综述:基于图的植物泛基因组学:技术、应用及挑战
本文围绕植物图泛基因组展开,介绍其构建算法、读长比对和变异基因分型的方法,阐述在植物基因组研究中的应用,包括发现遗传多样性、助力作物驯化与育种等,分析面临的挑战并展望未来,为植物基因组学研究提供了全面的参考。(泛基因组:Pangenome;图泛基因组:graph pangenome)
来源:aBIOTECH 4.6
时间:2025-03-29
科学家们发现了一种治疗镰状细胞病的潜在新基因变异靶点
来自约翰霍普金斯医学院(Johns Hopkins Medicine)和美国、非洲和欧洲其他八家机构的科学家表示,他们已经发现了一个潜在的新基因靶标,可以通过编辑来治疗镰状细胞病(sickle cell disease)。镰状细胞病是一种遗传性血液疾病,其特征是镰状红细胞,会导致剧烈疼痛,缩短寿命。
坦桑尼亚西北部乙肝病毒基因多样性的新变化:HBV/G 的出现及意义
为了解决坦桑尼亚乙肝病毒(HBV)感染分子特征研究稀缺问题,研究人员开展 HBV 基因多样性研究,发现 HBV/A 和 HBV/D 为主,出现新基因型 HBV/G,对防控有重要意义。
来源:Scientific Reports 3.8
时间:2025-03-08
HiFi测序揭秘串联重复序列!
PacBio HiFi长读长测序的高精确度使其可以全面地表征整个基因组的串联重复的种系和体细胞变异。Nature biotechnology上的一篇文章介绍了基于HiFi测序的串联重复基因分型工具以及串联重复可视化的配套方法。
PacBio公布了一种全面的全基因组串联重复分析的新方法
分析方法支持常见疾病的遗传原因研究
基因分型工具PK:PCR vs. 芯片
在人类基因组中,基因变异以许多不同的形式存在,包括体细胞突变、单核苷酸多态性(SNP)、拷贝数变异(CNV)和结构改变(插入缺失,Indel)。研究这些变异需要强大的基因分型工具。在这里,我们将介绍两大类工具,帮助你从基因分型实验中收集到更详细的信息。
Affymetrix推出全新Axiom™ Analysis Suite,一款全自动基因分型工具
Axiom™ Analysis Suite融合了Genotyping Console™ Software和SNPolisher软件的强大功能,提供了集成、单源的软件包,可实现所有Axiom® 芯片的完整基因分型分析,适合人类研究和农业基因分型应用。
来源:Affymetrix
时间:2015-04-30
Nature子刊:免疫性疾病中的缺失环节
在一项迄今最大的顽固性免疫缺陷疾病遗传学研究中,科学家发现了一个基因,可能过度活化和不活跃的免疫活性之间的一个“缺失环节”。这个候选基因在自身免疫性疾病(如1型糖尿病、类风湿性关节炎和过敏)中也发挥关键的作用。相关研究结果发表在四月二十日的《自然通讯》(Nature Communications)。
盘点Affymetrix的农业基因组学芯片[新品推荐]
自Affymetrix公司在2013年调整公司发展策略,将重点放在遗传分析业务以来,已经取得不错的成效。在2014年的过去三个季度,遗传分析业务部门的收入同比都有大幅度的增长。其中,农业生物学方面的业务稳定增长,在整个基因分型收入中占25%左右。在这两年的动植物基因组大会(PAG)上,Affymetrix都有新产品呈上。
Affymetrix推出小麦、三文鱼、玉米和玫瑰SNP芯片[新品推荐]
4月1日起,Affymetrix公司将开始发售四款新的高密度SNP基因分型芯片,适用于小麦、三文鱼、玉米和玫瑰的研究,以及一款密度较低的小麦SNP芯片,适合小麦育种人员。
来源:Affymetrix
时间:2014-02-10