新产品巡礼——PlasmidSelect  
 
 

层析柱: Source 30Q XK16/20 CV=24ml
缓冲液: 平衡及上样缓冲液0.4 M Nacl; 10 mMEDTA;
100 mMTriscl pH 7.0
洗脱缓冲液: 1.0 M Nacl; 10 mMEDTA;100 mMTriscl pH 7.0
上样: PlasimdSelect纯化的质粒,加入4倍体积的水稀释

上样后,以平衡缓冲液洗脱未结合DNA,以B液梯度洗脱,见图3。

 
图3. SOURCE 30Q精纯及浓缩超螺旋DNA

以上试验为10升发酵液 —— 菌体300克—最终纯化10毫克的超螺旋质粒DNA (6.1kb) (此试验在非GMP条件下进行)。

纯化的结果如下,见表2。

 

 
PlasmidSelect纯化质粒的问与答:

1. 问: 第一步Sepharose 6FF纯化过程中硫酸铵的浓度与不同来源的质粒有关吗?
答: 硫酸铵的浓度与质粒的来源及质粒的大小无关,试
验已经证明只有在1.5 M的浓度以上质粒DNA才能与RNA完全分离。如浓度低于1.5 M,质粒RNA会有残留。如浓度很低,质粒DNA根本不能与RNA分离。

2. 问: PlasmidSelect纯化超螺旋质粒DNA的原理?
答: PlasmidSelect是以琼脂糖Sepharose 6FF为基架与2硫吡啶共价结合,PlasmidSelect特异与超螺旋DNA,而不与开环DNA和RNA结合。其原理还在研究。超螺旋DNA与PlasmidSelect的特异结合是在2 M硫酸铵pH 7.0的条件下。如果硫酸铵的浓度较低,开环的DNA就会与PlasmidSelect结合,从而降低超螺旋DNA的纯度。

3. 问: 第一步离子交换层析的目的?
答: 离子交换的目的是浓缩、去除内毒素及精细纯化,如果要求质粒的纯度不是很高,此步骤可以省略。离子交换时可以选择线性洗脱,也可以选择阶段洗脱。

4. 问: PlasmidSelect凝胶可以使用多少次?
答: PlasmidSelect是一种琼脂糖凝胶,他与其它新一代Bioprocess凝胶一样,只要做好样品前处理,层析后
及时在位清洗,凝胶的寿命可以是很长的。一般使用几十次甚至几百次都是没有问题的。

表2. 10升发酵液纯化结果
超螺旋DNA
ccc
开环DNA
ccc
质粒
ug/ml
染色体
DNA
ug/mg
RNA
ug/mg
蛋白
ug/mg
内毒素
EU/mg
裂解上清
54
46
64
150
203
60000
150000
6FF
质粒-峰
71
29
52
6
<100
1077
4800
6FF
RNA-峰
-
-
3
126
35000
530000
65000
PS
穿过峰
-
100
1
8
<500
8000
46000
PS
洗脱峰
96
4
128
6
4
109
470
SOURCE 30Q
洗脱峰
97
3
326
2
0.25
3
9
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