• 生物物理所团队开发出纳米级三维各向同性超分辨显微镜

  　　12月2日，生物物理所徐涛院士课题组与纪伟课题组在《Nature Methods》上发表题为"Molecular-scale Isotropic 3D Super-Resolution Microscopy via Interference Localization"的研究论文，团队研制出三维干涉定位显微镜（ROSE-3D），首次在单分子定位成像领域，实现了基于相机的纳米尺度三维各向同性分辨率。　　这是该团队在发展的干涉定位显微镜ROSE（Nature Methods 2019）和ROSE-Z（Nature Methods 2021）基础上，在干涉定位显微

  来源：中国科学院生物物理研究所

  时间：2025-12-04

• 整合精准注释提升无义介导mRNA降解规则：基于1086例多组学数据的系统评估

  在人类遗传疾病研究中，由无义变异、移码InDels和剪接异常产生的提前终止密码子（PTCs）可能导致截短蛋白的产生，通过功能丧失、显性负效应或获得性功能效应引发疾病。无义介导的mRNA降解（NMD）作为真核生物保守的mRNA监视系统，能识别并降解含PTCs的转录本，但部分PTCs却能逃逸NMD降解。这种逃逸现象在疾病相关基因中尤为关键——仅逃逸降解的无义变异才引发疾病，而触发NMD的变异反而可能通过抑制截短蛋白加重表型。因此，准确判断PTCs是否触发NMD成为理解变异致病性的核心难题。现有研究提出了PTC位置依赖的NMD逃逸规则：若PTC位于最后一个外显子或距最后一个外显子-外显子连接处407

  来源：Nucleic Acids Research

  时间：2025-12-03

• 靶向TET3通过破坏Otx2超级增强子低甲基化抑制第3组髓母细胞瘤干性及进展

  在儿童脑肿瘤中，髓母细胞瘤(Medulloblastoma, MB)约占25%，其中第3组髓母细胞瘤(Group 3 Medulloblastoma, G3-MB)因具有强干性和治疗抵抗性，患者5年生存率不足50%，成为临床治疗的重大挑战。当前手术联合放化疗的治疗方案往往导致患儿神经系统不可逆损伤，而针对WNT和SHH亚组的靶向疗法对G3-MB效果有限，这主要源于该亚组缺乏明确的驱动突变，其发病机制主要与表观遗传调控异常相关。近年来研究发现，超级增强子(Super-Enhancer, SE)的异常活化在维持肿瘤细胞干性中发挥关键作用。Orthodenticle homeobox 2 (OTX2

  来源：Cell Reports Medicine

  时间：2025-12-03

• 逆转录子-Eco7抗噬菌体防御系统的结构机制：从tRNATyr切割到流产感染

  在微生物与病毒永无休止的军备竞赛中，细菌演化出了丰富多彩的防御武器库来对抗噬菌体的入侵。其中，逆转录子（Retron）作为一种独特的遗传元件，近年来被发现在抗噬菌体防御中扮演着关键角色。逆转录子通常由非编码RNA（ncRNA）、逆转录酶（RT）和多样的效应蛋白组成，能够通过产生一种特殊的RNA-DNA杂交体——多拷贝单链DNA（msDNA）来执行防御功能。然而，不同类型的逆转录子系统如何被激活、如何识别噬菌体感染、以及通过何种分子机制实现防御，仍是领域内亟待解决的核心科学问题。在大肠杆菌中发现的Retron-Eco7系统（曾被称为Retron-Ec78）就是一个典型的例子。该系统包含RT、14

  来源：Nature Communications

  时间：2025-12-03

• 人源多能干细胞衍生的皮肤类器官构建结核分枝杆菌感染病理模型揭示PI3K-AKT-AP1通路驱动皮肤纤维化新机制

  结核病（Tuberculosis, TB）是由结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis, Mtb）引起的一种古老传染病，至今仍在许多发展中国家流行。除常见的肺结核外，肺外结核占比可达8%-24%，其中皮肤结核（Cutaneous Tuberculosis, CTB）约占1.5%-3%。CTB病变常伴随肉芽肿形成和细胞外基质（Extracellular Matrix, ECM）重塑导致的纤维化，但因其症状隐匿、诊断延迟，且缺乏能够模拟人类皮肤复杂结构的体外模型，其病理机制研究进展缓慢。尤其成纤维细胞在纤维化过程中的具体作用尚不明确。为解决这一难题，军事医学科学院等单位的

