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基于生物学和纳米技术的新mRNA靶向递送平台
以色列特拉维夫大学（TAU）探索了一种生物学方法来指导装载有编码蛋白质“游戏改变者”的纳米载体到特定细胞。这种开创性的方法在治疗无数恶性肿瘤、炎症性疾病和罕见的遗传性疾病方面可能有用。以色列特拉维夫大学生命科学学院分子细胞生物学研究所，精密纳米医学实验室主任Dan Peer教授领导这项研究，由TAU的研究生Nuphar Veiga和实验室同事Meir Goldsmith、Yasmin Granot、Daniel Rosenblum、Niels Dammes、Ranit Kedmi及SurivasRamishetti共同完成。该研究发表在Nature Communications杂志上。在过去的
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卢煜明教授开发出一种更经济的液体活检方法
循环肿瘤DNA（ctDNA）分析为癌症的检测和监控提供了一种非侵入性的方法，引发各界关注。通常，人们是从中寻找癌症相关的突变。不过，香港中文大学的研究人员另辟蹊径，通过一种新颖的方法来捕捉DNA片段中的肿瘤信号。在这项周一发表于《美国科学院院刊》（PNAS）的研究中，研究小组通过对肝细胞癌、肝移植和肝炎患者血浆样本的分析，表明DNA片段的末端坐标可以作为癌症的标志物，这有望提高液体活检的成本效益。这项研究由香港中文大学的卢煜明（Dennis Lo）教授领导。他是无创产前检测（NIPT）的奠基人，也是液体活检领域的先驱。他曾经与美国Grail公司合作，将与病毒相关的头颈癌检测商业化。在这项研究中
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北大学者最新Nature文章：
生物信息追踪新方法揭示结直肠癌T细胞动态变化
来自北京大学未来基因诊断高精尖创新中心（ICG）、生命科学学院BIOPIC、北大-清华生命科学联合中心的张泽民研究组与美国安进公司欧阳文军团队及北京大学人民医院申占龙课题组合作在国际顶级杂志Nature在线发表了题为“Lineage tracking reveals dynamic relationships of T cells in colorectal cancer”的研究论文。该研究开发了STARTRAC（Single T-cell Analysis by Rna-seq and Tcr TRACking）的生物信息学分析方法，利用该方法系统性地刻画了来自12个结直肠癌病人的大量T细胞
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生物分子直接相互作用新型检测方法
蛋白质是细胞构建模块。它们对细胞、身体组织和器官的结构、功能和动态调节是必不可少的。蛋白质很少单独作用，它们相互作用，形成蛋白质复合体或结合DNA和RNA来控制细胞的功能。这些复合物是细胞内许多重要反应的关键部分，如能量代谢或基因调控。相互作用中的任何变化，例如可能由突变引起，都会在健康和疾病之间产生差异。因此，为了理解细胞如何运作，或者病态细胞中可能出现什么问题，了解它们的结构模块（蛋白质）如何相互作用是至关重要的。索取Pierce Magnetic RNA-Protein Pull-Down Kit的最新资料，了解轻松富集蛋白和RNA相互作用的奥秘在过去的几十年里，新技术使科学家能够理解生
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中科院学者最新Cell文章：一种观测细胞内动态过程的新技术
中国科学院生物物理研究所，美国霍华德休斯医学研究所的研究人员发表了题为“Visualizing intracellular organelle and cytoskeletal interactions at nanoscale resolution on millisecond timescales”的文章，介绍了一种观测细胞内动态过程的新技术——掠入射-结构光照明超高分辨率显微成像技术（GI-SIM, Grazing Incidence Structured Illumination Microscopy），该技术克服了全内反射荧光成像（TIRF）的成像深度局限，实现了快速（266帧/秒）
来源：中科院生物成像中心
