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综述:癌症药物研发中的合成致死性:挑战与机遇
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月12日 来源:Nature Reviews Drug Discovery 101.8
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本综述系统梳理了合成致死性(Synthetic Lethality, SL)领域的最新进展,涵盖基于CRISPR的基因筛选、机器学习指导的基因对优先排序以及新型表型读出策略,重点探讨了克服转化医学壁垒的创新方法,为靶向癌症特异性遗传依赖(Genetic Dependencies)提供了突破性治疗视角。
合成致死性概念自二十余年前提出以来,始终是癌症靶向治疗领域的重要方向。虽然PARP抑制剂在BRCA突变癌症中的临床应用已成功验证该理念,但多数临床前发现的合成致死相互作用仍未能转化为有效疗法。转化进程缓慢的根源在于:靶向遗传依赖的药物开发本身存在技术挑战,且这些相互作用具有显著的细胞类型和组织特异性。
大规模遗传筛选技术(尤其是CRISPR-Cas9基因编辑系统)革新了合成致死相互作用的发掘流程。通过全基因组敲除筛选,研究人员能够系统性鉴定肿瘤细胞中的必需基因群。近年来,组合CRISPR筛选(Combinatorial CRISPR Screens)、碱基编辑(Base Editing)和饱和突变筛选(Saturation Mutagenesis)等新方法进一步拓展了筛选维度和精度,使得隐匿的合成致死基因对得以浮现。
面对海量筛选数据,机器学习模型正成为预测和优先排序候选基因对的关键工具。这些模型整合多组学数据(如基因组、转录组、蛋白质相互作用网络),不仅加速高置信度合成致死相互作用的识别,还可用于发掘预测性生物标志物(Biomarkers),为患者分层(Patient Stratification)和精准治疗提供依据。
传统筛选多依赖于细胞增殖或存活等基础表型,而新型读出技术如高内涵成像(High-Content Imaging)和单细胞测序(Single-Cell Profiling)可解析更复杂的细胞表型,包括细胞周期阻滞、DNA损伤响应、细胞分化状态等。这些多维表型数据有助于揭示合成致死相互作用的生物学机制,提升靶点发现的转化潜力。
将合成致死性转化为临床方案仍面临多重挑战,包括靶点的成药性、肿瘤异质性以及耐药机制。然而,随着技术创新与跨学科合作深化,针对遗传依赖关系的治疗策略正逐步走向临床。通过整合功能性基因组学、人工智能与先进表型分析,研究者有望突破现有瓶颈,解锁合成致死性在癌症治疗中的全部潜力。
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