普洛麦格中文通讯 第七期 2003
siLentGeneTM U6 盒 RNA 干扰系统
快速筛选目标siRNA
Promega公司:Jolanta Vidugiriene, Ph.D., Thomas Yeager, Ph.D., Cynthia Sprecher, B.S., and Doug Storts, Ph.D. Allele Biotechnology and Pharmaceuticals公司:Lin Wang, Ph.D., Jiwu Wang, Ph.D. and Zhaohui Dong, Ph. D.
 

摘要

  我们开发、优化了一套在哺乳动物细胞中诱导 RNA干扰(RNAi)效果的试剂盒,该试剂盒用DNA盒表达siRNA。这些DNA盒的特点是具有一个精确而高效的真核RNA聚合酶III U6启动子。表达盒由PCR合成,然后转染所用细胞系,适合于多目标位点的快速筛选。

siLentGeneTM系统快速、廉价,提供快速筛选和确定不同siRNA效果的方便手段。


简介

  使用双链RNA(dsRNA)沉默基因表达,也就是 RNA干扰或称RNAi,为分析基因功能提供了有力工具。研究人员通过选择性向下调节(或“敲掉”)某一特定基因的表达这种方法,可以确定这个基因在许多细胞学过程中的功能。要了解某一个基因的功能,基因敲掉技术是很有用的工具。另外,简单及预测性强的敲掉技术使新药开发过程获益非浅。

   基因敲掉实验对许多生物学研究都有用,例如:绘制细胞学途径,选择适合的药物干预的靶标,开发基因治疗方案。SiLentGeneTM U6 盒RNA 干扰系统为研究者使用RNAi分析基因功能提供了一个方便的工具。

RNAi 现象

  RNAi指由dsRNA诱导的,能特异地降解与dsDNA同源的mRNA的细胞学过程。在有些系统中,几个拷贝的dsRNA可导致一个细胞中的全部同源转录子降解(1)。现已鉴别出一些在这个过程中发挥作用的基因产物,如果蝇III型RNA酶“Dicer”(2),“Dicer”将长链dsRNA或发夹状RNA(3)处理成双链小干扰 RNA(siRNA),这些siRNA一般有21-23个核苷酸(nt)。一旦这些siRNA出现,它们就诱导形成RNA-诱导的沉默复合体(RISC)。复合体中的解旋酶解开dsRNA,

由此产生的单链RNA(ssRNA)就成为选择底物的向导。一旦ssRNA与目标mRNA碱基互配,可能原来就存在于复合体中的核酸酶活性就会使mRNA降解(图1)。

 

图1. RNA干扰机理假说

在哺乳动物细胞中诱导RNAi的方法

  在Fire et al 1998 (1) 年发现RNAi现象后不久,dsRNA就被成功用于分析线虫,果蝇和植物的基因功能(4,5)。在哺乳动物细胞中,长链dsRNA能在小鼠胚胎肿瘤细胞和胚胎干细胞中诱导特异序列基因的沉默(6,7)。然而,向哺乳动物体细胞导入长dsRNA却可激活抗病毒防御系统,导致RNA转录子的非特异性降解(8),并使细胞丧失总体的蛋白合成功能(9,10)。这两个机制有效地关闭哺乳动物细胞的正常生理过程,而使dsRNA失去特异的RNAi能力。可是,在哺乳动物细胞中使用短的(21-23 nt)、并在3’端有2个核苷


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