时间：2018-10-30
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诺奖后的新突破！阻断癌症免疫抑制新思路！
比利时Ghent大学、Flanders生物技术研究所和argenx生物技术公司等机构阐明了抑制免疫应答的一个细胞机器的三维机构，他们还设计了阻断该组件和其下游诱导的免疫机制的抗体，这种抗体能刺激癌症患者产生对肿瘤细胞的免疫力，从而触发免疫细胞攻击肿瘤，这项研究发表在Science杂志。通过级联相互作用的免疫抑制调节性T淋巴细胞（regulatory T lymphocytes，Tregs）是一种免疫抑制细胞，可以抵消过度免疫反应以防自身性免疫疾病。但是，在癌症患者体内，Tregs对肿瘤细胞免疫反应调节反而会起到有害的作用。Tregs通过产生一种名为TGF-β的蛋白信使发挥作用，该蛋白信号抑制免
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Cell利用新技术破解糖尿病药物二甲双胍作用机制之谜
生物通报道：加拿大和英国的研究人员发现了重要的II型糖尿病药物：二甲双胍的作用机制——二甲双胍有助于细胞更好地摄取和使用葡萄糖。更为重要的是，这项研究也可以解释二甲双胍在预防各种慢性疾病（包括癌症）方面的潜在作用。这一研究成果公布在10月26日的Cell杂志杂志上。二甲双胍是II型糖尿病治疗的一线药物，可以预防糖尿病引起的大血管和微血管病变，改善高胰岛素血症和胰岛素抵抗，被称为“笑到最后”的糖尿病药物，而且这种药物也在其它疾病中扮演重要的角色，比如许多研究发现，II型糖尿病患者的癌症发生风险显著增高，而二甲双胍可以降低糖尿病患者的肿瘤风险。在最新研究中，蒙特利尔大学的生物化学家利用一种新方法，
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Nature子刊：利用质谱技术揭示药物副作用
生物通报道：来自牛津大学的研究人员利用一种质谱技术发现了抗HIV药物如何影响核纤层蛋白A，这是第一次利用质谱法研究未知蛋白靶标的脱靶结合。这一研究成果公布在Nature Chemistry杂志上。文章的通讯作者、牛津大学教授Dame Carol Robinson指出：“这是第一次用质谱法解开这个问题。我们研究过其他的膜蛋白，但没有用这种方法来。”有时候，服用简单的止痛药会导致意想不到的副作用，如头晕或恶心。然而，对于那些进行长期药物治疗的人来说，这些副作用可能从感到不舒服，到情况很严重，各种影响都有。例如，治疗人类免疫缺陷病毒（HIV）的药物——如洛匹那韦、利托那韦和安普那韦，常常引起轻度头痛
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Nature子刊：一种灵敏的蛋白质测序方法
德克萨斯大学奥斯汀分校的研究人员近日开发出一种新技术来测序蛋白质，与现有的方法相比要灵敏得多。这种技术有望对生物医学研究产生重大影响，有助于人们发现新的生物标志物，协助癌症及其他疾病的诊断。这篇题为“Highly parallel single-molecule identification of proteins in zeptomole-scale mixtures”的文章于周一发表在《Nature Biotechnology》杂志上。文章的通讯作者之一、德克萨斯大学奥斯汀分校细胞和分子生物学研究所的Edward Marcotte教授表示：“我们创造了一种类似于DNA测序的方法来研究蛋白质
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Nature子刊利用关键成像技术发现肢体控制的奥秘
生物通包：生物学，医学和机器人学的主要目标之一是了解肢体如何通过共同作用的神经元回路来控制的，从而了解有意义的肢体活动的整体机制。但问题在于，针对脊椎动物或无脊椎动物的行为过程，几乎不可能完全了解控制肢体的运动和前运动电路的活动。来自EPFL脑心研究所和生物工程研究所的Pavan Ramdya实验室的科学家开发了一种记录肢体控制神经回路活动的新方法。这一研究成果公布在Nature Communications杂志上，利用果蝇Drosophila melanogaster模式生物，采用双光子显微镜这种高级成像技术，观察荧光标记过的神经元的激发。这项研究聚焦于果蝇的腹神经索，这是控制腿，颈，翅膀和
