综述:等温扩增技术在DNA水凝胶生物传感中的整合应用

【字体: 时间:2025年09月06日 来源:TrAC Trends in Analytical Chemistry 11.8

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  这篇综述系统阐述了等温核酸扩增技术(INAATs)与DNA水凝胶的协同整合策略,通过酶依赖型(如LAMP、RPA、RCA)和酶非依赖型(如HCR、CHA)扩增方法,克服了传统水凝胶机械稳定性差、灵敏度低等局限,同时解决了INAATs依赖复杂仪器的问题,为即时检测(POCT)提供了新型生物传感平台。

  

合成方法学视角下的DNA水凝胶构建

DNA水凝胶可分为纯DNA型与杂化型两类。前者通过DNA纳米结构单元自组装或链置换反应构建,后者则整合聚合物/纳米材料以增强功能。例如,滚环扩增(RCA)产生的长单链DNA可同时作为支架与信号放大器,而杂交链式反应(HCR)生成的枝状网络能提升机械强度而不影响孔隙率。

INAATs与水凝胶的协同增效机制

酶依赖型策略如重组酶聚合酶扩增(RPA)能在水凝胶内实现局部高浓度扩增,突破扩散限制;酶非依赖型如熵驱动催化(EDC)则通过热力学调控实现自发组装。这种整合使检测限降低至阿摩尔级,并通过溶胀度变化实现裸眼读数。值得注意的是,Hg2+激活的Mg2+-DNAzyme系统可将金属离子检测灵敏度提升100倍。

CRISPR-Cas系统的革命性整合

当CRISPR-Cas12a的trans-cleavage活性与CHA扩增耦合时,可在水凝胶中实现"信号级联放大"。实验显示,这种设计对SARS-CoV-2核酸的检测限达5拷贝/μL,且通过荧光猝灭效应实现可视化判读。

智能材料与便携化突破

基于功能核酸(FNAs)的刺激响应性水凝胶,如pH敏感的i-motif结构,已成功集成到微流控芯片。最新研究将LAMP扩增产物引发的水凝胶相变与智能手机比色分析结合,使埃博拉病毒检测时间缩短至30分钟。

挑战与展望

当前瓶颈在于多重靶标检测时的交叉反应控制,以及长期储存稳定性。未来发展方向包括:①开发室温稳定的冻干水凝胶试剂盒;②整合机器学习算法优化多靶标识别路径;③探索类器官模型中的活体传感应用。

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