从寄生毛蕨根际土壤中分离的新型放线菌：环孢无胆甾原体新种(Amycolatopsis cyclosori sp. nov.)的鉴定与分类研究

来自中国湖南湘潭的研究人员从寄生毛蕨(Cyclosorus parasiticus)根际土壤中分离到一株具有分类学意义的新放线菌cg5T。通过多相分类学研究，结合全基因组测序(9.7 Mb)和16S rRNA分析(与A. xylanica CPCC 202699T相似度99.23%)，证实其代表无胆甾原体属(Amycolatopsis)新种，命名为Amycolatopsis cyclosori sp. nov. (模式菌株cg5T=MCCC 1K09227T=KCTC 59391T)，为微生物资源库增添新成员。

　　

科研团队在湖南湘潭的寄生毛蕨(Cyclosorus parasiticus)根际土壤中发现了一株编号为cg5^T的放线菌新菌株。该菌株细胞壁含有特征性组分内消旋二氨基庚二酸(meso-DAP)，全细胞糖谱显示阿拉伯糖、半乳糖、核糖和鼠李糖的存在，这些化学分类特征完美契合无胆甾原体属(Amycolatopsis)的典型特征。

基因组分析显示，这株G+C含量高达68.5%的菌株拥有约9.7兆碱基的基因组规模。通过全长的16S核糖体RNA(16S rRNA)序列比对，发现其与木质无胆甾原体(A. xylanica)CPCC 202699^T菌株的相似度达到99.23%。然而更深入的基因组水平比较却揭示出显著差异：平均核苷酸一致性(ANIm)仅为92.23%，数字化DNA-DNA杂交(dDDH)值低至45.8%，远低于界定新物种的阈值标准(ANIm 96.6%，dDDH 70%)。

基于表型特征、化学分类数据和基因组差异的综合分析，研究者正式将该菌株命名为环孢无胆甾原体(Amycolatopsis cyclosori sp. nov.)，其模式菌株cg5^T已保藏于中国海洋微生物菌种保藏中心(MCCC 1K09227^T)和韩国典型菌种保藏中心(KCTC 59391^T)，为微生物多样性研究和潜在应用提供了新的菌种资源。