普洛麦格中文通讯 2002年第五期
 
 

采用T-载体系统克隆PCR产物时,为什么 筛选时只得到蓝斑?
  对于T-载体克隆出现的问题,故障排除的第一步 是采用阳性对照检验。所有Promega公司T载体系统都提供一个插入DNA阳性对照,用来检测连接效率。当使用转化效率1×108cfu/μg DNA的感受态细胞时,大概产生100个克隆,其中10-30%为蓝斑,至少60%为白斑(重组子)。如果阳性对照不能产生预期结果,应检查以下几个项目。

●感受态细胞效率?确保你的感受态细胞效率至少为 1×10 8cfu/μg DNA。将感受态细胞转化0.1-1.0ng环状质粒DNA,在适当抗生素培养基上过夜培养, 计算克隆菌数目,以此测定感受态细胞效率。注意要用几个稀释度的转化细胞涂板(1:10,1:100),以确保克隆菌数目易于计算。Promega公司高转化效率JM109感受态细胞(产品目录号:L2001)是很多T-载 体克隆的理想选择。

●2×快速连接缓冲液或T4连接酶10×缓冲液是否可 以冻融多次?因为这些连接缓冲液含ATP,冻融多 次易引起降解,所以一般将连接缓冲液按一次用量 分装后保存,以避免反复冻融引起ATP失活。也可在连接缓冲液中补加ATP到终浓度1mM以补偿失 活ATP。

●T4DNA连接酶是否具有活性?将一个载体质粒单 酶切产生粘性末端,用此酶切产物进行连接反应,可 检测连接酶活性。注意连接反应一定要使用系统自己提供T4DNA连接酶,因为这种连接酶核酸外切酶活性最低。而T4 DNA连接酶的核酸外切酶活性可降解T-突出端和A-突出端,连接时引起载体自连,编码完整的有功能的β半乳糖苷酶,造成克隆 菌蓝斑数多于白斑。

 
采用T载体克隆时,用阳性对照连接正常, 而连接我自己的PCR产物却不能得到白斑,问题出在哪里?
  PCR产物的连接效率受很多因素影响,包括PCR产物的片段大小及核苷酸序列、PCR产物的纯度以及 载体与插入片段的摩尔比等。尽管采用Promega公司 T-载体可成功克隆12kb的PCR产物,但是插入大片段易发生重组或细菌性丢失,很难进行正常连接。所 以对于大片段的PCR产物的连接反应,应选择DNA重组最小化的宿主菌。另外插入片段如果很小,可能 造成lacZ基因的读码框不被破坏,因而导致与载体自连的本底相比有较高的蓝斑数目。PCR产物的纯度对 T-载体的连接也很重要,PCR反应产物中的盐、dNTP、引物及引物二聚体均不利于PCR产物的克隆。 用Wizard® SV凝胶及PCR纯化系统(产品目录号:A9282)纯化PCR产物可大大提高其克隆效率。

参考文献:
1.Promega公司 pGEM®-T 和pGEM®-T Easy 载体系统技术手册 TM042.
2.Promega公司PinPointTMXa-1载体系统技术手册TB234.
3.Promega公司pTARGETTM真核表达系统技术手册TM044.
4.Clark,J.M.(1988) Nucl. Acids Res.16,9677-86.
5.Promega公司Wizard® SV 凝胶及PCR纯化系统技术手册 TB308.

 操作手册:
pGEM®-T 载体系统技术手册TM042. (www.promega.com/tbs/tm042/tm042.html)
pGEM®-T Easy 载体系统技术手册TM042. (www.promega.com/tbs/tm042/tm042.html)
PinPointTM Xa-1载体系统技术手册TB234 (www.promega.com/tbs/tm234/tm234.html)
pTARGETTM真核表达系统技术手册TM044 (www.promega.com/tbs/tm044/tm044.html)
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