• 基于原子环境建模的蛋白质序列设计新方法LigandMPNN：突破非蛋白分子互作设计瓶颈

  编辑推荐：针对现有深度学习方法无法建模非蛋白原子环境的难题，Baker团队开发了LigandMPNN模型，通过构建蛋白质-配体图神经网络，在小分子（63.3% vs 50.4%）、核苷酸（50.5% vs 34.0%）和金属（77.5% vs 36.0%）结合位点的序列恢复率上显著超越ProteinMPNN和Rosetta，已成功设计100+个实验验证的结合蛋白，为酶工程和生物传感器开发提供新范式。

  来源：Nature Methods 36.1

  时间：2025-03-29

• 综述：理解线粒体蛋白质输入：前序列转位酶TIM23复合体的修正模型

  这篇综述系统梳理了线粒体TIM23复合体的研究进展，挑战了传统认知并提出全新机制模型。作者团队整合冷冻电镜（cryo-EM）等最新结构生物学证据，揭示Tim17亚基作为蛋白质"滑轨"的核心功能（原认为Tim23形成通道），同时解析了Mgr2作为膜侧"门控"的分子机制。文章巧妙调和了传统生化研究与新结构数据的矛盾，为线粒体蛋白质靶向运输（△μ^H+驱动）领域提供了范式转换的视角。

  来源：TRENDS IN Biochemical Sciences 11.6

  时间：2025-03-29

• “丢弃-重启”分子动力学算法：蛋白质中间态采样的革命性突破及其在药物发现中的应用

  本文推荐：针对传统分子动力学(MD)模拟难以高效捕获蛋白质构象变化的难题，耶鲁大学团队开发了"丢弃-重启"MD算法。该研究通过定义集体变量(CV)损失函数，选择性保留趋向目标构象的短时MD轨迹，实现了对PrP折叠中间态和α-Tubulin解折叠路径的高效采样（加速达2000倍），并结合AI技术识别潜在药物结合位点。这项发表于《Biophysical Journal》的工作为靶向动态蛋白状态的结构药物设计提供了新范式。

  来源：Biophysical Journal 3.4

  时间：2025-03-29

• 综述：成像与空间分辨质谱在肾脏病学中的应用

  本文系统评述了空间分辨质谱（MS）及MS成像技术在肾脏研究中的前沿进展。通过无标记、多组学（代谢物、药物、蛋白质及翻译后修饰PTMs）检测能力，这些方法揭示了肾脏结构与功能的多尺度分子特征，为急慢性肾病、糖尿病肾病等疾病的生物标志物发现和病理机制研究提供了新视角。技术挑战包括组织异质性解析和数据处理优化，但结合MALDI、DESI等技术，未来有望推动精准肾脏病诊疗发展。

  来源：Nature Reviews Nephrology

  时间：2025-03-29

• 综述：高压均质技术在植物蛋白中的应用进展：提升技术功能特性与生物活性肽释放

  本文系统综述了高压均质技术（HPH）对植物蛋白技术功能特性（如溶解性、乳化性）和生物活性肽释放的调控作用，揭示了HPH通过改变蛋白结构（如形成可溶性纳米聚集体）和协同pH调节优化性能的潜力，为开发多功能植物蛋白配料提供了创新视角。

  来源：Current Food Science and Technology Reports

  时间：2025-03-29

• 王飞团队在开发RNA结合蛋白TRBP抑制剂治疗肝癌的研究中取得新进展

  近日，中国科学院成都生物研究所国家天然药物工程技术研究中心王飞研究员与卢晓霞研究员团队在药物化学国际顶级期刊Journal of Medicinal Chemistry上发表题为“Design, Synthesis, and Antitumor Activity Evaluation of 2‑Phenylthiazole-5-Carboxylic Acid Derivatives Targeting Transactivation Response RNA-Binding Protein 2”的最新研究成果

  来源：中国科学院成都生物研究所

  时间：2025-03-29

• 果蝇和人类 Headcase 蛋白：应激反应中核糖核蛋白颗粒的关键调控者 —— 开拓细胞应激适应研究新视野

  为探究 Headcase（heca）在细胞应激反应中的分子作用，研究人员开展了关于果蝇和人类 heca 蛋白与核糖核蛋白（RNP）颗粒关系的研究。结果发现 heca 是 RNP 颗粒的成分，参与 RNP 颗粒形成和重塑、翻译控制，人类 HECA 与之功能相似。这为细胞应激反应研究提供新视角。

  来源：SCIENCE ADVANCES 11.7

  时间：2025-03-29

• 非编码 RNA 调控 DNMT3A 的机制：开拓表观遗传学新视野

  为探究调控蛋白和组蛋白尾巴存在时，调控 RNA 对 DNMT3A 的调控作用，研究人员开展了非编码 RNA 调控 DNMT3A 机制的研究。结果发现 Fos ecRNA 与 mRNA 相关，且调控 RNA 在多蛋白 - RNA 复合物中主导调节 DNMT3A 活性。该研究为理解表观遗传调控提供了新视角。

  来源：Epigenetics & Chromatin 4.2

  时间：2025-03-29

• 在无脊椎动物中发现铃蟾肽型神经肽信号系统及其功能特征：揭示进化起源与古老生理作用

  本文发现并鉴定了海星（<em>Asterias rubens</em>）中的铃蟾肽（BN）型神经肽信号系统。通过多种实验，确定了相关前体蛋白、受体，明确其分布及功能。该研究将 BN 型信号的进化追溯到棘皮动物和脊索动物的共同祖先，揭示其在调节摄食行为中的古老作用。

  来源：Proceedings of the National Academy of Sciences 9.4

  时间：2025-03-29

• 芳香化酶通过下调精浆细胞外囊泡中ATP合成相关蛋白表达降低公鸡精子活力

  编辑推荐：为解决芳香化酶(Cyp19a1)如何影响公鸡精液品质的机制问题，华中农业大学团队通过构建LV-CYP19A1慢病毒过表达模型，发现芳香化酶通过下调精浆细胞外囊泡(SPEV)中ENO4、SDHA等8种关键蛋白表达，抑制ATP合成和精子鞭毛运动，最终导致精子活力下降。该研究发表于《BMC Genomics》，为雄性生殖调控提供了新靶点。

  来源：BMC Genomics 3.5

  时间：2025-03-29

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