哈萨克斯坦牛冠状病毒流行特征及分子流行病学研究：首次全国性调查揭示高流行率与GIIa基因型分布

推荐：为解决哈萨克斯坦牛冠状病毒(BCoV)流行情况不明的问题，研究人员开展全国性横断面研究，通过ELISA和巢式RT-PCR检测2237头牛样本，发现动物水平血清阳性率88.2%、病毒检出率2.4%，首次证实GIIa基因型毒株流行，为制定防控策略提供重要依据。

　　

牛冠状病毒(BCoV)作为β冠状病毒属成员，在全球范围内给畜牧业造成重大经济损失，可引起犊牛腹泻、冬季痢疾和呼吸道疾病。尽管该病毒自1972年首次分离以来已在各大洲发现，但作为世界第九大国家、拥有724万头牛的哈萨克斯坦，其BCoV流行状况却从未被研究。更值得注意的是，该国44.7%的牛饲养在生物安全措施薄弱的后院农场，这种特殊养殖模式可能加剧疾病传播。面对这一知识空白，由Yuliya V. Perfilyeva领衔的研究团队在《The Veterinary Journal》发表了首份关于哈萨克斯坦BCoV的全面调查报告。

研究团队采用横断面设计，在2024年4月至8月期间采集了全国17个州390个农场的2237头临床健康牛的血清、鼻拭子和直肠拭子。通过商业ELISA试剂盒检测抗体，巢式RT-PCR靶向核衣壳蛋白(N)基因检测病毒RNA，并对阳性样本进行刺突蛋白(S)和血凝素酯酶(He)基因全长测序。采用广义估计方程(GEE)模型分析风险因素，最大似然法构建系统发育树。

研究结果显示，哈萨克斯坦牛群存在惊人的BCoV暴露率：动物水平血清阳性率达88.2%(95%CI:84.3%-92.0%)，群体水平达89.6%。东部地区血清阳性率显著低于其他地区(36.6% vs 88%-100%)。多因素分析揭示三个关键风险因素：后院养殖比例>50%(OR=8.1)、牛密度>4头/km²(OR=5.1)和小规模养殖(≤50头，OR=2.4)。值得注意的是，东部地区奶牛感染风险是杂交牛的8.3倍。

分子检测方面，巢式RT-PCR在2.4%(50/2085)的动物中检出病毒RNA，涉及12个州的7.8%农场。对12株病毒的N基因测序确认其为BCoV，其中两株完成全长的S和He基因测序显示属于GIIa基因型，与美国和中国近年分离株具有99.1%和97.5%的核苷酸相似性，而与原始Mebus株(GI型)相似性仅为96.1%-96.7%。

讨论部分指出，哈萨克斯坦BCoV的高流行可能源于后院养殖模式促进病毒持续传播，而GIIa基因型的流行则与从美国进口活牛的历史相符。研究首次证实BCoV在哈萨克斯坦呈地方性流行，为理解欧亚大陆BCoV传播规律提供了关键数据。作者建议针对高风险地区(特别是东部奶牛场)和小规模养殖场优先实施防控措施，并建立国家监测系统评估BCoV对畜牧业的经济影响。

该研究的局限性包括采样季节可能低估病毒排出率，以及缺乏俄罗斯参考毒株影响传播路径分析。未来研究应扩大分子监测覆盖更多季节和地区，并探索BCoV在哈萨克斯坦绵羊等潜在宿主动物中的流行情况。这些发现不仅填补了中亚地区BCoV研究的空白，也为制定区域化防控策略提供了科学依据。