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Cell：RNA结构探测技术
生物通报道：将化学探针与高通量测序相结合，就形成了一种灵活的方法可以揭示与细胞功能相关的RNA结构的作用机制。科学家们采用各种化学探针，这些每种化学探针都能报告RNA分子的不同特征，通过通用的工具包就可以研究体内和体外RNA结构以及与其他分子的相互作用了。Cell杂志“RNA Structure Probing Technologies”介绍了相关的研究成果。超灵敏RNA二级结构预测工具RNA与DNA指挥生命体生产所需蛋白，DNA包含遗传信息，RNA将信息的编码指令传递给细胞内的蛋白质制造点。DNA主要是完全碱基配对的双螺旋结构，相对DNA二级结构，RNA序列形成的结构更复杂。RNA互补碱基对
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基于癌症基因组学的非组织特异标签的药物重定位新方法
中国科学院上海生命科学研究院（营养与健康研究院）计算生物学研究所韩敬东研究组的论文“Accurate Drug Reposition through Non-Tissue Specific Core Signatures from Cancer Transcriptomes”。该研究通过从多组织的癌症基因组学数据构建非组织特异性的基因突变的核心标签，并与药物基因组学数据整合，构建了药物-基因靶定模式和药物特异性的评估方法，为靶点预测及药物重定位研究提供了新视角。这一研究成果公布在10月9日Cell Reports。由韩敬东研究组徐迟和艾道盛完成。针对药物重定位的大规模实验筛选常常被局限在基于体
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中国学者Nature Biotechnology发表蛋白质组学分析新技术
来自中科院计算技术研究所的研究人员发表了题为“Comprehensive identification of peptides in tandem mass spectra using an efficient open search engine”的文章，公布了新一代开放式搜索算法Open-pFind，可提高质谱数据解析的数量与质量，有望成为蛋白质组学日常数据分析的主力工具。这一研究成果公布在10月9日的Nature Biotechnology杂志上，文章的通讯作者为计算技术研究所贺思敏研究员，和迟浩博士（同为第一作者）。质谱数据的低解析率直接影响着肽段和蛋白质鉴定数目和鉴定精度的提高。质谱
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PNAS：短时间观测数据的未来预测理论和方法
中国科学院生物化学与细胞生物学研究所，苏州大学，东京大学和复旦大学的研究人员发表了题为“Randomly Distributed Embedding Making Short-term High-dimensional Data Predictable（高维短序列数据预测的随机嵌入分布方法）”的文章，提出了基于非线性动力学的全新随机嵌入理论和方法（随机嵌入分布方法RDE: Randomly Distributed Embedding），通过低维嵌入映射获得目标变量预测值的分布，最终使得高维短序列时间序列数据的预测成为可能。即建立了由短时间观测的高维数据，预测目标变量动态行为的全新理论和方法。这
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国家高新技术企业——北京全式金生物技术有限公司诚聘研发工程师
北京全式金生物技术(TransGen Biotech)有限公司成立于2006年3月21日，是一家专业从事分子生物学、细胞生物学产品的研发、生产、销售，提供实验技术服务的国家高新技术企业。公司总部坐落在首都北京高科技产业研发基地——中关村东升国际科学园。公司面积近10000平方米，建有GMP生产车间，基因扩增检测实验室。公司拥有全球领先的技术资源和经验丰富的管理团队，秉承“品质高于一切，精品服务科研”的理念，坚持以技术创新为先导，以产品质量为保障，以客户价值为根本，在激烈的市场竞争中快速发展，销售网络遍布国内外。 公司已通过国家ISO9000认证，产品被广泛地应用于医疗
