蛋白组学研究面临的重大问题是蛋白样本的高度复杂性。低丰度蛋白的纯化与定量尤其困难。Qiagen公司为蛋白质组学研究提供了一系列的蛋白分类抽提试剂盒,用于蛋白样品的制备。其优点在于:
试剂盒
制备蛋白类型
样本量
得到的组分
Qproteome Bacterial Protein Prep Kit
可溶性细菌蛋白
25ml培养液/1ml裂解液
Qproteome Mammalian Protein Prep Kit
哺乳动物细胞总蛋白
5-10x个细胞/1ml裂解液
Qproteome Soluble Protein Separation Kit
全部蛋白
-个细胞或500ul蛋白样本(蛋白总量0.5-4mg)
蛋白总量0.5-4mg,按照蛋白溶解性不同,将总蛋白分成6个部分。
Qproteome Cell Compartment Kit
细胞器/亚细胞定位特异性蛋白
5x 个细胞
蛋白总量0.5-1mg,按照蛋白亚细胞定位的不同,分为细胞质、细胞膜、细胞核与细胞骨架蛋白4个组分。
Qproteome Nuclear Subfractionation Kit
核蛋白
5x-1x 个细胞
蛋白总量1.5-2.5mg,分成胞质蛋白、‘不溶的’核蛋白(如组蛋白)和核酸结合蛋白,核酸结合蛋白可进一步细分成三个组分(50-100ug)
Qproteome Nuclear Protein Kit
蛋白总量1.5-2.5mg,分成胞质蛋白、‘不溶的’核蛋白(如组蛋白)和核酸结合蛋白
PhosphoProtein Purification Kit
磷酸化蛋白
1x 个细胞
分离磷酸化与非磷酸化蛋白
Qproteome Total Glycoprotein Kit
糖基化蛋白
个细胞或50ul血清
Qproteome Mannose Glycoprotein Kit
糖基化蛋白(富含甘露糖)
按照蛋白所含糖基的凝集素特异性分为3个部分
Qproteome Sialic Glycoprotein Kit
糖基化蛋白(富含硅铝酸)
Qproteome O-Glycan Glycoprotein Kit
糖基化蛋白(富含T-抗原类型糖基)
按照蛋白所含糖基的凝集素特异性分为2个部分
Qproteome Albumin/IgG Depletion Kit
血清和血浆蛋白
25 ul人血清或血浆
0.5-0.8mg不含白蛋白与IgG的血清或血浆蛋白
Qproteome Murine Albumin Depletion Kit
25 ul 鼠血清或血浆
0.2-0.3mg(小鼠),0.5-0.7(大鼠)不含白蛋白的血清或血浆蛋白
AllPrep RNA/Protein Kit
小量细胞培养样本
哺乳动物细胞总蛋白和总RNA
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