‘Honeycrisp’苹果抗黑星病Vhc1位点的精细定位与候选基因鉴定

来自国际团队的研究人员针对苹果黑星病抗性育种中遗传标记稀缺的问题，开展了对‘Honeycrisp’品种Vhc1 QTL区的精细定位研究。通过开发新型SSR标记并鉴定LRR类候选基因，将抗性区间缩小至4.2-cM（0.85-Mb），为标记辅助育种和抗病机制解析提供关键支撑。

　　

由真菌Venturia inaequalis引起的苹果黑星病是全球苹果生产中最具经济破坏性的病害。虽然已发现多个抗性基因源，但功能性抗性等位基因紧密连锁的遗传标记稀缺仍是抗病育种的主要瓶颈。本研究以携带Vhc1抗性位点的北美流行品种‘Honeycrisp’和感病品种‘Gala’为亲本，利用其染色体级别 phased基因组组装数据，开发了9个新型多态性SSR标记，结合已有2个标记覆盖Vhc1 QTL区。通过构建F₁群体并接种源自Malus floribunda 821的V. inaequalis分离株Vi-19-004进行连续两年抗性评价，测得广义遗传力为0.66。表型-基因型关联分析将解释5.2%–11.8%表型变异的中等效应QTL精细定位至4.2-cM遗传区间（对应0.85-Mb物理区域），其中SSR标记mdCu_2500、mdCu_3000和CH-Vf1与抗性共定位。在QTL区内鉴定出6个受病原诱导高表达的LRR编码基因，被推定为抗性候选等位基因。本研究开发的标记体系与候选基因为加速基于‘Honeycrisp’的抗病品种选育提供关键技术支撑。