DeCyder™ 2-D差异分析软件是特别为双向荧光差异凝胶电泳(2-D DIGE)开发的，是Ettan?DIGE系统的关键组成部分。在双向电泳的历史上第一次，对于每一块双向凝胶上的每一个点都有一个内标以获得最精确的定量可能。
DeCyder 2-D差异分析软件通过对蛋白差异的精确测量并给出统计学可信度极大地提高了工作通量，并且还将手工操作时间从几天减少到几分钟同时把操作者之间的误差减到最低。该软件对多重荧光图像进行全自动找点，匹配和蛋白点分析，并且能够在高的统计学可信度下检测到在蛋白点之间很小的差异。
DeCyder 2-D 6.0版本软件特点：
● 全自动分析，极大地减少手工操作时间
● 在同一块胶中不需要匹配，降低匹配误差
● 全自动进行每个点的统计学分析
● 采用内标的方法，提高准确率并且简化凝胶
之间的匹配
● 采用Oracle™数据库的用户终端-服务器安装方
式，使得更容易进行项目管理和确保数据安
性
● 通过未来的模块满足CFR 21 Part 11 的兼容性
传统的双向凝胶电泳是一个得到广泛应用的经典蛋白分析技术，虽然这一方法比较耗时耗力。需要跑许多凝胶，进行分析和比较。然而，在凝胶之间的重复性和显著的系统偏差使该方法很难区分系统和遗传生物差异，这就意味着在蛋白丰度上的差异很少能被确信的预期。
DeCyder 2-D差异分析软件包括一个完全自动化的图像分析软件包，进行找点，定量，匹配和2-D DIGE凝胶的分析。该软件兼容于CyDye™ DIGE最小标记荧光染料和微量样本标记试剂盒中的饱和标记染料。利用DeCyder 2-D软件，通过2-D DIGE鉴定出的表达差异能够被可靠地指定为诱导的生物学变化而非由于系统偏差引起。每个差异都伴随一个统计学可信度的数值。
DeCyder 2-D软件是唯一的，因为它安全开发了由多重分析，每一块胶上多个样品的共迁移和民内标的引入带来的优势。
多重分析是通过使用专有的电荷和分子量匹配的CyDye DIGE最小标记荧光染料或饱和标记染料来标记蛋白样品。多达3个样品可以在同一块胶上被分离，随后用Typhoon Trio系列多功能扫描仪扫描成像。通过DeCyder 2-D软件，可以在高水平可信度检测到在蛋白表达中微小的差异。
内标的使用非常有效地降低了凝胶与凝胶之间的偏差。在几分钟内可以检测到小于10%的表达差异而统计学可信度超过95%。
2-D DIGE工作流程的总体视图见图1。
DeCyder 2-D 6.0版本差异分析软件包包括几个模块，如图2所示。 |
图1. 2-D DIGE工作流程(三色标记实验举例)
图2.DeCyder 2-D 软件6.0版本 初始界面显示分析工作流程
Image Loader（图像导入模块）
图像导入模块可以把图像导入并存储在Oracle数据库中。
Administration Tools（管理工具）
管理工具维护客户终端-服务器Oracle数据库。
备份，数据库恢复，在数据库之间的数据
出被完全安全的管理。管理员通过总体管
和控制使用者和登录权限。该系统在网络
围内能够支持一个或多个使用者。 |