• 综述：长读长测序 DNA 甲基化的计算分析

  本文是一篇关于 DNA 甲基化计算分析的综述。DNA 甲基化（DNA methylation）在基因调控、发育等众多生物过程中至关重要。文章探讨了甲基化信号识别、样本间甲基化对比等计算方法，还分析了面临的挑战和未来发展方向，值得相关领域研究者阅读。

  来源：Nature Reviews Genetics

  时间：2025-03-29

• DNA 甲基化记忆：胰腺癌发生 “幕后推手”，无 KRAS 突变下的关键机制探索

  为探究细胞在无致癌基因突变情况下，对腺泡 - 导管化生（ADM）过渡状态的表观遗传记忆程度等问题，研究人员开展了 ADM 过渡状态 DNA 甲基化的研究。结果发现 ADM 期间 PI3K 和 Rho GTPase 通路基因差异甲基化且基因表达增加，且这种差异甲基化在恢复后仍存在。该研究为理解癌症发生机制提供新视角。

  来源：Genome Medicine 10.4

  时间：2025-03-29

• 原发性三阴性乳腺癌DNA甲基化图谱揭示基底与非基底表型的表观遗传调控机制

  编辑推荐：为解决三阴性乳腺癌(TNBC)分子异质性和表观遗传调控机制不明的问题，瑞典研究团队通过肿瘤纯度校正的DNA甲基化分析，首次系统描绘TNBC表观遗传图谱，鉴定出基底型(Basal)和非基底型(non-Basal)两大表观亚型及其五个分子亚群，揭示FOXA1/GATA3等关键转录因子的表观调控与PD-L1免疫逃逸、脂肪酸代谢网络的特异性关联，为TNBC分子分型和精准治疗提供新视角。

  来源：Nature Communications

  时间：2025-03-29

• OGT通过全基因组抑制TET活性阻止DNA去甲基化并抑制异染色质中转座元件的表达

  来自某研究机构的研究人员揭示了O-连接N-乙酰葡糖胺转移酶（OGT）在调控表观遗传中的关键作用。通过敲除小鼠胚胎干细胞（mES）中的Ogt基因或抑制OGT活性，发现5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）在全基因组（包括常染色质和异染色质）显著增加，而5-甲基胞嘧啶（5mC）相应减少。该研究阐明了OGT-TET互作在维持DNA甲基化稳态中的机制，为理解转座元件沉默及表观遗传失调相关疾病提供了新视角。

  来源：Nature Structural & Molecular Biology 12.5

  时间：2025-03-29

• 非编码 RNA 调控 DNMT3A 的机制：开拓表观遗传学新视野

  为探究调控蛋白和组蛋白尾巴存在时，调控 RNA 对 DNMT3A 的调控作用，研究人员开展了非编码 RNA 调控 DNMT3A 机制的研究。结果发现 Fos ecRNA 与 mRNA 相关，且调控 RNA 在多蛋白 - RNA 复合物中主导调节 DNMT3A 活性。该研究为理解表观遗传调控提供了新视角。

  来源：Epigenetics & Chromatin 4.2

  时间：2025-03-29

• 《AMOGEL：多组学与先验知识融合，精准解析癌症亚型的新突破》

  <strong>在癌症研究中，现有研究对图神经网络（GNN）非线性学习潜力利用不足，且整合高通量多组学数据与先验知识的能力欠缺。研究人员开展了基于关联图神经网络和关联规则挖掘（ARM）的多组学分类框架研究。结果显示，AMOGEL 在分类准确性等指标上优于现有模型，为癌症亚型分类提供了新方法</strong>

  来源：BMC Bioinformatics 2.9

  时间：2025-03-29

• 综述：父亲吸烟与超重/肥胖对儿童超重/肥胖影响的系统评价

  本研究系统评价了父亲吸烟及超重/肥胖（BMI≥25）与12岁以下儿童超重/肥胖（BMI≥85th百分位）的关联。证据表明，父亲超重/肥胖（OR 1.57-2.8）与儿童肥胖呈强相关性，而父亲孕期吸烟（5/6研究支持）可能通过表观遗传或行为模式增加风险。研究强调需关注父系因素（如BMI、吸烟）对儿童代谢健康的跨代影响，并建议综合干预社会经济决定因素。

  来源：Current Obesity Reports 9.5

  时间：2025-03-29

• 噬菌体在牙周微生物生态系统中的调控作用：从基因组视角揭示关键病原体的生存策略与治疗新靶点

  这篇综述系统阐述了牙周炎关键病原体中前噬菌体（prophage）的生态学意义，通过基因组分析揭示其编码的抗生素耐药基因（ARGs）、毒力因子（VFs）和辅助代谢基因（AMGs）如何塑造微生物群落。研究发现52.5%的病原体携带前噬菌体，其介导的水平基因转移（HGT）网络涉及碳水化合物活性酶（CAZymes）和抗宿主防御系统（如CRISPR-Cas、RM系统），为理解牙周炎进展机制和开发靶向微生物组的基因疗法提供了新视角。

  来源：mSystems 5.0

  时间：2025-03-29

• 间歇性禁食提升雄性生殖力：色氨酸 - 血清素通路的关键作用

  本文研究发现，间歇性禁食（IF）可预防雄性小鼠衰老相关的生育能力下降，虽未改善传统生殖指标，但能增强交配行为。其机制是 IF 通过减少色氨酸（Trp）向大脑的供应，降低中枢血清素水平，解除对性行为的抑制。该成果为改善男性生殖健康提供新方向。

  来源：Cell Metabolism 27.7

  时间：2025-03-29

• 表观遗传时钟：DNA甲基化作为生物年龄和年龄相关疾病的标志物

  推荐语：这篇综述系统阐述了DNA甲基化（DNAm）作为表观遗传时钟（Epigenetic Clock）核心标志物在评估生物年龄（Biological Age）与预测年龄相关疾病中的突破性进展。文章整合了Horvath^?、Hannum等经典时钟模型，解析了甲基化驱动衰老的靶基因（如ELOVL2、FHL2）及通路（如Wnt/β-catenin），为衰老干预（如Senolytics）提供新视角。

  来源：Biochemistry (Moscow) 2.3

  时间：2025-03-28

知名企业招聘：