  来源：Nature Communications

  时间：2025-12-03

• 裂殖酵母中PCNA与Rad52的多聚SUMO化修饰限制着丝粒重组的新机制

  在真核细胞中，基因组每时每刻都面临着内源性和外源性因素的威胁。即使在正常生长条件下，DNA复制过程也极易因复制叉停滞而产生突变，这种现象被称为复制应激（Replication Stress, RS）。复制叉停滞可能导致单链DNA（ssDNA）缺口甚至双链断裂（DSB）的形成，进而引发基因组不稳定——这正是肿瘤发生的早期关键驱动因素之一。为了应对这一挑战，细胞进化出了复杂的复制应激响应（RSR）机制，其中同源重组（HR）是确保DNA复制准确完成的重要途径。然而，如何在难以复制的基因组区域（如着丝粒）精确调控修复通路的选择，仍是领域内未解的核心问题。SUMO（Small Ubiquitin-lik

  来源：Nature Communications

  时间：2025-12-03

• 不完全射频消融后残留肿瘤细胞通过诱导CD177hiPAD4hi中性粒细胞促进肺癌转移

  对于确诊结直肠癌的患者来说，最令人担忧的莫过于发生肝转移。当癌细胞扩散到肝脏，治疗选择往往变得有限。射频消融（RFA）作为一种微创局部治疗技术，通过高频电流产生热量“烧死”肿瘤，已成为不适合手术的结直肠癌肝转移（CRLM）患者的重要希望。然而，临床上一个棘手的现象是，高达60-80%的患者在接受RFA治疗后5年内会出现复发，尤其是发生远处肺转移，严重影响了患者的长期生存。这背后的原因究竟是什么？是治疗时癌细胞“逃逸”了，还是“烧”得不彻底留下了隐患？这些残留的肿瘤细胞又是如何获得更强的转移能力？这些问题一直困扰着临床医生和研究人员。近日，发表在《Nature Communications》上的

  来源：Nature Communications

  时间：2025-12-03

• 噬菌体编码DNA结合蛋白ORF55激活细菌逆转录酶DRT4抗病毒防御机制的结构与功能研究

  在地球上无处不在的噬菌体，是细菌面临的最主要捕食者。在这场持续了数十亿年的军备竞赛中，细菌演化出了纷繁复杂的防御系统来抵抗病毒的入侵。其中，逆转录酶（Reverse Transcriptase, RT）——这种我们更熟悉其在真核生物逆转录病毒中作用的酶，在原核生物中也扮演着重要的防御角色。防御相关逆转录酶（Defense-associated Reverse Transcriptase, DRT）系统就是一类新发现的、由逆转录酶介导的抗噬菌体系统，但其具体的工作机制，尤其是它们如何被噬菌体感染激活并最终保护细菌群体，在很大程度上仍是一个谜团。此前的研究已将DRT系统分为多个类型（DRT1-DR

  来源：Nature Communications

  时间：2025-12-03

• 阿美替尼联合安罗替尼一线治疗EGFR突变伴脑转移NSCLC：颅内PFS突破30个月的单臂II期研究

  肺癌是全球死亡率最高的恶性肿瘤，其中约40%–50%的非小细胞肺癌（NSCLC）患者在疾病进程中会发生脑转移（BMs），而EGFR敏感突变人群颅内进展风险更高。传统全脑放疗或立体定向放疗虽可局部控制，但认知损伤及生活质量下降令医患两难；第一、二代EGFR-TKI血脑屏障穿透有限，颅内客观缓解率（iORR）不足50%，中位颅内无进展生存期（iPFS）仅10–13个月。第三代EGFR-TKI奥希替尼（osimertinib）将iPFS延长至15.2–20.8个月，却终究面临获得性耐药。抗血管生成药物可通过正常化肿瘤血管、增强药物递送、改善免疫微环境，理论上与EGFR-TKI协同延缓耐药，然而第三代

  来源：npj Precision Oncology

  时间：2025-12-03

• USP25通过去TAB2泛素化改善头颈鳞癌免疫抑制微环境的机制与意义

  头颈癌是全球第六大常见癌症，其中头颈鳞状细胞癌（HNSCC）占90%以上。多数患者确诊时已属晚期，生存率低且易发生转移。近年来，免疫检查点阻断（ICB）疗法为晚期HNSCC患者带来了希望，但仅有少数患者对其产生应答，这种治疗抵抗很大程度上归因于免疫抑制性肿瘤微环境（TIME）的存在。TIME是一个由肿瘤细胞与免疫细胞相互作用形成的复杂生态系统，其中髓系来源抑制细胞（MDSC）等抑制性细胞通过阻碍T细胞功能促进免疫逃逸。因此，阐明HNSCC免疫逃避的分子机制，寻找改善TIME、增强免疫治疗应答的策略至关重要。蛋白质泛素化是一种重要的翻译后修饰，而这一过程可被去泛素化酶（DUBs）逆转。泛素特异性

