分子诊断和分子影像
        

(SAM)程序,利用置换比较和计算错误检测率,被用于检测假性和梗塞样品之间基因表达的显著变化。差异表达基因被定义在g<0.02的错误检出率和≥1.5,≤0.5的倍数变化。

结果:
  1、一天后的表达情况, LADC 结扎一天后在梗塞区域出现大量下调的功能基因,如心脏肌钙蛋白I,T等。而梗塞区域表现出大量上调的基因,如肌球蛋白1等。而且平均上调3-11倍。

  2、28天后的表达情况,信号转导和炎症反应的基因表达在后阶段的梗塞区域里明显表达上升。一些产与转录,代谢和解毒的基因也开始表达。胞外基质再造的4个高表达基因说明细胞的生长和更新率很低。28天后偏僻区域里高表达基因数明显少于1天的表达情况。

  3、一天和二十八天后梗塞区域里转录因子的表达情况,在螺旋-环-螺旋结构,锌指结构,亮氨酸拉链结构和螺旋-转角-螺旋结构,各转录因子的差异表达。具体参见图1。

  4、天和二十八天后偏僻区域里转录因子的表达情况。参见图2

讨论:
  24小时内,在梗塞区域里下调的基因相对应在偏僻区域是上调的。而在后期(28天),一些基因在梗塞区域里恢复了表达。我们可以认识到,结扎后即使出现了大量表达下降的基因,在梗塞区域里仍存在转录基因和一些分子过程的竞争。这种竞争使得一部分的小鼠存活下来。24h后,偏僻区域由于激活许多信号转到通路,恢复了特异性包内保护解毒反应和抗氧化基因,表现出广泛的炎症反应,这也许限制了梗塞区域内的进一步损伤,保存了心脏的收缩功能。

  现在的研究结果显示了由于心肌梗塞展现发育期转录因子和信号转导通路,胞外基质再造,代谢途径复杂多样的表达模式。相关因子很可能参与了相同的途径,为诊断和治疗提供新的靶位点。

  我们采用更为精确的表达谱芯片,更宽的动态检测范围,聚类分析。因此能够在系统层面上理解多基因的统计学差异,而不  

 

仅仅在单个基因上看变化。表达数据为我们提供了一个细胞内反应蓝图,包括RNA稳定性,选择性剪切,翻译和翻译后修饰。这些新的发现纠正了过去我们对梗塞区和偏僻区内表达差异的错误理解。

  欲了解该研究的更多细节,请查阅Journal ofMolecular and Cellular cardiology,38(2005),103-117 。

图1.在第1天和28天的梗塞区中转录因子的表达式情况,基因按通常的因子结合元件或目标区域分类。

图2 在第1天和28天的远端区域中转录因子的表达情况

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