• 探寻溃疡性结肠炎潜在生物标志物：FOXO4、ALDOB 等基因的关键作用

  为探究溃疡性结肠炎（UC）相关基因表达，来自 Çukurova 大学 Balcalı医院胃肠病科的研究人员，对 UC 患者结肠黏膜中参与多种炎症通路的基因展开研究。结果发现 FOXO₄、ALDOB 等基因表达变化。这为 UC 的基因组鉴定和发病机制研究提供了新方向。

  来源：Genes & Genomics 1.6

  时间：2025-03-29

• 解析人类腺病毒与札如病毒共感染：解锁急性胃肠炎病毒遗传密码，助力疫情防控

  为探究急性胃肠炎的病因，来自中国深圳的研究人员开展人类腺病毒（HAdV）和札如病毒（SaV）共感染的研究。他们对 873 份腹泻粪便样本检测分析，发现两例共感染样本，且病毒具有特定的遗传特征。该研究为追踪疫情奠定基础。

  来源：Genes & Genomics 1.6

  时间：2025-03-29

• 解析漂浮水生植物水禾完整单倍型无缺口基因组：开启水稻抗涝基因资源开发新征程

  为探究水生植物水禾（Hygroryza aristata）适应水生环境的机制，助力水稻（Oryza sativa）抗涝基因资源开发，研究人员对水禾基因组进行测序和组装。研究获得了两个单倍型无缺口基因组，注释出大量蛋白编码基因，为相关研究提供了重要数据支持。

  来源：BMC Genomic Data 1.9

  时间：2025-03-29

• DNA 甲基化记忆：胰腺癌发生 “幕后推手”，无 KRAS 突变下的关键机制探索

  为探究细胞在无致癌基因突变情况下，对腺泡 - 导管化生（ADM）过渡状态的表观遗传记忆程度等问题，研究人员开展了 ADM 过渡状态 DNA 甲基化的研究。结果发现 ADM 期间 PI3K 和 Rho GTPase 通路基因差异甲基化且基因表达增加，且这种差异甲基化在恢复后仍存在。该研究为理解癌症发生机制提供新视角。

  来源：Genome Medicine 10.4

  时间：2025-03-29

• 北美入侵长角血蜱基因组：牛抗蜱疫苗研发的关键模板

  为解决长角血蜱（Haemaphysalis longicornis）对农业和畜牧业的威胁及传统杀螨剂耐药问题，研究人员开展了对长角血蜱基因组及转录组的研究。结果获得高质量基因组组装和基因目录，还筛选出潜在疫苗候选分子，为抗蜱疫苗研发提供了重要资源。

  来源：BMC Genomics 3.5

  时间：2025-03-29

• MACAW：一种半自动化检测基因组规模代谢模型错误的方法及其在人类和微生物代谢研究中的应用

  编辑推荐：基因组规模代谢模型(GSMMs)在预测代谢通量和药物靶点发现中具有重要价值，但错误反应严重制约其应用。波士顿大学团队开发了代谢准确性检查与分析工作流(MACAW)，通过死端测试、稀释测试、重复测试和循环测试四种算法，在人类、酵母和大肠杆菌GSMMs中成功识别并纠正了数百个反应错误，显著提高了Human-GEM对脂酸合成通路基因敲除的预测准确性，为代谢网络建模提供了创新工具。

  来源：Genome Biology 10.1

  时间：2025-03-29

• 拷贝数归一化：区分 ATAC-seq 和 ChIP-seq 中拷贝数差异驱动的差异信号，解锁基因组分析新视角

  在 ATAC-seq 和 ChIP-seq 差异分析中，拷贝数变异（CNV）常被忽视。研究人员开展了关于拷贝数归一化的研究，提出相关分析流程。结果表明该流程能分离拷贝数驱动的差异信号，在唐氏综合征研究中也有重要发现，为相关研究提供新方法。

  来源：BMC Genomics 3.5

  时间：2025-03-29

• 综述：环状 RNA（circRNAs）在人类疾病中的新兴作用及临床应用

  本文聚焦环状 RNA（circRNAs），详细阐述其在人类疾病中的作用。circRNAs 是一类非编码 RNA，结构特殊。它参与多种疾病进程，如癌症、神经退行性疾病等。文章还探讨其作为诊断和治疗生物标志物的潜力及面临的挑战，值得一读。

  来源：Functional & Integrative Genomics 3.9

  时间：2025-03-29

• 碳离子束与X射线对水稻幼苗分子转录组机制的解码：辐射育种与植物抗性研究新视角

  编辑推荐：为解析不同电离辐射（IR）在植物诱变育种中的差异机制，中国科学院近代物理研究所团队通过比较碳离子束（CIBs，高LET）与X射线（低LET）对水稻幼苗转录组的影响，发现X射线诱导更多差异表达基因（DEGs），且DNA复制修复、植物激素信号（如JAZ、ABA）及抗氧化途径（APX、POX）响应显著。研究揭示了LET依赖性损伤修复差异，为辐射育种优化和深空探索植物适应性提供关键数据，发表于《BMC Genomics》。

  来源：BMC Genomics 3.5

  时间：2025-03-29

• 代谢组与转录组联合分析揭示下丘脑调控雌性济宁青山羊性发育的分子机制

  编辑推荐：为解决山羊性成熟调控机制不明的问题，山东科研团队通过代谢组和转录组分析，发现MAP3K9、PRUNE2等基因与LPC22:5等代谢物协同调控GnRH神经元发育，阐明谷胱甘肽代谢通路的关键作用，为山羊育种提供新靶点。

  来源：BMC Genomics 3.5

  时间：2025-03-29

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