  来源：Cell Death Discovery

  时间：2025-12-03

• 视网膜退行性病变中细胞应激反应的比较转录组学分析：揭示不同细胞死亡途径的相对贡献

  当我们谈论失明的主要原因时，视网膜退行性病变是一组不容忽视的进行性疾病。这类疾病包括年龄相关性黄斑变性(AMD)、糖尿病视网膜病变(DR)、青光眼以及遗传性视网膜营养不良(IRDs)，影响着全球数百万人的视力健康。尽管临床表现各异，这些疾病的共同终点都是光感受器细胞和视网膜色素上皮(RPE)的功能障碍和死亡，而这一过程由多种应激诱导的细胞死亡机制驱动。虽然已有研究报道了多种细胞死亡途径参与视网膜退化过程，但科学界对每种途径的相对贡献仍知之甚少。传统的观点认为凋亡(apoptosis)是主要的细胞死亡机制，然而 caspase 抑制剂的疗效有限提示非凋亡性细胞死亡机制可能发挥着关键作用。这些机制

  来源：Cell Death & Disease

  时间：2025-12-03

• AGR2通过p53/FPN1调控轴抑制铁死亡并驱动胰腺癌治疗新策略

  胰腺导管腺癌(PDAC)是恶性程度最高的肿瘤之一，五年生存率不足10%，其治疗抵抗性强、预后极差，亟待探索新的治疗靶点。铁死亡(Ferroptosis)作为一种铁依赖性的程序性细胞死亡方式，在诱导耐药肿瘤细胞死亡方面展现出巨大潜力。然而，胰腺癌如何调控铁死亡敏感性，以及致癌因子如何参与这一过程，仍是未解之谜。前梯度蛋白2(AGR2)作为一种蛋白二硫键异构酶，在胰腺癌中高表达，与肿瘤转移、化疗抵抗密切相关。有趣的是，研究人员发现，当用铁死亡诱导剂Erastin或RSL3处理胰腺癌细胞时，AGR2的表达显著上调，且这一现象可被铁死亡特异性抑制剂Liproxstatin-1(Lip-1)和Ferro

  来源：Cell Death & Disease

  时间：2025-12-03

• Ca2+-NFATc1-Fis1信号轴通过调控线粒体动力学介导辐射性骨损伤中间充质干细胞成骨障碍

  头颈部癌症患者在接受放射治疗后，常常面临一个棘手的并发症——放射性骨坏死（osteoradionecosis）。这种病症表现为骨组织血供障碍、坏死和修复困难，严重影响患者的生活质量。当前的治疗手段，如手术、抗生素或高压氧治疗，效果往往不尽如人意。究其根本，辐射在杀死癌细胞的同时，也对正常的骨组织微环境造成了严重破坏。其中，作为骨形成关键细胞的间充质干细胞（Mesenchymal Stem Cells, MSCs）的功能受损被认为是导致骨修复障碍的核心环节。虽然辐射的破坏作用通常归因于DNA损伤和氧化应激，但作为细胞能量工厂的线粒体在其中扮演的角色日益受到关注。在MSCs向成骨细胞分化的过程中，

  来源：Cell Death & Disease

  时间：2025-12-03

• Slirp2通过调控线粒体蛋白翻译影响果蝇卵子发生的新机制

  在细胞这个微小的宇宙中，线粒体作为"能量工厂"扮演着至关重要的角色。它们通过氧化磷酸化(OXPHOS)过程为细胞提供能量货币ATP。尽管线粒体拥有自己的基因组，但其功能实现需要与核编码蛋白的精密协作。当这种协作出现问题时，就会引发一系列线粒体疾病。在果蝇这种模式生物中，研究人员发现线粒体功能与生殖系统发育和配子发生密切相关，特别是卵子发生过程对能量需求极高。近期发表在《Journal of Molecular Cell Biology》的研究聚焦于一个名为Slirp2的线粒体蛋白。该蛋白属于干细胞环相互作用RNA结合蛋白家族，在哺乳动物中已知与严重线粒体疾病相关。然而，Slirp2在体内的具体

  来源：Journal of Molecular Cell Biology

  时间：2025-12-03

• 甲烷生物转化：迈向低碳生物经济的新策略

  随着全球温室效应日益加剧，甲烷（CH4）作为温室效应潜力为CO284倍的强效温室气体，其排放控制已成为应对气候变化的焦点。尽管化学法可将CH4转化为高值化学品，但存在高能耗、高成本及二次污染等问题。相比之下，甲烷氧化菌（Methanotrophs）能够以CH4为唯一碳源和能源，通过生物转化途径合成单细胞蛋白（SCP）、生物塑料、有机酸等高值产物，兼具环境与经济效益。然而，CH4溶解度低、代谢网络复杂、遗传工具匮乏等问题严重限制了其产业化进程。为此，研究人员系统综述了甲烷生物转化领域的最新进展，相关成果发表于《National Science Review》。研究通过整合合成生物学、代谢工程与系