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生命科学产业的领导者——普洛麦格公司诚聘技术服务科学家
Promega公司是为生命科学产业提供创新型解决方案和技术支持的领导者。公司拥有2,000多种产品，致力于提高全球范围内的科学家对基因组学、蛋白质组学、细胞分析、分子诊断和遗传鉴定等领域的认知。公司成立于1978年，总部设在美国威斯康星州麦迪逊市，在15个国家设有分公司，在全球范围内还有50多个经销商。【热招职位】Technical Services Scientist（技术服务科学家）JOB TITLE: Technical Services ScientistJOB OBJECTIVE: Provide technical support to regional distrib
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单细胞转录组，基因组，表观基因组，蛋白质组如何分析？（九种新技术汇总）
多种新技术深入分析单个细胞中的DNA，RNA和蛋白质信息在过去的十年间，分子生物学领域的一部分重要进展来自于单个细胞内全基因组和全转录组测序研究。随着细胞分离和新一代测序的进步，研究人员不再需要分析来自群体中多个细胞的平均信号，而是可以逐个细胞地研究DNA，RNA，蛋白质和染色质。单细胞基因组学，表观基因组学，转录组学和蛋白质组学研究揭示出了即使是在同一组织中遗传相同的细胞之间，基因和蛋白质表达依然存在差异。但是来自美国Parker癌症免疫疗法研究所的生物学家Pier Federico Gherardini指出，目前大多数此类研究只检查了每个细胞的单层信息，这可能会产生偏差。“你不能只测量RN
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中外学者报道六种分析表观基因组、转录组和蛋白质组的新技术
生物通报道：现阶段，科学家们已经开始以单细胞分辨率组合多层信息。这些“多组学”技术可以更仔细地观察细胞之间的可变性，更清楚地识别特定细胞及其功能。分析基因组DNA揭示了单细胞基因组，甲基化组织或染色质，而分析RNA和蛋白质则能分别产生转录组和蛋白质组数据。前篇：生命科学新热点研究：单细胞中整合多个组学表观基因组和转录组分析细胞表观基因组和转录组的技术可以揭示甲基化和染色质可接近性（chromatin accessibility，生物通注）对基因表达的调控作用。“在肿瘤发生等复杂的生物过程中，异质性同时存在于基因组，表观基因组和转录组中，单独分析它们可能不起作用，”北京大学分子生物学家汤富酬教授
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如何选择技术方法来进行单细胞多组学研究
生物通报道：现阶段，科学家们已经开始以单细胞分辨率组合多层信息。这些“多组学”技术可以更仔细地观察细胞之间的可变性，更清楚地识别特定细胞及其功能。分析基因组DNA揭示了单细胞基因组，甲基化组织或染色质，而分析RNA和蛋白质则能分别产生转录组和蛋白质组数据。前篇：生命科学新热点研究：单细胞中整合多个组学六种分析表观基因组、转录组和蛋白质组的新技术 如何做出选择有了这么多种的检测方法可供选择，研究人员还需要根据他们提出的生物学问题，特定技术的成本，劳动密集程度和技术要求来决定使用哪些检测方法。“通常这需
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芯片上器官技术发现了治疗ALS的新型候选药物
通过一种芯片上肌肉的技术对肌萎缩性侧索硬化症（ALS，又称卢伽雷氏症）所进行的调查发现，一种新的药物组合或能成为这种进行性神经退行性疾病的有效治疗方法。这些发现凸显了芯片上的组织器官技术是有希望的测试候选药物及研究ALS发病机制（仍然基本未知）的平台；在这种技术中，微流控细胞培养可模仿活体中的情况。目前，美国大约有1.2万至1.5万人受到该病影响。ALS涉及脊髓和运动皮层中运动神经元的丧失，这会导致进行性麻痹、肌肉萎缩和死亡。尽管约10%的ALS患者具有家族性ALS（其发病通常可被追溯到某个基因突变），但90%的患者属“散发性ALS”，后者没有家族关联性或原因。由于得到FDA批准的治疗ALS的
来源：EurekAlert中文
时间：2018-10-12
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