制中心高福研究团队的文章Ebola Viral Glycoprotein Bound to Its Endosomal Receptor Niemann
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何志刚教授Cell发布再生治疗突破性成果
生物通报道 来自波士顿儿童医院的一项研究表明，有可能可以恢复因青光眼造成视神经受损的失明患者至少部分的视觉功能。在发布于1月14日《细胞》（Cell）杂志上的研究报告中，科学家们通过采用基因治疗让神经再生，及结合一个关键的步骤——添加一种通道阻断药物帮助神经将来自眼睛的神经脉冲传导大脑处，恢复了视神经损伤小鼠的视力。他们相信在未来仅采用药物就可以获得相同的疗效。论文的共同高级研究员、波士顿儿童医院神经学系及F.M. Kirby神经生物学中心的何志刚（Zhigang He）博士与Michela Fagiolini博士说，在这项研究中，从前失明的小鼠在接受这种治疗后能够跟随移动条的模式
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科学家找到预测白血病发展的新方法
科技日报多伦多1月11日电 （记者冯卫东）加拿大研究人员日前发现，健康血液干细胞向癌细胞转化具有清晰的、独立的步骤。该项发现是在血癌早期阶段进行识别和准确预测病情发展方面取得的重大进展。麦克马斯特大学干细胞和癌症研究所所长米克·巴蒂亚称，新研究已经确定了其中的两个步骤。在科学杂志《癌症细胞》上最新发表的论文描述了骨髓增生异常综合征（MDS）向急性髓细胞白血病（AML）转化的重要鉴别方法。研究发现，重要的GSK-3基因的一个变体被删除时，该基因的其他变体开始激活，但此时仍是非癌的。当该基因的第二个变体被删除时，AML癌症就会开始活动。巴蒂亚团队联合意大利研究人员，将这些初步研究结果应用于先前从M
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科学家开发新的人类基因组组装方法
生物通报道：最近，美国杨百翰大学的研究人员，开发出了一种新的人类基因组组装方法，并无意中发现了一种新的方法，可识别几种常见遗传病中难以捉摸的标记。延伸阅读：基因组组装可缩短至几分钟？。这种新方法依赖于研究人员开发的一种新算法，这种方法对于DNA序列中特定类型的变异，更为敏感。本文第一作者、计算机科学博士Paul Bodily指出：“这需要坚持不懈，结果并不是我原本打算调查的。我只是继续沿着一条路，不知道它将要去哪里，直到我发现有闪亮的东西出现。”每个人在其每个细胞中都有各自基因组的2个拷贝，每个拷贝都来自亲本一方。两个拷贝的序列是相同的，但有时也有一段序列被反转，称为倒位（inversion）
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Nature子刊：新方法让细胞重编程变得简单
生物通报道 瑞士洛桑联邦理工学院（EPFL）的科学家们开发出了一种新方法，通过“挤压”细胞可将它们转变为干细胞。这种方法为大规模生成医用干细胞铺平了道路。干细胞现在处于现代医学的前沿。它们可以转变为不同器官的细胞，为治疗从帕金森病到糖尿病等一系列的损伤和疾病提供了新途径。但以一种标准的方式生成正确的干细胞类型仍然是一个严峻的挑战。EPFL现在开发出了一种凝胶，通过简单地“挤压”正常细胞成形就可提高它们回复为干细胞的能力。尽管存在许多不同类型的干细胞，“诱导多能干细胞”（iPSCs）尤其引发医学兴趣。这些细胞是采用遗传方法重编程成熟的成体细胞而生成，它们的行为与干细胞相似（这就是它们
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Nature Methods：突破性单细胞表观基因组与转录组分析新技术
生物通报道 由英国及比利时的研究人员开发出的一种新方法，使得在单细胞中同时研究表观基因组及转录组成为可能。发布在《自然方法》（Nature Methods）上的实验方案，可帮助科学家们精确描绘出DNA甲基化改变与基因表达之间的关系。近年来单细胞测序技术发展迅速，被广泛用于研究细胞间的基因表达谱（转录组）差异。近期的一些单细胞实验方案也使得研究人员能够探索基因表达改变背后的驱动力——诸如DNA甲基化一类的DNA化学修饰。然而直到现在，都只能够分别研究单细胞转录组和表观基因组（延伸阅读：表观基因组和转录组数据分析新平台 ）。EMBL欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)的Oliver
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中国农科院6项成果获国家科学技术奖
科技日报讯 （记者瞿剑）1月8日在京举行的2015年度国家科学技术奖励大会上，以中国农科院及所属单位为第一完成单位的6项成果荣获国家科学技术奖励，其中国家技术发明奖二等奖2项，国家科技进步奖二等奖4项。油料作物研究所李培武研究员主持完成的“农产品黄曲霉毒素靶向抗体创制与高灵敏检测技术”，南京农业机械化研究所胡志超研究员主持完成的“花生收获机械化关键技术与装备”等2项分别荣获国家技术发明二等奖。作物科学研究所何中虎研究员主持完成的“CIMMYT小麦引进、研究与创新利用”、赵明研究员主持完成的“玉米冠层耕层优化高产技术体系研究与应用”、李少昆研究员主持完成的“玉米田间种植手册与挂图”（科普类）和农
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盘点国家科学技术奖 哪些高校生物类成果受热捧
生物通报道：2015年度国家科学技术奖励大会8日在北京举行，此次国家科学技术奖共授予295项成果和7位外籍科技专家。其中国家自然科学奖42项，国家技术发明奖66项，国家科学技术进步奖187项，授予7名外籍科技专家国际科学技术合作奖。其中备受瞩目的国家自然科学奖一等奖，颁给了中国科学技术大学潘建伟院士领衔的“多光子纠缠及干涉度量”项目。 不过今年的最高科技奖依然再次空缺，而且也有人提出，荣获2015年诺贝尔生理学或医学奖的屠呦呦，为何未能获评国家最高科技奖？ 据称其原因在于在2015年度国家最高科技奖评审过程中，没有个人或单位推荐屠呦呦。 此外，今年的国家自然科学奖、技术发明奖、科技进步奖受理项
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知名学者丁胜：细胞重编程技术重要进展
生物通报道：最近，美国Gladstone研究所和加州大学旧金山分校（UCSF）的科学家们，成功将人体皮肤细胞转化为功能健全的胰腺细胞。新的细胞可产生胰岛素响应葡萄糖水平的变化，并且，在移植到疾病小鼠模型体内之后，这些细胞可保护动物免于患上糖尿病。这项新的研究发表于《Nature Communications》，也代表了细胞重新编程技术上的重大进步，这将使得科学家们能够有效地扩大胰腺细胞的生产，以一种步进式的、可控的方式，制备上万亿个目标细胞。这一成就，为疾病建模和药物筛选打开了大门，让糖尿病患者距离个性化的细胞治疗更近了一步。延伸阅读：再生胰岛β细胞的新途径。本文共同资深作者、UCSF糖尿病中
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