  来源：National Science Review

  时间：2025-12-03

• 结构化学引导揭示碲四碘化物优异热绝缘性能：晶格周期性调控与声子工程新策略

  在能源转换、节能建筑和航空航天等领域，高效热管理材料的发展始终面临重大挑战。热导率（thermal conductivity）作为核心评价指标，其有效调控已成为材料科学研究的焦点。对于固态热绝缘体而言，电子对热传导的贡献通常需要被抑制，因此声子（phonon）输运的调控成为实现优异热绝缘性能的关键。当前研究面临的核心难题在于：如何通过合理的材料设计策略，在简单化学组成的体系中实现极低的热导率？传统观点认为复杂化学组成或重原子质量是获得低热导率的必要条件，但《National Science Review》最新发表的研究打破了这一认知局限。该工作从结构化学（structural chemistr

  来源：National Science Review

  时间：2025-12-03

• 内向整流钾通道KCNJ12通过Wnt/β-catenin通路调控肝癌细胞干性机制研究

  肝癌作为全球第六大常见恶性肿瘤，在中国呈现出独特的流行病学特征——占全球肝癌负担的45%-55%，每年新增病例达36.77万例。与西方国家主要病因不同，中国肝癌患者主要受乙型肝炎病毒（HBV）感染和膳食黄曲霉毒素暴露的影响，这种病因学差异导致了分子层面的异质性。尽管近年来治疗手段不断进步，但肝癌的高复发率、转移潜能和化疗耐药性仍是临床治疗的主要挑战，其中肿瘤干细胞（Cancer Stem Cells）的干性（stemness）维持被认为是导致治疗抵抗的关键因素。在这一背景下，由国家肝癌科学中心和东方肝胆外科医院王红阳院士团队主导的中国肝癌基因组图谱（CLCA）研究取得了突破性进展。该研究通过对

  来源：Journal of Molecular Cell Biology

  时间：2025-12-03

• 计算建模揭示啮齿类抑郁测试中的认知过程：从行为轨迹到强化学习机制

  在神经精神疾病研究领域，小鼠行为测试一直是探索疾病机制和药物疗效的重要工具。其中，强迫游泳测试(FST)和悬尾测试(TST)作为评估抑郁样行为的经典范式，已被广泛应用二十余年。然而，传统分析方法通常只关注测试最后几分钟的不动时间，将复杂的6分钟行为序列简化为单一指标，这种简化可能掩盖了丰富的时间动态信息，阻碍了对行为背后认知机制的深入理解。更为关键的是，尽管FST和TST常被用作相互验证的工具，但研究者对这两种测试是否真正测量相同的认知过程缺乏系统认识。行为适应假说认为，不动时间的逐渐增加反映了适应性学习过程，但这一假说缺乏充分的实证支持。同时，商业行为分析软件成本高昂，而开源姿势估计工具需要

  来源：Cell Reports Methods

  时间：2025-12-03

• 化学底物启用的压电代谢重编程疗法破解糖尿病伤口"恶性三重奏"

  糖尿病伤口愈合是一个全球性的医疗挑战，其高复发率和截肢率给患者和社会带来了沉重负担。与普通伤口不同，糖尿病伤口存在着独特的"恶性三重奏"——持续感染、失控炎症和免疫功能障碍相互交织，形成难以打破的恶性循环。在这种复杂病理环境中，生物膜形成物理屏障阻碍抗生素渗透，高糖微环境导致巨噬细胞功能失调，胞葬作用能力严重受损，使得凋亡细胞碎片堆积，进一步加剧炎症反应。传统治疗方法如清创术、血管成形术和抗菌疗法往往只能针对单一病理环节，难以同时解决感染、炎症和免疫失调的多维难题。近年来，压电疗法作为一种非侵入性治疗策略展现出巨大潜力，它利用压电材料在机械刺激下产生电场或催化活性，既能产生抗菌活性氧，又能调节

  来源：Cell Biomaterials

  时间：2025-12-03

• 中国西部多病原体呼吸道同步流行模式与预测模型：后疫情时代的流行病学转变与防控启示

  当全球逐渐从COVID-19大流行的阴影中走出，一个意想不到的公共卫生挑战悄然浮现——长期非药物干预措施（如口罩佩戴、社交距离等）在抑制SARS-CoV-2传播的同时，也彻底改变了其他呼吸道病原体的流行规律。中国西部作为人口密集且地理环境多样的区域，其病原体循环模式在防控政策调整后如何演变，成为亟待解答的科学问题。为此，刘玉松、黄毅等研究团队在《iScience》上发表了题为“中国西部多病原体呼吸道监测：同步循环模式与预测建模”的研究，通过对四川大学华西医院5年间5万余份临床标本的系统分析，揭示了后疫情时代呼吸道病原体“同步反弹”的独特现象。关键技术方法研究团队采用多重PCR技术对14种呼吸道

  来源：iScience

  时间：2025-12-03

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