基于生物信息学的社区获得性肺炎炎症关键基因鉴定与功能分析揭示免疫调控新机制
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时间:2025年09月30日
来源:Microbiology and Immunology 1.8
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本研究针对社区获得性肺炎(CAP)炎症相关基因缺乏系统研究的问题,通过生物信息学分析鉴定出CCL5、IL7R等5个关键基因,揭示其在细胞因子受体结合和JAK-STAT通路中的核心作用,qRT-PCR验证显示IL18R1显著上调(p<0.05),AUC值超0.7的诊断效能为CAP精准诊疗提供新靶点。
通过生物信息学技术对社区获得性肺炎(CAP)的炎症相关基因(IRGs)进行系统性分析,研究人员成功鉴定了健康人群与CAP患者之间的差异表达基因(CAP-DE-IRGs)。功能富集分析显示这些基因显著富集于细胞因子-细胞因子受体相互作用、JAK-STAT信号通路等关键生物学过程。从IRGs中筛选出5个枢纽基因,定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)验证表明:CCL5、IL7R、IL2RB和IL10RA在CAP患者中显著下调,而IL18R1显著上调(p<0.05)。诊断效能验证显示多数基因的曲线下面积(AUC)值超过0.7,表明其优异的诊断潜力。功能预测提示这些基因具有细胞因子受体结合、免疫受体活性、响应白细胞介素-7(interleukin-7)等重要功能。免疫浸润分析发现中性粒细胞在CAP患者中浸润水平显著升高。相关性分析证实IL18R1与CAP相关基因呈正相关。该研究揭示了IRGs与CAP的分子关联,为疾病机制研究和靶向治疗提供了新视角。
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