甲基化检测服务
 

      甲基化指在DNA甲基转移酶(DNMTs)的作用下将甲基添加在DNA分子中的碱基上,从而影响基因表达的一种常见表观遗传现象。

1、高通量——Illumina甲基化芯片
      流程简单,无需进行烦琐的免疫共沉淀,直接检测到发生甲基化的准确位点,而不像其它芯片那样仅检测到发生甲基化的区段。通量高,可一次性检测12份样品,每个样品最多可检测450,000个位点。

2、中通量——高分辨率熔解法(HRM)检测DNA甲基化
      HRM是一种最新的遗传学分析手段,具有很高的特异性、稳定性和重复性。

HRM目前的热点应用集中在

  • 对未知新突变的扫描、筛查疾病相关突变/SNP扫描、等位基因频率分析;
  • 动植物、微生物等物种及品种鉴定;
  • DNA指纹、DNA甲基化分析和研究;
  • 器官移植的HLA配型;
  • 法医学鉴定、亲子鉴定。

实验流程


3、低通量——BSP

      针对某一段感兴趣基因上可能的甲基化位点,或还不确切知道其位点的实验,在电泳之后对条带进行克隆测序,从而得到想要的部分片段的测序结果,通过软件分析可以知道该片段甲基化发生的确切位点,测序克隆也可以计算其发生甲基化的频率。

4、技术特点

 

Illumina

HRM

BSP

样品

新鲜组织、血液、细胞,石蜡样本等生物材料

DNA用量

500ng甲基化后的DNA

2ug未甲基化的DNA

2ug未甲基化的DNA

通量

1-12个样品/slide;每个样品可检测27k和450k个位点

1-96-384个样品;每个样品可检测几个位点

低通量,位点数少,是甲基化的金标准。

数据处理

探针注释、相关性分析、热图、与基因表达谱联合分析以及染色体搜索

特异熔解曲线

测序报告

 


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