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Oligo Pools合成服务---用于制备目标区域测序/全基因外显子序列测序RNA诱饵

        在二代测序中，对特定基因组目标区域测序至全基因外显子序列测序，常使用RNA诱饵捕获试剂盒，来富集感兴趣的目标基因或基因组区域的DNA片段，以提高测序的深度，准确性和灵敏度。常用的目标序列/全基因外显子捕获试剂盒由于RNA诱饵含量的限制，使用周期短，费用高。
        我们提供的Oligo Pools合成服务是通过Custom Oligoarray Synthesizer平台，在芯片上一次性电化学合成12000/94000条含相同PCR扩增引物端的寡核苷酸探针，再将合成探针从芯片上切割下来，经过严格质控后形成探针池（Oligo Pools）。一次合成的Oligo Pools可制备几万次反应所需要的RNA诱饵，极大降低序列捕获试剂盒成本。
        用户在购得Oligo Pools后，仅需一定量的oligo pool作为模板经过PCR扩增、RNA转录即可获得生物素化RNA诱饵，该RNA诱饵可用于几千次目标基因富集（或捕获）/位点富集（或捕获）/外显子富集（或捕获）。

Oligo Pools合成过程：

RNA诱饵制备过程与捕获原理：
        取一定量的单链oligo pool 作为模板，经过PCR扩增生成含有SP6或T7转录启动子序列的双链DNA产物，该双链DNA产物再经过RNA转录生成生物素化RNA诱饵（RNA转录体系中需加入生物素标记的尿核苷酸U）。

        生物素化的RNA诱饵通过碱基互补配对原理与目标序列DNA结合，从而将目标测序序列富集并用于后期二代测序应用。与传统序列捕获方法（用固定在芯片表面的DNA捕获）相比，生物素化RNA诱饵的捕获特异性好，灵敏度高。oligo pool到RNA诱饵的生产流程如下；


目标序列/全基因外显子捕获Oligo Pools合成优势：

  1. 更大程度节约捕获成本；与传统的RNA诱饵捕获试剂盒相比，Oligo Pools合成服务将每个测序反应的捕获成本降低99%。
  2. 确保测序平台能更好服务于您感兴趣序列的测序，增加序列测序深度，增大肿瘤细胞基因突变测序检测灵敏度；
  3. 用户可自定义目标序列区域/位点/基因/SNP,我们根据您的要求设计最优的探针并进行合成；（亦可直接提供已经设计好的引物序列；）
  4. 探针设计方式灵活，您可自行设计，我们也可代理为您设计；
  5. 通过软件对设计探针进行最优化分析，确保实验成功率；
  6. 我们对合成的Oligo Pools进行严格质量分析，确保合成诱饵95%以上具有活性。
  7. 兼容性，捕获Oligo Pools可与所有主要的新一代测序平台兼容。

探针设计时需要考虑的因素：

1. 感兴趣序列格式
        每张芯片最多可合成12000条或94000条诱饵序列，为保证探针设计的特异性，增加目标序列测序比例，请提供FASTA格式的序列文件或者基因组坐标（以及参考基因组）
2. Tiling 密度
        Tiling密度即诱饵之间的重叠程度，Tiling值越高越有利于捕获目标序列。一般来讲，2×Tiling为最佳值。
3. 诱饵长度
        建议目标序列诱饵长度介于80-120mers，长度越长，合成成本越高。
4. 序列长度统一性
        合成的寡核苷酸序列长度应相同或尽可能一致，此时合成质量最高；序列长度变化应<=10%

产品规格及说明：
A、用户可自定义目标序列区域/位点/基因/SNP,我们根据您的要求设计最优的探针并进行合成；
B、用户可直接提供已经设计好的探针序列；

Product

Part Number

Description

Units

12K Pool - 10-79mer

2000160

Cleaved oligonucletide product consisting of up to 12472 members of 10 to 79 base lengths

EA

12K Pool - 80-109mer

2000180

Cleaved oligonucletide product consisting of up to 12472 members of 80 to 109 base lengths

EA

12K Pool - 110-130mer

2000200

Cleaved oligonucletide product consisting of up to 12472 members of 110 to 130 base lengths

EA

12K Pool - 131-150mer

2000240

Cleaved oligonucletide product consisting of up to 12472 members of 131 to 150 base lengths

EA

12K Pool - 151-170mer

2000280

Cleaved oligonucletide product consisting of up to 12472 members of 151 to 170 base lengths

EA

12K Pool - 171-200mer

2000300

Cleaved oligonucletide product consisting of up to 12472 members of 171 to 200 base lengths

EA

90K Pool - 10-79mer

2000425

Cleaved oligonucletide product consisting of up to 92918 members of 10 to 79 base lengths

EA

90K Pool - 80-109mer

2000450

Cleaved oligonucletide product consisting of up to 92918 members of 80 to 109 base lengths

EA

90K Pool - 110-130mer

2000500

Cleaved oligonucletide product consisting of up to 92918 members of 110 to 130 base lengths

EA

90K Pool - 131-150mer

2000550

Cleaved oligonucletide product consisting of up to 92918 members of 131 to 150 base lengths

EA

90K Pool - 151-170mer

2000600

Cleaved oligonucletide product consisting of up to 92918 members of 151 to 170 base lengths

EA

90K Pool - 171-200mer

2000650

Cleaved oligonucletide product consisting of up to 92918 members of 171 to 200 base lengths

EA

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