玉米群体转座元件的进化动态与遗传多样性揭示及其功能影响研究

本研究基于103份玉米重测序数据，开发流程鉴定转座元件插入位点（TILs），揭示群体中80%的TILs存在多态性，发现不同TE超家族与家族进化动态差异显著，证实TE插入多态性可反映地理起源与进化关系，并显著影响基因表达，为玉米基因组进化与表型适应机制提供重要资源与分子标记。

　　

通过分析103份玉米（Zea mays）种质的重测序数据，研究人员利用新开发的生物信息学流程鉴定出转座元件（Transposable Elements, TEs）的插入位点（TILs），最终在82份材料中获得64 293个非冗余独特TILs。约80%（51 361个）位点在群体中呈现插入多态性。除短散在核元件（SINEs）外，所有TE超家族在玉米群体中频率均较低，而部分TE家族却存在大量固定插入，显示出TE超家族与家族间截然不同的进化动态。利用转座子插入多态信息进行的遗传分析表明，TE多态位点可有效反映玉米的地理起源和进化关系。此外，TE插入还能显著影响基因表达，暗示其对玉米表型与适应性具有潜在功能效应。这一研究为理解玉米基因组的进化机制和遗传多样性提供了新见解，并为分子标记开发及关联分析研究提供了宝贵资源。