基于cDNA-AFLP与转录组测序的龙眼氯酸钾诱导成花关键未知基因鉴定与分子标记开发

来自泰国的研究人员为解决氯酸钾(KClO3)诱导龙眼花期的环境风险问题，通过cDNA-AFLP技术开展早期分子响应机制研究。成功鉴定7个差异表达片段，其中LcAF9/14/18与已知转录组数据相似，LcAF7/10/14/17经qPCR验证具时序表达特性，并开发出LcAF8/9/17三个多态性分子标记，为龙眼育种提供新工具。

　　

通过比较cDNA-AFLP（扩增片段长度多态性）和转录组测序技术，科学家们揭开了泰国龙眼品种'E-Daw'在氯酸钾(KClO₃)处理下人工诱导开花过程中潜在未知基因的神秘面纱。研究团队采用cDNA-AFLP精准捕获到7个差异表达片段，经克隆测序后设计特异性引物。序列比对显示LcAF9、LcAF14和LcAF18与中泰龙眼品种转录组数据高度同源，尤其与KClO₃诱导开花实验及多种组织表达谱相关，而LcAF7等四个片段则可能是调控开花的新基因。

半定量RT-PCR和实时荧光定量PCR证实，经KClO₃处理的样本中LcAF7、LcAF10、LcAF14和LcAF17在特定时间点呈现显著差异表达，LcAF9和LcAF18则上演了随时间动态变化的表达"华尔兹"——时而上调时而下调。这些发现凸显了cDNA-AFLP在检测低丰度差异表达基因方面的独特优势，这些基因可能因检测阈值限制而逃逸RNA测序的法眼。

更令人振奋的是，所有7个LcAF引物均能成功扩增龙眼基因组DNA。其中LcAF8、LcAF9和LcAF17引物在32个泰国龙眼样本中展现出多态性PCR条带，宛如基因层面的"指纹图谱"，标志着它们作为分子标记的巨大潜力。这些标记将为龙眼遗传改良和品种选育提供精准高效的分子工具，推动龙眼产业向环保可持续方向发展。